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基于超声内镜影像组学和机器学习的胃肠道间质瘤与非胃肠道间质瘤鉴别方法 被引量:1
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作者 王卓然 张贤达 +17 位作者 曹羽成 张玲 龚婷婷 马烨波 段晓倩 郭康丽 李军 陈媛 张健涛 叶本功 丁进 朱建伟 刘枫 胡端敏 周春华 邹多武 李庆利 陈建刚 《海军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期21-28,共8页
目的建立并验证基于超声内镜影像组学和机器学习的胃肠道间质瘤与非胃肠道间质瘤的鉴别方法。方法纳入符合标准的患者435例,采集胃肠道间质瘤(257例)与非胃肠道间质瘤(包括胃平滑肌瘤145例、神经鞘瘤33例)超声内镜图像共3279张,按患者比... 目的建立并验证基于超声内镜影像组学和机器学习的胃肠道间质瘤与非胃肠道间质瘤的鉴别方法。方法纳入符合标准的患者435例,采集胃肠道间质瘤(257例)与非胃肠道间质瘤(包括胃平滑肌瘤145例、神经鞘瘤33例)超声内镜图像共3279张,按患者比7∶3分为训练集和测试集。采用Pyradiomics软件提取肿瘤影像组学特征,并应用主成分分析(PCA)、最小绝对收缩和选择算子(LASSO)、极致梯度提升树(XGBoost)、随机森林、递归式特征消除(RFE)算法设计特征筛选方案,基于所选特征通过支持向量机分类器建立模型。通过ROC曲线评估各模型对胃肠道间质瘤与非胃肠道间质瘤的预测效能。结果由最终筛选得到的超声内镜影像组学特征建立影像组学模型,基于5种特征筛选方案(PCA、PCA+LASSO、PCA+XGBoost、PCA+随机森林、PCA+RFE)建立的预测模型的AUC分别为0.581、0.870、0.874、0.860、0.661。结论PCA+XGBoost的特征筛选方案效果最佳,基于上述影像组学和机器学习方法鉴别胃肠道间质瘤与非胃肠道间质瘤的模型可用于患者的术前预测。 展开更多
关键词 胃肠道间质瘤 超声内镜 影像组学 机器学习 主成分分析 极致梯度提升树
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连续施用不同量污泥堆肥对土壤氮组分及δ^(15)N的影响 被引量:3
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作者 郭康莉 张水勤 +6 位作者 冀拯宇 刘晓 周吉祥 姜慧敏 杨俊诚 李桂花 张建峰 《同位素》 CAS 2018年第2期65-76,共12页
为探明连续施用无害化污泥堆肥(以下简称堆肥)对土壤全氮(TN)、不同活性氮组分含量及土壤δ^(15)N的影响,为堆肥改良和培肥沙质潮土提供理论依据。本研究以河南省小麦-玉米轮作区沙质潮土为研究对象,通过2013-2016年田间连续定位试验,... 为探明连续施用无害化污泥堆肥(以下简称堆肥)对土壤全氮(TN)、不同活性氮组分含量及土壤δ^(15)N的影响,为堆肥改良和培肥沙质潮土提供理论依据。本研究以河南省小麦-玉米轮作区沙质潮土为研究对象,通过2013-2016年田间连续定位试验,基于不同土壤活性氮组分分组技术和氮稳定性同位素技术,分析土壤活性氮组分和土壤δ^(15)N对堆肥施入量的响应特征。结果表明,1)连续施用堆肥显著增加了土壤碳氮含量,随施入量增加而显著增加,其中施堆肥量达45t·hm-2时效果最为显著,较单施化肥(CK)处理分别增加了265.83%和284.31%(P<0.05)。施用堆肥可以提高活性有机氮组分含量,其中颗粒态有机氮(PON)增加了104.57%~280.91%;处理间各活性氮组分含量呈现:颗粒态有机氮(PON)>轻组有机氮(LFON)>水溶性有机氮(DON)>微生物量氮(SMBN)。增加堆肥施入量提高了PON/TN和SMBN/TN分配比例,显著降低了LFON/TN和DON/TN分配比例(P<0.05),从而降低土壤活性氮组分在全氮中的分配比例,说明高堆肥施用量促进土壤氮素以稳定态有机氮形式储存,有利于土壤氮素的累积。2)施用堆肥显著降低了土壤δ^(15)N,通径分析和主成分分析表明,土壤δ^(15)N与土壤氮含量受堆肥施入量影响显著;相关性分析表明,δ^(15)N与土壤TN、PON和LFON含量呈显著相关性,表明土壤δ^(15)N变化特征可指示土壤氮组分受堆肥处理作用的响应。3)冗余分析表明,土壤pH、土壤水分及土壤肥力水平(IFI)均会对土壤氮组分含量、活性氮组分分配比例及δ^(15)N产生影响,其中对土壤IFI和土壤pH作用显著(P<0.05),解释率分别达48.2%和17.5%。综上可知,施用堆肥提高了土壤有机物含量,施用量达45t·hm-2时,显著提高了土壤氮储量和活性氮组分含量,对沙质潮土的培肥效果明显,同时,土壤稳定性同位素δ^(15)N变化特征可作为堆肥对沙质土壤质量提升效果的指示指标。 展开更多
关键词 无害化污泥堆肥 土壤培肥 沙质潮土 稳定性氮同位素 土壤活性有机氮
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2015-2020年广东省沿岸红树林矢量数据集 被引量:3
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作者 刘叶取 张立 +2 位作者 郭康丽 党二莎 唐世林 《中国科学数据(中英文网络版)》 CSCD 2022年第1期250-257,共8页
