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基于单细胞转录组学分析胰岛缺血性损伤分子机制及核心转录因子的鉴定
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作者 董博清 王颖 +7 位作者 王晨鸽 毕焕京 王婧雯 马睿阳 郑瑾 薛武军 丁小明 李杨 《器官移植》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期920-927,共8页
目的探讨胰岛移植损伤过程中的分子机制和细胞间相互作用。方法使用炎症因子处理的小鼠胰岛的单细胞转录组数据,基于Seurat包进行数据处理,并通过整合数据以去除批次效应。根据已知标志物对各个细胞亚群进行注释。基于CellChat包对炎症... 目的探讨胰岛移植损伤过程中的分子机制和细胞间相互作用。方法使用炎症因子处理的小鼠胰岛的单细胞转录组数据,基于Seurat包进行数据处理,并通过整合数据以去除批次效应。根据已知标志物对各个细胞亚群进行注释。基于CellChat包对炎症因子处理组中的细胞互作进行分析,基于细胞表面受体和配体的表达情况推断细胞间的相互作用。使用基因集富集分析明确炎症因子处理后β细胞中富集的生物过程。最后鉴定出差异表达的转录因子,并使用供者胰岛缺血性损伤的微阵列数据集以及蛋白质印迹法进行验证。结果在小鼠胰岛中共发现了7个不同的细胞亚群,其中β细胞占据的比例最大。细胞互作网络分析结果显示,导管细胞与其他细胞之间的相互作用数量和强度最高。基因集富集分析结果显示,炎症因子处理后,β细胞中的免疫反应正向富集,而肽类激素、胆汁酸代谢以及离子稳态下调。在小鼠的单细胞转录和供者胰岛缺血性损伤的微阵列数据集中鉴定出共同的差异转录因子早期生长反应因子1(EGR1)、核因子-κB抑制因子α(NFKBIA)、转录激活因子3(ATF3)。其中,NFKBIA、ATF3表达上调,EGR1表达下调。EGR1蛋白表达量在冷缺血24 h、48 h及72 h后下调。结论EGR1为与胰岛冷缺血密切相关的转录因子,未来的研究应重点探讨EGR1及其下游靶基因的具体机制,以期为胰岛移植的临床治疗提供更有效的策略。 展开更多
关键词 胰岛移植 1型糖尿病 单细胞转录组 细胞通讯 转录因子 冷缺血 早期生长反应因子 转录激活因子
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基于FAERS数据库的儿童实体器官移植受者应用他克莫司相关药物不良事件的研究
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作者 董博清 王婧雯 +5 位作者 毕焕京 陈祖涵 路翠楠 薛武军 李杨 丁小明 《器官移植》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期581-590,共10页
目的探讨他克莫司(Tac)在儿童实体器官移植受者中的不良药物事件(ADE)特征。方法研究数据来源于美国食品与药品监督管理局不良事件报告系统数据库,时间覆盖2004年第1季度至2023年第2季度,提取了以Tac为首要怀疑药物的儿童器官移植受者的... 目的探讨他克莫司(Tac)在儿童实体器官移植受者中的不良药物事件(ADE)特征。方法研究数据来源于美国食品与药品监督管理局不良事件报告系统数据库,时间覆盖2004年第1季度至2023年第2季度,提取了以Tac为首要怀疑药物的儿童器官移植受者的ADE数据,运用比例失衡法对Tac与ADE之间的关联进行定量分析。分析Tac相关ADE的基本特征及信号强度。探究不同年龄儿童及不同移植器官类型的Tac相关ADE。结果共筛选出1443份涉及Tac的儿童ADE报告,其中心脏移植188例(13.0%)、肝移植668例(46.3%)、肾移植531例(36.8%)、肺移植56例(3.9%),儿童的中位年龄为10岁,ADE上报国家的前3位分别是美国、法国及英国,中国上报为26例,占比为1.8%。感染及侵染类疾病在Tac相关ADE报告中占比最高(20.96%),包括EB病毒及巨细胞病毒感染等。不同年龄段儿童的Tac相关ADE中感染及侵染类疾病均占据最大比例,但病原体种类存在差异。排斥反应、免疫抑制水平不稳定以及肾功能损伤也是各年龄段儿童常见的Tac相关ADE。心脏移植受者中以神经系统疾病的ADE为主,而肝移植和肾移植受者中感染及侵染类疾病更为常见,肺移植受者中的ADE以排斥反应最为常见。结论Tac相关ADE在不同器官移植类型中呈现出不同的分布特点,需重视在儿童器官移植中进行个性化药物监测和风险评估,以优化Tac治疗并降低ADE风险。 展开更多
关键词 实体器官移植 儿童 他克莫司 不良药物事件 感染 排斥反应 食物过敏 神经系统疾病
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基于加权基因共表达网络鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型相关基因 被引量:1
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作者 董博清 李杨 +6 位作者 石玉婷 张静 冯新顺 郑瑾 李潇 丁小明 薛武军 《器官移植》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期83-92,共10页
