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大鼠肝再生的肝细胞周期启动及终止中骨髓瘤基因mRNA与其他非编码RNA的表达变化与作用
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作者 薛奇杰 常翠芳 +6 位作者 王子慧 臧夏炎 林凯琳 张春博 韩璐 叶丙雨 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期414-419,共6页
目的 了解大鼠肝再生(LR)0 h、6 h和72 h时骨髓瘤基因(MYC)及其mRNA相互作用的微小RNA(miRNA)和环状RNA(circRNA)调节肝细胞周期启动及终止的途径与方式。方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,... 目的 了解大鼠肝再生(LR)0 h、6 h和72 h时骨髓瘤基因(MYC)及其mRNA相互作用的微小RNA(miRNA)和环状RNA(circRNA)调节肝细胞周期启动及终止的途径与方式。方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量检测技术测定大鼠肝再生中肝细胞的mRNA、miRNA和circRNA[合称内源竞争RNA(ceRNA)]表达变化,用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网,用ceRNA综合分析等方法解析它们的表达相关性和作用相关性。结果 在PH后肝细胞周期启动0~6 h间的0 h和6 h时,MYC mRNA的比值为0.15±0.03和2.36±0.2,miR-134-5p为3.22±0.61和0.08±0.02,circRNA_12112为0.68±0.21和13.35±3.53。同时,PH后0 h时,MYC促进的细胞周期启动相关基因Ras关联域家族成员1(RASSF1)、细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、超氧化物歧化酶2(SOD2)表达下调,抑制的细胞周期启动相关基因嵌套蛋白(NES)、雷达21黏附复合物成分(RAD21)、CUE域包含2(CUEDC2)未发生有意义表达变化。PH后6 h时,MYC促进的细胞周期启动相关基因SOD2表达上调,抑制的细胞周期启动相关基因NES、RAD21、CUEDC2表达下调。相反,在细胞周期终止,即PH后72 h时,MYC mRNA的比值为0.30±0.10,miR-880-3p为0.54±0.01,circRNA_09599为0.54±0.16。同时,MYC促进的细胞周期终止相关基因肝细胞生长因子(HGF)表达上调,抑制的细胞周期终止相关基因MET原癌基因受体酪氨酸激酶(MET)和细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A(CDKN1A)表达下调。结论 上述circRNA抑制的miRNA、miRNA抑制的MYC mRNA以及MYC调节的细胞周期启动及终止相关基因的表达相关性和作用相关性有利于PH后6 h时肝细胞处于细胞周期启动状态和PH后72 h时肝细胞处于细胞周期终止状态。 展开更多
关键词 肝再生 肝细胞周期启动 肝细胞周期终止 生物高通量检测 大鼠
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大鼠肝再生中环状RNA的表达变化及其对细胞增殖的调节作用
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作者 郭学强 郭建林 +3 位作者 靳伟 常翠芳 徐存拴 陈广文 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期216-224,共9页
目的探讨环状RNA(circRNA)在大鼠肝再生中的表达变化及其对细胞增殖的调节作用。方法用生物高通量检测方法分析114只2/3肝切除大鼠诱导的大鼠肝再生中circRNA的表达变化,用miRanda和Target Scan网站分析大鼠肝再生的靶微小RNA(miRNA)及... 目的探讨环状RNA(circRNA)在大鼠肝再生中的表达变化及其对细胞增殖的调节作用。方法用生物高通量检测方法分析114只2/3肝切除大鼠诱导的大鼠肝再生中circRNA的表达变化,用miRanda和Target Scan网站分析大鼠肝再生的靶微小RNA(miRNA)及其mRNA,用基因本体论(GO)和IPA软件分析大鼠肝再生涉及的生理活动和信号通路,用Cytoscape v3.0.2软件构建大鼠肝再生的相互作用网络,用表达模式结合靶miRNA数量和功能挑选候选关键circRNA。结果在大鼠再生肝材料中检测到20878个circRNA,其中,560个发生差异表达,它们中的126个能与117个靶miRNA结合,后者调节6510个下游靶mRNA。这些靶mRNA涉及细胞增殖、应激反应、物质代谢等生理活动和转化生长因子β(TGF-β)、蛋白激酶A(PKA)、Wnt/β-连环蛋白(β-catenin)等信号通路。其中,circRNA03651、circRNA03653、circRNA04500、circRNA05865、circRNA11274、circRNA13559等6种circRNA可能通过12种miRNA调节15种mRNA进而在大鼠肝再生涉及的细胞增殖中发挥作用,视为大鼠肝再生的候选关键circRNA。结论大鼠肝再生中560个circRNA发生差异表达,其中circRNA03651、circRNA03653、circRNA04500、circRNA05865、circRNA11274、circRNA13559等6种circRNA通过12种miRNA和15种mRNA的相互作用网络支配大鼠肝再生涉及的细胞增殖。 展开更多
关键词 肝再生 细胞增殖 竞争性内源RNA网络 环状RNA 生物高通量检测 大鼠
