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基于网络药理学及分子对接探讨三七总皂苷治疗脓毒症的作用机制
1
作者
黄萍娥
杨萍
+4 位作者
黄威
刘云涛
王津
王远平
叶烨
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1028-1034,共7页
目的基于网络药理学与分子对接技术探讨三七总皂苷治疗脓毒症的作用机制。方法通过检索TCMSP、Swiss Target Prediciton和PharmMapper数据库得到三七总皂苷的作用靶点;在Genecard、Drugbank、Disgenet和OMIM数据库检索脓毒症的疾病相关...
目的基于网络药理学与分子对接技术探讨三七总皂苷治疗脓毒症的作用机制。方法通过检索TCMSP、Swiss Target Prediciton和PharmMapper数据库得到三七总皂苷的作用靶点;在Genecard、Drugbank、Disgenet和OMIM数据库检索脓毒症的疾病相关靶点;将筛选出的三七总皂苷作用靶点与脓毒症疾病相关靶点取交集,作为三七总皂苷治疗脓毒症的潜在作用靶点。通过STRING数据库构建潜在作用靶点的蛋白互作(PPI)网络,并筛选关键靶点;对潜在作用靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析,构建药物-疾病-靶点-通路网络;利用AutoDock Vina软件对三七总皂苷5种单体皂苷成分与三七总皂苷治疗脓毒症的关键靶点进行分子对接验证。结果获得三七总皂苷治疗脓毒症的潜在作用靶点206个;筛选得到AKT1、TP53、SRC、STAT3、JUN、TNF、IL6、MAPK1、PIK3R1和IL1B等关键靶点。潜在作用靶点GO功能富集分析得到2548项生物过程(BP)条目,174项分子功能(MF)条目,47项细胞组分(CC)条目;KEGG通路富集分析共得到171条信号通路。三七总皂苷主要活性成分三七皂苷R1、人参皂苷Rg1、人参皂苷Re、人参皂苷Rb1、人参皂苷Rd与关键靶点AKT1、TP53、STAT3、SRC、JUN具有较强的结合活性。结论三七总皂苷可能通过AKT1、TP53、SRC、STAT3、TNF等关键靶点,作用于PI3K-Akt、AGE-RAGE等主要信号通路,进而影响脓毒症的炎症反应、细胞凋亡和凝血反应等生理过程,发挥治疗脓毒症的作用。
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关键词
三七总皂苷
脓毒症
网络药理学
分子对接
炎症反应
细胞凋亡
凝血反应
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题名
基于网络药理学及分子对接探讨三七总皂苷治疗脓毒症的作用机制
1
作者
黄萍娥
杨萍
黄威
刘云涛
王津
王远平
叶烨
机构
广州中医药大学
广州中医药大学第二附属医院
广东省第二中医院
出处
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1028-1034,共7页
基金
广东省中医药管理局科研项目(20221189)。
文摘
目的基于网络药理学与分子对接技术探讨三七总皂苷治疗脓毒症的作用机制。方法通过检索TCMSP、Swiss Target Prediciton和PharmMapper数据库得到三七总皂苷的作用靶点;在Genecard、Drugbank、Disgenet和OMIM数据库检索脓毒症的疾病相关靶点;将筛选出的三七总皂苷作用靶点与脓毒症疾病相关靶点取交集,作为三七总皂苷治疗脓毒症的潜在作用靶点。通过STRING数据库构建潜在作用靶点的蛋白互作(PPI)网络,并筛选关键靶点;对潜在作用靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析,构建药物-疾病-靶点-通路网络;利用AutoDock Vina软件对三七总皂苷5种单体皂苷成分与三七总皂苷治疗脓毒症的关键靶点进行分子对接验证。结果获得三七总皂苷治疗脓毒症的潜在作用靶点206个;筛选得到AKT1、TP53、SRC、STAT3、JUN、TNF、IL6、MAPK1、PIK3R1和IL1B等关键靶点。潜在作用靶点GO功能富集分析得到2548项生物过程(BP)条目,174项分子功能(MF)条目,47项细胞组分(CC)条目;KEGG通路富集分析共得到171条信号通路。三七总皂苷主要活性成分三七皂苷R1、人参皂苷Rg1、人参皂苷Re、人参皂苷Rb1、人参皂苷Rd与关键靶点AKT1、TP53、STAT3、SRC、JUN具有较强的结合活性。结论三七总皂苷可能通过AKT1、TP53、SRC、STAT3、TNF等关键靶点,作用于PI3K-Akt、AGE-RAGE等主要信号通路,进而影响脓毒症的炎症反应、细胞凋亡和凝血反应等生理过程,发挥治疗脓毒症的作用。
关键词
三七总皂苷
脓毒症
网络药理学
分子对接
炎症反应
细胞凋亡
凝血反应
Keywords
Panax notoginsenosides
sepsis
network pharmacology
molecular docking
inflammatory reaction
apoptosis
coagulation response
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
R857.3 [医药卫生—航空、航天与航海医学]
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作者
出处
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1
基于网络药理学及分子对接探讨三七总皂苷治疗脓毒症的作用机制
黄萍娥
杨萍
黄威
刘云涛
王津
王远平
叶烨
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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