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基于CRISPR/Cas9技术构建猪KLF4基因敲除细胞系及其对细胞活性的影响分析
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作者 董娇 陆繁 +3 位作者 方晓敏 陈瑜哲 包文斌 王海飞 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期893-902,共10页
【目的】试验旨在利用CRISPR/Cas9技术构建Krüppel样因子4(Krüppel-like factor 4,KLF4)基因敲除的猪小肠上皮细胞,并探究KLF4基因敲除对于细胞活性和细胞周期的影响。【方法】在猪KLF4基因转录本第1外显子区域设计3条sgRNAs(... 【目的】试验旨在利用CRISPR/Cas9技术构建Krüppel样因子4(Krüppel-like factor 4,KLF4)基因敲除的猪小肠上皮细胞,并探究KLF4基因敲除对于细胞活性和细胞周期的影响。【方法】在猪KLF4基因转录本第1外显子区域设计3条sgRNAs(sgRNA1、sgRNA2和sgRNA3),经退火形成的双链DNA与线性化pGK1.1载体连接,产物转化大肠杆菌Top10感受态细胞进行鉴定,并将重组载体转染至猪小肠上皮细胞(IPEC-J2)。PCR扩增敲除位点附近序列,并通过测序判断sgRNA敲除效率;利用CruiserTMEnzyme酶切鉴定阳性细胞克隆,通过TA克隆测序鉴定敲除序列;利用Western blotting检测基因敲除细胞中KLF4蛋白表达情况。利用CCK-8和流式细胞术检测KLF4基因敲除后细胞活性和细胞周期的变化。【结果】重组载体测序结果显示,sgRNAs与pGK1.1成功连接。分析敲除效率发现,3个sgRNAs均可对靶序列进行敲除,其中sgRNA3有较高的敲除效率。PCR产物经CruiserTMEnzyme酶切筛选出2个阳性单克隆细胞。TA克隆测序分析发现,KLF4基因2个等位基因序列分别缺失116和137 bp。Western blotting结果表明,KLF4基因敲除细胞中未见KLF4蛋白表达。细胞活性及细胞周期分析显示,敲除KLF4基因极显著抑制了细胞活性(P<0.01),并导致G0/S细胞周期阻滞。【结论】本研究利用CRISPR/Cas9技术构建了KLF4基因敲除的IPEC-J2细胞,且KLF4基因敲除可抑制细胞活性,并引起G0/S细胞周期阻滞。KLF4基因敲除细胞可为进一步探究KLF4基因功能及分子机制提供材料。 展开更多
关键词 KLF4基因 CRISPR/Cas9技术 细胞活性 细胞周期
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干扰素刺激基因ISG15对猪流行性腹泻病毒复制的作用及机制分析
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作者 刘莉莉 边缘 +2 位作者 吴圣龙 包文斌 吴正常 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期2545-2555,共11页
【目的】探究干扰素刺激基因ISG15在猪流行性腹泻病毒(PEDV)复制中所发挥的作用及机制。【方法】利用实时荧光定量PCR检测ISG15基因组织表达谱及肠道组织差异表达情况,同时以猪小肠上皮细胞(IPEC-J2)为研究模型,检测PEDV CV777毒株感染... 【目的】探究干扰素刺激基因ISG15在猪流行性腹泻病毒(PEDV)复制中所发挥的作用及机制。【方法】利用实时荧光定量PCR检测ISG15基因组织表达谱及肠道组织差异表达情况,同时以猪小肠上皮细胞(IPEC-J2)为研究模型,检测PEDV CV777毒株感染细胞不同时间点PEDV M基因mRNA和N蛋白表达量,并从RNA和蛋白水平检测ISG15表达变化;分别构建猪ISG15基因干扰和过表达细胞,通过实时荧光定量PCR、Western blotting及间接免疫荧光试验检测ISG15基因表达对PEDV复制水平的影响;对ISG15基因过表达前后进行转录组测序分析,筛选其下游调控基因及信号通路。【结果】ISG15基因在仔猪肠道组织中特异性高表达,其中空肠和回肠中表达量极显著高于其他组织(P<0.01);PEDV感染组十二指肠、空肠及回肠中ISG15基因表达量显著或极显著高于健康组(P<0.05;P<0.01);M基因mRNA和N蛋白表达量出现上升趋势,与0 h相比,ISG15基因表达水平在24 h出现极显著上调(P<0.01);ISG15基因过表达后PEDV复制出现显著或极显著下降(P<0.05;P<0.01),而ISG15基因干扰后PEDV复制出现极显著上调(P<0.01);转录组测序发现,过表达ISG15基因前后存在1 532个差异表达基因,且其主要富集在自噬、MAPK、内吞等信号通路中。【结论】本研究揭示了PEDV感染过程中ISG15基因的调控功能及作用机制,发现ISG15基因上调可显著抑制PEDV复制,增进了对PEDV与宿主细胞互作分子机制的认识。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒(PEDV) ISG15基因 病毒复制 转录组