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大鼠肝再生启动阶段肝细胞CCAAT增强子结合蛋白α mRNA、微小RNA-144-3p和3种环状RNA的表达和作用 被引量:8
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作者 臧夏炎 王子慧 +4 位作者 李亚霏 郭建林 靳伟 常翠芳 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期901-908,共8页
目的了解大鼠肝再生启动阶段CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPα)mRNA、微小RNA(miR)-144-3p、rno-LOC100365958_0001、rno-Usp3_0010和rno-AC241873_0010调节肝细胞处于G_(0)期还是G_(1)期的途径和方法。方法按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切... 目的了解大鼠肝再生启动阶段CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPα)mRNA、微小RNA(miR)-144-3p、rno-LOC100365958_0001、rno-Usp3_0010和rno-AC241873_0010调节肝细胞处于G_(0)期还是G_(1)期的途径和方法。方法按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量分析技术检测大鼠肝再生中肝细胞竞争性内源RNA(ceRNA)表达的变化,用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网络,用ceRNA综合分析等方法解析它们表达的相关性和作用相关性。结果PH后0 h和6 h时,CEBPαmRNA的比值为4.88±0.78和1.12±0.27,miR-144-3p为1.30±0.11和2.97±0.81,rno-LOC100365958_0001为6.99±0.55和0.16±0.05,rnoUsp3_0010为8.48±0.67和0.13±0.01,rno-AC241873_0010为11.85±0.93和0.09±0.02。CEBPα促进的G_(0)期相关基因细胞周期蛋白依赖性激酶2相关蛋白2(CDK2AP2)为2.55±0.42和0.74±0.11,G_(0)/G_(1)开关2(G_(0)S2)为3.85±0.23和0.64±0.08,信号转导子和转录激活因子1(STAT1)为2.57±0.13和1.32±0.13,转化生长因子β受体2(TGFBR2)为2.77±0.20和0.79±0.13,抑制的G_(0)期相关基因细胞周期蛋白依赖性激酸酶抑制剂1a(CDKN1a)为0.39±0.07和0.93±0.15。CEBPα促进的G_(1)期相关基因细胞周期蛋白G2(CCNG2)为1.19±0.09和0.25±0.06,抑制的G_(1)期相关基因ETS变异转录因子6(ETV6)为0.77±0.05和2.22±0.68,血红蛋白加氧酶1(HMOX1)为1.05±0.21和4.57±0.88,MAPK14为1.01±0.15和2.01±0.32,STAT3为0.74±0.15和2.88±0.24,肿瘤坏死因子(TNF)为0.80±0.14和2.29±0.51。结论PH后0 h时,CEBPαmRNA上调,有利于CEBPα促进的G_(0)期相关基因表达和肝细胞处于G_(0)期。相反,PH后6 h时,rno-LOC100365958_0001、rno-Usp3_0010、rno-AC241873_0010和miR-144-3p的相互作用加强了后者对CEBPαmRNA的抑制,不利于CEBPα形成,有利于CEBPα抑制的G_(1)期相关基因表达和肝细胞处于G_(1)期。 展开更多
关键词 部分肝切除 肝再生 G_(0)期肝细胞 G_(1)期肝细胞 CCAAT增强子结合蛋白α 竞争性内源RNA综合分析 生物高通量检测 大鼠
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大鼠肝再生终止阶段肝细胞CCAAT增强子结合蛋白α mRNA、微小RNA-144-3p和3种环状RNA的表达和作用
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作者 臧夏炎 王子慧 +4 位作者 高寒 郭建林 靳伟 常翠芳 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期909-912,共4页
目的了解大鼠肝再生终止阶段CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPα)mRNA、miR-144-3p、rnoLOC100365958_0001、rno-Usp3_0010和rno-AC241873_0010调节肝细胞进入G_(1)期的途径和方法。方法按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsro... 目的了解大鼠肝再生终止阶段CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPα)mRNA、miR-144-3p、rnoLOC100365958_0001、rno-Usp3_0010和rno-AC241873_0010调节肝细胞进入G_(1)期的途径和方法。方法按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量分析技术检测大鼠肝再生中肝细胞竞争性内源RNA(ceRNA)表达的变化,用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网络,用ceRNA综合分析等方法解析它们表达的相关性和作用相关性。