目的鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型表达的相关基因并构建风险模型预测移植肾存活。方法在基因表达综合(GEO)数据库下载肾移植术后的GSE36059及GSE21374数据集。GSE36059包括发生排斥反应和稳定移植物的样本,使用该数据集进行... 目的鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型表达的相关基因并构建风险模型预测移植肾存活。方法在基因表达综合(GEO)数据库下载肾移植术后的GSE36059及GSE21374数据集。GSE36059包括发生排斥反应和稳定移植物的样本,使用该数据集进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异分析筛选差异表达的巨噬细胞M1亚型相关差异表达基因(M1-DEG)。随后将GSE21374数据集(包含了移植物丢失的随访数据)按照7∶3拆分为训练集以及验证集,在训练集中使用最小绝对收缩和选择算法(LASSO)筛选变量构建多因素Cox模型,并评估模型预测移植物存活的能力。使用CIBERSORT分析高、低风险组浸润的免疫细胞的差异,并分析两组间人类白细胞抗原(HLA)相关基因的分布,基因集富集分析(GSEA)用于进一步明确高风险组中富集的生物学过程以及通路。最后使用数据库预测与预后基因互作的微小核糖核酸(miRNA)。结果在GSE36059数据集中,筛选得到14个M1-DEG。在GSE21374数据集中,使用LASSO-Cox回归筛选出Toll样受体8(TLR8)、Fcγ受体1B(FCGR1B)、BCL2相关蛋白A1(BCL2A1)、组织蛋白酶S(CTSS)、鸟苷酸结合蛋白2(GBP2)及半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶招募域家族成员16(CARD16),基于这6个M1-DEG构建多因素Cox模型。风险模型在训练集中预测1年及3年移植物存活的受试者工作特征曲线下面积(AUC)分别为0.918和0.877,在验证集中预测1年及3年移植物存活的AUC分别为0.765及0.736。免疫浸润分析表明,高风险组静息及活化的CD4+记忆T细胞、γδT细胞、巨噬细胞M1亚型浸润增多(均为P<0.05)。高风险组HLAⅠ类基因表达上调。GSEA分析表明,高风险组免疫反应及移植物排斥反应富集。CTSS与8个miRNA相互作用、BCL2A1和GBP2与3个miRNA相互作用、FCGR1B与1个miRNA相互作用。结论本研究基于6个M1-DEG构建的预后风险模型对于预测移植肾存活具有良好的表现,可为早期对高风险受者干预提供依据。 展开更多
关键词 肾移植 排斥反应 移植肾丢失 巨噬细胞 M1亚型 加权基因共表达网络分析 差异表达基因 免疫反应 微小核糖核酸
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核心素养视域下科学思维的内涵及其实现路径 被引量:40
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作者 董博清 彭前程 《课程.教材.教法》 CSSCI 北大核心 2019年第4期84-90,共7页
科学思维是我国中学物理课程目标的重要组成部分,也是物理学科核心素养的核心。本文基于物理学科核心素养的视域,结合物理学科的本质及理论特征,尝试构建了科学思维内涵的结构模型,包括科学思维的目的、内容、过程和方法等。物理教育中... 科学思维是我国中学物理课程目标的重要组成部分,也是物理学科核心素养的核心。本文基于物理学科核心素养的视域,结合物理学科的本质及理论特征,尝试构建了科学思维内涵的结构模型,包括科学思维的目的、内容、过程和方法等。物理教育中实现科学思维的培养,教材编写是一个很重要的方面。 展开更多
关键词 物理学科 核心素养 科学思维 教材编写
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纳米材料在肾移植中的应用研究进展
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作者 栗泽鹏 丁晨光 +2 位作者 郑瑾 董博清 薛武军 《精准医学杂志》 2022年第5期377-382,共6页
随着肾移植技术的发展,精准个体化的治疗已成为众多临床工作者最为关注的问题之一。纳米材料因其具有高靶向、易于编辑等特性为肾脏移植精准化术后评估及不良反应的防治提供了可能,且纳米材料在肾脏移植中的作用也是目前的研究热点之一... 随着肾移植技术的发展,精准个体化的治疗已成为众多临床工作者最为关注的问题之一。纳米材料因其具有高靶向、易于编辑等特性为肾脏移植精准化术后评估及不良反应的防治提供了可能,且纳米材料在肾脏移植中的作用也是目前的研究热点之一。本文就纳米材料在肾脏移植后移植肾脏免疫状态评估、缺血再灌注损伤的预防及免疫抑制剂的靶向给药等方面进行述评。 展开更多
关键词 肾移植 纳米结构 再灌注损伤 免疫抑制剂 精准医学 综述
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新形势下中医药院校研究生流行病学教学改革的分析与探讨
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作者 陈世艺 罗丹 +4 位作者 董柏青 李海 邵凯 秦小玲 黎强 《内科》 2022年第5期587-589,共3页
自2019年末新冠肺炎疫情暴发以来,中医药在我国新冠肺炎疫情防控中发挥了重要的作用。中医药是我国医药卫生事业一面鲜明独特的旗帜,必须加强中医药的传承和创新,而中医院校的研究生教育在其中扮演着极为重要的角色。掌握和应用流行病... 自2019年末新冠肺炎疫情暴发以来,中医药在我国新冠肺炎疫情防控中发挥了重要的作用。中医药是我国医药卫生事业一面鲜明独特的旗帜,必须加强中医药的传承和创新,而中医院校的研究生教育在其中扮演着极为重要的角色。掌握和应用流行病学方法对提高中医药院校研究生临床研究能力具有重要作用。中医药院校研究生科研能力薄弱,传统的流行病学课程教学效果有限。新形势下,如何培养中医药院校研究生的医学科研思维,提高其运用流行病学方法解决实际问题的创新能力,是中医药院校研究生流行病学教学中值得深思和探讨的问题。 展开更多
关键词 中医药院校 研究生 流行病学 教学改革
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合并糖尿病的终末期肾病患者肾移植术后的近期效果分析 被引量:6
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作者 李杨 董博清 +6 位作者 胡筱筠 丁晨光 丁小明 田普训 项和立 郑瑾 薛武军 《中华器官移植杂志》 CAS 北大核心 2020年第8期459-463,共5页
