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全切片图像扫描技术在临床病理诊断工作中的应用 被引量:8
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作者 唐仲平 崔权哲 +2 位作者 杨李波 包骥 赵春 《河北医科大学学报》 CAS 2018年第10期1205-1209,共5页
目的探讨全切片图像扫描技术(whole slide images,WSI)在日常病理诊断工作中的应用价值与效果。方法选取300例连续的组织学病例作为研究对象,将所有样本的病理切片运用WSI技术进行数字化扫描,在电脑屏幕上阅读数字化切片后作出病理诊断... 目的探讨全切片图像扫描技术(whole slide images,WSI)在日常病理诊断工作中的应用价值与效果。方法选取300例连续的组织学病例作为研究对象,将所有样本的病理切片运用WSI技术进行数字化扫描,在电脑屏幕上阅读数字化切片后作出病理诊断。再将在显微镜下常规病理切片的病理诊断与在电脑屏幕上数字化切片的病理诊断进行对比,分析WSI技术在日常病理诊断工作中的应用效果。结果 300例HE染色的常规病理切片与数字化病理切片诊断病变性质的总体符合率为98.67%(296/300)。300例HE染色的常规病理切片与数字化病理切片诊断病变种类完全符合272例(90.67%),部分符合9例(3.00%),不符合19例(6.33%)。与经验丰富的上级医师制定的标准答案比较,常规病理切片与数字化病理切片诊断HE染色、亚甲基蓝染色、免疫组织化学染色的符合率差异均无统计学意义(P>0.05)。结论在日常病理诊断工作中,同一医师在显微镜下常规病理切片的病理诊断与在电脑屏幕上数字化病理切片的病理诊断有较高的符合率。随着医学信息数字化的不断发展,数字病理在教学、诊断、科学研究和数据保存上的优势会越来越明显,数字病理在将来的病理日常工作中也会变得越来越重要。 展开更多
关键词 病理学 临床 诊断 全切片图像扫描技术
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去分化脂肪肉瘤潜在核心基因的生物信息学预测及分析 被引量:1
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作者 胡美娟 周燕燕 +5 位作者 彭冉 邱琰 周永杰 杨李波 包骥 步宏 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期8-12,共5页
目的探讨去分化脂肪肉瘤的潜在核心基因在其恶性生物学行为中的作用。方法获取基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)数据库中GSE21122和GSE52390的芯片数据,通过GEO2R筛选差异表达基因,对差异表达基因进行GO功能、KEGG通路富集... 目的探讨去分化脂肪肉瘤的潜在核心基因在其恶性生物学行为中的作用。方法获取基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)数据库中GSE21122和GSE52390的芯片数据,通过GEO2R筛选差异表达基因,对差异表达基因进行GO功能、KEGG通路富集分析和蛋白互作分析,并用Cytoscape筛选潜在核心基因。结果筛选出68个差异表达基因(矫正后P<0.05,|LogFC|≥2),10个基因表达上调,58个基因表达下调;GO功能富集分析表明,差异表达基因主要参与的生物过程包括代谢和能量通路;KEGG通路富集分析表明,差异表达基因主要参与脂肪细胞因子信号通路、AMPK信号通路、PPAR信号通路和调控脂肪分解信号通路;蛋白互作分析表明,筛选的10个潜在核心基因为LEP、ADIPOQ、SCD、PLIN1、LPL、CAV1、PNPLA2、LIPE、CEBPA和CIDEA。结论潜在核心基因表达下调在去分化脂肪肉瘤的恶性生物学行为中发挥重要作用,为分析去分化脂肪肉瘤的分子机制和治疗靶点奠定基础。 展开更多
关键词 软组织肿瘤 去分化脂肪肉瘤 差异表达基因 生物信息学 信号通路
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数字化阅片在病理诊断中的可重复性和正确率研究 被引量:2
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作者 唐仲平 崔权哲 +2 位作者 包骥 蔡玮 赵春 《中国当代医药》 2020年第3期28-31,共4页
目的探讨数字化阅片在临床病理诊断中的可重复性和正确率。方法选取成都市第一人民医院病理科于2015年9月诊断的300例连续组织学病例作为研究对象,将所有病理切片运用全切片图像扫描技术(WSI)进行数字化扫描;再分别于2015年11月、2016年... 目的探讨数字化阅片在临床病理诊断中的可重复性和正确率。方法选取成都市第一人民医院病理科于2015年9月诊断的300例连续组织学病例作为研究对象,将所有病理切片运用全切片图像扫描技术(WSI)进行数字化扫描;再分别于2015年11月、2016年1月、2016年3月再次阅片后做出第一次数字化诊断、第二次显微镜诊断及第二次数字化诊断;最后对不同时间用不同方式诊断的四次结果进行比较,分析数字化阅片在临床病理诊断中的可重复性和正确率。结果同显微镜诊断一样,数字化诊断在病变性质及种类上均有很高的可重复性和正确率;同第一次数字化诊断与显微镜诊断的符合率比较,第二次数字化诊断与显微镜诊断的符合率明显升高;无论是显微镜阅片还是数字化阅片,对疑难病例复诊的正确率均高于初诊。结论数字化阅片在临床病理诊断中有很高的可重复性和正确率。随着病理医师对数字化阅片的逐渐适应,数字化诊断会越来越贴近、甚至超越显微镜诊断的可重复性和正确率。 展开更多
