冬凌草甲素抗食管鳞癌转录的组学研究

目的:探索冬凌草甲素对食管鳞癌细胞增殖和凋亡的影响及其作用的组学研究。方法:取食管鳞癌细胞系EC109和TE1细胞,分别用0、10、20、40、80和160μmol/L的冬凌草甲素处理,采用MTT法和流式细胞仪检测冬凌草甲素对EC109和TE1细胞增殖及凋亡的影响;冬凌草甲素处理食管鳞癌细胞后提取总RNA,采用全转录组分析技术(RNA-seq)探索食管鳞癌细胞转录组的变化;运用GO聚类分析对差异表达的基因进行功能分析。结果:冬凌草甲素可抑制食管鳞癌EC109和TE1细胞增殖,促进细胞凋亡(P<0.05);RNA-seq分析结果显示,在EC109细胞中冬凌草甲素可使463个基因表达上调,419个基因下调,在TE1细胞中冬凌草甲素可使2023个基因表达上调,1642个基因下调;其中,共同上调的基因284个,共同下调的基因176个。冬凌草甲素处理后细胞出现明显的热激反应,HSPA1A、HSPA1B、BAG3、HSPH1、DNAJB1、HSPA8、HSP90AA1、DNAJA4和DNAJA1等基因表达升高,同时作为调节GSH-ROS的TRIM16、SLC7A11、TXNRD1、SRXN1、GCLM和GCLC等的基因表达也升高。GO聚类分析显示,差异表达基因为热激反应基因、蛋白错误折叠相关基因和神经投射发生基因。结论:冬凌草甲素抑制食管鳞癌细胞的增殖并促进其凋亡,其分子机制与热激反应及GSH-ROS系统密切相关。

高氨诱导的肝细胞中凋亡相关LncRNA表达谱的变化

目的:探讨高氨诱导的肝细胞中凋亡相关长链非编码RNA(LncRNA)表达谱的变化。方法:将人正常肝细胞LO2细胞分为3组,对照组常规培养,高氨1组、高氨2组分别用10 mmol/L氯化铵溶液诱导24、48 h,以制备高氨肝细胞模型。应用人凋亡通路LncPathTM芯片筛选3组肝细胞差异表达的LncRNA和mRNA,并进行GO注释和KEGG通路分析,使用Cytoscope构建ceRNA网络图。结果:3组间差异表达的LncRNA有8个,差异表达的mRNA有13个。GO注释和KEGG通路分析结果显示,差异表达LncRNA及mRNA主要参与的信号通路有孕激素介导的卵母细胞成熟通路、神经营养因子信号通路、卵母细胞减数分裂和MAPK信号通路;ceRNA网络分析结果提示MAPK12是LncRNA BAIAP3的靶基因。结论:LncRNA BAIAP3可能通过靶向MAPK12在高氨致肝细胞凋亡过程中发挥重要作用。