目的:基于网络药理学方法探讨蒲黄治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的作用机制。方法:运用中药系统药理分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)提取蒲黄的...目的:基于网络药理学方法探讨蒲黄治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的作用机制。方法:运用中药系统药理分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)提取蒲黄的活性成分及对应靶点,借助UniProt数据库对靶点进行规范化,通过GeneCards数据库和OMIM数据库获取DR的相关靶点,并利用R语言筛选药物与疾病的交集靶点。通过Cytoscape软件构建蒲黄“活性成分-疾病靶点”可视化调控网络,利用STRING数据库构建蛋白互相作用网络,并借助Bioconductor平台进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集通路分析。结果:共获得蒲黄6个活性成分,药物与疾病127个交集靶点,核心靶点包含蛋白激酶B、血管内皮生长因子A、肿瘤蛋白53等;GO功能富集分析涉及转录因子活性、酶活性、受体活性及生物化学过程调控等过程,KEGG通路富集分析涉及动脉粥样硬化、AGEs-RAGE等通路。结论:蒲黄中的槲皮素等活性成分作用于Akt1等疾病靶点,参与酶结合、应激反应等生物学功能调控AGEs-RAGE等信号通路,从而治疗DR。展开更多
文摘目的:基于网络药理学方法探讨蒲黄治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的作用机制。方法:运用中药系统药理分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)提取蒲黄的活性成分及对应靶点,借助UniProt数据库对靶点进行规范化,通过GeneCards数据库和OMIM数据库获取DR的相关靶点,并利用R语言筛选药物与疾病的交集靶点。通过Cytoscape软件构建蒲黄“活性成分-疾病靶点”可视化调控网络,利用STRING数据库构建蛋白互相作用网络,并借助Bioconductor平台进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集通路分析。结果:共获得蒲黄6个活性成分,药物与疾病127个交集靶点,核心靶点包含蛋白激酶B、血管内皮生长因子A、肿瘤蛋白53等;GO功能富集分析涉及转录因子活性、酶活性、受体活性及生物化学过程调控等过程,KEGG通路富集分析涉及动脉粥样硬化、AGEs-RAGE等通路。结论:蒲黄中的槲皮素等活性成分作用于Akt1等疾病靶点,参与酶结合、应激反应等生物学功能调控AGEs-RAGE等信号通路,从而治疗DR。