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蓟马取食诱导的紫花苜蓿类黄酮生物合成基因表达分析
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作者 陈崎 代蕊 +6 位作者 张岩 爽爽 霍晓伟 边林 郭娜 张志强 张雨桐 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1034-1043,共10页
紫花苜蓿(Medicago sativa)是国内外广泛栽培的重要豆科牧草。本研究利用PacBio技术对抗蓟马苜蓿品种‘草原4号’进行全长转录组测序,共获得35.10 Gb的clean data,355992条环形一致性序列(CCS Reads),其中全长非嵌合序列(FLNC Reads)238... 紫花苜蓿(Medicago sativa)是国内外广泛栽培的重要豆科牧草。本研究利用PacBio技术对抗蓟马苜蓿品种‘草原4号’进行全长转录组测序,共获得35.10 Gb的clean data,355992条环形一致性序列(CCS Reads),其中全长非嵌合序列(FLNC Reads)238454个,占40.46%,共鉴定出11271个可变剪切事件(AS),32102个SSR位点,11514个lncRNA和76293个完整的CDS序列。在NR、COG、GO、KEGG、Swiss-Prot和Pfam数据库中注释了83008个转录本。基于转录组数据,对参与类黄酮生物合成基因进行qRT-PCR检测,分析发现除了ANS外,类黄酮生物合成基因DFR,FLS,F3H,CYP93B2_16,C3′H,CHI,CYP75B1,HCT,ANR的表达量在蓟马取食7天后均显著上调,之后急剧下降(P≤0.05);ANS基因则随着蓟马取食时间的延长表达量逐渐上升。研究结果表明类黄酮生物合成基因参与苜蓿响应蓟马取食过程,且大部分基因参与早期防御反应,ANS可能参与晚期防御反应。 展开更多
关键词 紫花苜蓿 全长转录组 类黄酮 蓟马
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废弃纤维再生混凝土非线性蠕变模型
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作者 霍晓伟 盛冬发 +2 位作者 蔡猛 秦飞飞 柴正一 《科学技术与工程》 北大核心 2024年第3期1170-1175,共6页
为研究废弃纤维再生骨料混凝土的蠕变过程,引入一个非线性黏性元件,与经典Burgers模型串联组成五元件六参数非线性蠕变模型。通过对废弃纤维再生骨料混凝土的拉伸蠕变试验,得到了不同体积率纤维掺量以及不同再生骨料取代率混凝土的拉伸... 为研究废弃纤维再生骨料混凝土的蠕变过程,引入一个非线性黏性元件,与经典Burgers模型串联组成五元件六参数非线性蠕变模型。通过对废弃纤维再生骨料混凝土的拉伸蠕变试验,得到了不同体积率纤维掺量以及不同再生骨料取代率混凝土的拉伸蠕变柔度随加载时间的变化规律。参照蠕变模型中蠕变柔量与时间的关系式,通过基于Levenberg-Marquardt优化算法的混凝土蠕变参数识别,得到混凝土非线性蠕变模型的六个力学参数。模型拟合结果与试验结果一致,表明该模型能够较好地反映废弃纤维再生骨料混凝土的蠕变特性,也表明掺入0.12%体积率废弃聚丙烯纤维与50%再生骨料取代率的混凝土具有较好的经济实用价值。 展开更多
关键词 BURGERS模型 蠕变 再生骨料混凝土 Levenberg-Marquardt优化算法
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水性颜料体系无树脂色浆的制备与应用 被引量:2
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作者 吴振江 霍晓伟 +1 位作者 刘守军 杨颂 《应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期212-219,共8页
中性墨水属于热力学上不稳定的颜料悬浮体系,选择低黏度、高稳定性的色浆是保证墨水体系分散稳定性的重要手段之一。基于此,以颜料炭黑和酞菁蓝为着色剂,配合超分散剂(EK43)与协同增效剂(BM10),制备了两款适用于中性墨水体系的无树脂色... 中性墨水属于热力学上不稳定的颜料悬浮体系,选择低黏度、高稳定性的色浆是保证墨水体系分散稳定性的重要手段之一。基于此,以颜料炭黑和酞菁蓝为着色剂,配合超分散剂(EK43)与协同增效剂(BM10),制备了两款适用于中性墨水体系的无树脂色浆。首次从色浆粒径与体系分散稳定性角度出发,确定了EK43、BM10用量以及最佳研磨时间,并对其理化性能、稳定性与书写性能进行分析测试。结果表明:在黑色浆中添加质量分数10.0%的EK43、2.5%的BM10,研磨时间为90 min;在蓝色浆中添加质量分数8.0%的EK43、2.0%的BM10,研磨时间为120 min时,两种色浆的粒径与分散稳定性均达到最佳。所制备的无树脂色浆颜料固含量高、黏度较低、储存稳定性好、着色力强,以其调配的中性墨水书写性能良好,且具有较好的离心稳定性和耐热稳定性。 展开更多
