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生物化学元素融入《微生物生态学》课程教学改革及其思政建设方法初探 被引量:2
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作者 冯有智 包远远 陈瑞蕊 《广东化工》 CAS 2024年第14期189-191,共3页
微生物生态学作为生态学的重要分支,主要研究微生物的多样性、功能及其与环境和其他生物之间的相互作用关系,对理解生态系统的结构和功能、维护生态平衡、促进可持续发展具有重要意义。传统的微生物生态学教学和科研主要依靠理论框架和... 微生物生态学作为生态学的重要分支,主要研究微生物的多样性、功能及其与环境和其他生物之间的相互作用关系,对理解生态系统的结构和功能、维护生态平衡、促进可持续发展具有重要意义。传统的微生物生态学教学和科研主要依靠理论框架和数学模型等来介绍或研究微生物与其周围生物及非生物环境之间的联系。然而,所发现的规律往往缺乏微生物生理和生化层面的验证。生物化学是研究生命现象化学本质的一门科学,将生物化学理论和技术应用于微生物生态学教学和科研,有助于揭示微生物生态学现象背后的本质规律。此外,生物化学家们的甘于寂寞、乐于奉献、敢于创新和精益求精的科学精神为新时代中国特色社会主义高等院校课程思政建设提供了宝贵元素。本文初步探讨了在微生物生态学课程教学过程中引入生物化学元素和课程思政教育的必要性和实施途径。分别从优化师资队伍、增设跨学科理论和综合实验课程、生物化学科研实例应用于微生物生态学课程教学和科研,以及结合课程思政教育几个方面进行具体阐述。期望通过上述关于教育改革和创新模式的探讨,在一定程度上推动高等院校微生物生态学课程教育改革,助力新时代中国特色社会主义生态文明建设。 展开更多
关键词 生物化学 微生物生态学 教育改革 创新教学方式 课程思政
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两种典型水稻土中秸秆碳转化的微生物过程 被引量:9
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作者 仇存璞 陈晓芬 +5 位作者 刘明 李委涛 吴萌 江春玉 冯有智 李忠佩 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第13期2268-2279,共12页
【目的】研究土壤中秸秆腐解速率、腐解过程中微生物群落结构变化和参与秸秆腐解的功能微生物群落组成,为揭示土壤有机质转化和积累的微生物学机制提供理论依据。【方法】以我国亚热带两种典型水稻土——常熟乌栅土和鹰潭红壤性水稻土... 【目的】研究土壤中秸秆腐解速率、腐解过程中微生物群落结构变化和参与秸秆腐解的功能微生物群落组成,为揭示土壤有机质转化和积累的微生物学机制提供理论依据。【方法】以我国亚热带两种典型水稻土——常熟乌栅土和鹰潭红壤性水稻土为研究对象,设置不添加秸秆(CK)和添加13C标记的水稻秸秆(RS)处理,厌氧恒温培养38 d,在培养过程中定期测定气体释放量,研究秸秆矿化速率的动态变化;采集土壤样品,利用13C-PLFA-SIP技术分析参与秸秆降解的微生物群落的动态变化。【结果】培养前12 d,秸秆降解缓慢,此时秸秆对土壤有机质(SOM)产生正激发效应;培养12-18 d秸秆快速降解,18 d后趋缓。培养结束时,秸秆碳在红壤性水稻土和乌栅土中的矿化率分别为24%和33%。秸秆碳对CO2和CH4贡献率随培养时间的延长而增加,在培养末期分别为53%-60%和54%-57%。添加秸秆可以提高土壤微生物生物量及微生物活性,乌栅土微生物活性高于红壤性水稻土。16:0(一般细菌)是参与秸秆分解主要类群,i16:0和i15:0(G+细菌)和18:1ω9c(真菌)也是参与秸秆分解的重要微生物类群。随培养时间增加,G+细菌和放线菌的相对丰度增加,G-细菌呈降低趋势。红壤性水稻土和乌栅土PLFAs中标记利用秸秆碳的PLFAs的比例分别为27%-32%和18%-24%。真菌和一般细菌对秸秆碳的利用效率较高,而土壤原有有机质(SOM)矿化主要与G-和放线菌相关联。添加秸秆造成乌栅土和红壤性水稻土两种水稻土微生物群落结构呈现明显差异,但分解利用外源秸秆碳的微生物群落结构相似,而分解利用SOM微生物群落结构有差异。【结论】秸秆厌氧降解过程中秸秆碳的矿化滞后于土壤自身SOM;不同本底微生物活性和多样性是影响秸秆碳矿化速率的重要因素;添加秸秆后不同土壤微生物群落结构的差异主要是参与SOM降解的微生物差异,土壤原SOM是导致这种差异的重要因素。 展开更多
关键词 秸秆降解 13C-PLFA-SIP 水稻土 微生物群落
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水稻和小麦根际效应及细菌群落特征的比较研究 被引量:12
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作者 王晓婷 陈瑞蕊 +3 位作者 井忠旺 冯有智 姚童言 林先贵 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期443-453,共11页
