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Data mining in clinical big data:the frequently used databases,steps,and methodological models 被引量:22
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作者 Wen-Tao Wu Yuan-Jie Li +4 位作者 ao-zi feng Li Li Tao Huang An-Ding Xu Jun Lv 《Military Medical Research》 SCIE CSCD 2021年第4期552-563,共12页
Many high quality studies have emerged from public databases,such as Surveillance,Epidemiology,and End Results(SEER),National Health and Nutrition Examination Survey(NHANES),The Cancer Genome Atlas(TCGA),and Medical I... Many high quality studies have emerged from public databases,such as Surveillance,Epidemiology,and End Results(SEER),National Health and Nutrition Examination Survey(NHANES),The Cancer Genome Atlas(TCGA),and Medical Information Mart for Intensive Care(MIMIC);however,these data are often characterized by a high degree of dimensional heterogeneity,timeliness,scarcity,irregularity,and other characteristics,resulting in the value of these data not being fully utilized.Data-mining technology has been a frontier field in medical research,as it demonstrates excellent performance in evaluating patient risks and assisting clinical decision-making in building disease-prediction models.Therefore,data mining has unique advantages in clinical big-data research,especially in large-scale medical public databases.This article introduced the main medical public database and described the steps,tasks,and models of data mining in simple language.Additionally,we described data-mining methods along with their practical applications.The goal of this work was to aid clinical researchers in gaining a clear and intuitive understanding of the application of data-mining technology on clinical big-data in order to promote the production of research results that are beneficial to doctors and patients. 展开更多
关键词 Clinical big data Data mining Machine learning Medical public database Surveillance Epidemiology and End Results National Health and Nutrition Examination Survey The Cancer Genome Atlas Medical Information Mart for Intensive Care
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基于SEER数据库的胰腺癌患者自杀风险因素分析
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作者 黄礼莹 黄韬 +4 位作者 李莉 冯敖梓 何宁霞 李淑娜 吕军 《医学新知》 CAS 2022年第3期192-200,共9页