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济南轨道交通3号线弓网异常磨耗研究
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作者 赵金城 朱合宾 +3 位作者 李占斌 包文斌 安贵磊 蘧靖宇 《中国高新科技》 2024年第1期117-120,共4页
针对济南轨道交通3号线弓网关系异常情况,文章逐一分析并确定可能的原因,详细概述改善弓网关系的具体步骤,记录整改流程并提出针对性的建议,对弓网异常磨耗研究具有重要意义。
关键词 接触网 受电弓 弓网异常磨耗
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茶树油对断奶仔猪血清、肝脏和肠黏膜抗氧化指标的影响 被引量:7
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作者 董丽 王淑楠 +6 位作者 刘军 毛俊舟 彭众 霍永久 魏瑧武 包文斌 喻礼怀 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期1440-1446,共7页
本试验旨在研究茶树油对断奶仔猪血清、肝脏和肠黏膜抗氧化指标的影响。试验选取21日龄体重[(6.73±0.12)kg]相近的健康"杜×长×大"三元杂交断奶仔猪120头,随机分为5组,每组6个重复,每个重复4头仔猪。5个组分别... 本试验旨在研究茶树油对断奶仔猪血清、肝脏和肠黏膜抗氧化指标的影响。试验选取21日龄体重[(6.73±0.12)kg]相近的健康"杜×长×大"三元杂交断奶仔猪120头,随机分为5组,每组6个重复,每个重复4头仔猪。5个组分别为对照组(CON组,饲喂基础饲粮)、抗生素组[ANT组,饲喂基础饲粮+200 mg/kg硫酸黏菌素(10%)+75 mg/kg金霉素(15%)]、低茶树油组(LTO组,饲喂基础饲粮+50 mg/kg茶树油)、中茶树油组(MTO组,饲喂基础饲粮+100 mg/kg茶树油)和高茶树油组(HTO组,饲喂基础饲粮+150 mg/kg茶树油)。试验期21 d。结果表明:1)HTO组仔猪血清总抗氧化能力(T-AOC)显著高于LTO和MTO组(P<0.05),MTO组仔猪血清超氧化物歧化酶(SOD)活性显著高于HTO、CON和ANT组(P<0.05),LTO组仔猪血清过氧化氢(H_2O_2)含量显著低于MTO、HTO和CON组(P<0.05)。2)与CON和ANT组相比,LTO、MTO和HTO组仔猪肝脏T-AOC显著提高(P<0.05),LTO和MTO组仔猪肝脏谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性和H_2O_2含量显著提高(P<0.05),HTO组仔猪肝脏还原型谷胱甘肽(GSH)含量显著提高(P<0.05);与CON组相比,LTO和MTO组仔猪肝脏SOD活性显著提高(P<0.05)。3)HTO组仔猪空肠黏膜GSH-Px和SOD活性显著高于ANT组(P<0.05),LTO、MTO、HTO和ANT组仔猪空肠黏膜H_2O_2含量显著低于CON组(P<0.05)。4)HTO组仔猪回肠黏膜SOD活性和GSH含量显著高于CON组(P<0.05),LTO、MTO、HTO和ANT组仔猪回肠黏膜丙二醛(MDA)含量显著低于CON组(P<0.05)。综上,茶树油可提高断奶仔猪血清、肝脏和肠黏膜抗氧化酶活性,减少血清、空肠黏膜H_2O_2的含量,进而提高断奶仔猪的机体抗氧化功能,总体效果优于抗生素,建议添加量为100 mg/kg。 展开更多
关键词 茶树油 抗生素 断奶仔猪 抗氧化酶 过氧化氢
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猪缝隙连接蛋白43(GJA1)结构和功能的预测与分析 被引量:4
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作者 戴开宇 曹越 +3 位作者 郜重丞 王海飞 包文斌 吴圣龙 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第12期3305-3316,共12页