关键词 无树脂色浆 研磨时间 分散稳定性 颜料固含量 着色力 书写性能
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Zeylenone promotes apoptosis of chronic myelogenous leukemia-derived K562 cells by a mechanism involving Jak2 and src kinase 被引量:1
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作者 huo xiao-wei LIAO Yong-hong +4 位作者 TIAN Yu GAO Li LIU Dong-yu LI Li-yong CAO Li 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1069-1070,共2页
OBJECTIVE The present study was designed to investigate anticancer effect of zeylenone(Zey)on K562 cells derived from chronic myelogenous leukemia(CML)both in vitro and in vivo,followed by exploring the underlying mec... OBJECTIVE The present study was designed to investigate anticancer effect of zeylenone(Zey)on K562 cells derived from chronic myelogenous leukemia(CML)both in vitro and in vivo,followed by exploring the underlying mechanisms.METHODS Initially,the effects of Zey on cel viability,proliferation,and apoptosis were measured in K562 cells by MTT,soft agar assay,AO/EB staining,hoechst 33258 staining and flow cytometric analysis after they were treated with Zey for indicated time,the involving signaling pathways were then investigated by JC-1,real-time quantitative polymerase chain reaction(RT-q PCR),Western blotting and immunofluorescence analysis.Furthermore,the in vivo anti-tumoractivity of Zey was assessed with nude xenografts and the involving mechanism was confirmed by immunohistochemical(IHC)and histopathological analysis.RESULTS We identified that Zey dose-dependently decreased cell viability,colony formation and expression of Proliferating Cell Nuclear Antigen(PCNA),and significantly induced K562 cell apoptosis via regulating Bcl-2 family members,decreasing mitochondrial transmembrane potential,and activating caspase-3,caspase-9,and caspase-8(P<0.05 or P<0.01).Further study revealed that Zey significantly inhibited phosphorylation of Jak2 and Src and downregulated their downstream proteins,including stat3,PI3K/AKT/m TOR,and ERK1/2 signaling pathways(P<0.05 or P<0.01).Zey also suppressed tumor growth with low toxicity in mouse xenograft model of K562cells through decreasing expression of Jak2 and Src.CONCLUSION Our data demonstrated that Zey substantially suppressed K562 cells both in vitro and in vivo through Jak2 and Src pathways.These findings suggest the potential of Zey as an effective anticancer agent in CML treatment. 展开更多
