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基于WGCNA分析反复种植失败胚胎种植窗口期关键生物标志物及免疫相关性
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作者 覃韦丽 王嘉伟 +1 位作者 黄汉记 覃爱平 《蛇志》 2023年第2期177-184,共8页
目的 应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨反复种植失败(RIF)胚胎种植窗口期关键生物学标志物以及子宫内膜局部免疫细胞浸润情况。方法 从GEO数据库中下载基因芯片数据,以logFC≥1,P<0.05为筛选条件;以GSE103465和GSE111974作为... 目的 应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨反复种植失败(RIF)胚胎种植窗口期关键生物学标志物以及子宫内膜局部免疫细胞浸润情况。方法 从GEO数据库中下载基因芯片数据,以logFC≥1,P<0.05为筛选条件;以GSE103465和GSE111974作为模型组,获取RIF和正常妊娠志愿者差异表达基因(DEGs),使用GO和KEGG对DEGs进行功能富集分析。使用WGCNA和LASSO回归筛选RIF关键生物学标志物,并使用GSE26787、GSE71835和GSE92324作为验证组进行验证。基于ssGSEA分析RIF浸润免疫细胞相对丰富度以及与关键生物学标志物相关性。结果 相对于正常妊娠者,RIF患者共筛选出178个DEGs,其中高表达115个,低表达63个。WGCNA和LASSO回归证实模型组GJA1(AUC=0.875)和PHF8(AUC=0.903)是RIF密切相关的诊断性标志物,在验证组(GJA1:AUC=0.777;PHF8:AUC=0.885)同样发现佐证了该结果。而且模型组和验证组均发现RIF患者GJA1呈低表达,PHF8呈高表达,与浸润免疫细胞存在明显的相关性。RIF和正常妊娠志愿者WOI子宫内膜样本之间免疫细胞浸润存在一定的差异。结论 GJA1和PHF8能够用于RIF患者的诊断与识别,与子宫内膜浸润免疫细胞密切相关。 展开更多
关键词 反复种植失败 加权基因共表达网络分析 差异表达基因 种植窗 子宫内膜容受性
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广西高校易班建设现状及对策研究 被引量:1
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作者 黄汉记 杨仕婷 +3 位作者 邓小艳 王宇 彭平 何彦妮 《投资与创业》 2017年第6期92-94,共3页
2014年,广西成为全国第一批推广易班建设的省区,并于同年9月选定12所高校进行推广.通过3年的推广,易班建设取得了初步成效.本文在调查研究广西易班发展现状情况和广西易班的推广成效基础上,进一步分析广西易班发展过程中发现的现实瓶颈... 2014年,广西成为全国第一批推广易班建设的省区,并于同年9月选定12所高校进行推广.通过3年的推广,易班建设取得了初步成效.本文在调查研究广西易班发展现状情况和广西易班的推广成效基础上,进一步分析广西易班发展过程中发现的现实瓶颈,并探讨出针对广西易班发展的建议. 展开更多
关键词 易班 广西高校 推广建设
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大学生志愿者暑期“三下乡”关爱农村“留守儿童”社会实践活动对策分析 被引量:8
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作者 黄汉记 刘鑫鑫 《乡村科技》 2017年第16期24-26,共3页
农村留守儿童问题越来越受到社会各界的关注,高校大学生志愿者的社会实践活动在推进关爱农村留守儿童工作方面发挥着重要作用。本文在分析大学生志愿者暑期"三下乡"关爱农村"留守儿童"社会实践活动存在的优势与不... 农村留守儿童问题越来越受到社会各界的关注,高校大学生志愿者的社会实践活动在推进关爱农村留守儿童工作方面发挥着重要作用。本文在分析大学生志愿者暑期"三下乡"关爱农村"留守儿童"社会实践活动存在的优势与不足的基础上,积极探索大学生开展暑期"三下乡"关爱农村"留守儿童"社会实践活动的有效路径。 展开更多
关键词 留守儿童 大学生志愿者 社会实践
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miR-499a-5p在骨肉瘤中的表达及其对骨肉瘤发生发展的影响
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作者 崔小飞 朱博 +3 位作者 李康路 黄汉记 卢德杰 赵劲民 《广西医科大学学报》 CAS 2022年第3期375-382,共8页
