VicK磷酸酶活性调控变异链球菌主要毒力的转录组学分析

目的探究VicK磷酸酶活性对变异链球菌(S.mutans)主要毒力因子调控的全貌。方法采用RNA-seq技术对VicK^(P222A)突变株和野生对照株进行全基因转录组分析,并将分析所得的差异表达基因归类,推测S.mutans主要毒力表型的变化并进行相关验证。结果与野生对照株相比,VicK^(P222A)中810个基因的转录水平发生了明显变化。除了参与多糖和麦芽糖合成的基因外,细胞凝集、应激耐受、胞外DNA(eDNA)释放和细菌素合成相关基因都发生了变化。对转录组分析发现,与野生对照株相比,VicK^(P222A)在高渗环境中生长较慢,但对渗透压的敏感性较低,面对过氧化氢刺激VicK^(P222A)表现出较弱的抵抗力;VicK^(P222A)突变株中,eDNA的释放高于野生对照株,提示细胞自溶增强;S.mutans与血链球菌(S.sanguinis)拮抗实验证实,当S.mutans作为早期定植者时,VicK^(P222A)对S.sanguinis表现出更强的抑制作用。结论本研究揭示了VicK磷酸酶活性对S.mutans全基因组转录水平的影响,抑制VicK磷酸酶活性会影响S.mutans的渗透压耐受、氧化应激、细胞自溶及细菌素分泌等过程。

Parametric g-formula方法在因果分析中的应用

目前,传统的统计学方法在控制时依性混杂等方面存在局限,本研究详细介绍了一种可调整时依性混杂的分析方法——parametric g-formula,并举例说明了实施的具体步骤,为研究者处理长期观察性数据提供了新的参考.

生命历程流行病学中的动态路径分析

现代流行病学研究中，疾病或健康相关事件的发生常难以完全用短期的暴露状态来解释。生命历程流行病学着眼于生命早期阶段的暴露因素对个人整个生命历程中的健康或疾病状况所产生的长期影响，并逐渐得到重视。当对暴露因素的病因机制及其通过其他因素产生的作用大小进行分析时，由于时间因素的存在，传统统计分析方法难以满足生命历程流行病学中病因分析的需求。本文概述了能用于生命历程病因分析的动态路径分析方法，包括该模型的结构、意义及其在生命历程流行病学病因分析中的应用。同时说明了如何准备数据、进行病因机制分析，并证明动态路径分析模型可作为生命历程流行病学中有效的病因分析工具。