关键词 zeylenone APOPTOSIS K562 cells JAK2 SRC
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LD泵浦掺Pr3+的可见光固体激光器研究进展 被引量:6
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作者 霍晓伟 齐瑶瑶 +5 位作者 李宇琪 陈彬 唐敬玲 白振旭 王雨雷 吕志伟 《光电技术应用》 2019年第5期7-15,共9页
近年来,可见光激光器在激光彩色显示、生物光学、全息技术等领域备受关注。Pr^3+的能级结构决定了该离子可实现蓝光、绿光、橙光、红光及深红光等多个可见光波长的能级跃迁,随着蓝光激光二极管(LD)技术的成熟和商业化应用,利用蓝光LD泵... 近年来,可见光激光器在激光彩色显示、生物光学、全息技术等领域备受关注。Pr^3+的能级结构决定了该离子可实现蓝光、绿光、橙光、红光及深红光等多个可见光波长的能级跃迁,随着蓝光激光二极管(LD)技术的成熟和商业化应用,利用蓝光LD泵浦掺Pr^3+激光晶体直接实现可见光输出的激光器逐渐成为研究热点。对掺Pr^3+的连续、脉冲和单纵模全固态激光器的国内外研究现状和发展情况进行了综述。 展开更多
关键词 ^Pr3+ 激光二极管 全固态激光器 可见光
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省域历史城市文化资源体系性研究——以浙江省域历史城市资源研究为例 被引量:6
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作者 霍晓卫 张捷 +1 位作者 骆文 吴奇霖 《中国名城》 2019年第11期4-11,共8页
从历史发展进程来看,一定区域内历史城市具有共同的自然地理和人文地理基础,往往互相影响、彼此关联,各个城市不仅经历着自身独特的发展历程,也共同塑造出区域城市群特色与文化性格但在历史文化名城的保护与实践中,却较少以省域为单位... 从历史发展进程来看,一定区域内历史城市具有共同的自然地理和人文地理基础,往往互相影响、彼此关联,各个城市不仅经历着自身独特的发展历程,也共同塑造出区域城市群特色与文化性格但在历史文化名城的保护与实践中,却较少以省域为单位、对省域范围内所有历史城市文化资源进行体系性研究,从而以体系性的视角对历史城市的价值进行解读及定位、对历史城市文化资源进行评估、对省域历史城市文化资源给出整体保护展示建议。结合浙江省域历史城市文化资源评估与利用潜力研究课题实践,对省域历史城市文化资源体系性解读、评估、保护与展示的方法进行探索。 展开更多
关键词 历史城市资源 体系性 浙江省域
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从历史文化名城保护到历史城市保护的思考——以滇中历史城市保护实践为例 被引量:4
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作者 霍晓卫 刘东达 +1 位作者 张捷 贾宁 《中国名城》 2019年第10期4-12,共9页
历史城市具有一定数量的文化遗存资源与不同时期的格局风貌特征,是彰显我国传统城市文化体系的基础性重要承载体。在当今新型城镇化的背景下,存量更新和高质量发展成为城市主要发展方向,历史城市传统文化基因亟需在城市更新大潮中得以... 历史城市具有一定数量的文化遗存资源与不同时期的格局风貌特征,是彰显我国传统城市文化体系的基础性重要承载体。在当今新型城镇化的背景下,存量更新和高质量发展成为城市主要发展方向,历史城市传统文化基因亟需在城市更新大潮中得以有效保留和提质发展。因此,拓宽城市文化遗产保护理念,从历史文化名城走向历史城市,借鉴历史文化名城保护工作体系和技术方法对一般历史城市实施保护,具有广泛的现实需求和重要的现实意义。结合参与的若干滇中历史城市保护项目实践,对历史城市的文化特性、保护发展思路等方面进行探讨。 展开更多
关键词 历史城市 历史文化名城 城市群滇中坝区城市
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一株牛源致病性蜡样芽孢杆菌的分离鉴定与部分生物学特性分析 被引量:10
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作者 霍晓伟 宋扬 +6 位作者 刘杰 范培超 史量全 蒙小刚 刘锴 温树波 鲁会军 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2020年第11期1252-1256,共5页