为了探究猪缝隙连接蛋白43(GJA1)的结构和相关功能,本研究对16个哺乳动物的GJA1蛋白进行多重序列比对及系统发育分析,并通过相关的生物信息学数据库和软件从理化性质、蛋白修饰位点、跨膜区、亚细胞定位、二级结构、三级结构、多态位点... 为了探究猪缝隙连接蛋白43(GJA1)的结构和相关功能,本研究对16个哺乳动物的GJA1蛋白进行多重序列比对及系统发育分析,并通过相关的生物信息学数据库和软件从理化性质、蛋白修饰位点、跨膜区、亚细胞定位、二级结构、三级结构、多态位点、功能区域和互作蛋白等方面对猪GJA1蛋白的结构和功能进行系统分析。系统发育分析结果显示,GJA1蛋白在16种哺乳动物中变异未达到饱和,物种间遗传距离小且同源性高,其中猪与马的GJA1蛋白序列最为接近,同源性达93.3%,在进化树上的分类也证实了这一结果。蛋白结构分析结果显示,猪GJA1蛋白分子质量为43.08ku,理论等电点为8.88,由20种氨基酸组成,不稳定指数为44.06,平均疏水系数为-0.240,脂溶指数为82.67,不分泌信号肽,有4个跨膜区、6个O-糖基化位点和38个磷酸化位点,最有可能位于细胞质膜和高尔基体内,其二级结构和三级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。蛋白功能分析结果显示,在猪GJA1蛋白的CDS序列中有2个超级家族结构功能区域和6个错义突变位点,且猪GJA1蛋白还与ZO-1和Cx36等蛋白及多种蛋白激酶存在相互作用。本研究通过生物信息学分析系统地揭示了猪GJA1蛋白的结构和功能,为后续进一步研究GJA1蛋白在猪体内发挥生物学功能的遗传调控机制提供一定的理论支持。 展开更多
关键词 缝隙连接蛋白43(GJA1) 蛋白结构 蛋白功能
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猪FUT2基因密码子使用偏好性分析及优化 被引量:2
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作者 戴开宇 黄焱杰 +2 位作者 吴丽思 包文斌 吴圣龙 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第7期1863-1872,共10页
为了揭示猪α-(1,2)岩藻糖转移酶2(FUT2)基因密码子使用特性并提高其在外源宿主内的表达量,本研究综合运用EMBOSS Explorer网站和CodonW软件包分析了猪FUT2基因的密码子使用偏好性的相关参数,并与3种模式生物(大肠杆菌、酵母菌和果蝇)... 为了揭示猪α-(1,2)岩藻糖转移酶2(FUT2)基因密码子使用特性并提高其在外源宿主内的表达量,本研究综合运用EMBOSS Explorer网站和CodonW软件包分析了猪FUT2基因的密码子使用偏好性的相关参数,并与3种模式生物(大肠杆菌、酵母菌和果蝇)基因组密码子使用模式进行比较,最后参照与之最为相近的模式生物基因组密码子使用方式,利用JCat和OPTIMIZER两个密码子优化网站对猪FUT2基因密码子进行优化。结果显示,猪FUT2基因表达水平不高,存在24种偏好密码子,且这24种偏好密码子中有23种以G/C结尾;猪FUT2基因与果蝇基因组密码子使用模式的差异小于大肠杆菌和酵母基因组,表明果蝇更适合猪FUT2基因的外源表达;根据果蝇基因组密码子使用模式优化猪FUT2基因密码子,优化后其适应指数有了明显提高,而整体GC含量没有明显变化,说明在理论上猪FUT2基因优化成功。本研究从翻译水平上揭示了猪FUT2基因的密码子使用特性,为其在遗传改良中选择最佳外源表达系统及提高其在宿主细胞内的表达水平提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 FUT2基因 密码子使用偏好性 密码子优化
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猪TLR5基因表达水平与F18大肠杆菌侵染关系分析 被引量:2
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作者 赵呈祥 戴开宇 +2 位作者 杜雨露 包文斌 吴圣龙 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第5期1163-1169,共7页
为了探究猪Toll样受体(Toll-like receptor 5,TLR5)基因表达水平与F18大肠杆菌抗性的关系,试验通过不同血清型产肠毒素大肠杆菌(F18ab和F18ac)侵染猪小肠上皮细胞(IPEC-J2),同时通过脂多糖(LPS)分别诱导IPEC-J2细胞4和8h,利用实时荧光定... 为了探究猪Toll样受体(Toll-like receptor 5,TLR5)基因表达水平与F18大肠杆菌抗性的关系,试验通过不同血清型产肠毒素大肠杆菌(F18ab和F18ac)侵染猪小肠上皮细胞(IPEC-J2),同时通过脂多糖(LPS)分别诱导IPEC-J2细胞4和8h,利用实时荧光定量PCR检测TLR5基因表达水平变化,并利用Western blotting进行蛋白表达分析。结果显示,不同血清型大肠杆菌(F18ab和F18ac)菌体侵染IPEC-J2细胞后,TLR5基因表达水平均极显著上调(P<0.01);LPS诱导IPEC-J2细胞4和8h后,TLR5基因表达水平均极显著上调(P<0.01),且在LPS诱导IPEC-J2细胞8h后,TLR5基因表达水平明显高于诱导4h。与对照组相比,细胞中TLR5蛋白的表达水平极显著上调(P<0.01),与LPS诱导及F18大肠杆菌菌体刺激IPEC-J2细胞后mRNA表达水平结果相一致。本研究在细胞水平上分析了TLR5表达水平和F18大肠杆菌侵染的相关性,进一步证实猪TLR5基因的表达水平在细胞抵抗F18大肠杆菌的侵染过程中发挥了重要的调控作用,为今后关于TLR5基因功能及其在大肠杆菌腹泻遗传育种应用的研究奠定基础。 展开更多
