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利用单片段代换系定位水稻抽穗期QTL 被引量:41
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作者 何风华 席章营 +2 位作者 曾瑞珍 akshay talukdar 张桂权 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期1505-1513,共9页
抽穗期是水稻品种的重要农艺性状之一,对抽穗期QTL进行定位并研究其遗传效应在水稻育种中是至关重要的。本研究利用以6个水稻品种为供体的52个单片段代换系为试验材料,通过t测验比较单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间抽穗期的差异,对... 抽穗期是水稻品种的重要农艺性状之一,对抽穗期QTL进行定位并研究其遗传效应在水稻育种中是至关重要的。本研究利用以6个水稻品种为供体的52个单片段代换系为试验材料,通过t测验比较单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间抽穗期的差异,对代换片段上的抽穗期QTL进行了鉴定。以P≤0.001为阈值共鉴定出20个抽穗期QTL,这些QTL分布于水稻的10条染色体。QTL加性效应值为–5.9~1.1,加性效应百分率为–7.4%~1.4%。有8个QTL被定位在小于10.0cM的区段内。利用1个单片段代换系与华粳籼74杂交发展的F2群体对qHD-3-1进行了定位。在作图群体中,早抽穗和迟抽穗植株数符合3:1的分离比,早抽穗表现为显性。利用微卫星标记将qHD-3-1定位于3号染色体短臂,PSM304和RM569分别位于其两侧,遗传距离分别为2.4cM和5.1cM。 展开更多
关键词 水稻 单片段代换系 抽穗期 QTL 基因定位 水稻品种 代换系 定位 片段 3号染色体
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利用高代回交和分子标记辅助选择建立水稻单片段代换系 被引量:52
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作者 何风华 席章营 +2 位作者 曾瑞珍 akshay talukdar 张桂权 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第8期825-831,共7页
以水稻品种华粳籼74为受体,以6个水稻品种为供体,通过高代回交和微卫星标记辅助选择相结合的方法,建立了水稻的一个单片段代换系群体。该群体由86个单片段代换系组成,其中52个在BC3F2中获得,34个在BC3F3中获得。每个单片段代换系只含有... 以水稻品种华粳籼74为受体,以6个水稻品种为供体,通过高代回交和微卫星标记辅助选择相结合的方法,建立了水稻的一个单片段代换系群体。该群体由86个单片段代换系组成,其中52个在BC3F2中获得,34个在BC3F3中获得。每个单片段代换系只含有来自一个供体的一个染色体代换片段,而遗传背景与华粳籼74相同。这些单片段代换系的代换片段分布于水稻的12条染色体,代换片段的长度为1.5~56.3cM,平均长度为23.0cM。全部代换片段在水稻基因组上的覆盖率为57.1%。 展开更多
关键词 水稻 微卫星标记 分子标记辅助选择 单片段代换系
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利用单片段代换系定位水稻粒形QTL 被引量:54
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作者 曾瑞珍 akshay talukdar +1 位作者 刘芳 张桂权 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期647-654,共8页
目的水稻谷粒形状(粒长、粒宽和长宽比)是衡量稻米外观品质的重要指标之一,为更好地开展粒形分子育种,对水稻粒形QTL进行分子定位。方法以单片段代换系(SSSL)为材料构建分离群体,利用微卫星标记对控制水稻谷粒长和谷粒宽的2个粒形QTL进... 目的水稻谷粒形状(粒长、粒宽和长宽比)是衡量稻米外观品质的重要指标之一,为更好地开展粒形分子育种,对水稻粒形QTL进行分子定位。方法以单片段代换系(SSSL)为材料构建分离群体,利用微卫星标记对控制水稻谷粒长和谷粒宽的2个粒形QTL进行分子定位。结果粒宽QTLGw-8被定位于第8染色体长臂末端微卫星标记RM502与RM447之间,遗传距离均为0.3cM。在此基础上构建了覆盖Gw-8的物理图谱,RM502与RM447位于同一克隆AP005529,两者之间的物理距离为55.0kb。粒长QTLgl-3被定位于第3染色体着丝粒附近的微卫星标记RM6146和PSM377之间,遗传距离分别为1.5cM和11.0cM。结论利用单片段代换系能准确地定位水稻粒形QTL,这两个粒形QTL的定位为其克隆及稻米外观品质的分子育种奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 基因定位 粒形 单片段代换系
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利用单片段代换系鉴定水稻株高及其构成因素的QTL 被引量:19
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作者 何风华 席章营 +2 位作者 曾瑞珍 akshay talukdar 张桂权 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期387-392,共6页
通过t测验比较了单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间的表型差异,对以6个水稻品种为供体的52个单片段代换系代换片段上株高及其构成因素的QTL进行了鉴定.以P≤0.001为阈值,在14个代换片段上共鉴定出24个QTL,包括10个株高QTL、2个穗长QTL... 通过t测验比较了单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间的表型差异,对以6个水稻品种为供体的52个单片段代换系代换片段上株高及其构成因素的QTL进行了鉴定.以P≤0.001为阈值,在14个代换片段上共鉴定出24个QTL,包括10个株高QTL、2个穗长QTL、4个倒1节间长QTL、5个倒2节间长QTL、3个倒3节间长QTL,这些QTL分布于水稻的9条染色体上.QTL加性效应值为-4.08~3.98 cm,加性效应百分率为-19.35%~10.43%. 展开更多
