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猫泛白细胞减少症病毒分离鉴定及VP2基因的遗传变异分析
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作者 张启龙 李振河 +9 位作者 程敏姮 栗云鹏 高晓龙 傅彩霞 王林 高敏 余琦 周德刚 张玮 李志军 《动物医学进展》 北大核心 2024年第8期28-34,共7页
为分析北京地区猫泛白细胞减少症病毒(Feline panleukopenia virus,FPV)的流行毒株及其VP2基因遗传变异情况,对FPV胶体金试纸条检测结果为阳性的病死猫组织进行病毒分离,通过细胞病变、荧光定量PCR、间接免疫荧光和全基因组测序等试验,... 为分析北京地区猫泛白细胞减少症病毒(Feline panleukopenia virus,FPV)的流行毒株及其VP2基因遗传变异情况,对FPV胶体金试纸条检测结果为阳性的病死猫组织进行病毒分离,通过细胞病变、荧光定量PCR、间接免疫荧光和全基因组测序等试验,分离鉴定到1株FPV,命名为FPVBJ-CP/2022株。对决定病毒宿主范围和抗原性的VP2基因系统进化树分析表明,分离株与FPVJF-3株、FPVBeijing-01/2018聚为一支,与FPV疫苗株、CPV群亲缘关系较远。VP2蛋白主要功能位点分析结果显示,VP2蛋白中决定病毒抗原性和宿主嗜性的10个关键位点氨基酸均未发生突变,但该分离株的VP2蛋白序列与GenBank其他FPV毒株的VP2蛋白相比,91位氨基酸由丙氨酸(A)突变为丝氨酸(S),505位氨基酸由天冬酰胺(N)突变为天冬氨酸(D),该突变是否对FPVBJ-CP/2022株VP2蛋白的功能和生物学特性造成改变,有待于进一步研究。论文通过对毒株的遗传变异分析,为更好地预防和控制FPV感染提供了研究基础。 展开更多
关键词 猫泛白细胞减少症病毒 分离 鉴定 VP2基因 遗传进化分析
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北京市猪场猪圆环病毒3型感染状况调查及其ORF2基因遗传进化分析 被引量:3
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作者 李蕊 王林 +9 位作者 何伟勇 薛水玲 赵景义 傅彩霞 石英男 冯小宇 程敏姮 李栋梁 梅力 郑博君 《中国兽药杂志》 2020年第1期1-8,共8页
为了解猪圆环病毒3型(PCV3)在北京市不同区县猪场中的流行情况,研究建立PCR检测方法,对来自北京市8个区县56个养殖场的1177份临床样品进行检测,并对获得的部分ORF2全基因序列进行遗传进化分析。结果显示,PCV3总体阳性率为1.0%(12/1177)... 为了解猪圆环病毒3型(PCV3)在北京市不同区县猪场中的流行情况,研究建立PCR检测方法,对来自北京市8个区县56个养殖场的1177份临床样品进行检测,并对获得的部分ORF2全基因序列进行遗传进化分析。结果显示,PCV3总体阳性率为1.0%(12/1177),猪场阳性率为8.9%(5/56)。对PCV3阳性样本进行ORF2基因测序及同源性比对,共测得12株PCV3 ORF2全长基因序列,其中包括6株不同的ORF2全长基因序列。结果显示,该6株序列之间的核苷酸相似性为97.7%~99.5%,推导氨基酸序列的相似性为97.2%~100%;与参考毒株之间的核苷酸同源性为96.0%~99.5%,推导氨基酸同源性为92.1%~100.0%;进化树显示北京毒株属于PCV3b基因型。试验表明,PCV3在北京多个猪场呈现一定的流行趋势,流行毒株以PCV3b基因型为主。 展开更多
关键词 猪圆环病毒3型 PCR检测 ORF2基因 遗传进化分析
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犬瘟热病毒实时荧光RT-RPA检测方法的建立及应用 被引量:3
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作者 张启龙 傅彩霞 +6 位作者 张玮 高晓龙 王林 程敏姮 郑雪莹 刘海莹 周德刚 《动物医学进展》 北大核心 2020年第11期19-23,共5页
为建立犬瘟热病毒(CDV)临床快速检测方法,针对CDV保守N基因依据重组酶聚合酶等温扩增(RPA)引物设计原理进行RPA引物探针设计,通过反应条件优化、敏感性试验、特异性试验和临床样品检测,建立了CDV实时荧光RT-RPA检测方法。结果显示,反应... 为建立犬瘟热病毒(CDV)临床快速检测方法,针对CDV保守N基因依据重组酶聚合酶等温扩增(RPA)引物设计原理进行RPA引物探针设计,通过反应条件优化、敏感性试验、特异性试验和临床样品检测,建立了CDV实时荧光RT-RPA检测方法。结果显示,反应体系中M-MLV反转录酶最适浓度为4 U/μL,所建CDV实时荧光RT-RPA检测方法特异性较好,敏感性最低可检测到5.68×102 copies/μL,高于国标RT-PCR(GB/T 27532-2011)检测方法。建立的CDV实时荧光RT-RPA检测方法具有较高的敏感性和特异性、操作简便、20 min内判定结果,可用于临床犬瘟热快速诊断,对犬瘟热的防控具有重要意义。 展开更多
关键词 犬瘟热病毒 实时荧光 反转录-重组酶聚合酶等温扩增 检测
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犬细小病毒可视化LAMP检测方法的建立与应用 被引量:1
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作者 潘珺 程敏姮 +7 位作者 张启龙 张玮 吴迪 宋彦军 刘晓冬 周德刚 王林 韦海涛 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2020年第8期28-31,I0004,共5页
为建立一种快速简便、灵敏度高、准确性好的犬细小病毒环介导等温扩增(LAMP)可视化检测方法,本研究根据犬细小病毒(CPV)的VP2基因保守区域设计特异性引物,通过优化引物浓度、反应温度、反应时间,建立了犬细小病毒LAMP可视化快速检测方... 为建立一种快速简便、灵敏度高、准确性好的犬细小病毒环介导等温扩增(LAMP)可视化检测方法,本研究根据犬细小病毒(CPV)的VP2基因保守区域设计特异性引物,通过优化引物浓度、反应温度、反应时间,建立了犬细小病毒LAMP可视化快速检测方法。结果显示,该方法在63℃条件下恒温扩增60 min具有良好的敏感性和特异性,其最低检测限为10拷贝/μL,与犬瘟热病毒、犬冠状病毒、狂犬病病毒、犬流感病毒均无交叉反应。对200份临床样品进行检测,检出阳性样品21份,与实时荧光定量PCR检测结果符合率为100%。该方法无需特殊设备,肉眼即可直接观察检测结果,具有高效、简便、特异性好、灵敏度高等优点,适用于犬细小病毒现场快速诊断。 展开更多
