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PTGS2调控细胞增殖及抗氧化能力影响结肠癌患者预后
1
作者
贺旸知歌
姜旭
+1 位作者
张志文
龚依伊
《基础医学与临床》
CAS
2024年第11期1522-1529,共8页
目的基于前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)在结肠癌中的表达及预后分析,探讨并验证PTGS2影响结肠癌患者预后的潜在分子机制。方法从TCGA、HPA、UALCAN等数据库收集泛癌的转录组和蛋白质组学数据,并结合肿瘤患者的分期分型、生存时间等...
目的基于前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)在结肠癌中的表达及预后分析,探讨并验证PTGS2影响结肠癌患者预后的潜在分子机制。方法从TCGA、HPA、UALCAN等数据库收集泛癌的转录组和蛋白质组学数据,并结合肿瘤患者的分期分型、生存时间等临床数据,分析PTGS2基因的表达模式和预后价值。基于基因集合富集分析(GSEA)鉴定在PTGS2高表达患者中显著激活的生物学功能,并以结肠癌细胞系SW480为例,进行体外验证。构建PTGS2过表达细胞株,使用CCK8法测定对细胞增殖的影响;使用不同浓度H 2O 2形成梯度氧化胁迫,检测细胞抗氧化能力的变化;并通过蛋白质免疫印迹初步验证其调控机制。结果PTGS2的转录水平和表达水平在结肠癌患者中均显著上调(P<0.05),且PTGS2的表达升高与患者的死亡风险升高相关(P<0.05)。数据分析和体外实验表明过表达PTGS2可能通过激活mTOR通路促进结肠癌细胞增殖;并通过上调氧化应激调控蛋白SOD2、NRF2调控细胞抗氧化能力。结论PTGS2是一个潜在的结肠癌危险因素,其表达水平升高促进细胞增殖,增强细胞抗氧化能力,并与结肠癌患者不良预后相关。
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关键词
结肠癌
前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)
泛癌
增殖
抗氧化能力
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职称材料
小型猪发育期牙胚蛋白提取方法探讨
被引量:
2
2
作者
李阳
龚依伊
+3 位作者
谢亦林
王劲松
张春梅
王松灵
《口腔生物医学》
2015年第2期83-86,共4页
目的:比较不同蛋白质提取方法在牙胚蛋白提取中的效果,寻找适合牙齿发育高通量蛋白质组学分析的蛋白质提取方法。方法:取猪胚胎第40、50、60天第三乳磨牙牙胚,利用碱性碳酸盐溶液提取牙胚初步钙化部分的蛋白,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳比...
目的:比较不同蛋白质提取方法在牙胚蛋白提取中的效果,寻找适合牙齿发育高通量蛋白质组学分析的蛋白质提取方法。方法:取猪胚胎第40、50、60天第三乳磨牙牙胚,利用碱性碳酸盐溶液提取牙胚初步钙化部分的蛋白,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳比较液氮研磨法和电动研磨器研磨法提取牙胚总蛋白效果,BCA(bicinchoninic acid)蛋白浓度测定法比较RIPA裂解液与尿素溶液提取牙胚总蛋白含量。结果:与液氮研磨法相比,电动研磨法提取蛋白后的聚丙烯酰胺电泳图谱蛋白条带明显更深,蛋白含量高。尿素溶液对牙胚总蛋白的提取量高于RIPA裂解液组,蛋白电泳分离效果均可。结论:采用电动研磨器研磨牙胚,组织损失量小,提取蛋白效果好于液氮研磨;采用尿素溶液提取牙胚总蛋白效果优于RIPA裂解液。初步找到适合下游高通量蛋白质组学分析的牙胚蛋白提取方法。
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关键词
牙胚
蛋白质提取
尿素
电动研磨
小型猪
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职称材料
题名
PTGS2调控细胞增殖及抗氧化能力影响结肠癌患者预后
1
作者
贺旸知歌
姜旭
张志文
龚依伊
机构
中国医学科学院、北京协和医学院、北京协和医院生物信息技术平台
中国医学科学院、北京协和医学院、北京协和医院生物标志物平台
中国医学科学院、北京协和医学院、北京协和医院病理科
出处
《基础医学与临床》
CAS
2024年第11期1522-1529,共8页
