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基于线粒体COⅠ和Cytb基因探讨北鲍南养对皱纹盘鲍群体遗传结构的影响
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作者 吴宙 周丽青 +6 位作者 迟长凤 吴彪 孙秀俊 刘志鸿 赵丹 于涛 郑言鑫 《水产学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期110-120,共11页
为探讨近三十年来我国皱纹盘鲍养殖模式对群体遗传结构产生的影响,利用线粒体细胞色素C氧化酶亚基(COⅠ)基因和细胞色素b(Cytb)基因分析了定殖漳州的群体、大连培育蓬莱越冬群体、荣成培育福建越冬群体及长山列岛(砣矶岛、大钦岛、南隍... 为探讨近三十年来我国皱纹盘鲍养殖模式对群体遗传结构产生的影响,利用线粒体细胞色素C氧化酶亚基(COⅠ)基因和细胞色素b(Cytb)基因分析了定殖漳州的群体、大连培育蓬莱越冬群体、荣成培育福建越冬群体及长山列岛(砣矶岛、大钦岛、南隍城岛)皱纹盘鲍群体的遗传多样性与群体遗传结构。结果显示,在259个个体730 bp的COⅠ序列片段中检测到48个变异位点和30个单倍型,6个群体的单倍型多样性为0.586~0.897,核苷酸多样性为0.0056~0.0081。259个个体730 bp的Cytb序列片段中检测到59个变异位点和32个单倍型,6个群体的单倍型多样性为0.605~0.909,核苷酸多样性为0.0077~0.0120。基于COⅠ和Cytb基因的群体间Fst值以及AMOVA结果表明,绝大部分群体之间存在显著的遗传分化,并且遗传变异主要来源于群体内。现行的皱纹盘鲍北鲍南养模式加强了不同群体之间的基因交流,使不同遗传背景的种群二次接触,导致皱纹盘鲍6个群体均具有较高的单倍型多样性和核苷酸多样性;而各养殖群体中的不同选育条件则可能是造成显著遗传分化的重要原因。本研究对分属南北沿海的6个皱纹盘鲍群体的遗传评估将为我国皱纹盘鲍资源的合理利用以及养殖模式对遗传结构的影响提供科学依据。 展开更多
关键词 皱纹盘鲍 细胞色素C氧化酶亚基基因 细胞色素B基因 遗传多样性 遗传结构
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Identification and Expression Profile of a Neuropeptide LFRFamide-Like Gene During Different Stages of Gonadal Development in the Cephalopod Sepia pharaonis
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作者 QIU Jiayin SUN Lianlian +3 位作者 LI Shuang ZHOU Xu chi changfeng ZHENG Libing 《Journal of Ocean University of China》 CAS CSCD 2024年第2期499-508,共10页
Neuropeptides are widely distributed in vertebrates and invertebrates,regulating a variety of physiological activities in the organisms,such as metabolism,feeding and reproduction.In this study,to explore the function... Neuropeptides are widely distributed in vertebrates and invertebrates,regulating a variety of physiological activities in the organisms,such as metabolism,feeding and reproduction.In this study,to explore the function of neuropeptide LFRFamide in Sepia pharaonis,the full-length cDNA of LFRFamide-like gene(named SpLFRFL,MG869822.1)was identified with rapid amplification of cDNA ends(RACE)method.The sequence of SpLFRFL was 860 bp in length and encoded 188 amino acids containing 4 different mature peptides:1 copy of PHTPFRFamide,NSLFRFamide,TIFRFamide,and 3 copies of GNLFRFamide.Multiple alignment and phylogenetic analysis results showed that SpLFRFL shared high identity with LFRFamides of Sepia officinalis and Sepiella japonica and had the closest relationship with them.Through quantitative Real-time PCR(qRT-PCR),it was found that the SpLFRFL gene was highly expressed in the optic lobe and brain at three different stages during gonad development in both genders.Moreover,the four mature peptides at a concentration of 0.01μmol L^(−1) could inhibit the protein synthesis in the Chinese hamster ovary cell strain-K1(CHOK1)induced by SpGnRH.These data suggest that SpLFRFL might be involved in the development and reproduction of S.pharaonis.The results can contribute to future studies on neuropeptide evolution and function and benefit the cuttlefish farming. 展开更多
关键词 NEUROPEPTIDE LFRFamide-like CEPHALOPOD CUTTLEFISH Sepia pharaonis development REPRODUCTION
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探地雷达散射矩阵在估算地下管线方位角的应用 被引量:3
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作者 陈筠 池昌峰 +1 位作者 徐东升 梁风 《中国岩溶》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期101-109,共9页
