吉非替尼获得性耐药非小细胞肺癌细胞中差异表达环状RNA分析

目的 :建立吉非替尼获得性耐药非小细胞肺癌细胞株,并筛选和分析耐药前后差异表达的环状RNA(circular RNA,circ RNA)。方法:利用吉非替尼敏感性非小细胞肺癌细胞株H292(简称为H292_S),采用逐步加药法建立吉非替尼获得性耐药株(命名为H292_R)。CCK-8法检测吉非替尼对2种细胞增殖的抑制作用;RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)法筛选2种细胞中差异表达的circRNA;实时荧光定量PCR法验证RNA-seq结果,并结合统计学和生物信息学方法对差异circRNA来源基因的生物学功能进行分析。结果:吉非替尼对H292_S和H292_R细胞增殖的半数抑制浓度分别为(108.63±0.32)nmol/L和(982.37±2.62)nmol/L,2者间差异有统计学意义(P值均<0.05),耐药细胞H292_R对吉非替尼的耐药指数为9.04。2种细胞中存在36个差异表达circRNA,其中耐药细胞中24个circRNA表达上调(P值均<0.05),12个circRNA表达下调(P值均<0.05);GO富集分析发现,异常表达的circRNA主要涉及调节细胞生长增殖、蛋白转运和基因转录等生物学过程;KEGG通路分析发现,异常circRNA的信号通路主要涉及细胞质DNA感受通路、核因子κB(nuclear factor-kappa B,NF-κB)、胞吞和凋亡等通路。实时荧光定量PCR法验证2种细胞中差异表达circRNA hsa_circ_0000567和hsa_circ_0000620的表达水平差异,结果显示耐药细胞中这2个circRNA水平均明显上调(P值均<0.05),与RNA-seq结果相符。结论:筛选出吉非替尼获得性耐药相关的差异表达circRNA,这有助于更深入地阐明非小细胞肺癌耐药的机制,并可能为其早期诊断提供生物学标志。

Ct-OATP1B3基因对人卵巢癌细胞迁移、侵袭与增殖调控的研究

肿瘤型有机阴离子转运多肽1B3(cancer-type organic anion transporting polypeptide1B3,Ct-OATP1B3)是新近发现于多种恶性肿瘤组织及细胞中的分子,是表达于肝脏的溶质转运体(solute carrier,SLC)超家族成员OATP1B3的剪接异构体,但其在肿瘤细胞中的生物学功能尚不明确。该研究采用免疫组织化学染色方法观察Ct-OATP1B3在正常卵巢及卵巢癌组织中的表达,分析其表达阳性率与卵巢癌组织临床病理特征的关系;Real-time PCR和Western blot法观察Ct-OATP1B3在卵巢癌细胞SKOV3和OVCAR3中的表达水平;细胞免疫荧光染色法观察Ct-OATP1B3在卵巢癌细胞SKOV3和OVCAR3中的表达定位;Transwell实验检测Ct-OATP1B3对卵巢癌细胞迁移和侵袭能力的影响;CCK-8法观察Ct-OATP1B3对卵巢癌细胞增殖能力的影响。结果显示,在正常卵巢组织中未检测到Ct-OATP1B3的表达,而在卵巢癌组织中表达明显上调,且卵巢癌临床分期越晚,CtOATP1B3表达阳性率越高;卵巢癌细胞株SKOV3与OVCAR3同样存在Ct-OATP1B3的高表达,主要定位于细胞质中;尽管Ct-OATP1B3对卵巢癌细胞的生长增殖有一定的促进作用,但其主要的生物学功能是促进卵巢癌细胞的迁移和侵袭能力。