关键词 犬细小病毒 环介导等温扩增 可视化 快速检测
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Hepatitis associated with hepatitis B virus in broilers
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作者 ZHAO Yue MAO Jing-jing +8 位作者 SHE Rui-ping HU Feng-jiao Majid H Soomro LIANG Rui-ping YANG Yi-fei DU Fang WANG Tong-tong GUO Zhao-jie cheng min-heng 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2016年第1期191-199,共9页
Infection by hepatitis B virus (HBV) results in acute and chronic liver damages in humans. Liver products of broilers as a primary food consumed in our daily life have a close connection with public health. The prev... Infection by hepatitis B virus (HBV) results in acute and chronic liver damages in humans. Liver products of broilers as a primary food consumed in our daily life have a close connection with public health. The prevalence of the virus in livers and serum of broilers is of great significance, owning to the potential transmission between chickens and humans. Liver tissues and serum samples were tested to investigate the prevalence of hepatitis B virus infection in slaughtered broilers, for expression of HBV antigens and antibodies. The distribution and positive rate of hepatitis B surface antigen (HBsAg), hepatitis B core antigen (HBcAg) and hepatitis B e antigen (HBeAg) in liver samples were examined using immunohistochemistry. HBsAg was mainly located in the cytoplasm of hepatocytes with a positivity of 81.61% whereas HBeAg and HBcAg were primarily located in the nucleus of hepatocytes with a positivity of 40.13 and 49.10%, respectively. Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) analysis of serum for HBV serological markers demonstrated a high prevalence of hepatiits B surface antibody (HBsAb, 54.91%) and hepatitis B core antibody (HBcAb, 27.68%), whereas HBeAb, HBsAg and HBeAg were rarely detectable. Classic hepatitis pathological changes, including swollen hepatocytes, focal parenchymal necrosis, lymphocytic infiltration and hyperplasia of fibrous connective tissues were observed using histopathological analysis. Some of the liver samples were found positive for HBV DNA using nested PCR. Sequence comparison confirmed that all sequences shared 97.5-99.3% identity with human HBV strains. These results demonstrated the existence of HBV in livers and serums of broilers. Animals or animal products contaminated with HBV could raise an important public health concern over food safety and zoonotic risk. 展开更多
关键词 BROILERS hepatitis B virus detection prevalence investigation
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