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印尼3个地区热泉中可培养细菌的分子鉴定与系统发育分析
被引量:
1
1
作者
王帅
林学政
+2 位作者
黄晓航
ZILDA Dewi Seswita
chasanah ekowati
《海洋科学进展》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期355-363,共9页
采用MSM寡营养培养基从印度尼西亚Pantai cermin,Kalianda和Banyu wedang地区的热泉水样、泥样以及沉积物中根据菌落的形态学特征共分离获得69株细菌,通过菌株的16S rDNA的限制性片段长度多态性(PCRRFLP)分析、序列比对和生理生化分析,...
采用MSM寡营养培养基从印度尼西亚Pantai cermin,Kalianda和Banyu wedang地区的热泉水样、泥样以及沉积物中根据菌落的形态学特征共分离获得69株细菌,通过菌株的16S rDNA的限制性片段长度多态性(PCRRFLP)分析、序列比对和生理生化分析,对其进行鉴定并构建系统发育树。结果表明,分离获得的69株细菌菌株分别属于8种基因型(Ⅰ~Ⅷ),其中1类(基因型I)属于短芽孢杆菌属(Brevibacillus),约占20.28%;1类(基因型Ⅷ)属于地芽孢杆菌属(Geobacillus),约占14.49%;其余6类(基因型Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅴ,Ⅵ,Ⅶ)均属于芽孢杆菌属(Bacillus),约占总菌株数量的65.22%,为优势菌群。分离获得的8类细菌均为革兰氏阳性兼性好氧菌,接触酶、氧化酶反应均呈阳性,吲哚反应都呈阴性。产酶实验表明,分离到的菌株在中性pH值,37~70℃范围内能够分泌多种耐热的水解酶类,4种基因型(Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ)的菌株分泌蛋白酶,5种基因型(Ⅳ,Ⅴ,Ⅵ,Ⅶ,Ⅷ)的菌株分泌水解脂肪酶,1种基因型(Ⅳ)的菌株分泌淀粉酶,并且发现其中1种基因型(Ⅳ)的芽孢杆菌可同时产生3种水解酶类。利用限制性内切酶AluI对16S rDNA进行的RFLP技术分析结果表明,利用该技术能够对嗜热细菌的16SrDNA多样性进行有效的分析,经凝胶电泳图谱将菌种鉴定到属的水平,揭示了印尼热泉生态系统中蕴藏着丰富的嗜热菌菌种资源。
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关键词
热泉
嗜热细菌
嗜热酶
细菌多样性
限制性片段长度多态性(RFLP)
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职称材料
题名
印尼3个地区热泉中可培养细菌的分子鉴定与系统发育分析
被引量:
1
1
作者
王帅
林学政
黄晓航
ZILDA Dewi Seswita
chasanah ekowati
机构
国家海洋局第一海洋研究所海洋生物活性物质重点实验室
印度尼西亚海洋与渔业研究局海洋生物技术与水产品加工研究中心
出处
《海洋科学进展》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期355-363,共9页
基金
中央级公益性科研院所基本科研基金项目--印尼热泉生态系统微生物多样性及其产嗜热酶研究(2010G13)
文摘
采用MSM寡营养培养基从印度尼西亚Pantai cermin,Kalianda和Banyu wedang地区的热泉水样、泥样以及沉积物中根据菌落的形态学特征共分离获得69株细菌,通过菌株的16S rDNA的限制性片段长度多态性(PCRRFLP)分析、序列比对和生理生化分析,对其进行鉴定并构建系统发育树。结果表明,分离获得的69株细菌菌株分别属于8种基因型(Ⅰ~Ⅷ),其中1类(基因型I)属于短芽孢杆菌属(Brevibacillus),约占20.28%;1类(基因型Ⅷ)属于地芽孢杆菌属(Geobacillus),约占14.49%;其余6类(基因型Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅴ,Ⅵ,Ⅶ)均属于芽孢杆菌属(Bacillus),约占总菌株数量的65.22%,为优势菌群。分离获得的8类细菌均为革兰氏阳性兼性好氧菌,接触酶、氧化酶反应均呈阳性,吲哚反应都呈阴性。产酶实验表明,分离到的菌株在中性pH值,37~70℃范围内能够分泌多种耐热的水解酶类,4种基因型(Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ)的菌株分泌蛋白酶,5种基因型(Ⅳ,Ⅴ,Ⅵ,Ⅶ,Ⅷ)的菌株分泌水解脂肪酶,1种基因型(Ⅳ)的菌株分泌淀粉酶,并且发现其中1种基因型(Ⅳ)的芽孢杆菌可同时产生3种水解酶类。利用限制性内切酶AluI对16S rDNA进行的RFLP技术分析结果表明,利用该技术能够对嗜热细菌的16SrDNA多样性进行有效的分析,经凝胶电泳图谱将菌种鉴定到属的水平,揭示了印尼热泉生态系统中蕴藏着丰富的嗜热菌菌种资源。
关键词
热泉
嗜热细菌
嗜热酶
细菌多样性
限制性片段长度多态性(RFLP)
Keywords
hotspring
thermophile bacterium
thermostable hydrolytic enzymes
bacterial diversity
re- striction fragment length polymorphism (RFLP)
分类号
Q939 [生物学—微生物学]
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作者
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1
印尼3个地区热泉中可培养细菌的分子鉴定与系统发育分析
王帅
林学政
黄晓航
ZILDA Dewi Seswita
chasanah ekowati
《海洋科学进展》
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
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参考文献
引证文献
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