关键词 TLR5基因 大肠杆菌 MRNA表达 WESTERN BLOTTING
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猪m^(6)A甲基化酶WTAP基因与F18大肠杆菌感染的关系 被引量:2
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作者 肖叶懿 郜重丞 +2 位作者 包文斌 吴正常 吴圣龙 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1709-1716,共8页
本研究旨在探讨猪m 6A甲基化酶WTAP表达水平与大肠杆菌(E.coli)感染抗性的关系。选取35日龄苏太断奶仔猪(Sus scrofa)大肠杆菌抗性型和敏感型个体各4头,采集十二指肠和空肠组织,利用RT-qPCR检测WTAP在E.coli抗性型和敏感型个体十二指肠... 本研究旨在探讨猪m 6A甲基化酶WTAP表达水平与大肠杆菌(E.coli)感染抗性的关系。选取35日龄苏太断奶仔猪(Sus scrofa)大肠杆菌抗性型和敏感型个体各4头,采集十二指肠和空肠组织,利用RT-qPCR检测WTAP在E.coli抗性型和敏感型个体十二指肠、空肠的表达差异,并分别利用产肠毒素大肠杆菌(F18ab、F18ac)刺激和内毒素(LPS)诱导猪小肠上皮细胞(IPEC-J2),检测WTAP基因的表达变化。同时构建WTAP基因干扰载体并转染IPEC-J2细胞,通过菌毛定量、菌落计数以及间接免疫荧光试验检测该基因沉默对大肠杆菌黏附能力的影响。结果显示:在十二指肠和空肠组织中,WTAP基因在E.coli抗性型个体中的表达量显著高于敏感型个体(P<0.01);并且在F18ab和F18ac刺激后表达量显著下降,与LPS诱导6 h后结果相一致(P<0.01)。沉默WTAP基因后,大肠杆菌黏附能力极显著上升(P<0.01)。本研究在细胞和个体水平上验证发现,m 6A甲基转移酶WTAP的高表达可能有助于仔猪抗大肠杆菌感染,为进一步揭示仔猪抗大肠杆菌感染的RNA甲基化调控机制奠定基础。 展开更多
关键词 N6-甲基腺嘌呤(m^(6)A) RNA甲基化酶 肾母细胞瘤1-相关蛋白 大肠杆菌
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VI-RADS在膀胱癌中运用的研究进展及其局限性 被引量:4
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作者 保文斌 栾婷 +2 位作者 郝金钢 王海峰 王剑松 《医学影像学杂志》 2022年第5期849-852,共4页
2018年一个专家小组提出膀胱影像报告和数据系统(VI-RADS)评分,旨在标准化膀胱癌分期的MRI评估和报告。一些评估VI-RADS预测肌层浸润性膀胱癌价值的研究已经发表,多数研究者认为它是鉴别非肌层浸润性膀胱癌和肌层浸润性膀胱癌的可靠工... 2018年一个专家小组提出膀胱影像报告和数据系统(VI-RADS)评分,旨在标准化膀胱癌分期的MRI评估和报告。一些评估VI-RADS预测肌层浸润性膀胱癌价值的研究已经发表,多数研究者认为它是鉴别非肌层浸润性膀胱癌和肌层浸润性膀胱癌的可靠工具。但它在膀胱癌中的运用仍存在许多局限性。本文将重点就近年来将VI-RADS新技术用于膀胱癌诊断的研究进展及其局限性作一综述。 展开更多
关键词 膀胱影像报告和数据系统 磁共振成像 膀胱癌 临床分期
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猪m^6A去甲基化酶FTO、ALKBH5基因表达水平与大肠杆菌F18感染抗性的关系分析 被引量:2
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作者 齐晓艺 杨荔 +2 位作者 吴正常 包文斌 吴圣龙 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第9期2960-2967,共8页
