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神经轴突再生过程中微小RNA(miRNA)、转录因子和靶基因的网络功能分析(英文)
被引量:
5
1
作者
Li-ning SU
Xiao-qing SONG
+3 位作者
Zhan-xia XUE
chen-qing zheng
Hai-feng YIN
Hui-ping WEI
《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》
SCIE
CAS
CSCD
2018年第4期293-304,共12页
创新点:本研究比较详细地阐明了与神经轴突再生相关的微小RNA(mi RNA)、转录因子和靶基因的相互作用关系,为神经系统疾病的恢复奠定基础。方法:本研究从基因表达综合数据库中获得与轴突再生相关的转录因子和基因数据,利用文献报道及生...
创新点:本研究比较详细地阐明了与神经轴突再生相关的微小RNA(mi RNA)、转录因子和靶基因的相互作用关系,为神经系统疾病的恢复奠定基础。方法:本研究从基因表达综合数据库中获得与轴突再生相关的转录因子和基因数据,利用文献报道及生物信息学数据库预测的方法筛选与轴突再生相关的基因靶向mi RNA。利用生物信息学方法分析了三者之间的网络作用关系,预测了在相互作用网络中发挥重要作用的节点。最后对目标基因的基因本体(GO)功能进行了富集。结论:通过分析,初步筛选了与神经轴突再生相关的51个mi RNA、27个转录因子和59个靶标基因。进一步分析得到359对前馈环路,在此基础上推测了神经轴突再生过程中发挥重要作用的7个核心基因(Nap1l1、Arhgef12、Sema6d、Akt3、Trim2、Rab11fip2和Rps6ka3),6个miRNA(hsa-miR-204-5p、hsa-miR-124-3p、hsa-miR-26a-5p、hsamiR-16-5p、hsa-miR-17-5p和hsa-miR-15b-5p)和8个转录因子(Smada2、Fli1、Wt1、Sp6、Sp3、Smad4、Smad5和Creb1)。
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关键词
转录因子
MIRNA
靶基因
神经轴突
网络分析
原文传递
题名
神经轴突再生过程中微小RNA(miRNA)、转录因子和靶基因的网络功能分析(英文)
被引量:
5
1
作者
Li-ning SU
Xiao-qing SONG
Zhan-xia XUE
chen-qing zheng
Hai-feng YIN
Hui-ping WEI
机构
Department of Basic Medicine
Department of Pharmacy
Shenzhen Real Omics (Biotech) Co.
出处
《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》
SCIE
CAS
CSCD
2018年第4期293-304,共12页
基金
Project supported by the Key Project of Hebei North University(No.120177)
the Science and Technology Bureau Research Development Plan of Zhangjiakou City in Hebei(No.0911021D-4)
China
文摘
创新点:本研究比较详细地阐明了与神经轴突再生相关的微小RNA(mi RNA)、转录因子和靶基因的相互作用关系,为神经系统疾病的恢复奠定基础。方法:本研究从基因表达综合数据库中获得与轴突再生相关的转录因子和基因数据,利用文献报道及生物信息学数据库预测的方法筛选与轴突再生相关的基因靶向mi RNA。利用生物信息学方法分析了三者之间的网络作用关系,预测了在相互作用网络中发挥重要作用的节点。最后对目标基因的基因本体(GO)功能进行了富集。结论:通过分析,初步筛选了与神经轴突再生相关的51个mi RNA、27个转录因子和59个靶标基因。进一步分析得到359对前馈环路,在此基础上推测了神经轴突再生过程中发挥重要作用的7个核心基因(Nap1l1、Arhgef12、Sema6d、Akt3、Trim2、Rab11fip2和Rps6ka3),6个miRNA(hsa-miR-204-5p、hsa-miR-124-3p、hsa-miR-26a-5p、hsamiR-16-5p、hsa-miR-17-5p和hsa-miR-15b-5p)和8个转录因子(Smada2、Fli1、Wt1、Sp6、Sp3、Smad4、Smad5和Creb1)。
关键词
转录因子
MIRNA
靶基因
神经轴突
网络分析
Keywords
Transcription factors
miRNAs
Target genes
Axon
Network analysis
分类号
R49 [医药卫生—康复医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
神经轴突再生过程中微小RNA(miRNA)、转录因子和靶基因的网络功能分析(英文)
Li-ning SU
Xiao-qing SONG
Zhan-xia XUE
chen-qing zheng
Hai-feng YIN
Hui-ping WEI
《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》
SCIE
CAS
CSCD
2018
5
原文传递
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参考文献
引证文献
统计分析
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