结果PH后6 h和72 h时,CEBPαmRNA的比值为1.12±0.27和2.52±0.15,miR-144-3p为2.97±0.81和0.99±0.36,rno-LOC100365958_0001为0.16±0.05和6.78±0.62,rnoUsp3_0010为0.13±0.01和7.61±0.69,rno-AC241873_0010为0.09±0.02和7.53±0.69。CEBPα促进的G_(1)期相关基因细胞周期蛋白G2(CCNG2)为0.25±0.06和1.10±0.22,抑制的G_(1)期相关基因ETS变异转录因子6(ETV6)为2.22±0.68和0.99±0.27,MAPK14为2.01±0.32和0.85±0.11,信号转导子和转录激活因子3(STAT3)为2.88±0.24和1.08±0.07,肿瘤坏死因子(TNF)为2.29±0.51和0.86±0.51。CEBPα促进的G_(0)期相关基因G_(0)/G_(2)期开关2(G_(0)S2)为0.64±0.08和4.71±0.91,磷脂酶A2-IVA(PLA2G4A)为0.42±0.13和2.83±0.62。结论PH后6 h时,rno-LOC100365958_0001、rno-Usp3_0010、rno-AC241873_0010和miR-144-3p的相互作用加强了后者对CEBPαmRNA的抑制,不利于CEBPα形成,有利于CEBPα抑制的G_(1)期相关基因表达和肝细胞处于G_(1)期。相反,PH后72 h时,CEBPαmRNA上调,有利于CEBPα促进G_(0)期相关基因表达和肝细胞处于G_(0)期。 展开更多
关键词 部分肝切除 肝再生 G_(0)期肝细胞 G_(1)期肝细胞 CCAAT增强子结合蛋白α 生物高通量检测 竞争性内源RNA综合分析 大鼠
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大鼠肝再生启动阶段肝细胞CCAAT增强子结合蛋白ζ mRNA、微小RNA-136-3p和4种环状RNA的表达和作用
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作者 高寒 王子慧 +4 位作者 臧夏炎 靳伟 常翠芳 郭建林 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期921-924,共4页
目的了解大鼠肝再生启动阶段CCAAT增强子结合蛋白ζ(CEBPζ)mRNA、miR-136-3p、rno-Got1_0001、rno-Crebrf_0009、rno-Slc38a9_0001和rno-LOC100362999_0001调节肝细胞处于G_(0)期还是G_(1)期的途径和方法。方法按Higgins等方法制备大鼠... 目的了解大鼠肝再生启动阶段CCAAT增强子结合蛋白ζ(CEBPζ)mRNA、miR-136-3p、rno-Got1_0001、rno-Crebrf_0009、rno-Slc38a9_0001和rno-LOC100362999_0001调节肝细胞处于G_(0)期还是G_(1)期的途径和方法。方法按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量分析技术检测大鼠肝再生中肝细胞的ceRNA表达变化,用Cytoscape 3.2软件构建竞争性内源RNA(ceRNA)的相互作用网络,用ceRNA综合分析等方法解析它们表达的相关性和作用相关性。结果PH后0 h和6 h时,CEBPζmRNA的比值为0.97±0.15和2.56±0.12,miR-136-3p为1.05±0.32和0.38±0.04,rno-Got1_0001为0.33±0.03和4.35±0.78,rnoCrebrf_0009为1.17±0.32和2.99±0.28,rno-Slc38a9_0001为0.67±0.08和2.64±0.29,rno-LOC100362999_0001为0.25±0.02和0.92±0.22。CEBPζ抑制的G_(0)期相关基因细胞周期蛋白依赖性激酶2相关蛋白2(CDK2AP2)为2.55±0.42和0.74±0.11,myb1膜运输蛋白的靶标(TOM1)为2.80±0.91和1.40±0.36,含缬草肽蛋白质(VCP)为2.63±0.17和1.10±0.10。CEBPζ促进的G_(1)期相关基因c AMP响应元件结合蛋白3样4(CREB3L4)为1.13±0.63和2.00±0.81,硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)为1.03±0.07和2.50±0.19。结论PH后0 h时,CEBPζmRNA未上调,有利于CEBPζ抑制G_(0)期相关基因的表达和肝细胞处于G_(0)期。相反,PH后6 h时,rno-Got1_0001、rno-Crebrf_0009、rnoSlc38a9_0001、rno-LOC100362999_0001和miR-136-3p的相互作用解除了后者对CEBPζmRNA的抑制,有利于CEBPζ的形成,有利于CEBPζ促进G_(1)期相关基因的表达和肝细胞处于G_(1)期。 展开更多
关键词 肝再生 G_(0)期肝细胞 G_(1)期肝细胞 CCAAT增强子结合蛋白ζ 竞争性内源RNA综合分析 生物高通量检测 大鼠
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大鼠肝再生启动阶段肝细胞CCAAT增强子结合蛋白δ mRNA、微小RNA-3553和rno-Acad8_0002的表达和作用
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作者 李亚霏 王子慧 +4 位作者 臧夏炎 靳伟 常翠芳 郭建林 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期917-920,共4页