为了探讨猪6-甲基腺嘌呤(m^6A)去甲基化酶mRNA表达水平与仔猪大肠杆菌F18抗性的关系,本研究运用实时荧光定量PCR方法检测m^6A去甲基化酶FTO和ALKBH5基因在35日龄苏太猪断奶仔猪大肠杆菌F18抗性型和敏感型个体十二指肠和空肠组织中的mRN... 为了探讨猪6-甲基腺嘌呤(m^6A)去甲基化酶mRNA表达水平与仔猪大肠杆菌F18抗性的关系,本研究运用实时荧光定量PCR方法检测m^6A去甲基化酶FTO和ALKBH5基因在35日龄苏太猪断奶仔猪大肠杆菌F18抗性型和敏感型个体十二指肠和空肠组织中的mRNA表达差异,同时分别利用F18ab、F18ac大肠杆菌菌体刺激和内毒素LPS诱导猪小肠上皮细胞(IPEC-J2),检测FTO、ALKBH5基因表达变化。结果表明,FTO、ALKBH5基因在抗性型个体十二指肠和空肠中的表达量均极显著或显著高于敏感型个体(P<0.01,P<0.05);不同F18大肠杆菌菌体刺激IPEC-J2细胞后,FTO基因表达水平均无显著变化(P>0.05),而ALKBH5基因在F18ac刺激后表达量显著上调(P<0.05);LPS诱导4 h时,FTO和ALKBH5基因表达量均显著上调(P<0.05)。本研究在细胞和个体水平上初步验证并发现了m^6A去甲基化酶FTO和ALKBH5基因表达水平与大肠杆菌感染仔猪密切相关,为今后深入研究RNA去甲基化修饰在仔猪细菌性腹泻调控中的作用机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 m6A甲基化 FTO基因 ALKBH5基因 大肠杆菌
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XSSD-P:改进的SSD行人检测算法 被引量:1
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作者 鲍文斌 张冬泉 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2022年第23期132-141,共10页
SSD(single shot multi-box detector)是目前广泛应用于行人检测的神经网络算法,为了提高其检测精度和检测速度,对SSD算法进行了有效改进(改进后的算法称为XSSD-P)。选择Xception网络作为XSSD-P算法的骨干网络并重新选择用于预测的特征... SSD(single shot multi-box detector)是目前广泛应用于行人检测的神经网络算法,为了提高其检测精度和检测速度,对SSD算法进行了有效改进(改进后的算法称为XSSD-P)。选择Xception网络作为XSSD-P算法的骨干网络并重新选择用于预测的特征层;根据行人外形尺寸的特征设计了多尺度卷积核和基础锚框,并将二者耦合,基础锚框通过调节自身大小得到锚框(anchors)用于位置回归;再使用深度可分离卷积代替常规卷积在特征图上进行预测,实现了行人的有效检测。在INRIA数据集、VOC数据集和COCO数据集上进行检测精度对比测试,与SSD以及其他主流算法相比,XSSD-P算法在行人检测方面拥有更高的检测精度,并在Caltech行人数据集和MIT行人数据集中验证了XSSD-P算法的泛化性能。在检测速度方面,与SSD算法相比,XSSD-P算法的检测速度高出30 FPS,提高了42.86%。实验结果表明,XSSD-P的检测精度和检测速度均优于SSD算法。 展开更多
关键词 行人检测 SSD算法 卷积神经网络 多尺度卷积核 Xception网络
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猪ALCAM基因密码子偏好性分析、蛋白结构功能预测以及组织表达谱检测
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作者 许写 陈瑜哲 +3 位作者 杨建生 吴正常 包文斌 吴圣龙 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第11期85-90,共6页
为探讨猪活化白细胞黏附分子(Activated Leukocyte Cell Adhesion Molecule,ALCAM)基因的结构与功能,本研究运用EMBOSS和Codon W软件分析猪ALCAM基因密码子使用偏好性,运用生物信息学相关软件分析ALCAM蛋白的理化性质、结构功能并预测... 为探讨猪活化白细胞黏附分子(Activated Leukocyte Cell Adhesion Molecule,ALCAM)基因的结构与功能,本研究运用EMBOSS和Codon W软件分析猪ALCAM基因密码子使用偏好性,运用生物信息学相关软件分析ALCAM蛋白的理化性质、结构功能并预测与其存在互作关系的蛋白,运用实时荧光定量的方法检测ALCAM基因在梅山猪不同组织中的表达水平。结果表明:ALCAM基因偏好使用以A/U结尾的密码子,存在28个偏好性较强的密码子(RSCU值>1),其中CGG、AGA、GGA、GCU、ACA这5个密码子的偏好性最强,猪ALCAM基因与小鼠和酵母基因组的密码子使用差异小于大肠杆菌基因组,表明小鼠和酵母更适合作为ALCAM基因的外源表达系统;猪ALCAM基因CDS区序列全长1713 bp,编码570个氨基酸,为脂溶性、不稳定的亲水性蛋白,存在一个跨膜结构域(515~537 aa)和信号肽区域(1~27 aa);该蛋白存在5个潜在的N-糖基化位点和96个特异性蛋白激酶结合位点,二级结构以无规则卷曲和延伸链为主,可能与CD6、CD44、PTPRC和CNTN4蛋白存在互作关系。组织表达谱分析显示,ALCAM基因在梅山猪不同组织中均有表达,尤其在肺和淋巴组织中呈现高表达。本研究从密码子、蛋白质结构和功能以及组织表达谱层面初步揭示了猪ALCAM基因的结构与功能,为今后深入研究猪ALCAM基因的生物学功能提供一定的理论基础。 展开更多