稻麦轮作是我国重要的农业生产方式,但水稻和小麦的根际效应及其对土壤功能的相对贡献仍不清楚。利用中国科学院常熟农业生态试验站典型乌栅土壤,同时分别设置种植水稻和小麦的盆栽试验,通过比较根际和非根际土壤中活性组分含量、脱氢... 稻麦轮作是我国重要的农业生产方式,但水稻和小麦的根际效应及其对土壤功能的相对贡献仍不清楚。利用中国科学院常熟农业生态试验站典型乌栅土壤,同时分别设置种植水稻和小麦的盆栽试验,通过比较根际和非根际土壤中活性组分含量、脱氢酶活性、细菌群落多样性等指标的差异,研究植稻和植麦土壤根际效应及细菌群落特征。结果表明:水稻和小麦根际和非根际土壤的养分含量、微生物活性和细菌群落多样性以及主要细菌种类均具有显著性差异;根际土壤可溶性有机碳(DOC)、微生物生物量碳(MBC)含量和脱氢酶活性(DHA)均高于非根际土壤,而土壤可溶性有机氮(DON)含量及细菌阿尔法(Alpha)多样性均低于非根际土壤;水稻各指标根际效应(DOC:2.07%,MBC:8.61%,DHA:41.11%,DON:61.07%,Chao1指数:7.62%)均小于小麦对应指标的根际效应(DOC:3.37%,MBC:22.62%,DHA:44.48%,DON:71.43%,Chao1指数:16.59%);小麦根际和非根际细菌群落分布之间的差异显著大于水稻。以上结果表明,与旱作小麦相比,水稻根际土壤与非根际土壤的差异较小,水稻根际效应较小,有利于光合碳及土壤养分的运移,有利于土壤微生物尤其是非根际微生物的生长。这些结果从新的角度阐释了根际效应及其对稻麦轮作土壤可持续性发展的作用机制。 展开更多
关键词 稻麦轮作 根际效应 细菌群落多样性 高通量测序 主坐标分析
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Bacillus asahii OM18菌剂载体筛选及其对玉米的促生效果 被引量:3
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作者 蒋华云 冯有智 +1 位作者 王一明 林先贵 《南京师大学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期122-128,共7页
芽胞杆菌Bacillus asahii OM18是潮土地力提升的关键土著微生物.为了将该菌种资源应用到提升华北平原潮土地力的实际农业生产中,也为了促进农业废弃物资源化应用,本研究以5种农业废弃物生产的有机肥(封丘站有机肥、鸡粪有机肥、酒糟有... 芽胞杆菌Bacillus asahii OM18是潮土地力提升的关键土著微生物.为了将该菌种资源应用到提升华北平原潮土地力的实际农业生产中,也为了促进农业废弃物资源化应用,本研究以5种农业废弃物生产的有机肥(封丘站有机肥、鸡粪有机肥、酒糟有机肥、菜粕有机肥和牛粪有机肥)为研究对象,通过评价B.asahii OM18在有机肥中的生长繁殖以及对作物的促生效果,系统性地筛选出适合该菌种生长和发挥生态功能的菌剂载体.结果表明,菜粕有机肥适合作为B.asahii OM18菌剂制备的载体,以菜粕有机肥制备的B.asahii OM18菌剂回接到潮土后,施有机肥接种OM18菌剂(Inoculant)处理玉米茎叶干重(9.27±0.95)g显著高于其他处理(P<0.05),在潮土中能够显著促进玉米的生长.因此,以菜粕有机肥为载体复合B.asahii OM18菌剂有助于我国华北平原地力的提升. 展开更多
关键词 BACILLUS asahii OM18 农业废弃物 有机肥 菌剂 潮土 植物促生
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水旱轮作对土壤微生物群落构建过程的影响机制 被引量:16
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作者 刘文静 张建伟 +3 位作者 邱崇文 包远远 冯有智 林先贵 《土壤》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期710-717,共8页
为探究稻田生态系统微生物学机制,采集水旱轮作稻田土壤,并以相同土壤母质下长期淹水的藕田土壤以及旱作的果树土壤为对照,研究了稻田生态系统细菌群落结构以及基于零模型的群落构建机制。结果表明:旱作和水旱轮作两个生态系统,由于频... 为探究稻田生态系统微生物学机制,采集水旱轮作稻田土壤,并以相同土壤母质下长期淹水的藕田土壤以及旱作的果树土壤为对照,研究了稻田生态系统细菌群落结构以及基于零模型的群落构建机制。结果表明:旱作和水旱轮作两个生态系统,由于频繁耕作以及施肥管理等农业措施形成特定的生态位格局,确定性过程主导群落构建。旱作生态系统下确定性过程占78.6%,随机性过程占10.7%;相对于旱作,由于水旱轮作的淹水条件,土壤肥力积累,水体连通性较好等特性导致内部环境变化缓和,其随机性过程(39.3%)影响增加,确定性过程(50.0%)下降;同理,长期淹水的水生生态系统中随机性群落构建(50.0%)成为主导过程。群落构建影响细菌群落结构和功能,因此随机性生态过程的增强进一步增加了细菌多样性以及物种生态网络的交互度和稳定性,增强了微生物抵抗外部环境扰动的能力,该过程有助于维持农田生态系统功能的稳定性和可持续性。 展开更多