广东省是全国红树林分布面积最大、范围最广、种类最为丰富的地区之一,摸清广东沿岸红树林的分布范围和利用现状至关重要。本数据选取了2015–2020年共119景覆盖广东沿岸、低云量的高分二号卫星遥感数据,数据预处理后采用面向对象特征... 广东省是全国红树林分布面积最大、范围最广、种类最为丰富的地区之一,摸清广东沿岸红树林的分布范围和利用现状至关重要。本数据选取了2015–2020年共119景覆盖广东沿岸、低云量的高分二号卫星遥感数据,数据预处理后采用面向对象特征的分类方法,提取广东省沿岸红树林矢量数据。精度评价结果表明,数据集的总体精度、Kappa系数和生产精度分别是95.83%,0.8872和85.83%。本数据集反映了广东省沿岸2015–2020年红树林分布状况及变化,可作为该区域红树林资源的保护、恢复、管理及湿地动态监测、海洋环境变化等应用的基础数据。 展开更多
关键词 广东省 红树林 高分二号 遥感 数据集
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Effect of Temperature on the Release of Transparent Exopolymer Particles(TEP)and Aggregation by Marine Diatoms(Thalassiosira weissflogii and Skeletonema marinoi) 被引量:1
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作者 CHEN Jie guo kangli +1 位作者 Daniel COThornton WU Yi 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS CSCD 2021年第1期56-66,共11页
The presence of diatoms is accompanied by the production of a large amount of extracellular polymeric substances,which are mainly composed of carbohydrates.Transparent exopolymer particles(TEP)are a large class of ext... The presence of diatoms is accompanied by the production of a large amount of extracellular polymeric substances,which are mainly composed of carbohydrates.Transparent exopolymer particles(TEP)are a large class of extracellular polymeric substances with high stickiness that promotes the formation of aggregates and marine snow,which affects marine bio-carbon pump efficiency.The purpose of this research was to determine how temperature increases affect the allocation of cellular carbohydrates and the formation and aggregation of TEP.The results showed that the responses of two different diatom species(Thalassiosira weissflogii and Skeletonema marinoi)differed according to temperature.The cell density and chlorophyll a concentration of the former were not significantly correlated with temperature,while those of the latter were significantly decreased with increasing temperature.This indicates that the two species of diatom may have different heat tolerance ranges.A temperature increase will promote significant formation of TEP by both types of diatoms,including aggregation of S.marinoi as the temperature rises,meaning that the high temperature will produce an aggregate with a larger particle size and thus may increase the sedimentation rate of organic carbon.Moreover,the TEP aggregation of T.weissflogii did not increase;therefore,its particle size was smaller,and so it may remain on the sea surface at high temperatures for longer periods.These influences have a profound impact on the biogeochemical cycling of carbon. 展开更多