关键词 水稻 单片段代换系 株高 数量性状座位
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不同Waxy基因型水稻的遗传多样性 被引量:16
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作者 何风华 曾瑞珍 +2 位作者 席章营 akshay talukdar 张桂权 《分子植物育种》 CAS CSCD 2003年第2期179-186,共8页
利用均匀分布于水稻基因组的 2 38个微卫星标记对包含 15种Waxy复等位基因的 4 1个水稻品种(系 )的遗传多样性进行了分析。结果表明有 2 2 1对SSR引物在供试材料间检出多态性 ,共检出 115 6个等位基因 ,平均每个座位可检出 5 2 3个等... 利用均匀分布于水稻基因组的 2 38个微卫星标记对包含 15种Waxy复等位基因的 4 1个水稻品种(系 )的遗传多样性进行了分析。结果表明有 2 2 1对SSR引物在供试材料间检出多态性 ,共检出 115 6个等位基因 ,平均每个座位可检出 5 2 3个等位基因 ;各个座位的多态信息量 (Polymorphisminformationcontent ,PIC值 )的变幅为 0 0 5 - 0 89,平均PIC值为 0 5 9。聚类分析结果表明 :4 1个供试品种 (系 )明显地聚为两大类群 ,分别对应于籼亚种和粳亚种 ,不同 (CT)重复次数的品种 (系 )在两大类群中有明显的分布规律 :(CT)重复次数较少 (n =8、 10、 11和 12 )的品种 (系 )只出现在籼稻类群中 ,粳稻类群的重复次数相对较多 (n =14 - 2 1) ,而 (CT) 17和 (CT) 18的品种 (系 )中既有属于籼稻类群的 ,又有属于粳稻类群的 ;Waxy基因第一内含子 5′端剪切位点上的G -T单核苷酸多态与籼粳分类没有直接联系。 4 1个品种 (系 )之间的遗传相似系数介于 0 13- 0 88之间 ,平均相似系数为 0 35。Waxy座位上丰富的等位基因 ,以及品种间较高的遗传多样性 。 展开更多
关键词 Waxy基因型 水稻 遗传多样性 微卫星标记 类群 直链淀粉含量 蜡质基因
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水稻Wx复等位基因的鉴定及单片段代换系的建立 被引量:8
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作者 曾瑞珍 张泽民 +6 位作者 何风华 席章营 akshay talukdar 施军琼 秦利军 黄朝锋 张桂权 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期495-500,共6页
利用微卫星标记“484/485”和“484/W2R”结合AccⅠ酶切对278份来自国内外水稻品种(系)进行了Wx座位复等位基因分析,共检测到15种等位基因,其中(CT)12G、(CT)15G、(CT)16G、(CT)17G、(CT)18G、(CT)21G为新发现的等位基因。以含不同Wx等... 利用微卫星标记“484/485”和“484/W2R”结合AccⅠ酶切对278份来自国内外水稻品种(系)进行了Wx座位复等位基因分析,共检测到15种等位基因,其中(CT)12G、(CT)15G、(CT)16G、(CT)17G、(CT)18G、(CT)21G为新发现的等位基因。以含不同Wx等位基因的20个品种(系)为供体亲本,利用回交和微卫星标记辅助选择相结合的方法,建立了72个以Wx等位基因为(CT)11G的“华粳籼74”为受体的Wx复等位基因单片段代换系。这些单片段代换系共包含12种Wx等位基因,其代换片段长度最短为2.2cM,最长为77.3cM,平均为17.4cM。 展开更多
关键词 水稻 糯性基因 单片段代换系
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Identification of QTLs for Plant Height and Its Components by Using Single Segment Substitution Lines in Rice (Oryza sativa) 被引量:6
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作者 akshay talukdar 《Rice science》 SCIE 2005年第3期151-156,共6页
QTLs for plant height and its components on the substituted segments of fifty-two single segment substitution lines (SSSLs) in rice were identified through t-test (P〈0.001) for comparison between each SSSL and re... QTLs for plant height and its components on the substituted segments of fifty-two single segment substitution lines (SSSLs) in rice were identified through t-test (P〈0.001) for comparison between each SSSL and recipient parent Huajingxian 74. On the 14 substituted segments, 24 QTLs were detected, 10 for plant height, 2 for panicle length, 4 for length of the first internode from the top, 5 for length of the second internode from the top and 3 for length of the third internode from the top, respectively. All these QTLs were distributed on nine rice chromosomes except chromosomes 5, 9 and 11. The additive effect ranged from -4.08 to 3.98 cm, and the additive effect percentages varied from -19.35% to 10.43%. 展开更多