文章分析了探地雷达与电磁场的入射和散射相关的散射矩阵S的性质,散射矩阵中的四个元素提供了入射波场不同极化方向对应的信息,基于此,利用散射矩阵S的Alford旋转,估算细长目标体的方位角。由于低振幅和噪声等缘故,实际上角度的估算是... 文章分析了探地雷达与电磁场的入射和散射相关的散射矩阵S的性质,散射矩阵中的四个元素提供了入射波场不同极化方向对应的信息,基于此,利用散射矩阵S的Alford旋转,估算细长目标体的方位角。由于低振幅和噪声等缘故,实际上角度的估算是一个不稳定的过程,因此,选择使用范数作为筛选最佳振幅的工具,使角度的估算更加准确和稳定。利用埋在均匀半空间内的金属管的三维模型所得到的模拟数据,对该方法进行了测试,在选择合适的振幅时,确定Frobenius范数‖S‖F≥0.1·‖S‖F(max)的标准,结果表明,估算地下管线方位角的方法是有效的。 展开更多
关键词 地质雷达 散射矩阵 极化 Alford旋转
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Isolation via enrichment and characterization of ten polymorphic microsatellite loci in the cuttlefish, Sepiella maindroni de Rochebruns 被引量:6
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作者 WU Changwen chi changfeng +2 位作者 HE Guangyuan LU Zhenming XU Meiying 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2010年第6期121-124,共4页
Ten novel polymorphic microsatellite loci were developed using an enrichment and colony hybridization protocol and characterized for the cuttlefish,Sepiella maindroni.Polymorphism was explored by using 30 individuals ... Ten novel polymorphic microsatellite loci were developed using an enrichment and colony hybridization protocol and characterized for the cuttlefish,Sepiella maindroni.Polymorphism was explored by using 30 individuals from the coastal waters of Zhanjiang,Guangdong province,China,in December 2007.The number of alleles ranged from 5 to 13.The ranges of observed and expected heterozygosity were from 0.578 9 to 1.000 0 and 0.682 8 to 0.925 7,respectively,and the average polymorphic information content (P IC) was 0.778 5.These microsatellite loci will certainly facilitate the detection of the genetic variation and population structure of S.maindroni. 展开更多
关键词 SepieUa maindroni microsatellite DNA CUTTLEFISH genetic variation
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曼氏无针乌贼精子鞭毛蛋白1(Spef1)基因克隆以及组织表达特异性
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作者 周林 李颖 +3 位作者 吕振明 迟长凤 吴常文 史会来 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期1189-1198,共10页
为研究精子鞭毛蛋白1(Spef1)在精子鞭毛结构的形成与组装中的生物学意义及功能,本研究采用RACE技术和荧光定量PCR技术对曼氏无针乌贼Spef1(简称Sj Spef1)基因cD NA全长进行克隆和组织表达特异性分析。结果显示,SjS pef1 cD NA全长序列共... 为研究精子鞭毛蛋白1(Spef1)在精子鞭毛结构的形成与组装中的生物学意义及功能,本研究采用RACE技术和荧光定量PCR技术对曼氏无针乌贼Spef1(简称Sj Spef1)基因cD NA全长进行克隆和组织表达特异性分析。结果显示,SjS pef1 cD NA全长序列共1 135 bp,5′和3′非编码区分别为178 bp和165 bp,预测的开放阅读框(ORF)全长792 bp。编码的蛋白理论分子量为30.567 7 ku,等电点7.03,是一种亲水性蛋白。不存在跨膜区以及信号肽序列,是在细胞内发挥作用的蛋白。二级结构分析发现该蛋白含有丰富的螺旋结构(49%)。氨基酸同源建模显示其蛋白的CH2结构域主要由4个螺旋结构组成,并由多个loop结构串联而成。同源氨基酸序列比对发现,它与加州双斑蛸的相似性最高且仅为59.49%,表明Spef1在进化中并不保守。基于Spef1氨基酸序列构建的系统进化分析表明,曼氏无针乌贼和加州双斑蛸进化关系最近。组织特异性分析表明Spef1在曼氏无针乌贼的精巢中有显著表达。Spef1基因的成功克隆以及组织表达特异性分析对于深入研究其细胞定位以及生物学功能具有重要意义。 展开更多
关键词 曼氏无针乌贼 Spef1 CDNA 生物信息学 荧光定量PCR
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玻璃管动物标签标志曼氏无针乌贼幼体的效果初探
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作者 董智勇 刘立芹 +4 位作者 龚理 刘炳舰 江丽华 迟长凤 吕振明 《中国渔业质量与标准》 2019年第5期17-22,共6页
近年来,随着苗种繁育技术的突破,曼氏无针乌贼大规模增殖放流工作已在中国沿海迅速展开,但至今中国尚不能对增殖放流活动的实际效果进行准确评估,建立适于曼氏无针乌贼( Sepiella japonica )的增殖放流标志方法是准确评估增殖放流效果... 近年来,随着苗种繁育技术的突破,曼氏无针乌贼大规模增殖放流工作已在中国沿海迅速展开,但至今中国尚不能对增殖放流活动的实际效果进行准确评估,建立适于曼氏无针乌贼( Sepiella japonica )的增殖放流标志方法是准确评估增殖放流效果的重要前提。本研究采用玻璃管动物标签法对曼氏无针乌贼幼体进行了标志,并对该标志的有效性、保持率及其对乌贼行为、生长及存活率的影响进行了评估。结果表明:将玻璃管动物标签植入内壳包膜后,可在乌贼幼体(胴长2.63~2.88 cm)背部标签所在位置形成明显的隆起,可直接通过肉眼或标签阅读器进行准确快速识别;室内养殖条件下,50 d后乌贼标志的保存率达100%;标志后乌贼行为活动正常,并仍保持较快的生长速度,50 d内即达到成体规格并达性成熟,其瞬时生长率达5.93 %/d;标志乌贼的全长、胴长、胴宽、体重、壳长、壳宽和壳重等生长参数上均与对照组无显著差别( P >0.05);标志乌贼实验期内的累计存活率达78.85%,与对照组相比无显著差别( P >0.05)。研究认为,玻璃管动物标签是一种易识别、低损伤、保持率高的理想增殖标志,可有效运用于曼氏无针乌贼的大规模标志放流及增殖效果评估过程。本研究可为曼氏无针乌贼及其他头足类水产动物种质资源保护提供方法支持。 展开更多
关键词 曼氏无针乌贼 幼体 玻璃管动物标签 标志方法 增殖放流 生长 存活率 保持率
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