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鉴定铁死亡相关基因作为狼疮性肾炎诊断生物标志物的研究
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作者 吴昱升 林栩 +5 位作者 王蓉 黄慕源 徐璐瑶 张洁 杨岚茵 蓝梦麟 《右江医学》 2023年第1期6-14,共9页
目的以铁死亡相关基因(ferroptosis-related genes,FRGs)为目的基因筛选狼疮性肾炎(lupus nephritis,LN)的生物标志物。方法分别从基因表达数据库和FerrDB数据库下载LN相关数据和FRGs。接着使用差异表达分析、加权基因共表达网络分析(we... 目的以铁死亡相关基因(ferroptosis-related genes,FRGs)为目的基因筛选狼疮性肾炎(lupus nephritis,LN)的生物标志物。方法分别从基因表达数据库和FerrDB数据库下载LN相关数据和FRGs。接着使用差异表达分析、加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)、LASSO(least absolute shrinkage and selection operator)回归和支持向量机递归特征消除筛选关键基因,并绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估关键基因的诊断能力,并验证诊断基因的表达量。结果本研究鉴定出2个关键基因(PTEN和NR4A1),关键基因的ROC曲线下面积均大于0.79,且PTEN在LN样本中高表达,NR4A1在LN样本中低表达。结论PTEN和NR4A1的发现为LN铁死亡相关研究提供了新的视角。 展开更多
关键词 狼疮性肾炎 铁死亡 生物标志物 诊断基因
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基于网络药理学和分子对接探讨鸡血藤治疗糖尿病肾病的作用机制研究
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作者 王蓉 林栩 +3 位作者 吴昱升 黄慕源 徐璐瑶 张洁 《右江医学》 2023年第12期1069-1075,共7页
目的运用网络药理学和分子对接探讨鸡血藤治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在作用机制。方法通过检索多个数据库筛选出鸡血藤活性成分和核心靶点,借助Drugbank、TTD、OMIM、Genecard、PharmGkb数据库收集DKD作用靶点,运用Venny 2.1.0获取鸡血藤... 目的运用网络药理学和分子对接探讨鸡血藤治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在作用机制。方法通过检索多个数据库筛选出鸡血藤活性成分和核心靶点,借助Drugbank、TTD、OMIM、Genecard、PharmGkb数据库收集DKD作用靶点,运用Venny 2.1.0获取鸡血藤与DKD的交集靶点基因。使用STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,并使用Cytoscape软件和CytoNCA插件进行分析筛选出核心靶点。然后进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。最后,使用AutoDock Tools软件通过分子对接技术验证活性化合物与核心靶点的结合能力。结果挖掘出24种鸡血藤的关键活性成分,DKD靶点12818个,有48个二者的交集靶点基因。筛选出鸡血藤活性成分3种(芦荟大黄素、木犀草素、甘草查尔酮a),核心靶点基因4种[热休克蛋白90 Alpha家族A级成员1(HSP90AA1)、MYC原癌基因(MYC)、肿瘤蛋白p53(TP53)、信号传感器和转录激活剂3(STAT3)]。GO功能共富集498个条目,KEGG通路共富集61个条目。分子对接技术验证了3种活性化合物与其作用的关键靶点具有可靠的亲和力。结论推测鸡血藤治疗DKD具有多成分-多靶点-多途径的特点,为进一步研究鸡血藤治疗DKD的分子机制提供了新的思路。 展开更多
关键词 网络药理学 分子对接 鸡血藤 糖尿病肾病
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miR-155在高糖诱导足细胞损伤的表达及其与足细胞损伤相关蛋白表达的相关性
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作者 王蓉 林栩 +6 位作者 吴昱升 唐志明 王晨 韦美理 黄慕源 张洁 徐璐瑶 《右江医学》 2023年第4期300-306,共7页