目的探讨合并糖尿病的终末期肾病患者接受死亡后器官捐献(DD)供者供肾移植的近期效果。方法回顾性分析西安交通大学第一附属医院肾移植科70例肾移植的临床资料,根据受者肾移植前是否合并糖尿病将受者分为糖尿病组和对照组。比较两组受... 目的探讨合并糖尿病的终末期肾病患者接受死亡后器官捐献(DD)供者供肾移植的近期效果。方法回顾性分析西安交通大学第一附属医院肾移植科70例肾移植的临床资料,根据受者肾移植前是否合并糖尿病将受者分为糖尿病组和对照组。比较两组受者免疫抑制方案、移植肾功能及血糖的变化。比较两组术后移植肾功能恢复延迟(DGF)、急性排斥反应(AR)、不良反应发生率以及受者和移植肾术后1年的存活情况。结果两组受者肾移植术后DGF、AR、感染发生率及移植肾功能的差异均无统计学意义(P>0.05)。两组间术后1年受者和移植肾的存活率的差异均无统计学意义(P>0.05)。糖尿病组受者术后住院时间、使用环孢素A的受者比例,伤口愈合不良和排尿困难发生率,以及术后1年内血糖水平均显著高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论合并糖尿病的终末期肾病患者肾移植术后易出现伤口愈合不良、排尿困难等并发症,血糖仍高于非糖尿病受者,但术后1年内的移植效果良好。 展开更多
关键词 终末期肾病 合并症 糖尿病 肾移植 预后
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On the decay of higher order derivatives of solutions to Ladyzhenskaya model for incompressible viscous flows 被引量:6
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作者 dong boqing JIANG Wei 《Science China Mathematics》 SCIE 2008年第5期925-934,共10页
This article concerns large time behavior of Ladyzhenskaya model for incompressible viscous flows in ?3. Based on linear L p -L q estimates, the auxiliary decay properties of the solutions and generalized Gronwall typ... This article concerns large time behavior of Ladyzhenskaya model for incompressible viscous flows in ?3. Based on linear L p -L q estimates, the auxiliary decay properties of the solutions and generalized Gronwall type arguments, some optimal upper and lower bounds for the decay of higher order derivatives of solutions are derived without assuming any decay properties of solutions and using Fourier splitting technology. 展开更多
关键词 Ladyzhenskaya model L 2 decay upper and lower bounds 35Q35 76A05
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肾移植术后高水平BK病毒尿症与HLA位点关联分析
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作者 董博清 李杨 +3 位作者 石玉婷 郑瑾 丁小明 薛武军 《中华器官移植杂志》 CAS 2022年第6期321-327,共7页
目的探讨肾移植术后高水平BK病毒(BKV)尿症的时间分布, 以及高水平BKV尿症与临床因素以及供、受者特定人类白细胞抗原(HLA)位点的关联。方法回顾性分析于2017年1月1日至2019年12月31日于西安交通大学第一附属医院行器官捐献供肾肾移植的... 目的探讨肾移植术后高水平BK病毒(BKV)尿症的时间分布, 以及高水平BKV尿症与临床因素以及供、受者特定人类白细胞抗原(HLA)位点的关联。方法回顾性分析于2017年1月1日至2019年12月31日于西安交通大学第一附属医院行器官捐献供肾肾移植的212例受者的资料, 定义肾移植术后尿液BKV-DNA定量大于107(拷贝/ml)尿液为高水平BKV尿症, 选择同期性别组成相同的低于该阈值的212例受者作为低水平对照组。对于两组间临床资料及HLA位点进行统计描述, 使用单因素以及多因素Logistic回归筛选高水平BKV尿症的危险因素。结果肾移植术后受者首次高水平BKV尿症发生时间中位数为125.5 d。在单因素Logistic分析中, 移植肾功能延迟(DGF)以及受者HLA-A24是高水平BKV尿症的危险因素, 供者HLA-DQ9是保护因素。在多因素Logistic分析中, DGF(OR=2.18, 95%CI 1.18~4.01, P=0.012)以及受者HLA-A24(OR=1.63, 95%CI 1.06~2.53, P=0.027)是高水平BKV尿症的独立危险因素, 供者HLA-DQ9(OR=0.58, 95%CI 0.36~0.91, P=0.019)是独立保护因素。结论肾移植术后高水平BKV尿症和供者及受者特定的HLA位点相关, 针对危险因素及保护因素对受者进行早期危险因素分层有助于定制术后免疫抑制剂、筛查方案和开发T淋巴细胞相关疫苗。 展开更多
关键词 肾移植 人类白细胞抗原 BK病毒 移植肾功能延迟 危险因素