关键词 全切片图像扫描技术 数字化阅片 临床病理诊断 可重复性 正确率
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可信病理人工智能:从理论到实践 被引量:1
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作者 周燕燕 邓杨 +1 位作者 包骥 步宏 《协和医学杂志》 CSCD 2022年第4期525-529,共5页
人工智能正在融入病理学研究的各个领域,但在临床实践中却遇到了诸多挑战,包括因医疗数据隐私保护而形成“数据孤岛”,不利于人工智能模型的训练;现有人工智能模型缺乏可解释性,导致使用者无法理解而难以形成人机互动;人工智能模型对多... 人工智能正在融入病理学研究的各个领域,但在临床实践中却遇到了诸多挑战,包括因医疗数据隐私保护而形成“数据孤岛”,不利于人工智能模型的训练;现有人工智能模型缺乏可解释性,导致使用者无法理解而难以形成人机互动;人工智能模型对多模态数据利用不足,致使其预测效能难以进一步提升等。为解决上述难题,我们建议在现有病理人工智能研究中引入可信人工智能技术:(1)数据安全共享,在坚持数据保护的基础上打破数据孤岛,使用联邦学习的方法、仅调用数据训练的结果而不上传数据本身,在不影响数据安全的情况下大大增加可用于训练的数据量;(2)赋予人工智能可解释性,使用图神经网络技术模拟病理医生学习病理诊断的过程,使得模型本身具有可解释性;(3)多模态信息融合,使用知识图谱技术对更为多样和全面的数据来源进行整合并深入挖掘分析,获得更准确的模型。相信通过此三方面的工作,可信病理人工智能技术可使病理人工智能达到可控可靠和明确责任,从而促进病理人工智能的发展和临床应用。 展开更多
关键词 可信人工智能 病理 数据安全共享 可解释性 多模态信息融合
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全切片图像扫描技术在病理切片质控中的作用 被引量:3
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作者 唐仲平 崔权哲 +2 位作者 包骥 蔡玮 赵春 《中国医药科学》 2020年第12期33-38,共6页
目的探讨WSI技术在日常病理切片的数字化扫描和质量控制中的作用。方法选取成都市第一人民医院2015年9月由作者诊断的300例连续的组织学病例作为研究对象,将所有病理切片运用WSI技术进行数字化扫描,在电脑屏幕上阅读数字化切片后评估扫... 目的探讨WSI技术在日常病理切片的数字化扫描和质量控制中的作用。方法选取成都市第一人民医院2015年9月由作者诊断的300例连续的组织学病例作为研究对象,将所有病理切片运用WSI技术进行数字化扫描,在电脑屏幕上阅读数字化切片后评估扫描效果,分析WSI技术在日常病理切片的数字化扫描中的应用效果及我科HE切片的主要质量缺陷。结果WSI技术的总体扫描优良率为89.86%,而因扫描机原因造成的扫描不良率仅为1.83%。我科HE切片质量优良率较高(99.74%),宫内膜和皮肤组织是我科制片难点。我科HE切片的主要质量缺陷包括裂隙、折叠、刀痕、裱贴位置不当和切片厚薄不均。结论WSI技术对日常病理切片的数字化扫描及质量控制有较高的可行性及独特的优势。 展开更多
关键词 全切片图像扫描技术(WSI) 日常病理切片扫描 病理科质量控制 质量缺陷
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基于电商“直播助农”模式的阜蒙县脱贫渠道研究 被引量:1
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作者 包吉 朱文君 +1 位作者 徐晶晶 刘旸 《中小企业管理与科技》 2021年第23期114-115,共2页
农业产业发展是落实乡村振兴战略和减少相对贫困的重要路径,而农产品网络直播能够扩宽区域特色农产品的营销渠道。论文通过对阜蒙县“直播助农”模式的发展和应用现状的分析,发现了阜蒙县在电商直播发展中存在的问题,并提出了进一步发... 农业产业发展是落实乡村振兴战略和减少相对贫困的重要路径,而农产品网络直播能够扩宽区域特色农产品的营销渠道。论文通过对阜蒙县“直播助农”模式的发展和应用现状的分析,发现了阜蒙县在电商直播发展中存在的问题,并提出了进一步发展该模式的对策,为促进农民脱贫致富提供参考。 展开更多
关键词 电商 “直播助农” 阜蒙县
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miR-152靶向IRS-1对结肠癌细胞增殖、迁徙及侵袭的影响
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作者 代莹 包骥 +4 位作者 许波 姜媛媛 邱海燕 黄艺 詹发平 《山西医科大学学报》 CAS 2020年第6期473-478,共6页