关键词 水稻土 微生物生态 群落构建过程 生态系统可持续性
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基于磁性纳米颗粒分选的土壤活性纤维素降解微生物富集研究 被引量:4
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作者 荣楠 张建伟 +3 位作者 包远远 何世颖 冯有智 林先贵 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1457-1467,共11页
磁性纳米粒子介导分离(magnetic nanoparticle-mediated isolation,MMI)技术是从复杂微生物群落中鉴定分离具有特定代谢功能活性物种的有力工具。针对我国江西鹰潭水稻土三种不同施肥模式(不施肥CK、化肥NPK和有机肥OM),利用MMI技术定... 磁性纳米粒子介导分离(magnetic nanoparticle-mediated isolation,MMI)技术是从复杂微生物群落中鉴定分离具有特定代谢功能活性物种的有力工具。针对我国江西鹰潭水稻土三种不同施肥模式(不施肥CK、化肥NPK和有机肥OM),利用MMI技术定向富集活性纤维素降解细菌。结果表明,与不施肥相比,施肥可提高微生物数量和活性,增加拟杆菌门与厚壁菌门(特别是紫单胞菌科与类芽孢杆菌科)等活性纤维素降解细菌的占比,同时降低活性微生物种间依赖性,进而加速羧甲基纤维素钠的降解;此外,有机肥还增加了微生物生态网络中的潜在生态功能模块数量,因而效果好于化肥。以上结论与基于DNA稳定性同位素核酸探针(DNA-based stable isotope probing,DNA-SIP)技术的结论一致,进而证明了MMI技术用于鉴定分离活性纤维素降解菌的可行性,同时本结果也为农田秸秆的资源化管理提供理论依据和实际指导。 展开更多
关键词 土壤微生物 微域培养 高通量测序 分子生态网络 秸秆资源化
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纳米磁性氧化铁对玉米根际土壤真菌群落结构和功能的影响 被引量:3
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作者 曹际玲 冯有智 林先贵 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期357-363,共7页
纳米产品的广泛应用导致纳米材料不可避免地进入农田土壤,对农田生态系统产生潜在影响.本研究以纳米磁性氧化铁(Fe_3O_4)为研究对象,以玉米(Zea mays L.)为供试植物,采用盆栽试验方法,模拟不同纳米Fe_3O_4水平(0.1、1.0、10.0 mg/kg)的... 纳米产品的广泛应用导致纳米材料不可避免地进入农田土壤,对农田生态系统产生潜在影响.本研究以纳米磁性氧化铁(Fe_3O_4)为研究对象,以玉米(Zea mays L.)为供试植物,采用盆栽试验方法,模拟不同纳米Fe_3O_4水平(0.1、1.0、10.0 mg/kg)的土壤,并以相同水平的微米Fe_3O_4为纳米效应的对照,利用Illumina高通量测序技术对土壤真菌群落结构进行分析,并结合FUNGuild解析土壤真菌功能对纳米Fe_3O_4的响应.通过比较不同Fe_3O_4处理的土壤真菌多样性和群落结构发现,微米Fe_3O_4和纳米Fe_3O_4对土壤真菌多样性的影响较小,但10.0 mg/kg施加水平的纳米Fe_3O_4显著(P <0.05)改变了土壤真菌群落结构,使真菌群落结构发生显著分异(P<0.05),主要表现为降低了篮状菌Talarmyces、镰刀菌Fusarium、隐球菌Cryptococcus和被孢霉Mortierella等的相对丰度. FUNGuild分析发现10.0 mg/kg的纳米Fe_3O_4降低了腐生营养型真菌的相对丰度,但增加了共生营养型和病理营养型真菌的相对丰度.由此可见,一定浓度的纳米Fe_3O_4可显著改变土壤真菌群落结构和功能,对植物生长和土壤养分循环产生潜在影响.(图3表2参52) 展开更多
关键词 纳米FE3O4 高通量测序 FUNGuild 真菌群落结构 生态功能
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玉米秸秆对滨海中度盐土微生物活性的提升及机理 被引量:1
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作者 董洋 陈瑞蕊 +3 位作者 俞冰倩 姚荣江 冯有智 林先贵 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期394-400,共7页