目的探讨高糖(HG)诱导足细胞损伤中miR-155的表达变化及miR-155与足细胞损伤相关蛋白表达的关系。方法体外培养人肾小球足细胞(AB8/13),用30 mmol/L的D-葡萄糖溶液刺激AB8/1348 h作为HG组,同时以终浓度为5 mmol/L的D-葡萄糖溶液处理细胞... 目的探讨高糖(HG)诱导足细胞损伤中miR-155的表达变化及miR-155与足细胞损伤相关蛋白表达的关系。方法体外培养人肾小球足细胞(AB8/13),用30 mmol/L的D-葡萄糖溶液刺激AB8/1348 h作为HG组,同时以终浓度为5 mmol/L的D-葡萄糖溶液处理细胞48 h作为正常对照(NC)组。用CCK8法检测细胞增殖活性。实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测nephrin、F-actin、synaptopodin、p-cadherin的mRNA和miR-155的表达。Western blot法检测nephrin、F-actin、synaptopodin、p-cadherin蛋白的表达。鬼笔环肽染色观察细胞骨架变化。细胞免疫荧光检测蛋白nephrin、synaptopodin。结果HG可抑制足细胞增殖,降低细胞存活率(P<0.01)。HG作用的Ab8/13中的miR-155表达水平升高,nephrin、F-actin、synaptopodin、p-cadherin的mRNA与蛋白表达水平降低(P<0.05)。HG会导致足细胞骨架紊乱。结论HG作用的人足细胞中miR-155表达升高,miR-155表达与HG诱导的足细胞损伤有关,可作为足细胞损伤诊断和治疗的靶点。 展开更多
关键词 足细胞损伤 MIR-155 高糖 足细胞相关蛋白
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慢病毒载体介导过表达和敲低miR-155的AB 8/13细胞株的建立 被引量:1
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作者 唐志明 林栩 +5 位作者 梁钊 王晨 韦美理 王蓉 吴昱升 黄慕源 《右江医学》 2022年第5期321-327,共7页
目的 利用慢病毒载体构建稳定过表达miR-155的AB 8/13细胞株(AB 8/13-LV-has-miR-155)和稳定敲低miR-155的AB 8/13细胞株(AB 8/13-LV-has-miR-155p inhibiton),为研究miR-155在足细胞焦亡和肾脏疾病中的作用奠定基础。方法 体外培养AB 8... 目的 利用慢病毒载体构建稳定过表达miR-155的AB 8/13细胞株(AB 8/13-LV-has-miR-155)和稳定敲低miR-155的AB 8/13细胞株(AB 8/13-LV-has-miR-155p inhibiton),为研究miR-155在足细胞焦亡和肾脏疾病中的作用奠定基础。方法 体外培养AB 8/13细胞,使用不同浓度嘌呤霉素刺激AB 8/13细胞48 h,在光学显微镜下观察AB 8/13细胞的死亡情况;使用LV-has-miR-155阴性对照病毒、LV-has-miR-155-5p inhibiton阴性对照病毒分别感染AB 8/13细胞,在荧光显微镜下观察AB 8/13细胞的状态和感染效率;在嘌呤霉素筛选出稳定细胞株后,通过实时荧光定量PCR法检测稳定细胞株的miR-155表达量。结果 在3.5μg/mL及以上浓度的嘌呤霉素作用于AB 8/13细胞48 h后,所有细胞全部死亡。LV-has-miR-155慢病毒感染AB 8/13细胞的感染效率达到80%的最佳条件为在含HiTransG P的完全培养基中进行感染,MOI为10;LV-has-miR-155-5p inhibiton慢病毒感染AB 8/13细胞的感染效率达到80%的最佳条件为在含HiTransG A的完全培养基中进行感染,MOI为100。qRT-PCR结果显示AB 8/13-LV-has-miR-155细胞株的miR-155表达量明显升高,AB 8/13-LV-has-miR-155p inhibiton细胞株的miR-155表达量降低。结论 成功构建AB 8/13-LV-has-miR-155稳定细胞株和AB 8/13-LV-has-miR-155p inhibiton稳定细胞株,为进一步探究miR-155在人足细胞焦亡中的作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 AB 8/13细胞 慢病毒载体 MIR-155
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巨噬细胞极化在肾脏纤维化中的研究进展
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作者 黄慕源 王蓉 吴昱升 《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》 2022年第10期168-171,共4页
肾脏纤维化是一种复杂的病理变化,表现为肾间质纤维化、肾小球硬化,可有蛋白尿、血清肌酐升高、血尿素氮升高等肾功能损害表现。肾脏纤维化的发病机制复杂,至今尚未完全明确。近年来新的试验研究表明,巨噬细胞在肾脏纤维化的发病过程中... 肾脏纤维化是一种复杂的病理变化,表现为肾间质纤维化、肾小球硬化,可有蛋白尿、血清肌酐升高、血尿素氮升高等肾功能损害表现。肾脏纤维化的发病机制复杂,至今尚未完全明确。近年来新的试验研究表明,巨噬细胞在肾脏纤维化的发病过程中发挥着重要的生物学作用,M1型巨噬细胞的促炎作用可驱动肾脏纤维化的发生和促进其发展。也有研究发现M2型巨噬细胞的抗炎作用在抗肾脏纤维化中起着举足轻重的作用。本文也将分别从巨噬细胞的起源、极化及其在肾脏纤维化中的作用做相关领域的理论综述,以阐明巨噬细胞极化在肾脏纤维化整个发生发展中的作用,探索新的抗肾脏纤维化药物治疗的靶点,提供新的研究思路。 展开更多
关键词 巨噬细胞 极化 肾脏纤维化
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