关键词 ALCAM基因 密码子偏好性 生物信息学 组织表达谱
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梅山猪PBD-1基因CDS区克隆、组织表达及生物信息学分析
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作者 冯海悦 曹越 +3 位作者 郜重丞 吴正常 包文斌 吴圣龙 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS 北大核心 2018年第3期9-15,共7页
为系统探究猪β防御素-1(PBD-1)基因的结构和功能,以梅山猪为试验材料,扩增PBD-1基因CDS区,应用生物信息学分析猪PBD-1基因编码蛋白的特性和功能,运用DnaSP和MEGA分析猪PBD-1基因与其他物种进化关系,同时利用实时荧光定量方法检测PBD-1... 为系统探究猪β防御素-1(PBD-1)基因的结构和功能,以梅山猪为试验材料,扩增PBD-1基因CDS区,应用生物信息学分析猪PBD-1基因编码蛋白的特性和功能,运用DnaSP和MEGA分析猪PBD-1基因与其他物种进化关系,同时利用实时荧光定量方法检测PBD-1基因在梅山猪不同组织中的表达水平。结果表明:猪PBD-1基因CDS区长195bp,编码64个氨基酸,为脂溶性疏水性、不稳定的分泌型蛋白,无跨膜结构,存在信号肽区域(第1~22位氨基酸);该蛋白存在3个特异性蛋白质激酶的结合位点(PKC、PKA、UNSP),二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主;包含defensin-beta保守结构域(第28~62位氨基酸),且该蛋白可能与PBD-2、CCR6、NPG1、PAMP-23、ZCCHC3等蛋白存在相互作用关系。进化分析显示,猪PBD-1基因与驴、驯鹿具有较高的同源性,可聚为一类。组织表达谱显示,PBD-1基因在梅山猪不同组织中均有表达,尤其在胃、免疫组织(胸腺、淋巴)及肠道组织(空肠、回肠)中呈现高表达。这一研究为今后深入研究PBD-1基因功能提供了理论参考。 展开更多
关键词 梅山猪 PBD-1基因 克隆 组织表达 生物信息学
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梅山猪CD14基因多态性及其对部分免疫指标和繁殖性能的关联分析
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作者 杜雨露 魏宗友 +2 位作者 叶兰 包文斌 吴圣龙 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第7期1898-1904,共7页
试验旨在研究梅山猪白细胞分化抗原14(cluster of differentiation antigen 14,CD14)基因多态性及其对部分免疫指标和繁殖性能的遗传效应。采用PCR-RFLP方法对梅山猪CD14基因-61bp处多态性进行分析,同时对部分重要细胞因子(IL-1β、IL-4... 试验旨在研究梅山猪白细胞分化抗原14(cluster of differentiation antigen 14,CD14)基因多态性及其对部分免疫指标和繁殖性能的遗传效应。采用PCR-RFLP方法对梅山猪CD14基因-61bp处多态性进行分析,同时对部分重要细胞因子(IL-1β、IL-4、IL-6、IL-8、IL-10、IFN-γ、TNF-α和TGF-β1)水平及繁殖性能(总产仔数、断奶仔猪数、初生窝重和断奶窝重)进行测定,并分析CD14基因多态性与部分免疫指标和繁殖性能的相关性。结果显示,梅山猪CD14基因-61bp处经BamHⅠ酶切后共检测到3种基因型,分别定义为:AA、AG和GG;χ2适合性检验显示,梅山猪处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);多态信息含量(PIC)分析显示,梅山猪群体处于中度多态。关联分析结果表明,AA和AG基因型个体的IL-10水平显著高于GG基因型个体(P<0.05);在初产母猪中,3种基因型间的繁殖性能均无显著差异(P>0.05),而在经产母猪中,AA和AG基因型个体的断奶窝重显著高于GG基因型个体(P<0.05)。本试验结果表明,基于CD14基因-61bp处多态性对梅山猪进行分子选育时,无论是一般抗病力还是繁殖性能,GG基因型可能均为不利基因型,可以将CD14基因-61bp处作为一个潜在的遗传标记进行深入系统的验证和分析。 展开更多