目的 探讨胰腺癌患者自杀的风险因素。方法 利用SEER(Surveillance,Epidemiology,and End Results)Research Plus数据库筛选1975—2018年胰腺癌患者,描述自杀死亡者、非自杀死亡者和存活者的分布特征,计算人年自杀率、标准化死亡比并分... 目的 探讨胰腺癌患者自杀的风险因素。方法 利用SEER(Surveillance,Epidemiology,and End Results)Research Plus数据库筛选1975—2018年胰腺癌患者,描述自杀死亡者、非自杀死亡者和存活者的分布特征,计算人年自杀率、标准化死亡比并分析相应群体特点。使用回归分析探索胰腺癌患者自杀的风险因素,并进一步分析男性患者的自杀风险因素。结果 153 612例胰腺癌患者中,白色人种(80.68%)、65岁及以上(65.02%)、不建议手术(70.57%)、肿瘤远处转移(57.28%)、已婚(56.06%)、家庭年收入中位数在50 000~74 999美元(47.17%)、未采取化疗(52.48%)的患者群体占比较高,且与138名胰腺癌自杀患者的群体特征分布相似。回归分析结果显示,男性[aRR=12.81,95%CI (6.85,23.96),P <0.001]、白色人种[aRR=3.56,95%CI(1.43,8.85),P=0.006]、诊断年龄为65岁及以上[aRR=1.55,95%CI(1.07,2.26),P=0.022]、不建议手术[aRR=2.06,95%CI(1.23,3.44),P=0.006]、建议但未采取手术[aRR=2.86,95%CI(1.37,5.98),P=0.005]的患者具有更高的自杀风险,而肿瘤区域转移[aRR=0.56,95%CI(0.37,0.85),P=0.006]和局部转移[aRR=0.44,95%CI(0.23,0.86),P=0.015]、已婚[aRR=0.57,95%CI(0.40,0.82),P=0.002]、化疗[aRR=0.34,95%CI(0.23,0.51),P <0.001]的患者自杀风险相对较低。男性胰腺癌患者的自杀风险显著高于女性患者,不同种族、手术选择、婚姻状态及化疗选择的男性胰腺癌患者,自杀风险具有显著差异。结论 性别、种族、诊断年龄、是否采取手术治疗、SEER阶段、婚姻状态及化疗选择是胰腺癌患者自杀的重要风险因素。对于男性、白色人种、诊断年龄为65岁及以上、不建议手术或建议但未采取手术治疗、肿瘤处于远处转移阶段、单身、未采取化疗的胰腺癌患者需加强识别、干预和护理。 展开更多
关键词 胰腺癌 自杀 SEER数据库 风险因素
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基于SIR模型分析不同强度防控手段在当前武汉市新型冠状病毒(2019-nCoV)感染的肺炎疫情中的作用 被引量:19
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作者 武文韬 李达宁 +3 位作者 李莉 冯敖梓 徐安定 吕军 《医学新知》 CAS 2020年第1期78-82,共5页
新型冠状病毒疫情爆发后,武汉市确诊和疑似病例的人数迅速上升。在目前未发现有良好治疗措施的情况下,如何迅速采取有效的防控措施仍是当务之急。本研究基于官方数据和传染病动力学SIR模型对采取不同强度防控措施的结局进行预测并为制... 新型冠状病毒疫情爆发后,武汉市确诊和疑似病例的人数迅速上升。在目前未发现有良好治疗措施的情况下,如何迅速采取有效的防控措施仍是当务之急。本研究基于官方数据和传染病动力学SIR模型对采取不同强度防控措施的结局进行预测并为制定新一轮防控策略提供建议。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 COVID-19 肺炎 SIR模型 预测模型 预防策略
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有效控制措施下新型冠状病毒流行趋势模拟 被引量:10
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作者 柏如海 董琬月 +4 位作者 石莹 冯敖梓 李莉 徐安定 吕军 《医学新知》 CAS 2020年第2期94-98,共5页
目的模拟新型冠状病毒(2019-nCoV)携带者进入未感染2019-nCoV地区,在有效对发病患者进行治疗与隔离并降低该地区人与人之间密切接触的前提下,模拟2019-nCoV感染的流行趋势。方法通过公开信息获得2019-nCoV感染者的疾病潜伏时间,患病就... 目的模拟新型冠状病毒(2019-nCoV)携带者进入未感染2019-nCoV地区,在有效对发病患者进行治疗与隔离并降低该地区人与人之间密切接触的前提下,模拟2019-nCoV感染的流行趋势。方法通过公开信息获得2019-nCoV感染者的疾病潜伏时间,患病就诊后疾病治愈时间,以及密切接触感染概率。采用主体建模的方法,构建简易交互环境。假设特定易感人群中第一例2019-nCoV感染者出现临床症状后能够得到有效的治疗与隔离,同时该人群中其余人之间相互密切接触降至最低,评估病毒携带者进入未感染2019-nCoV人群后,2019-nCoV感染的流行状况。结果截至2020年1月30日,感染2019-nCoV的患者疾病潜伏时间为6.6天(95%CI:5.9-7.5),感染2019-nCoV发病就诊后疾病治愈时间为9.8天(95%CI:8.8-10.8)。当病毒携带者进入未感染2019-nCoV人群时,随着该人群每日密切接触人数的上升,感染人数增加。当该人群出现第一例感染者发病时,每日密切接触15人造成的感染人数是密切接触5人的42.4倍。潜伏期结束后,2019-nCoV感染人数将保持一定时间的稳定,感染人数在16天开始出现下降,27天后患病人数趋于0。结论在新感染2019-nCoV的区域内,对2019-nCoV感染发病病人有效的治疗与隔离,同时在发现病例后有效减少该区域内人群间密切接触的前提下,2019-nCoV的传播可能不会超过1个月。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 主体建模 流行趋势 模拟
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