目的:探讨miR-499a-5p在骨肉瘤(OS)中的表达及其对OS发生发展的影响。方法:通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证miR-499a-5p在OS细胞系(143B、MNNG)及正常成骨细胞(hFOB1.19)中的差异表达,并使用3种在线预测工具对miR-499a-5p的靶基因进... 目的:探讨miR-499a-5p在骨肉瘤(OS)中的表达及其对OS发生发展的影响。方法:通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证miR-499a-5p在OS细胞系(143B、MNNG)及正常成骨细胞(hFOB1.19)中的差异表达,并使用3种在线预测工具对miR-499a-5p的靶基因进行了预测,并取3种数据共同交集得到的靶基因作为候选靶基因。利用靶基因进行基因功能分析(GO)富集分析,并利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,然后经过蛋白互作网络(PPI)分析,筛选节点最高的3个关键hub基因,并利用生存分析从这3个关键hub基因中筛选出具有预后意义的关键基因。结果:RT-qPCR结果显示,与正常的成骨细胞比较,OS细胞中miR-499a-5p表达降低(P<0.05)。通过3种在线预测工具预测miR-499a-5p的靶基因并交集获得181个靶基因。GO分析结果表明,生物过程(BP)最显著富集的是RNA聚合酶Ⅱ促子转录的正向调控,细胞组成(CC)最显著富集的是细胞核,分子功能(MF)最显著富集的是蛋白结合。在KEGG的通路富集中,最显著的是人类T细胞白血病病毒1感染信号通路,其次是轴突引导通路、催产素信号通路和T细胞激活信号通路。靶基因的蛋白互作网络分析发现节点最高的3个关键hub基因分别是异质核糖核蛋白C(HNRNPC)、真核翻译起始因子4γ2(EIF4G2)和真核翻译起始因子4A同工型2(EIF4A2)。生存分析结果显示,高度表达HNRNPC的OS患者的生存率显著降低(P<0.05)。结论:miR-499a-5p可能通过调控HNRNPC基因对OS发展产生潜在的影响。 展开更多
关键词 骨肉瘤 生物信息学 miR-499a-5p 异质核糖核蛋白C
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不同浓度明胶水凝胶用于3D生物打印的初步研究 被引量:1
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作者 贺思 黄汉记 雷丹青 《当代化工研究》 2021年第4期148-150,共3页
目的:利用天然高分子材料明胶的生物学性能及交联特性,构建不同浓度的可用于3D生物打印的生物墨水,并对其进行制备,表征与分析,为之后的生物打印提供材料基础。方法:基于以往研究,制备不同浓度的甲基丙烯酸酐(MA)改性明胶水凝胶,分别进... 目的:利用天然高分子材料明胶的生物学性能及交联特性,构建不同浓度的可用于3D生物打印的生物墨水,并对其进行制备,表征与分析,为之后的生物打印提供材料基础。方法:基于以往研究,制备不同浓度的甲基丙烯酸酐(MA)改性明胶水凝胶,分别进行MA改性明胶水凝胶制备、溶胀性能、力学性能、营养液渗透、3D生物打印实验,以此来确定明胶水凝胶的物理特性及生物学特性。结果:在浓度为10%~20%的MA改性的明胶水凝胶范围内,浓度越低,水凝胶越透明,透光性越好;溶胀性能实验表明,在浓度为10%~20%的MA改性的明胶水凝胶范围内,浓度越高,溶胀率越低;力学性能实验表明,在浓度为10%~20%的MA改性的明胶水凝胶范围内,浓度越大,杨氏模量越大;营养液渗透实验表明,在浓度为10%~20%的MA改性的明胶水凝胶中,浓度越低,营养液渗透的越快。3D生物打印表明利用明胶水凝胶可以打印出预先设计的几何形状,且经过紫外光交联后,能够形成具有一定机械强度的水凝胶胶体。结论:15%的MA改性明胶水凝胶具有优良的溶胀性能,力学强度以及适合的孔隙率,并具备3D打印能力。 展开更多
关键词 明胶 水凝胶 3D生物打印 墨水
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GEO芯片联合分析筛选鼻咽癌关键基因CCNB1,CDK1,CCNA2
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作者 劳远司 黄汉记 莫武宁 《中国科技期刊数据库 医药》 2022年第1期10-12,共3页
