上海市农业种质资源信息共享服务平台设计与应用

上海市农业种质资源信息共享服务平台是对上海市保护单位的农业种质资源进行规范管理和共享利用的服务体系。为了解决当前规模化和多样化的种质分散于不同保护单位,不利于资源信息共享与利用的问题,本研究根据农业种质资源库(圃)的工作流程研发了以保护单位、资源用户和主管单位为主要角色的一站式共享服务平台,为保护单位建立了管理系统模块,保护单位管理员可进行本单位的种质资源数据管理、资源共享信息发布、申请审核和利用成效管理,促进各保护单位种质资源数据的规范化和共享服务。为资源用户创建了申请共享和利用反馈机制,主要提供种质资源信息查询服务、申请利用服务、利用成效反馈服务等,可同时申请多个保护单位的种质。为主管单位提供全面调查的统计汇总信息,包括全市资源存量、资源分发利用、资源利用成效等信息,实时掌握资源共享动向和利用成效。种质资源信息共享服务平台将为保护单位、资源用户和主管单位提供便捷的服务,有助于提高农业种质资源保存与利用效率。

血液核酸筛查系统在不同检测筛查模式下的乙肝检测结果分析及评价

目的通过分析罗氏Cobas s 201的血液核酸检测(NAT)结果评估其对HBV的检测效果。方法将检测结果根据酶联免疫吸附试验(ELISA)和NAT混合检测(MP)、NAT单样本检测(ID)以及重复NAT单样本检测(rID)分组,分为ELISA+/NAT(ID)+、ELISA+/NAT(rID)+、ELISA-/NAT(ID)+、ELISA-/NAT(rID)+4组进行统计分析,探讨重复NAT对反应性结果的检出是否存在差异,对于不同ELISA结果的NAT反应性标本的循环阈值(cycle threshold,Ct)与核酸检出率的关联性。再通过补充试验,包括其他方法学的NAT系统和化学发光血清学标志物检测,进一步分析献血者的真实感染情况。结果766293份献血者标本中共有1691组HBV NAT(MP)+,其中1418组(83.86%)检出反应性结果(1418份HBV NAT+,7090份NAT-),仍有273组(16.14%)经重复检测仍未检出[共计1638份NAT-,Ct(MP):39.49±3.62]。HBV NAT+中,881份(62.13%)ELISA+/NAT(ID)+,19份(1.34%)ELISA+/NAT(rID)+,451份(31.81%)ELISA-/NAT(ID)+,67份(4.72%)ELISA-/NAT(rID)+。对于不同ELISA结果的标本,重复NAT对HBV的检出存在差异(P<0.05)。各组间Ct(ID)值仅ELISA+/NAT(rID)+和ELISA-/NAT(ID)+、ELISA+/NAT(rID)+和ELISA-/NAT(rID)+2组比较无差异(P>0.05),其余各组间两两比较,均有差异(P<0.05)。对228份ELISA-/NAT(MP)+(ID)-进行补充试验,有56份(24.56%)经化学发光检测HBsAg+和7份(3.07%)经其他NAT系统检出反应性。剩余221份(96.93%)NAT-标本中,53份(23.98%)HBsAg+的献血者可能存在慢性感染,40份(18.10%)抗-HBe+和(或)抗-HBc+的献血者可能存在既往感染,其余128份(57.92%)均无反应性的献血者为NAT(MP)假反应性,且各组间抗-HBs含量差异较大(P<0.05)。结论重复NAT对不同反应性类别或不同血清学结果的献血者标本存在差异性检出,尤其在一定区间范围内,对于ELISA-标本进行重复NAT可明显提高检出率。Ct值可辅助评估NAT系统的稳定性和准确性。对于ELISA-/NAT(MP)+(ID)-献血者,结合其他高灵敏度的检测手段可降低病毒残余风险,保障临床用血安全。