目的分离鉴定牛源致病性蜡样芽孢杆菌,并分析其部分生物学特性。方法利用PCR方法检测猝死西门塔尔病牛各组织脏器中常见病毒感染情况,同时做涂片镜检,分离感染的细菌,通过形态学观察、生化检测、药敏试验、16SrRNA基因序列分析、毒力基... 目的分离鉴定牛源致病性蜡样芽孢杆菌,并分析其部分生物学特性。方法利用PCR方法检测猝死西门塔尔病牛各组织脏器中常见病毒感染情况,同时做涂片镜检,分离感染的细菌,通过形态学观察、生化检测、药敏试验、16SrRNA基因序列分析、毒力基因扩增、动物致病性实验等对分离菌进行鉴定及部分生物学特性分析。结果从猝死牛肝脏中分离到1株革兰阳性蜡样芽孢杆菌,将其命名为TL-19,该菌株含有entFM、nheB、hblD、nblA、nheC、nheA、hblC和cytk等毒力基因,且对小鼠具有较强的致病性,感染鼠24h后全部死亡。结论成功分离到1株牛源蜡样芽孢杆菌TL-19。该菌含有多种毒力基因,通辽市西门塔尔牛猝死与该TL-19感染有关。 展开更多
关键词 蜡样芽孢杆菌 细菌生化实验 药敏实验 致病性
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鹅源奇异变形杆菌的分离鉴定及毒力基因检测 被引量:10
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作者 尹有勤 马德慧 +3 位作者 李岩松 蒙小刚 霍晓伟 刘锴 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期2152-2163,共12页
【背景】奇异变形杆菌(Proteusmirabilis)是一种人兽共患机会致病菌,革兰氏阴性,兼性厌氧,呈多形性。【目的】探明内蒙古自治区通辽市某养殖场雏鹅发生死亡的病因,研究致病菌的分类地位和毒力基因携带情况。【方法】通过病原菌的筛查和... 【背景】奇异变形杆菌(Proteusmirabilis)是一种人兽共患机会致病菌,革兰氏阴性,兼性厌氧,呈多形性。【目的】探明内蒙古自治区通辽市某养殖场雏鹅发生死亡的病因,研究致病菌的分类地位和毒力基因携带情况。【方法】通过病原菌的筛查和感染试验确定发病原因,对其16S rRNA基因测序,建立病原菌系统进化树,结合BD PhoenixTM 100全自动微生物鉴定仪对病原菌进行分析鉴定,综合判定致病菌的种类及其分类地位;根据已报道的基因序列合成奇异变形杆菌的ure C、zapA、mrp A、ucaA、rsbA、pmfA、atfA、atfC8个毒力基因引物,通过PCR扩增研究病原菌毒力基因携带情况。【结果】致病茵的16Sr RNA基因与已报道的奇异变形杆菌(P.mirabilis)相似性在99%以上,通过构建系统进化树和BDPhoenixTM100全自动微生物鉴定仪鉴定,确定该菌株为P.mirabilis并编号为AYQ-1;8种毒力基因在该致病菌中均被检测到;雏鹅腹腔注射感染可导致雏鹅死亡,半致死浓度(LD_(50))为1.51×10~7 CFU/mL;药敏试验结果显示,该菌对链霉素、氨曲南和氧氟沙星等19种药物敏感,对万古霉素、青霉素和四环素等15种药物耐药。【结论】AYQ-1经鉴定为鹅奇异变形杆菌,毒力基因型为ureC(+)、zapA(+)、mrpA(+)、ucaA(+)、rsbA(+)、pmfA(+)、atfA(+)、atfC(+)型。 展开更多
关键词 奇异变形杆菌 鉴定 毒力基因
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不同来源奇异变形杆菌对小鼠致病力及其毒力基因携带情况的比较 被引量:5
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作者 尹有勤 韩春华 +3 位作者 崔一龙 石芸 霍晓伟 马德慧 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第3期289-294,共6页
目的比较通辽地区不同来源奇异变形杆菌对小鼠致病力及其毒力基因携带情况。方法取4株(SPM、GPM、BPM-1和BPM-2)不同来源的奇异变形杆菌,进行生化鉴定、药物敏感性测试及动物致病性试验,对4株菌株的8种毒力基因(ureC、zapA、mrpA、ucaA... 目的比较通辽地区不同来源奇异变形杆菌对小鼠致病力及其毒力基因携带情况。方法取4株(SPM、GPM、BPM-1和BPM-2)不同来源的奇异变形杆菌,进行生化鉴定、药物敏感性测试及动物致病性试验,对4株菌株的8种毒力基因(ureC、zapA、mrpA、ucaA、rsbA、pmfA、atfA、atfC)进行PCR检测,对其16S r RNA基因序列进行同源性和系统进化树分析。结果 4株菌株均被鉴定为奇异变形杆菌;对4株病原菌均高度敏感的药物有丁胺卡那、美罗培南、头孢他啶、头孢噻肟、头孢吡肟、他巴克坦和氨曲南7种,均不敏感的药物有庆大霉素、亚胺培南、头孢唑啉、氨苄西林、克拉维酸、黏菌素、磺胺甲恶唑、氯霉素、环丙沙星和四环素10种;4株菌株的半数致死量(LD50)按BPM-2、BPM-1、SPM、GPM依次降低,鹅源的毒力最高;奇异变形杆菌具有不同的毒力基因谱,8种毒力基因在菌株SPM、GPM、BPM-2中均被检出,菌株BPM-2未检出ucaA基因。BPM-2和BPM-1处于同一分支,但分处于不同的末支;SPM和GPM分处于不同的小分支。结论不同来源的奇异变形杆菌对小鼠的致病力存在较小的差异,且对小鼠有致病力的基因表型与该毒力基因的分布可能存在一定的相关性。 展开更多
关键词 奇异变形杆菌 鹅源 牛源 猪源 致病力 毒力基因