揭示秸秆添加对滨海中度盐土微生物活性的影响,并探讨其提升机理,可为改善滨海盐土微生物生态功能提供新思路.以山东东营中度盐渍土壤(1501μS/cm)、非盐渍土壤(116.9μS/cm)为供试土壤,分别添加玉米秸秆、不添加秸秆进行室内培养实验.... 揭示秸秆添加对滨海中度盐土微生物活性的影响,并探讨其提升机理,可为改善滨海盐土微生物生态功能提供新思路.以山东东营中度盐渍土壤(1501μS/cm)、非盐渍土壤(116.9μS/cm)为供试土壤,分别添加玉米秸秆、不添加秸秆进行室内培养实验.恒温避光培养2个月后进行脱氢酶活性、参与养分循环的9种胞外酶活性以及微生物底物代谢热动力学的测定分析.结果显示,秸秆的添加极大缓解了盐对微生物活性的抑制作用,体现在土壤脱氢酶胞外酶活性显著提升,微生物底物诱导代谢热散逸动力学曲线向非盐渍土壤趋同.玉米秸秆的添加使盐渍土壤碳、氮、磷、硫获取胞外酶活性比例由0.46:1:0.73:1.62变为1.08:1:0.62:0.85,极大增加了碳获取胞外酶的生产比例;而非盐渍土壤胞外酶化学计量比没有发生明显变化.此外,添加秸秆使土壤微生物生物量均得到显著提高,且使盐渍土壤中单位微生物生物量脱氢酶活性从0.37提高到0.66,而对非盐渍土壤却没有显著的促进作用.整体而言,添加秸秆,极大地缓解中度盐渍土壤盐分对微生物活性的抑制作用,加大了盐土微生物对参与碳循环的胞外酶的生产获取以更多的碳源供微生物抵御盐胁迫,进而提升单个细胞活性及微生物生物量,最终使微生物活性得到恢复. 展开更多
关键词 中度盐渍土壤 土壤酶活 秸秆 微生物活性 资源分配
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磁性纳米颗粒介导分离技术筛选土壤中多氯联苯降解菌及其降解特性
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作者 朋婷婷 项兴佳 +5 位作者 冯有智 何世颖 吴宇澄 张锋 曾军 林先贵 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期3771-3783,共13页
【背景】磁性纳米颗粒介导分离(magnetic nanoparticle-mediated isolation,MMI)技术是近年来发展起来的一种无须底物标记就能从复杂菌群中分离活性功能微生物的方法,目前尚无研究报道该技术应用于难降解污染物3,3′,4,4′-四氯联苯(3,3... 【背景】磁性纳米颗粒介导分离(magnetic nanoparticle-mediated isolation,MMI)技术是近年来发展起来的一种无须底物标记就能从复杂菌群中分离活性功能微生物的方法,目前尚无研究报道该技术应用于难降解污染物3,3′,4,4′-四氯联苯(3,3′,4,4′-tetrachlorobiphenyl,PCB77)。【目的】从土壤中筛选PCB77活性降解菌并研究其污染物降解特性。【方法】利用磁性纳米颗粒(magnetic nanoparticles,MNPs)富集原位活性PCB77降解菌群,通过高通量测序分析细菌群落变化,经平板筛选得到PCB77降解菌,并研究其对多氯联苯和多溴联苯醚的降解特性。【结果】基于MMI技术获取的富集培养液能够高效地转化PCB77,与对照组相比底物降解效率从6%提升至79.3%,同时该富集培养液中细菌物种多样性显著降低,群落组成发生明显变化。从对照组和MMI处理组中分别筛选到PCB77降解菌红球菌CT2和类芽孢杆菌MT2,发现红球菌为对照组中唯一的优势物种,而MMI处理组的优势物种由红球菌和类芽孢杆菌共同组成。菌株MT2对PCB77具有优异的降解能力,唯一碳源条件下对PCB77的降解率高达65.2%,接近于富集菌群的降解效果,并显著高于菌株CT2(26.3%)。同时,菌株MT2也对多种多氯联苯和多溴联苯醚表现出相对更好的降解效果。【结论】通过MMI技术有效富集出PCB77的高效降解菌群,并从中筛选到多氯联苯高效降解菌Paenibacillus sp.MT2,为发展高效的多氯联苯污染土壤生物修复技术提供了理论参考。 展开更多
关键词 PCB77 磁性纳米颗粒介导分离技术 类芽孢杆菌 多氯联苯 多溴联苯醚
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Effect of Rhizobacterium Rhodopseudomonas palustris Inoculation on Stevia rebaudiana Plant Growth and Soil Microbial Community 被引量:6
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作者 XU Jiangbing feng youzhi +1 位作者 WANG Yanling LIN Xiangui 《Pedosphere》 SCIE CAS CSCD 2018年第5期793-803,共11页