目的探讨微小RNA-152(miR-152)靶向胰岛素受体底物1(IRS-1)对结肠癌细胞增殖、迁徙及侵袭的影响。方法体外培养人结肠癌SW480细胞,设置对照组(不转染任何载体)、无义转染组(转染nonsense siRNA载体)和miR-152 siRNA组(转染miR-152 siRN... 目的探讨微小RNA-152(miR-152)靶向胰岛素受体底物1(IRS-1)对结肠癌细胞增殖、迁徙及侵袭的影响。方法体外培养人结肠癌SW480细胞,设置对照组(不转染任何载体)、无义转染组(转染nonsense siRNA载体)和miR-152 siRNA组(转染miR-152 siRNA载体)。qRT-PCR法检测SW480细胞中miR-152、IRS-1表达水平;CCK-8法检测SW480细胞增殖;Transwell法检测SW480细胞迁徙、侵袭情况;蛋白印迹(WB)法检测SW480细胞中IRS-1、增殖细胞核抗原(PCNA)、基质金属蛋白酶-2(MMP-2)、MMP-9蛋白表达水平。结果对照组和无义转染组SW480细胞中miR-152、IRS-1 mRNA表达水平、OD值、迁徙细胞数、侵袭细胞数、IRS-1、PCNA、MMP-2、MMP-9蛋白表达水平差异无统计学意义(P>0.05)。与对照组和无义转染组相比,miR-152 siRNA组SW480细胞中miR-152表达水平显著降低(P<0.05),IRS-1表达水平、OD值、迁徙细胞数、侵袭细胞数及IRS-1、PCNA、MMP-2、MMP-9蛋白表达水平显著升高(P<0.05)。结论 miR-152抑制结肠癌细胞增殖、迁徙与侵袭,其作用机制可能与靶向调控IRS-1有关。 展开更多
关键词 微小RNA-152 胰岛素受体底物1 结肠癌 细胞增殖 细胞迁徙 细胞侵袭
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医教协同背景下全科住院医师规范化培训带教师资对置信职业行为的需求调查
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作者 舒明蓉 王洪键 +3 位作者 王星月 魏星 包骥 陈淑玲 《中国循证医学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第9期1011-1015,共5页
目的了解在当前全科住院医师(含全科专硕)规范化培训大背景下,带教师资对置信职业行为(entrustable professional activities,EPAs)的应用现状以及客观需求,探索建立全科住院医师EPAs评价考核体系的可行方案。方法采用问卷调查法,对158... 目的了解在当前全科住院医师(含全科专硕)规范化培训大背景下,带教师资对置信职业行为(entrustable professional activities,EPAs)的应用现状以及客观需求,探索建立全科住院医师EPAs评价考核体系的可行方案。方法采用问卷调查法,对158位临床带教师资进行调查,分析当前全科住院医师的规范化培训评价体系现状,以及他们对EPAs的了解程度和意见建议。结果在职业行为维度上,师资对医学知识和医学技能的考核效果认可度高;师资认为医德教育中的人文情怀考核不足;在实际需求上,带教师资对EPAs的重视顺序为:规范化(93.04%)、客观化(93.04%)、多维化(92.41%)、轻量化(90.51%)和多样化(86.04%)。结论应针对现行全科住院医师规范化培训体系中人文教育方面存在的短板,并基于中国全科住院医师培训的实际需求设计置信职业行为EPAs体系,在提高师资的教学胜任力的同时保障全科医学教育的产出成果。 展开更多
关键词 全科住院医师 专业学位硕士研究生 临床带教师资 导师 置信职业行为 教学评价
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大数据背景下的农村精准扶贫调查报告--以辽宁省阜蒙县为例
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作者 赵嘉宁 包吉 +1 位作者 孟唤婷 刘旸 《中小企业管理与科技》 2021年第23期174-175,共2页
论文主要针对阜蒙县精准扶贫现状进行分析,通过梳理理论和现实依据对阜新地区扶贫工作存在的问题进行研究和了解,进而提出与大数据平台相结合的扶贫模式,在分析将大数据应用于精准扶贫的必要性和可行性的基础上,有针对性地提出问题的解... 论文主要针对阜蒙县精准扶贫现状进行分析,通过梳理理论和现实依据对阜新地区扶贫工作存在的问题进行研究和了解,进而提出与大数据平台相结合的扶贫模式,在分析将大数据应用于精准扶贫的必要性和可行性的基础上,有针对性地提出问题的解决方法和建议。 展开更多
关键词 大数据 农村 精准扶贫 阜蒙县
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医教协同背景下全科住院医师规范化培训带教师资对职业置信行为的知信行调查 被引量:1
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作者 魏星 王洪键 +2 位作者 王星月 包骥 陈淑玲 《中国循证医学杂志》 CSCD 北大核心 2023年第10期1212-1217,共6页