关键词 CD14基因 免疫指标 繁殖性能
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女性根治性膀胱切除术后性功能障碍的研究进展 被引量:1
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作者 保文斌 王海峰 +2 位作者 栾婷 丁明霞 王剑松 《临床泌尿外科杂志》 CAS 2022年第3期234-238,共5页
根治性膀胱切除术是浸润性膀胱癌的标准治疗方式,传统女性膀胱全切术对术后性功能有明显影响。术后性功能的影响因素包括尿流改道方式、是否保留盆腔器官以及泌尿外科医生对女性术后性功能的关注度。但目前何种尿流改道方式最有利于术... 根治性膀胱切除术是浸润性膀胱癌的标准治疗方式,传统女性膀胱全切术对术后性功能有明显影响。术后性功能的影响因素包括尿流改道方式、是否保留盆腔器官以及泌尿外科医生对女性术后性功能的关注度。但目前何种尿流改道方式最有利于术后性功能的恢复以及是否保留盆腔器官仍然存在较大争议。同时,泌尿外科医生对女性术后性功能障碍的关注度远不如男性,这就导致了相关研究的缺乏。所以,进行如何改善年轻女性患者术后性功能的研究尤为迫切和重要。本文也将对目前女性膀胱癌术后性功能障碍的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 膀胱癌 根治性膀胱切除术 女性 性功能障碍
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Efficient generation of transgenic chickens using the spermatogonial stem cells in vivo and ex vivo transfection 被引量:13
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作者 LI BiChun SUN GuoBo +9 位作者 SUN HuaiChang XU Qi GAO Bo ZHOU GuanYue ZHAO WenMing WU XinSheng bao wenbin YU Fei WANG KeHua CHEN GuoHong 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2008年第8期734-742,共9页
The highly efficient novel methods to produce transgenic chickens were established by directly in-jecting the recombinant plasmid containing green fluorescent protein (GFP) gene into the cock's testis termed as te... The highly efficient novel methods to produce transgenic chickens were established by directly in-jecting the recombinant plasmid containing green fluorescent protein (GFP) gene into the cock's testis termed as testis-medianted gene transfer (TMGT), and transplanting transfected spermatogonial stem cells (TTSSCs). For the TMGT approach,four dosages of pEGFP-N1 DNA/cationic polymer complex were injected intratesticularly. The results showed: (1) 48 h after the injection,the percentages of testis cells expressing GFP were 4.0%, 8.7%, 10.2% and 13.6% in the 50, 100, 150 and 200 μg/mL group, re-spectively. The difference from the four dosage groups was significant (P<0.05). On day 25 after the injection, a dosage-dependent and time-dependent increase in the number of transgenic sperm was observed. The percentages of gene expression reached the