关键词 transparent exopolymer particles DIATOM Thalassiosira weissflogii Skeletonema marinoi AGGREGATION
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深度学习技术对胃肠道间质瘤与平滑肌瘤超声内镜图像的鉴别诊断价值
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作者 郭康丽 朱建伟 +2 位作者 黄张浩 刘纯平 胡端敏 《中华消化内镜杂志》 CSCD 北大核心 2024年第6期449-454,共6页
目的尝试构建基于深度学习技术的胃肠道间质瘤(gastrointestinal stromal tumors,GISTs)与平滑肌瘤(leiomyomas,LM)超声内镜图像分类模型,并验证其鉴别诊断价值。方法回顾性纳入2014年10月至2021年10月在苏州大学附属第二医院接受超声... 目的尝试构建基于深度学习技术的胃肠道间质瘤(gastrointestinal stromal tumors,GISTs)与平滑肌瘤(leiomyomas,LM)超声内镜图像分类模型,并验证其鉴别诊断价值。方法回顾性纳入2014年10月至2021年10月在苏州大学附属第二医院接受超声内镜检查且经外科手术或内镜下切除后病理确诊的69例GISTs和73例LM病例,每例病例选取1张清晰且有典型病变的超声内镜图片,利用留出法将每种疾病图片按训练集图片数比验证集图片数为8∶2的比例分入训练集和验证集,最终由113张(55张GISTs和58张LM)超声内镜图片组成训练集,由29张(14张GISTs和15张LM)超声内镜图片组成验证集,训练集用于对深度学习模型进行训练与优化,验证集用于对分类模型进行验证,主要观察指标包括鉴别诊断的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和准确率。结果利用Resnet 34网络结构建立的分类模型对GISTs与LM进行鉴别诊断的准确率趋于0.89,较Resnet 50网络结构建立的分类模型(0.81)的分类性能更佳。基于Resnet 34网络结构构建的分类模型对验证集中超声内镜图片进行鉴别诊断的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和准确率分别为85.71%(12/14)(95%CI:67.38%~100.00%)、93.33%(14/15)(95%CI:80.71%~100.00%)、92.31%(12/13)(95%CI:77.82%~100.00%)、87.50%(14/16)(95%CI:71.30%~100.00%)和89.66%(26/29)(95%CI:78.57%~100.00%)。结论深度学习技术用于GISTs与LM超声内镜图像的鉴别诊断是可行的,可为临床医师对两者的鉴别提供辅助诊断意见。基于Resnet 34网络结构建立的深度学习模型对GISTs与LM超声内镜图像进行鉴别诊断的准确性较高。 展开更多
关键词 人工智能 深度学习 超声内镜检查术 胃肠道间质瘤 平滑肌瘤
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NIR-Ⅱ responsive Janus nanoparticles amplify immunogenic cell death for enhanced cancer immunotherapy
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作者 CHEN BeiBei guo kangli +3 位作者 WANG HaoRan XU Fu-Jian WANG JuLin ZHAO NaNa 《Science China(Technological Sciences)》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第1期321-329,共9页
Immunotherapy brings new hope for tumor treatment by inducing immunogenic cell death(ICD)of tumor cells.However,insufficient immunogenicity and low immune response rate greatly limit antitumor immunity.Herein,by optim... Immunotherapy brings new hope for tumor treatment by inducing immunogenic cell death(ICD)of tumor cells.However,insufficient immunogenicity and low immune response rate greatly limit antitumor immunity.Herein,by optimizing the composition and morphology,the rational design of Janus nanoparticles composed of