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印度尼西亚卡利安达岛近岸热泉微生物和氢酶基因的多样性 被引量:1
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作者 何培青 dewi seswita zilda +5 位作者 李江 张学雷 崔菁菁 白亚之 Gintung Patantis Ekowati Chasanah 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期119-129,共11页
研究对2011年7月采自印度尼西亚卡利安达岛近岸热泉的样品,进行了细菌和古菌16SrRNA基因和细菌氢酶基因克隆文库的构建、序列测定和多样性分析。结果表明:热泉系统的细菌和古菌由16个门组成,Proteobacteria为热液流体和沉积物的优势类群... 研究对2011年7月采自印度尼西亚卡利安达岛近岸热泉的样品,进行了细菌和古菌16SrRNA基因和细菌氢酶基因克隆文库的构建、序列测定和多样性分析。结果表明:热泉系统的细菌和古菌由16个门组成,Proteobacteria为热液流体和沉积物的优势类群,丰度分别为59.5%和73.3%,Cyanobacteria为菌苔的优势类群(丰度,56.5%);具有氨氧化作用的Crenarchaeota为古菌的优势类群。热泉系统中,70%以上的种类与海洋细菌的亲缘关系最近,说明该系统具有海洋特性;约20%的种类与陆地热泉中嗜热或中等嗜热细菌的亲缘关系最近,这些种类可能来源于高温地层内部,并参与了铁氧化还原、氢氧化、硫氧化和硝酸还原等过程。热泉系统中,NAD(P)-关联的双向NiFe-氢酶基因和FeFe-氢酶基因的组成分布也受到温度和盐度分布变化的影响。研究为揭示浅海热液系统提供理论参考。 展开更多
关键词 印度尼西亚卡利安达岛 近岸热泉 16SrRNA 氢酶基因
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印度尼西亚Padang Cermin热泉古菌多样性分析 被引量:1
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作者 沈继红 宋维志 +2 位作者 林学政 王帅 dewi seswita zilda 《海洋科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期534-540,共7页
通过印度尼西亚苏门答腊岛Padang Cermin热泉环境基因组DNA构建古菌16SrRNA基因文库,并利用PCR-RFLP技术对其古菌多样性和系统发育分析进行了研究。根据限制性内切酶AluⅠ和MspⅠ的特征性酶切图谱,将62个阳性克隆归类为14个分类操作单位... 通过印度尼西亚苏门答腊岛Padang Cermin热泉环境基因组DNA构建古菌16SrRNA基因文库,并利用PCR-RFLP技术对其古菌多样性和系统发育分析进行了研究。根据限制性内切酶AluⅠ和MspⅠ的特征性酶切图谱,将62个阳性克隆归类为14个分类操作单位(operational taxonomic unit,OTU),文库的覆盖度达90.32%。克隆文库的优势类群为OTU2和OTU1,分别占克隆文库的27.42%和20.96%。从每个OUT中选取一个代表性克隆进行16SrRNA基因的序列测定与系统发育分析,结果表明,测定的Padang Cermin热泉中的古菌均属于泉古菌门,包括热变形菌目(Thermoproteales)、硫还原球菌目(Desulfurococcales)、杂色泉古菌(miscellaneous crenar-chaeotic group,MCG)和未培养泉古菌(uncultured Crenarchaeota,UC),该热泉代表性克隆与GenBank数据库已有16SrRNA序列的相似性为91.9%~97.8%,而且与其相似性最高的序列均来自未培养的古菌克隆,由结果可见,Padang Cermin热泉古菌群落与已报道的其他热泉古菌群落的相似性较低,表明该热泉可能具有某些独特的特征,存在着特殊的古菌生态类群。 展开更多
关键词 热泉 古菌 多样性 系统发育分析
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Screening and Characterization of the Alkaline Protease Isolated from PLI-1, a Strain of Brevibacillus sp. Collected from Indonesia's Hot Springs 被引量:3
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作者 WANG Shuai LIN Xuezheng +2 位作者 HUANG Xiaohang ZHENG Li dewi seswita zilda 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS 2012年第2期213-218,共6页
A total of 69 strains of thermophilic bacteria were isolated from water, soil and sediment samples from three Indonesia's hot spring areas (Pantai cermin, Kalianda and Banyu wedang) by using Minimal Synthetic Medi... A total of 69 strains of thermophilic bacteria were isolated from water, soil and sediment samples from three Indonesia's hot spring areas (Pantai cermin, Kalianda and Banyu wedang) by using Minimal Synthetic Medium (MSM). The extreme thermophile Brevibacillus sp. PLI-1 was found to produce extracellular thermophilic alkaline protease with optimal activity at 70℃ and pH 8.0-9.0. The molecular weight of the protease was estimated to be around 56 kD by SDS-PAGE. The maximum activity of the protease was 26.54 U mL-1. The protease activity did not decrease after 30 min and still retained more than 70% of relative activity after 60 min at 70℃ and pH 8.0. The ion Mg2+ was found to promote protease activity at both low and high concentrations, whereas Cu2+ and Zn2+ could almost completely inhibit the activity. Divalent cation chelator EDTA inhibited the enzyme activity by 55.06% ± 0.27%, while the inhibition caused by PMSF, Leupeptin, Pepstain A and Benzamidine were 66.78% ± 3.25%, 52.37% ± 0.25%, 62.47% ± 2.96% and 50.99% ± 0.24%, respectively. Based on these observations, the enzyme activity was conspicuously sensitive to the serine and cysteine protease inhibitors. All these results indicated that the protease isolated from the strain PLI-1 was a thermophilic protease and had a high-temperature stability and a pH stability. 展开更多
关键词 碱性蛋白酶 应变 温泉 印尼 半胱氨酸蛋白酶抑制剂 蛋白酶活性 SDS-PAGE 极端嗜热菌
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