summit and became stable from day 70 to 160, being 12.7%, 12.8%, 15.9% and 19.1%, respectively. The difference from the four dosage groups was also significant (P<0.05). (2) 70 d after the injection, strong green fluorescent could be observed in the seminiferous tubules by whole-mount in-situ hybridization. (3) 70 d after the injection, the semen was collected and used to artificially inseminate wild-type females. The blastoderms of F1 and F2 transgenic chicken expressed GFP were 56.2% (254/452) and 53.2% (275/517), respectively. The detec-tion of polymerase chain reaction (PCR) of F1 and F2 transgenic chicken blood genomic DNA showed that 56.5% (3/23) of F1 and 52.9% (9/17) of F2 were positive. Southern blot showed GFP DNA was in-serted in their genomic DNAs. (4) Frozen whole mount tissue sections of F1 and F2 transgenic chicken liver, heart, kidney and muscle showed that the rates of green fluorescent positive were between 50.0% and 66.7%. (5) With the TTSSCs method, SSCs ex vivo transfected with GFP were transplanted into recipient roosters whose endogenic SSCs had been resoluted. The donor SSCs settled and GFP ex-pression became readily detectable in the frozen whole mount tissue sections of recepient testes. Moreover, sperms carrying GFP could be produced normally. The results of artificially inseminating wild-type females with these sperms showed 12.5% (8/64) of offspring embryo expressed GFP and 11.1% (2/18) hatched chicks were tested transgenic. Our data therefore suggest TMGT and TTSSCs are the feasible methods for the generation of transgenic chickens. 展开更多
关键词 CHICKEN spermatogonial stem cells green fluorescent protein gene BIOREACTOR
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膀胱脉管瘤1例
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作者 保文斌 黄宇 +1 位作者 王海峰 王剑松 《临床泌尿外科杂志》 CAS 2022年第6期486-488,共3页
膀胱脉管瘤是一种较为罕见的膀胱良性肿瘤,临床表现为间歇性无痛性肉眼血尿,部分患者可合并膀胱炎症状。它的影像学检查缺乏特异性,最终确诊需要靠病理学检查。目前手术治疗被认为是治疗膀胱脉管瘤最有效的方式。现报道昆明医科大学第... 膀胱脉管瘤是一种较为罕见的膀胱良性肿瘤,临床表现为间歇性无痛性肉眼血尿,部分患者可合并膀胱炎症状。它的影像学检查缺乏特异性,最终确诊需要靠病理学检查。目前手术治疗被认为是治疗膀胱脉管瘤最有效的方式。现报道昆明医科大学第二附属医院诊治的1例膀胱脉管瘤患者。 展开更多
关键词 膀胱肿瘤 脉管瘤 膀胱占位 膀胱部分切除术
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