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差异表达基因CDCA8、CDC20与肾母细胞瘤患者预后及免疫细胞浸润的关系
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作者 杨迪 黄业华 +5 位作者 黄和松 蒙菲 黄靓 岑琴 覃花杏 张东虎 《医学信息》 2024年第8期1-9,共9页
目的探讨差异表达基因CDCA8及CDC20在肾母细胞瘤中的表达,以及与肾母细胞瘤患者预后及免疫细胞浸润的关系。方法登录并下载GEO数据库及Target数据库中与肾母细胞瘤相关的基因表达谱数据;利用R语言筛选出差异表达基因,筛选出与肾母细胞... 目的探讨差异表达基因CDCA8及CDC20在肾母细胞瘤中的表达,以及与肾母细胞瘤患者预后及免疫细胞浸润的关系。方法登录并下载GEO数据库及Target数据库中与肾母细胞瘤相关的基因表达谱数据;利用R语言筛选出差异表达基因,筛选出与肾母细胞瘤预后有关的基因;利用R语言中的CIBERSORT计算方法计算出肾母细胞瘤中免疫细胞浸润的表达;利用SPSS分析肾母细胞瘤预后有关的基因与免疫细胞浸润的相关性。结果GEO表达谱数据GSE66405、GSE73209、GSE11151筛选出共同差异表达基因1260个,其中高表达398个,低表达862个;蛋白互作网络筛选出15个核心蛋白,包括CDK1、CCNA2、TOP2A、CCNB2、KIF11、BUB1、BUB1B、ASPM、NUSAP1、CDC20、CDCA8、KIF20A、DLGAP5、TPX2、CENPF,其中CDCA8及CDC20与肾母细胞瘤患者预后有关;T cells CD4 memory activated(P=0.026)、T cells follicular helper(P=0.031)、Macrophages M0(P=0.005)、Dendritic cells activated(P=0.025)的表达高于正常对照组,而Plasma cells(P=0.023)、T cells CD4 memory resting(P=0.002)、NK cells resting(P=0.045)、Monocytes(P=0.013)在肾母细胞瘤中低表达。相关性分析显示,CDCA8与6个免疫细胞浸润具有相关性,CDC20与5个免疫细胞浸润具有相关性。结论CDCA8及CDC20有可能成为肾母细胞瘤患者治疗的新潜在靶点。 展开更多
关键词 肾母细胞瘤 CDCA8 CDC20 免疫细胞浸润
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