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The comparison study of Chinese and American secondary school students’knowledge structure—an experimental research based on concept map assessment technique
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作者 ZHANG Liping WANG Yan +1 位作者 dong boqing ZHOU Zengyao 《Frontiers of Education in China》 2009年第2期286-297,共12页
A concept map is a schematic device for representing a set of concept meanings embedded in a framework of propositions.It can be used to evaluate students’knowledge structure.This article introduces the comparative s... A concept map is a schematic device for representing a set of concept meanings embedded in a framework of propositions.It can be used to evaluate students’knowledge structure.This article introduces the comparative study of Chinese and American secondary school students’knowledge structure.They are compared quantitatively and qualitatively in terms of mean score,individual proposition scores,proposition choice and map structure.The results indicate that students’knowledge structures in the two countries are remarkably different.Compared with American students,Chinese students’ability to take an exam is stronger and their mean score is higher.However,Chinese students need to improve their general knowledge and creativity although their basic knowledge is solid and they are better in mastering discipline knowledge and knowledge application. 展开更多
关键词 subject knowledge structure knowledge structure assessment concept map assessment Chinese secondary school students American secondary school students
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A NOTE ON L^2 DECAY OF LADYZHENSKAYA MODEL
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作者 dong boqing 《Journal of Partial Differential Equations》 2006年第4期304-318,共15页
This paper is concerned with time decay problem of Ladyzhenskaya model governed incompressible viscous fluid motion with the dissipative potential having p-growth (p ≥ 3) in R^3. With the aid of the spectral decomp... This paper is concerned with time decay problem of Ladyzhenskaya model governed incompressible viscous fluid motion with the dissipative potential having p-growth (p ≥ 3) in R^3. With the aid of the spectral decomposition of the Stokes operator and L^p - L^q estimates, it is rigorously proved that the Leray-Hopf type weak solutions decay in L^2(R^3) norm like t-n/2(1/r-1/2) under the initial data uo ∈ L^2(R^3) ∩ L^r(R^3) for 1≤ r 〈 2. Moreover, the explicit error estimates of the difference between Ladyzhenskaya model and Navier-Stokes flow are also investigated. 展开更多
关键词 Ladyzhenskaya model L^2 decay spectral decomposition.
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