基于等值面的分子溶剂可及表面快速生成算法

分子表面的描述在蛋白-蛋白、蛋白-配体相互作用分析中起着关键的作用。为此,本研究设计了基于等值面原理的分子溶剂可及表面生成程序并进行了性能测试。该程序采用一维递归快速高斯滤波计算方法,在三维离散空间中快速构造等值面,利用等值面提取技术(Marching Cubes)获取以三角面片表示的分子溶剂可及表面,并使用中心差分法计算三角面片的法向量,从而获得更好的显示效果。实际测试结果表明,该算法计算速度较快,准确性良好,可为基于结构的靶标识别方法提供有效药物靶标的分子表面表征。目前该程序已经被整合入国产大型药物设计图形软件包D^3 Pharma中。

基于反向药效团匹配的网络药理学方法

多向药理学计算方法为药物重定位和毒副作用预测提供了有力工具.靶标预测平台PharmMapper采用反向药效团匹配策略,并整合了配套的靶标数据库.但是,鉴于靶标数据库之间的差异难以衡量,直接将靶标得分作为不同药物之间的评价指标,往往会影响其预测可靠性.本文提出了一种新方法以提高PharmMapper的区分能力.通过计算配体与靶标数据库中所有药效团的匹配值,作者建立了配体-靶标交叉得分矩阵.该矩阵能反射背景数据库的活跃程度,并可通过靶标得分评估随机发现一个给定靶标的概率.为验证策略有效性,作者从DrugBank搜集整理了1490个药物分子和673个靶标,开展了回顾性靶标筛选测试,以及针对两种常用药物的不良反应进行靶标预测,结果均表明改进后的得分可获得更高的预测精度.

国内软件质量与软件测试标准化研究

软件产业是引领新一轮科技革命的关键力量,在全球经济发展中占据重要地位。软件质量对促进软件产业健康有序发展具有重要意义,软件测试是保证软件质量的可靠手段。标准化作为规范软件质量与软件测试的技术手段,可以提高软件产品质量、减少软件开发与测试费用,为软件行业的发展提供引领与支撑。本文详细给出了国内软件质量与软件测试的标准化情况,并分析了国内软件质量与软件测试标准之间的关系,最后总结了国内软件质量与测试标准存在的问题及建议。该论文有利于需方、开发方、独立评价方以及质量保证与控制人员更好地理解、使用软件质量与测试的相关标准。

面向领域的软件质量评价方法研究

针对特定领域的软件质量模型与软件质量评价方法 ,在ISO/IEC软件质量模型的基础上,基于层次分析法和模糊综合评价法,引入信息熵、贴近度分析、拟优一致矩阵等技术建立了改进的软件质量综合评价模型。通过对某嵌入式领域软件系统实施评价表明,该模型对软件质量评价具有可行性和实用价值。

微服务架构应用质量模型与测试方法分析

针对微服务架构应用质量测量和软件测试时所面临的依赖关系复杂、运行环境多样、缺陷难以定位等问题,提出了微服务架构应用的质量模型。依据GB/T 25000.10—2016对维护性、性能效率、兼容性和可靠性4个特性作了详细阐述;介绍了微服务架构应用的单元测试、集成测试、组件测试等5个测试方法,可为微服务架构应用的建设提供参考。

医疗行业Web应用程序渗透测试实例研究

随着各行各业信息化建设和互联网概念的不断深化,越来越多的安全问题也随之而来。为此,通过对医疗行业Web应用程序的渗透测试,参照OWASP TOP 10安全风险分类,分析现阶段医疗行业Web应用程序存在的安全隐患,并给出常见漏洞的描述、实例和防范措施,为医疗行业乃至其他各个行业的Web应用程序安全风险评估提供一定的参考和依据。

一种基于异构网络算法的药物-蛋白关联性研究方法

药物与蛋白质间关联性的研究,有助于药物的重新定位和发现药物新的使用途径,是网络药理学的重要研究内容。应用现有网络随机游走算法预测药物与蛋白质间新的关联时,一般直接在药物-蛋白质二分图网络内进行随机游走,并且不断重复此过程,这种方法效率很低,还会遗漏药物-药物相似性网络和蛋白-蛋白相似性网络中部分拓扑信息。鉴于此,本文提出一种异构网络异步重启随机游走算法(Drug Restart Walk Random Prediction,DRWRP),构建药物-蛋白质异构网络,深层次挖掘二者间潜在的关联性。该算法分别在药物相似性网络、蛋白质相似性网络以及药物-蛋白质二分图网络中进行随机游走,然后在网络间不停跳转,反复迭代后形成稳态概率向量,最终得到潜在最优关联。仿真实验表明,本文提出的算法可以有效预测药物与蛋白质间新的关联,多数预测结果获得了文献证据支持。

大数据软件的质量模型分析

通过对通用软件产品质量评估模型进行分析,结合大数据软件的特性,分别从功能性、性能效率、兼容性、易用性、可靠性等八大质量特性对大数据系统的软件质量进行评估,形成一套适用于大数据系统的软件质量评估模型,为大数据系统的建设和测试提供参考。