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甘薯扩展蛋白IbEXPA2基因克隆和表达分析
被引量:
2
1
作者
蔡兆琴
龙婷晞
+5 位作者
肖冬
王爱勤
黄咏梅
李慧峰
詹洁
何龙飞
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第5期1401-1407,共7页
扩展蛋白(Expansin)是细胞壁的重要组成成分,参与细胞壁的舒张,与植物器官生长发育密切相关。甘薯是一种块根类作物,其块根不仅是繁殖器官,也是储能器官,因此,开展甘薯块根生长膨大机理研究具有重要意义。本研究在前期转录组学研究基础...
扩展蛋白(Expansin)是细胞壁的重要组成成分,参与细胞壁的舒张,与植物器官生长发育密切相关。甘薯是一种块根类作物,其块根不仅是繁殖器官,也是储能器官,因此,开展甘薯块根生长膨大机理研究具有重要意义。本研究在前期转录组学研究基础上,克隆到一个可能与块根膨大相关的扩展蛋白基因IbEXPA2,并进行生物信息学和qPCR表达分析。生物信息分析表明,IbEXPA2编码253个氨基酸,包含DPBB_1和Pollen_allerg_1结构域,具有一段信号肽及23个氨基酸的跨膜结构域。该基因编码的蛋白与三裂叶薯expansin-A4蛋白(登录号:XP_031109781.1)的同源性最高,为98.03%;时空表达分析表明该基因在甘薯品种‘西瓜红’和‘桂经薯8号’块根中表达显著高于纤维根,‘西瓜红’生长的各个时期块根中表达均显著高于茎和叶,在移栽50 d时表达量最高,为对照纤维根的8.49倍;‘桂经薯8号’生长多数时期在块根中的表达也显著高于茎和叶,在移栽35 d时表达量最高,为对照的8.11倍。推测该基因参与甘薯块根生长膨大调控。
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关键词
扩展蛋白
生信分析
表达分析
块根
甘薯
原文传递
题名
甘薯扩展蛋白IbEXPA2基因克隆和表达分析
被引量:
2
1
作者
蔡兆琴
龙婷晞
肖冬
王爱勤
黄咏梅
李慧峰
詹洁
何龙飞
机构
广西大学农学院
广西大学
广西农业科学院玉米研究所
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第5期1401-1407,共7页
基金
国家自然科学基金项目(32060419)
广西薯类创新团队首席专家项目(nycytxgxcxtd-11-01)共同资助。
文摘
扩展蛋白(Expansin)是细胞壁的重要组成成分,参与细胞壁的舒张,与植物器官生长发育密切相关。甘薯是一种块根类作物,其块根不仅是繁殖器官,也是储能器官,因此,开展甘薯块根生长膨大机理研究具有重要意义。本研究在前期转录组学研究基础上,克隆到一个可能与块根膨大相关的扩展蛋白基因IbEXPA2,并进行生物信息学和qPCR表达分析。生物信息分析表明,IbEXPA2编码253个氨基酸,包含DPBB_1和Pollen_allerg_1结构域,具有一段信号肽及23个氨基酸的跨膜结构域。该基因编码的蛋白与三裂叶薯expansin-A4蛋白(登录号:XP_031109781.1)的同源性最高,为98.03%;时空表达分析表明该基因在甘薯品种‘西瓜红’和‘桂经薯8号’块根中表达显著高于纤维根,‘西瓜红’生长的各个时期块根中表达均显著高于茎和叶,在移栽50 d时表达量最高,为对照纤维根的8.49倍;‘桂经薯8号’生长多数时期在块根中的表达也显著高于茎和叶,在移栽35 d时表达量最高,为对照的8.11倍。推测该基因参与甘薯块根生长膨大调控。
关键词
扩展蛋白
生信分析
表达分析
块根
甘薯
Keywords
Expansin protein
Bioinformatics analysis
Expression analysis
Root tube
Sweet potato
分类号
S531 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘薯扩展蛋白IbEXPA2基因克隆和表达分析
蔡兆琴
龙婷晞
肖冬
王爱勤
黄咏梅
李慧峰
詹洁
何龙飞
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023
2
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参考文献
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