基于幼苗图像分析鉴定水稻品种旱直播耐深播特性

[目的]本文基于幼苗图像分析建立鉴定水稻耐深播相关特性的方法,鉴定旱直播条件下水稻耐深播的农艺性状.[方法]以不同中胚轴伸长能力的18份水稻品种和稗草、 马唐的种子,设置3cm、5cm、7cm、9cm和11cm深度的砂培试验,观察出苗情况并在播种后第15天摄取幼苗照片,采用图像分析技术提取幼苗生长相关的表型指标.[结果]在人工标记幼苗胚芽鞘节等部位前提下,通过图像分析可一次性测定中胚轴长度和累积绿叶投射面积;当播种深度为3cm时,短中胚轴水稻品种能在播后第6天前后出苗,长中胚轴品种能在播后第5天出苗;播种深度为5-7cm时,短中胚轴品种不能正常出苗,长中胚轴品种能在播后第7-10天出苗;在同等播种深度下长中胚轴品种第15天幼苗叶面积高于短中胚轴品种,在7cm以上播种深度下差异极为明显;稗草和马唐都具有幼苗中胚轴伸长能力,种子能从5cm或3cm深度下正常出苗.[结论]基于幼苗图像分析技术,本试验建立了水稻旱直播耐深播相关指标的表型检测方法,识别幼苗中胚轴和叶片等部位,提取中胚轴长度和累积绿叶投射面积指标.水稻差异性代表品种和常见禾本科杂草的观察结果表明中胚轴伸长能力是深播后快速、 整齐出苗并较早形成自养能力的关键.

栽培稻深根性的遗传研究进展

根系是植物吸收水分和养分的主要器官,培育发达的深根系统是水稻抗旱育种的重要目标。该文系统介绍了水稻根系生长角度、根系向重力性、根系穿透力、深层土壤根系分布特征等深根性相关性状的遗传研究进展,指出今后需针对目标环境开展水稻深根性QTL发掘与利用、加快主效深根性QTL的验证及其在水稻抗旱分子育种的应用。

水稻自然变异群体淹水发芽相关特性鉴定

首先,利用30份水稻品种资源,观测淹水萌发过程中胚芽鞘长度的动态变化,确定水稻淹水发芽相关性状的鉴定方法;然后,对一套250个品种的水稻自然变异群体,分别在淹水和正常条件下开展发芽试验,观测其发芽率和幼苗胚芽鞘长度。结果表明:大部分参试品种不具备淹水发芽成苗能力,胚芽鞘长度差值的变异系数达到28.5%,提示参试群体的淹水发芽能力存在较为丰富的遗传变异;粳稻品种的淹水发芽能力优于籼稻品种。模拟直播淹水试验表明,淹水发芽胚芽鞘长度与成苗率密切相关;筛选出‘隆化毛葫’‘丽江新团黑谷’‘高阳淀稻’‘黄皮糯’4个高成苗率的优异种质,可用作耐水直播水稻育种的亲本材料。

智慧急救对颅脑创伤手术治疗患者预后的影响

目的探讨智慧急救对颅脑创伤手术治疗患者预后的影响。方法选择2018年6月至2020年1月在我院手术治疗的颅脑损伤患者60例为研究对象,随机分为干预组与对照组,每组各30例。对照组采用常规急救措施,干预组采用智慧急救措施。比较两组术中不良反应发生率,术后GCS评分、FMA评分及GOS评分。结果①干预组术中心率>100次/min的发生率显著高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。②术后7 d、1个月干预组GCS评分均显著高于术前,差异有统计学意义(P<0.05);术后1个月对照组GCS评分显著高于术前,差异有统计学意义(P<0.05);术后7 d、术后1个月,干预组GCS评分显著高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。③术后3个月,两组FMA评分均显著高于术后1个月,差异有统计学意义(P<0.05);术后1个月与术后3个月,干预组FMA评分均显著高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。④干预组GOS评分优于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论智慧急救可优化颅脑创伤手术急救流程,改善患者的预后。

基于图像识别技术发掘水稻耐旱性QTL

为了快速鉴定水稻耐旱性基因资源和耐旱候选基因,本研究建立了一种基于图像识别技术测量水稻在PEG-6000(聚乙二醇)模拟干旱胁迫和H2O2胁迫处理条件下的绿叶率反映水稻耐旱性的方法,相关性分析表明图像识别技术测量的绿叶率与实测的绿叶比重呈极显著正相关,相关系数大于0.85。利用该方法测量了‘珍汕97B’‘/IRAT109’重组自交系群体在PEG-6000(聚乙二醇)模拟干旱胁迫和H2O2胁迫处理条件下的绿叶率,并结合该群体的基因型数据开展了QTL定位分析,两种胁迫处理条件下分别定位了4个QTL。这些定位的QTL将有助于理解水稻耐旱性的遗传基础,同时本研究鉴定获得的耐旱材料和定位的耐旱QTL将为水稻耐旱育种提供基因资源。