目的了解大鼠肝再生启动阶段CCAAT增强子结合蛋白δ(CEBPδ)mRNA、miR-3553和rno-Acad8_0002调节肝细胞处于G_(0)期还是G_(1)期的途径和方法。方法按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量... 目的了解大鼠肝再生启动阶段CCAAT增强子结合蛋白δ(CEBPδ)mRNA、miR-3553和rno-Acad8_0002调节肝细胞处于G_(0)期还是G_(1)期的途径和方法。方法按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量分析技术检测大鼠肝再生中肝细胞竞争性内源RNA(ceRNA)表达的变化,用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网络,用ceRNA综合分析等方法解析它们表达和作用的相关性。结果PH后0 h和6 h时,CEBPδmRNA的比值为0.40±0.08和2.15±0.24,miR-3553为2.53±0.47和1.17±0.31,rno-Acad8_0002为1.24±0.04和2.66±0.54。CEBPδ抑制的G_(0)期相关基因转化生长因子β受体2(TGFBR2)为2.77±0.20和0.79±0.13,磷脂酶A2-IVA(PLA2G4A)为2.56±0.76和0.42±0.13。CEBPδ促进的G_(1)期相关基因纤溶酶原激活剂尿激酶受体(PLAUR)为0.27±0.08和2.62±0.31,丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)为1.01±0.15和2.01±0.32,ETS变异转录因子6(ETV6)为0.77±0.05和2.22±0.68,血红蛋白加氧酶1(HMOX1)为1.05±0.21和4.57±0.88。结论PH后0 h时,CEBPδmRNA下调,有利于CEBPδ抑制的G_(0)期相关基因表达和肝细胞处于G_(0)期。相反,PH后6 h时,rno-Acad8_0002和miR-3553的相互作用解除了后者对CEBPδmRNA的抑制,有利于CEBPδ形成,有利于CEBPδ促进的G_(1)期相关基因表达和肝细胞处于G_(1)期。 展开更多
关键词 肝再生 G_(0)期肝细胞 G_(1)期肝细胞 CCAAT增强子结合蛋白δ 竞争性内源RNA综合分析 生物高通量检测 大鼠
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The role of acupuncture-moxibustion in ovulation induction based on the Chinese Medicine and Acupuncture-moxibustion Databank
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作者 chang cui-fang Zhang Shu-jing +1 位作者 Huang Qin-feng Zhang Cui-hong 《Journal of Acupuncture and Tuina Science》 CSCD 2016年第6期450-456,共7页
Ovulatory dysfunction refers to absent ovulation or luteal insufficiency. It is commonly seen in women with irregular menstruation or menstrual cycles, especially in those with oligomenorrhea or amenorrhea. Ovulatory ... Ovulatory dysfunction refers to absent ovulation or luteal insufficiency. It is commonly seen in women with irregular menstruation or menstrual cycles, especially in those with oligomenorrhea or amenorrhea. Ovulatory dysfunction is considered the single-most frequent cause of female infertility. Clinically, the two major causes of ovulatory dysfunction are polycystic ovarian syndrome(PCOS) and luteinized unruptured follicle syndrome(LUFS). Acupuncture-moxibustion improves ovulation and helps with infertility. Through a systematic review and analysis on relevant literatures in Chinese Medicine and Acupuncture-moxibustion Databank over the last decade, this paper summarized the characteristics and pattern of acupuncture-moxibustion points for improving ovulation in order to provide an optimal acupuncture-moxibustion protocol in this regard. 展开更多
关键词 Acupuncture-moxibustion Therapy Acupuncture Therapy Moxibustion Therapy OVULATION INFERTILITY Female BIBLIOMETRICS
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