不同富营养培养基对人肠道菌群的体外培养效果比较分析

以富含营养的培养基(rich media,RM)为关键组成部分的培养组学技术的兴起为肠道菌群与宿主互作的机制研究提供了重要保障。为了探究不同RM对人肠道菌群的体外培养效果,采用平板计数法以及16S rDNA高通量测序技术分析YCFA培养基(yeast extract-casein hydrolysate-fatty acid medium)、GAM培养基(gifu anaerobic medium)和一种具有专利保护的ZJ培养基对人肠道菌群的体外培养效果。平板计数法显示在不同培养基中培养不同时间(0~7 d)后菌落总数多呈先上升后下降的趋势,经3种培养基培养后肠道菌群的菌落总数的最高值为:ZJ(9.88 lg CFU/mL)>GAM(9.79 lg CFU/mL)>YCFA(9.68 lg CFU/mL)。高通量测序结果显示体外培养后细菌多样性降低,各培养基会选择性富集不同菌株,其中ZJ培养基培养后群落多样性下降最为明显。β-多样性分析结果显示GAM培养基培养后肠道菌群的组成更接近于未培养时的菌群组成。因此,与YCFA和ZJ培养基相比,GAM培养基是一种更优的适合肠道菌群体外培养的RM培养基。