Experimental validation of inter-subspecific genetic diversity in rice represented by the differences between the DNA sequences of 'Nipponbare' and '93-11'

The pedigrees of three sequenced rice cultivars were analyzed to show that a majority of the genetic composition of 'Nipponbare' originates from japonica cultivars while the minority originates from indica cultivars. In contrast, '93-11' is derived mainly from indica cultivars with a smaller contribution from japonica cultivars. All ancestors of 'Guang lu ai 4' appeared to be indica lines. A set of molecular markers (46 InDels and 53 SSRs) polymorphic between 'Nipponbare' and '93-11' were examined in 46 typical indica and 47 typical japonica cultivars selected from 443 accessions according to Cheng's index. All cultivars were divided into indica and japonica groups without overlapping when clustered by Cheng's index, InDels and SSRs. Much higher InDel and SSR diversity between groups than within groups implies that the marker polymorphisms between 'Nipponbare' and '93-11' represent a large proportion of inter-subspecific diversity. About 85% of indica cultivars and more than 90% of japonica cultivars were confirmed to have the same PCR banding patterns as '93-11' and 'Nipponbare', respectively. Some polymorphic loci between 'Nipponbare' and '93-11' cannot be validated in other indica and japonica cultivars, either as subspecies-specific but not predominant alleles, or alleles not specific between the two groups. It was concluded that molecular markers developed from sequence polymorphism between 'Nipponbare' and '93-11' often represent inter-subspecific diversity, although some exceptions were sensitive to either particular marker loci or particular cultivars.

浙江省乙肝酶免阳性核酸阴性献血者结果分析

目的分析浙江省血液中心无偿献血者乙肝酶免阳性核酸阴性感染情况[以下简称HBsAg-ELISA(+)/HBV-DNA(-)],探讨造成酶免与核酸结果不一致的原因。方法对常规血液筛查结果为HBsAg-ELISA(+)/HBV-DNA(-)献血者进行单人份核酸再次检测,分析该类献血者的检测结果。结果2022年5月至11月共114017例献血者中筛选出205例HBsAg-ELISA(+)/HBV-DNA(-)标本,男性献血者(0.14%)显著低于女性献血者(0.24%)(χ^(2)=14.761,P<0.005);初次献血者(0.32%)显著高于再次献血者(0.09%)(χ^(2)=78.781,P<0.005);不同文化程度之间差异有统计学意义(χ^(2)=47.753,P<0.005)。经单人份核酸再次检测后,ELISA双试剂阳性标本再次检测核酸阳性率高于单试剂阳性标本(χ^(2)=94.378,P<0.005);ELISA试剂1与试剂2再次检测核酸阳性率无显著性差异(χ^(2)=0.163,P>0.005);2种核酸检测系统的再次核酸检测阳性率无显著性差异(χ^(2)=0.626,P>0.005)。血清学补充实验显示11例HBV-DNA(+)标本经化学发光检测后共出现2种血清学组合模式,分别是HBsAg(+)/HBeAb(+)和HBeAb(+),大部分为HBsAg(+)/HBeAb(+),共10例,占90.91%,只有一例为HBeAb(+),占9.09%;HBsAg定量结果显示大多数处于低HBsAg水平。结论通过单人份核酸检测方法再次检测后,献血者HBsAg-ELISA(+)/HBV-DNA(-)标本中有一定比例为HBV-DNA(+)。但大部分标本仍为HBV-DNA(-),还需进行HBV血清学标志物和HBV-DNA的补充实验来确定其真实感染状态,明确造成酶免与核酸结果检测结果不一致的原因。另外,在献血者筛查中,尽可能选择灵敏度和特异度较高的核酸和HBsAg检测试剂,确保结果准确性。