There is an increasing concern that the continuous use of chemical fertilizers might lead to harmful effects on soil ecosystem.Accordingly, a biocompatible approach involving inoculation of beneficial microorganisms i... There is an increasing concern that the continuous use of chemical fertilizers might lead to harmful effects on soil ecosystem.Accordingly, a biocompatible approach involving inoculation of beneficial microorganisms is presented to promote plant growth and simultaneously minimize the negative effect of chemical fertilizers. In this study, Rhodopseudomonas palustris, a plant growth-promoting rhizobacterium(PGPR), was inoculated into both fertilized and unfertilized soils to assess its influence on Stevia rebaudiana plant growth and microbial community in rhizosphere soils in a 122-d field experiment. Soil enzyme assays(dehydrogenase, urease, invertase, and phosphomonoesterase), real-time quantitative polymerase chain reaction(RT-_qPCR), and a high-throughput sequencing technique were employed to determine the microbial activity and characterize the bacterial community. Results showed that the R.palustris inoculation did not significantly influence Stevia yields and root biomass in either the fertilized or unfertilized soil. Chemical fertilization had strong negative effects on soil bacterial community properties, especially on dehydrogenase and urease activities.However, R. palustris inoculation counteracted the effect of chemical fertilizer on dehydrogenase and urease activities, and increased the abundances of some bacterial lineages(including Bacteroidia, Nitrospirae, Planctomycetacia, Myxococcales, and Legionellales). In contrast, inoculation into the unfertilized soil did not significantly change the soil enzyme activities or the soil bacterial community structure. For both the fertilized and unfertilized soils, R. palustris inoculation decreased the relative abundances of some bacterial lineages possessing photosynthetic ability, such as Cyanobacteria, Rhodobacter, Sphingomonadales, and Burkholderiales. Taken together, our observations stress the potential utilization of R. palustris as PGPR in agriculture, which might further ameliorate the soil microbial properties in the long run. 展开更多
关键词 bacterial community structure beneficial microorganism chemical fertilization plant growth-promoting rhizobacterium soil enzyme activity
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