目的 了解当前全科住院医师(含全科专硕)规范化培训评价体系的特点和不足,分析带教医师对职业置信行为(EPAs)的认知和态度,并探讨建立全科住院医师EPAs评价考核体系的可行方案。方法 采用问卷调查法,对158位临床带教师资进行调查,分析... 目的 了解当前全科住院医师(含全科专硕)规范化培训评价体系的特点和不足,分析带教医师对职业置信行为(EPAs)的认知和态度,并探讨建立全科住院医师EPAs评价考核体系的可行方案。方法 采用问卷调查法,对158位临床带教师资进行调查,分析当前全科住院医师的规范化培训评价体系现状,以及带教医师对EPAs的了解程度和建议。结果 现阶段对受训全科住院医师的考核较为普遍,但存在书面化、单一化、形式化等问题;培训前带教医师对EPAs的认知率仅为15.9%,培训后带教医师对EPAs的认知率上升至71.51%,EPAs体系可以在短期内提高了解水平、快速投入运用(P<0.001),师资在认可EPAs理念的同时提出精简EPAs的建议。结论 针对当前全科住院医师规范化培训评价体系的短板,应该开展针对性的EPAs设计工作,建立精简、实用的全科住院医师的EPAs评价体系。此外,应该加强师资对EPAs的宣传和培训,以提高师资的教学胜任力并保障全科医学教育的产出成果。 展开更多
关键词 全科住院医师 专业学位硕士研究生 临床带教师资 导师 职业置信行为 教学评价
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紫外光固化胶在病理切片快速封片中的应用
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作者 张炳琪 周燕燕 +8 位作者 邓杨 罗添友 李丽 陈菲 包春娟 姜勇 马朗 包骥 步宏 《中华病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期394-396,共3页
目的为了解决传统的中性树脂封片固化时间长,空间占用率高,不适合数字切片扫描等问题,探究紫外光固化胶的制备,保证切片制备质量同时提高封片效率。方法选择环保安全的预聚物、活性稀释剂和光引发剂制备干燥速度快,透光率高,适用范围广... 目的为了解决传统的中性树脂封片固化时间长,空间占用率高,不适合数字切片扫描等问题,探究紫外光固化胶的制备,保证切片制备质量同时提高封片效率。方法选择环保安全的预聚物、活性稀释剂和光引发剂制备干燥速度快,透光率高,适用范围广,性质稳定的紫外光固化胶替代传统封片剂。结果制备出的紫外光固化胶(UV42胶)封片后在紫外光照下15 s可完全固化,透光率达88.4%~89.7%(在波长400~600 nm范围内),广泛适用于冷冻和石蜡切片的常规染色处理封片。使用UV42胶封片的病理切片,放置3年后性质依然稳定,且耐黄变性能良好。结论 UV42胶满足快速病理切片封片的需求。 展开更多
关键词 紫外光固化胶 病理切片 活性稀释剂 环保安全 干燥速度 固化时间 透光率 紫外光照
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靶向猪基因组单链向导RNA快速筛选以及利用图案微阵列收获单克隆细胞的研究
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作者 高孟雨 朱星龙 +9 位作者 王诗盛 张炳琪 张芸琳 何宇婷 周燕燕 李顺 杨光 廖光能 包骥 步宏 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第1期111-121,共11页
规律性短重复回文序列簇(CRISPR)和CRISPR辅助蛋白9(Cas9)构成的CRISPR/Cas9基因编辑技术快速推进了基因修饰猪作为医学研究模式动物的广泛应用。而高效的靶基因单链向导RNA(sgRNA)是利用CRISPR/Cas9技术进行基因编辑成功的关键,对于猪... 规律性短重复回文序列簇(CRISPR)和CRISPR辅助蛋白9(Cas9)构成的CRISPR/Cas9基因编辑技术快速推进了基因修饰猪作为医学研究模式动物的广泛应用。而高效的靶基因单链向导RNA(sgRNA)是利用CRISPR/Cas9技术进行基因编辑成功的关键,对于猪等繁殖周期较长的大动物,则需要在实施动物实验前,在体外筛选出高效的sgRNA以避免时间和资源成本浪费。另外,如何高效获得阳性基因编辑单克隆细胞是目前尚待解决的难题。本研究建立了靶向猪基因组的sgRNA快速筛选方法,利用荧光载体富集基因编辑细胞,同时探索利用图案微阵列培养技术快速获得单克隆细胞的方法,在此基础上高效获得延胡索酰乙酰乙酸酶(Fah)基因编辑细胞,为后续生产作为人类肝细胞生物反应器的Fah基因敲除猪奠定基础。 展开更多
关键词 规律性短重复回文序列簇及辅助蛋白9 大动物基因编辑 延胡索酰乙酰乙酸酶基因敲除 单链向导RNA快速筛选 图案微阵列
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New possible silver lining for pancreatic cancer therapy:Hydrogen sulfide and its donors 被引量:6
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作者 Xu Hua Yan Xiao +9 位作者 jianan Sun bao ji Shanshan Luo Bo Wu Chao Zheng Peng Wang Fanxing Xu Keguang Cheng Huiming Hua Dahong Li 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS CSCD 2021年第5期1148-1157,共10页