Fe_(3)O_(4) nanospheres and SiO_(2)nanorods was realized for enhanced cancer immunotherapy through amplified ICD.After glucose oxidase(GOx)was loaded by the Janus nanoparticles,the resultant M-FS-GOx consumes glucose at tumor sites to generate gluconic acid and hydrogen peroxide(H_(2)O_(2))for starvation therapy while the H_(2)O_(2)supply promotes the production of highly toxic·OH to achieve effective chemodynamic therapy(CDT).Under a 1064 nm light irradiation,the photothermal effect of M-FS-GOx enhances the enzyme activity of GOx for improved starvation therapy.Furthermore,both tumor-associated antigens released during the process of ICD and the intrinsic immunoadjuvant property of M-FS-GOx stimulate dendritic cell maturation to activate antitumor immune responses.This work provides a promising strategy for the construction of Janus nanoparticles to achieve enhanced cancer immunotherapy through combination therapy-amplified ICD. 展开更多
关键词 Janus nanoparticles immunogenic cell death cancer immunotherapy
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珠海近岸海域叶绿素a时空分布特征及其环境调控因素浅析 被引量:5
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作者 党二莎 张立 +2 位作者 郭康丽 郑淑敏 龙超 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期240-247,共8页
基于2017年11月(秋季)和2018年3月(春季)两个航次在珠海近岸海域开展的水环境调查,分析了水质理化参数、叶绿素a的浓度以及叶绿素a的空间分布及其环境调控因素.结果显示:①春季海水中叶绿素a含量高于秋季,其中秋季表层海水中叶绿素a的... 基于2017年11月(秋季)和2018年3月(春季)两个航次在珠海近岸海域开展的水环境调查,分析了水质理化参数、叶绿素a的浓度以及叶绿素a的空间分布及其环境调控因素.结果显示:①春季海水中叶绿素a含量高于秋季,其中秋季表层海水中叶绿素a的浓度为0.47~20.64μg∙L^(-1),平均值为3.23μg∙L^(-1);底层浓度为0.74~13.27μg∙L^(-1);平均值为2.18μg∙L^(-1).春季表层海水中叶绿素a的浓度为1.32~63.90μg∙L^(-1),平均值为9.35μg∙L^(-1);底层浓度为2.21~7.46μg∙L^(-1);平均值为4.36μg∙L^(-1).春秋两季叶绿素a浓度变化规律存在相似性,呈现东北部高、西南部低的趋势.②不同水质参数对海水叶绿素a浓度的影响具有季节性差异,秋季对叶绿素a含量影响较大的参数有温度、盐度、溶解氧、活性磷酸盐;春季影响较大的参数则是盐度和化学需氧量. 展开更多
关键词 近岸海域 叶绿素A浓度 环境参数
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内镜超声引导下细针抽吸术诊断脾脏病变系列报道(含视频)
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作者 郭康丽 徐丽明 +4 位作者 吴伟 徐龙江 胡端敏 黄佳亮 程桂莲 《中华消化内镜杂志》 CSCD 2022年第3期242-244,共3页
脾脏肿瘤并不多见,但随着现代影像学技术的发展,越来越多的脾脏占位在体检时被偶然发现,而脾脏是人体的“血库”,活检出血风险极大,因此选择安全的技术获得脾脏样本尤为重要。本文报道了3例内镜超声引导下细针抽吸术(endoscopic ultraso... 脾脏肿瘤并不多见,但随着现代影像学技术的发展,越来越多的脾脏占位在体检时被偶然发现,而脾脏是人体的“血库”,活检出血风险极大,因此选择安全的技术获得脾脏样本尤为重要。本文报道了3例内镜超声引导下细针抽吸术(endoscopic ultrasoud-guided fine needle aspiration,EUS-FNA)诊断的脾脏恶性肿瘤,EUS-FNA有助于明确诊断、指导临床医师制定治疗方案。 展开更多
关键词 脾肿瘤 淋巴瘤 大B细胞 弥漫性 内镜超声引导下细针抽吸术 脾脏继发恶性肿瘤
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