利用生物信息学设计基于抗原表位的非洲猪瘟疫苗的总效果

非洲猪瘟是一种严重的传染性出血性疾病,会造成养猪业巨大的经济损失,非洲猪瘟(African swine fever,ASF)病毒是导致猪发生非洲猪瘟的病原体。目前该病既没有治疗方法,也没有疫苗可以预防,控制其传播的唯一方法是大规模扑杀猪群。到目前为止,传统的疫苗开发方法在安全性和有效性方面都没有取得理想的结果。如今,由于基因组学和蛋白质组学技术的进步,可以探索反向疫苗学策略。在本研究中,使用公开可用的免疫信息学工具分析ASF病毒蛋白序列,以确定未来疫苗组合所相关的抗原表位。这些抗原表位包括免疫抗原表位数据库中已被实验验证的序列,以及重新预测的序列。经实验验证的和预测的抗原表位按照一系列标准进行优先排序,这些标准包括进化保守性、存在于强毒力和目前流通的非洲猪瘟病毒格鲁吉2007/1(Georgia 2007/1)分离株中,以及与猪的蛋白质组或来自猪肠道微生物群的假定蛋白质缺乏一致性。根据这一策略,选择了29个B细胞、14个CD4+T细胞和6个CD8+T细胞抗原表位,这意味着是一个研究基于ASF病毒抗原表位的疫苗的保护能力的起点。