As one of the most lethal diseases,pancreatic cancer shows a dismal overall prognosis and high resistance to most treatment modalities.Furthermore,pancreatic cancer escapes early detection during the curable period be... As one of the most lethal diseases,pancreatic cancer shows a dismal overall prognosis and high resistance to most treatment modalities.Furthermore,pancreatic cancer escapes early detection during the curable period because early symptoms rarely emerge and specific markers for this disease have not been found.Although combinations of new drugs,multimodal therapies,and adjuvants prolong survival,most patients still relapse after surgery and eventually die.Consequently,the search for more effective treatments for pancreatic cancer is highly relevant and justified.As a newly re-discovered mediator of gasotransmission,hydrogen sulfide(H2S)undertakes essential functions,encompassing various signaling complexes that occupy key processes in human biology.Accumulating evidence indicates that H2S exhibits bimodal modulation of cancer development.Thus,endogenous or low levels of exogenous H2S are thought to promote cancer,whereas high doses of exogenous H2S suppress tumor proliferation.Similarly,inhibition of endogenous H2S production also suppresses tumor proliferation.Accordingly,H2S biosynthesis inhibitors and H2S supplementation(H2S donors)are two distinct strategies for the treatment of cancer.Unfortunately,modulation of endogenous H2S on pancreatic cancer has not been studied so far.However,H2S donors and their derivatives have been extensively studied as potential therapeutic agents for pancreatic cancer therapy by inhibiting cell proliferation,inducing apoptosis,arresting cell cycle,and suppressing invasion and migration through exploiting multiple signaling pathways.As far as we know,there is no review of the effects of H2S donors on pancreatic cancer.Based on these concerns,the therapeutic effects of some H2S donors and NO-H2S dual donors on pancreatic cancer were summarized in this paper.Exogenous H2S donors may be promising compounds for pancreatic cancer treatment. 展开更多
关键词 Pancreatic cancer Hydrogen sulfide donor Sulfur-containing compound Cell proliferation Antitumor effect Signaling pathway
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