关键词 RICE single segment substitution line plant height quantitative trait locus
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Identification of Multiple Alleles at the Wx Locus and Development of Single Segment Substitution Lines for the Alleles in Rice 被引量:5
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作者 akshay talukdar 《Rice science》 SCIE 2006年第1期9-14,共6页
The microsatellite markers 484/485 and 484/W2R were used to identify the multiple alleles at the Wx locus in rice germplasm. Fifteen alleles were identified in 278 accessions by using microsatellite class and G-T poly... The microsatellite markers 484/485 and 484/W2R were used to identify the multiple alleles at the Wx locus in rice germplasm. Fifteen alleles were identified in 278 accessions by using microsatellite class and G-T polymorphism. Among these alleles, (CT)12-G, (CT)15-G, (CT)16-G, (CT)17-G, (CT)18-G and (CT)21-G have not been reported. Seventy-two single-segment substitution lines (SSSLs) carrying different alleles at the Wx locus were developed by using Huajingxian 74 with the (CT)11-G allele as a recipient and 20 accessions containing 12 different alleles at the Wx locus as donors. The estimated length of the substituted segments ranged from 2.2 to 77.3 cM with an average of 17.4 cM. 展开更多
关键词 RICE waxy gene single segment substitution line allelic variation molecular marker-assisted selection
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Analysis of Introgressed Segments in Near-isogenic Lines for F_1 Pollen Sterility in Rice (Oryza sativa)
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作者 akshay talukdar 《Rice science》 SCIE 2003年第1期1-5,共5页
One hundred and fifty-eight microsatellite markers showing polymorphism among parents were used to survey the introgressed segments in the 50 near-isogenic lines of F_1 pollen sterility. Two hundred and sixty introgre... One hundred and fifty-eight microsatellite markers showing polymorphism among parents were used to survey the introgressed segments in the 50 near-isogenic lines of F_1 pollen sterility. Two hundred and sixty introgressed segments were detected in 50 near-isogenic lines, each carrying 5.2 introgressed segments on an average. Among the 260 segments, one hundred carrying F_1 pollen sterility loci concentrated on the region of F_1 pollen sterility genes, and the remaining one hundred and sixty without F_1 pollen sterility loci distributed randomly over 12 chromosomes. Both the average number and length of the introgressed segments decreased along with the increase of backcross generations. The number of introgressed segments was less than four and the length was less than 20 cM in the near-isogenic lines after backcrossing for four or more times. 展开更多
关键词 introgressed segment near-isogenie line pollen sterility RICE
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