本研究旨在探讨新型生物标志物和筛选鼻咽癌患者的关键基因。方法:从GEO数据库中下载GSE12452和GSE64634两个数据库,并利用R语言“SVA”软件包进行合并,采用R语言“limma”软件包进行差异分析。对差异基因利用R语言“clusterProfiler”... 本研究旨在探讨新型生物标志物和筛选鼻咽癌患者的关键基因。方法:从GEO数据库中下载GSE12452和GSE64634两个数据库,并利用R语言“SVA”软件包进行合并,采用R语言“limma”软件包进行差异分析。对差异基因利用R语言“clusterProfiler”软件包进行KEGG富集分析,最终利用string数据库和Cytoscape软件筛选出关键基因。结果:差异基因主要在细胞因子-细胞因子受体相互作用通路中富集,该通路中的Top3关键基因是CCNB1,CDK1和CCNA2。结论:CCNB1,CDK1和CCNA2在鼻咽癌中起到关键作用,并可能通过细胞因子-细胞因子受体相互作用通路影响鼻咽癌的发生发展进程。 展开更多
关键词 鼻咽癌 生物信息学 GEO
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环状RNA hsa_circ_0003568通过miR-140-3p及miR-502-5p调控靶基因CDK6及NFYA在骨肉瘤中的作用
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作者 李康路 黄汉记 +3 位作者 严国华 谭曼利 黄大计 朱博 《右江民族医学院学报》 2020年第6期710-715,共6页
目的探讨环状RNA hsa_circ_0003568在骨肉瘤(OS)中的表达并采用生物信息学方法进行circRNA-miRNA-mRNA的网络构建,分析其可能的机制及临床意义。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测hsa_circ_0003568在OS细胞系及正常成骨细... 目的探讨环状RNA hsa_circ_0003568在骨肉瘤(OS)中的表达并采用生物信息学方法进行circRNA-miRNA-mRNA的网络构建,分析其可能的机制及临床意义。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测hsa_circ_0003568在OS细胞系及正常成骨细胞中的表达。随后,基于circRNA-miRNA和miRNA-mRNA构建circRNA-miRNA-mRNA网络。通过多种circRNA软件数据库进行分析hsa_circ_0003568靶向的miRNA,并进一步通过miRNA数据软件预测其靶基因,选择至少4个以上软件支持的靶向miRNA及靶基因,并通过GEPIA数据库软件对靶基因进行生存分析筛选出显著预后差异的靶基因从而分析hsa_circ_0003568潜在的临床意义。结果RT-qPCR检测结果表明:与正常对照组相比,hsa_circ_0003568在OS细胞系中显著升高(P<0.05)。测序发现hsa_circ_0003568的成环连接点位于IST1前体RNA的第5和6外显子上。生物信息学分析结果显示:hsa_circ_0003568同时靶向两个miRNA(miR-140-3p及miR-502-5p),构建了hsa_circ_0003568、miR-140-3p/miR-502-5p及13个靶基因的circRNA-miRNA-mRNA网络,此外,GEPIA数据库分析中发现CDK6和NFYA两个靶基因,与OS患者的生存预后显著相关(P<0.05),并且NFYA同时是miR-140-3p及miR-502-5p的潜在靶基因。结论高表达的hsa_circ_0003568可能通过miR-140-3p及miR-502-5p调控基因CDK6及NFYA参与OS的发生发展过程。 展开更多
关键词 circRNA MIRNA MRNA 骨肉瘤 非编码RNA
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可注射水凝胶的研究进展
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作者 贺思 黄汉记 雷丹青 《蛇志》 2020年第2期228-230,255,共4页
本文综述了传统水凝胶存在的不足及可注射水凝胶的优点。可注射水凝胶具有较高的载药率和微创治疗作用,避免手术创伤,且具有响应性等优点,可注射水凝胶支架材料,可注射水凝胶在药物递送、骨再生、伤口修复等方面的应用,并对可注射水凝... 本文综述了传统水凝胶存在的不足及可注射水凝胶的优点。可注射水凝胶具有较高的载药率和微创治疗作用,避免手术创伤,且具有响应性等优点,可注射水凝胶支架材料,可注射水凝胶在药物递送、骨再生、伤口修复等方面的应用,并对可注射水凝胶的未来发展前景进行展望。 展开更多
关键词 可注射水凝胶 临床应用 发展前景
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