基金
北京市自然科学基金(7244392,7242106)
国家自然科学基金(82100942)
中央高水平医院临床科研专项经费(2022-PUMCH-A-202)。
文摘
目的基于前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)在结肠癌中的表达及预后分析,探讨并验证PTGS2影响结肠癌患者预后的潜在分子机制。方法从TCGA、HPA、UALCAN等数据库收集泛癌的转录组和蛋白质组学数据,并结合肿瘤患者的分期分型、生存时间等临床数据,分析PTGS2基因的表达模式和预后价值。基于基因集合富集分析(GSEA)鉴定在PTGS2高表达患者中显著激活的生物学功能,并以结肠癌细胞系SW480为例,进行体外验证。构建PTGS2过表达细胞株,使用CCK8法测定对细胞增殖的影响;使用不同浓度H 2O 2形成梯度氧化胁迫,检测细胞抗氧化能力的变化;并通过蛋白质免疫印迹初步验证其调控机制。结果PTGS2的转录水平和表达水平在结肠癌患者中均显著上调(P<0.05),且PTGS2的表达升高与患者的死亡风险升高相关(P<0.05)。数据分析和体外实验表明过表达PTGS2可能通过激活mTOR通路促进结肠癌细胞增殖;并通过上调氧化应激调控蛋白SOD2、NRF2调控细胞抗氧化能力。结论PTGS2是一个潜在的结肠癌危险因素,其表达水平升高促进细胞增殖,增强细胞抗氧化能力,并与结肠癌患者不良预后相关。
关键词
结肠癌
前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)
泛癌
增殖
抗氧化能力
Keywords
colon cancer
prostaglandin-endoperoxide synthase 2(PTGS2)
prognosis
proliferation
antioxidant capacity
分类号
R735 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
小型猪发育期牙胚蛋白提取方法探讨
被引量:
2
2
作者
李阳
龚依伊
谢亦林
王劲松
张春梅
王松灵
机构
首都医科大学口腔医学院.牙再生与口腔颌面组织功能重建北京市重点实验室
清华大学生命科学学院.教育部生物信息学重点实验室
首都医科大学附属北京朝阳医院口腔科
出处
《口腔生物医学》
2015年第2期83-86,共4页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)基金资助项目(2010CB944801)
北京学者基金资助项目(PXM 2013_014226_000055)
文摘
目的:比较不同蛋白质提取方法在牙胚蛋白提取中的效果,寻找适合牙齿发育高通量蛋白质组学分析的蛋白质提取方法。方法:取猪胚胎第40、50、60天第三乳磨牙牙胚,利用碱性碳酸盐溶液提取牙胚初步钙化部分的蛋白,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳比较液氮研磨法和电动研磨器研磨法提取牙胚总蛋白效果,BCA(bicinchoninic acid)蛋白浓度测定法比较RIPA裂解液与尿素溶液提取牙胚总蛋白含量。结果:与液氮研磨法相比,电动研磨法提取蛋白后的聚丙烯酰胺电泳图谱蛋白条带明显更深,蛋白含量高。尿素溶液对牙胚总蛋白的提取量高于RIPA裂解液组,蛋白电泳分离效果均可。结论:采用电动研磨器研磨牙胚,组织损失量小,提取蛋白效果好于液氮研磨;采用尿素溶液提取牙胚总蛋白效果优于RIPA裂解液。初步找到适合下游高通量蛋白质组学分析的牙胚蛋白提取方法。
关键词
牙胚
蛋白质提取
尿素
电动研磨
小型猪
Keywords
Tooth germ
Protein extraction
Urea
Electro-grinding
Miniature pig
分类号
R780.2 [医药卫生—口腔医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PTGS2调控细胞增殖及抗氧化能力影响结肠癌患者预后
贺旸知歌
姜旭
张志文
龚依伊
《基础医学与临床》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
小型猪发育期牙胚蛋白提取方法探讨
李阳
龚依伊
谢亦林
王劲松
张春梅
王松灵
《口腔生物医学》
2015
2
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职称材料
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