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猪细小病毒1型河南流行毒株的遗传进化分析 被引量:2
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作者 许夕雅 丁晨梦 +7 位作者 孙亚威 韩紫薇 齐江坤 吕晨哲 石蒙蒙 郭子仪 邓梦梦 陈陆 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第2期288-297,351,共11页
【目的】监测河南省猪细小病毒1型(porcine parvovirus 1,PPV1)的变异情况。【方法】采集自河南省鹤壁市和安阳市初产母猪的流产胎儿阳性样品,利用PCR方法鉴定获得2株PPV1流行毒株,经过全基因组测序,分别命名为CH/HN-H/2021和CH/HN-3/2... 【目的】监测河南省猪细小病毒1型(porcine parvovirus 1,PPV1)的变异情况。【方法】采集自河南省鹤壁市和安阳市初产母猪的流产胎儿阳性样品,利用PCR方法鉴定获得2株PPV1流行毒株,经过全基因组测序,分别命名为CH/HN-H/2021和CH/HN-3/2021。通过分析同源性和构建遗传进化树分析PPV1全基因组、NS1基因、VP2基因的变异情况,并且比对分析NS1蛋白和VP2蛋白的氨基酸变异情况及非编码区基因缺失情况。【结果】2条序列的核苷酸相似性为99.9%;与46株国内外PPV1流行毒株全基因组的核苷酸同源性为93.5%~99.9%;NS1基因核苷酸同源性为98.6%~99.9%,NS1蛋白氨基酸同源性为98.2%~99.9%;VP2基因核苷酸同源性为98.4%~99.9%,VP2蛋白氨基酸同源性为98.3%~99.9%,说明本研究鉴定的毒株呈现遗传进化稳定性。本研究鉴定株与湖南及吉林毒株亲缘关系最近,而与河南原有毒株亲缘关系较远。在对NS1蛋白与VP2蛋白的氨基酸变异分析中发现,NS1蛋白发生6处突变,VP2蛋白发生7处突变,均在经典突变位点范围内,符合PPV1遗传变异的保守性。鉴定株VP2基因后部非编码区基因与NADL-2株相比缺失127 nt。【结论】本研究鉴定的毒株呈现遗传进化稳定性,河南省存在新旧PPV1毒株同时流行的情况。 展开更多
关键词 猪细小病毒1型 全基因组测序 遗传变异分析 NS1基因 VP2基因
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浅谈水龙头装配线的优化设计
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作者 齐江坤 罗红霞 《科技与企业》 2013年第7期306-306,共1页
针对某水龙头企业装配线目前存在的生产效率低,生产线员工反映工作强度大等问题,通过进行实地考察后,运用时间流程程序分析的方法,对该企业水龙头生产装配线进行了优化设计。改造后的装配线装配效率得到了明显的提高,生产线员工的工作... 针对某水龙头企业装配线目前存在的生产效率低,生产线员工反映工作强度大等问题,通过进行实地考察后,运用时间流程程序分析的方法,对该企业水龙头生产装配线进行了优化设计。改造后的装配线装配效率得到了明显的提高,生产线员工的工作强度也得到了有效降低。 展开更多
关键词 装配线 流程程序分析 优化
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主成分分析法在高校学生质量综合评价中的应用 被引量:10
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作者 王吉权 邱立春 +2 位作者 王英 王福林 齐江坤 《数学的实践与认识》 CSCD 北大核心 2010年第13期25-31,共7页
主成分分析法能够在保证原始数据信息损失最小的情况下,以少数的综合变量取代原有的多维变量,使数据结构大为简化,并且客观地确定变量权重,避免了主观随意性.应用主成分分析方法对高等学校学生质量进行了综合评价,根据综合得分给出了科... 主成分分析法能够在保证原始数据信息损失最小的情况下,以少数的综合变量取代原有的多维变量,使数据结构大为简化,并且客观地确定变量权重,避免了主观随意性.应用主成分分析方法对高等学校学生质量进行了综合评价,根据综合得分给出了科学的排名,客观地反映了学生各方面的特征. 展开更多
关键词 主成分分析 综合评价 质量
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2株GⅡb亚群猪流行性腹泻病毒分离、鉴定及变异分析 被引量:2
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作者 郭子仪 孙亚威 +8 位作者 许夕雅 丁晨梦 邓梦梦 韩紫薇 吕晨哲 齐江坤 于林洋 王新卫 陈陆 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期2005-2012,共8页
为了分离猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)变异毒株,了解其进化趋势及致病性,并为后续PEDV特性及疫苗研发提供候选毒株,本研究将PEDV阳性样品接种于Vero细胞传代,采用间接免疫荧光试验(IFA)对分离株进行鉴定,基... 为了分离猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)变异毒株,了解其进化趋势及致病性,并为后续PEDV特性及疫苗研发提供候选毒株,本研究将PEDV阳性样品接种于Vero细胞传代,采用间接免疫荧光试验(IFA)对分离株进行鉴定,基于RT-PCR及第2代测序技术进行全基因组测序、同源性比对及遗传进化分析,通过动物致病性试验进行毒力测定。IFA表明2株分离株能与PEDV S蛋白抗体发生特异性反应,确定为PEDV。2株毒株与参考毒株核苷酸同源性为95.6%~98.7%,属于变异毒株GⅡb群。分离的2株毒株分别命名为CH-HNKF-03和CH-HNPDS-01株。CH-HNKF-03和CH-HNPDS-01对哺乳仔猪攻毒后18 h即可发病,于24~56 h均出现典型的水样腹泻、呕吐、消瘦、脱水等症状,96 h内全部死亡。综上所述,本研究获得2株GⅡb亚群PEDV变异强毒株,为新型PEDV疫苗研发提供了候选毒株。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 变异株 GⅡb亚群 分离鉴定 遗传进化分析
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PRVΔgE/TK/UL49.5基因缺失株的构建及相关特性研究
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作者 丁晨梦 孙亚威 +8 位作者 石蒙蒙 韩紫薇 许夕雅 吕晨哲 齐江坤 杨寒 于林洋 李永涛 陈陆 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期1814-1819,1836,共7页
为探究UL49.5基因缺失对伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV)变异株毒力的影响,本试验以PRVΔgE/TK株为亲本株,通过同源重组和Cre-loxP系统构建重组病毒PRVΔgE/TK/UL49.5,并对该毒株遗传稳定性、体外生长特性、干扰SLAⅠ抗原递呈能... 为探究UL49.5基因缺失对伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV)变异株毒力的影响,本试验以PRVΔgE/TK株为亲本株,通过同源重组和Cre-loxP系统构建重组病毒PRVΔgE/TK/UL49.5,并对该毒株遗传稳定性、体外生长特性、干扰SLAⅠ抗原递呈能力及对小鼠的安全性进行初步研究。经PCR及测序确定PRVΔgE/TK/UL49.5株UL49.5基因缺失474bp。与PRV YY和PRVΔgE/TK株相比,PRVΔgE/TK/UL49.5在Vero细胞上增殖滴度相似,可稳定传代,具有良好的增殖能力。与PRV YY株相比,PRVΔgE/TK/UL49.5株感染PK-15细胞后下调SLAⅠ和TAP转录水平能力降低,并对小鼠具有安全性。本试验通过同源重组技术构建了PRVΔgE/TK/UL49.5株,为PRV基因缺失疫苗候选毒株筛选奠定了基础。 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 基因缺失 UL49.5基因 同源重组
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