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一株进口胎牛血清源BVDV毒株的分离与鉴定 被引量:4
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作者 温树波 宋扬 +9 位作者 蒙小刚 陈卓 孟令浩 王沐笙 王云龙 霍晓伟 刘锴 翟景波 鲁会军 金宁一 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2021年第7期743-746,共4页
目的分离进口胎牛血清中的牛病毒性腹泻-粘膜病病毒(BVDV)毒株并进行系统进化分析。方法通过RT-PCR检测购买胎牛血清中的BVDV核酸,确定有BVDV污染后。将该血清样品接种MDBK细胞,连续传代5次,利用免疫荧光、PCR扩增、测序以及遗传进化分... 目的分离进口胎牛血清中的牛病毒性腹泻-粘膜病病毒(BVDV)毒株并进行系统进化分析。方法通过RT-PCR检测购买胎牛血清中的BVDV核酸,确定有BVDV污染后。将该血清样品接种MDBK细胞,连续传代5次,利用免疫荧光、PCR扩增、测序以及遗传进化分析等方法对其进行鉴定。结果成功分离到1株BVDV毒株,PCR和免疫荧光检测均为BVDV阳性,命名为FBS-TL20。基于5’UTR、Npro和E2基因序列的同源性分析表明,FBS-TL20毒株与分离自埃及新生羊体内的毒株BSU1同源性分别为99.18%、98.89%和97.27%。遗传进化分析显示,该毒株属于BVDV-1b型。结论从进口胎牛血清中成功分离到1株非致细胞病变型BVDV 1 b亚型毒株,为进一步研究BVDV的相关分子机制提供了实验材料。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 分离鉴定 遗传进化分析
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PRRSV体外感染原代猪肺泡巨噬细胞上调IFITMs分子mRNA转录水平的研究 被引量:2
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作者 温树波 蒙小刚 +4 位作者 霍晓伟 刘锴 宋扬 翟景波 鲁会军 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2021年第8期867-870,877,共5页
目的检测PRRSV病毒体外感染原代猪肺泡巨噬细胞(PAM)对猪源IFITM分子mRNA转录水平的影响。方法无菌采集PRRSV、PCV2和JEV阴性仔猪肺脏,分离PAM并用PRRSV病毒接种感染。于感染后不同时间点收集细胞,采用PCR检测PAM细胞PRRSV感染情况,采... 目的检测PRRSV病毒体外感染原代猪肺泡巨噬细胞(PAM)对猪源IFITM分子mRNA转录水平的影响。方法无菌采集PRRSV、PCV2和JEV阴性仔猪肺脏,分离PAM并用PRRSV病毒接种感染。于感染后不同时间点收集细胞,采用PCR检测PAM细胞PRRSV感染情况,采用荧光定量PCR检测PRRSV在PAM细胞中的复制情况以及IFITM分子mRNA的转录水平变化。结果成功分离到猪原代PAM细胞,接种PRRSV后出现明显的细胞病变。荧光定量PCR检测结果显示,PRRSV感染12 h后可显著上调PAM细胞中IFITM1、IFITM2和IFITM3 mRNA的转录水平,分别在感染后的第36 h、24 h和36 h达到高峰。结论 PRRSV体外感染PAM可显著上调猪IFITM mRNA转录,表明IFITM参与宿主抗PRRSV天然免疫反应,为揭示抗PRRSV天然免疫反应机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征 猪肺泡巨噬细胞 荧光定量PCR 干扰素刺激基因
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甘草酸对酒精性肝损伤大鼠脏器的保护作用:18α-与18β-甘草酸配比的影响 被引量:3
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作者 孙晓可 杨飒 +3 位作者 霍小位 王士中 孟祥波 赵燕燕 《现代食品科技》 EI CAS 北大核心 2018年第7期21-27,共7页
探讨了不同配比的18α-与18β-甘草酸(Gly)对酒精性肝损伤大鼠重要脏器组织形态学的影响。健康雄性SD大鼠,随机分组,即正常对照组、模型对照组、阳性药物对照组(水飞蓟宾)、7个给药组(18α-Gly与18β-Gly不同配比组,浓度为10.83 mg/kg;... 探讨了不同配比的18α-与18β-甘草酸(Gly)对酒精性肝损伤大鼠重要脏器组织形态学的影响。健康雄性SD大鼠,随机分组,即正常对照组、模型对照组、阳性药物对照组(水飞蓟宾)、7个给药组(18α-Gly与18β-Gly不同配比组,浓度为10.83 mg/kg;配比为10:0,8:2,6:4,5:5,4:6,2:8,0:10)。给药4周后,摘取各组大鼠的肝脏、肾脏及脾脏等重要组织,称重,计算脏器指数,进行常规HE染色和油红O染色,光镜下观察不同给药组大鼠脏器的病理特征变化。结果显示,18α-Gly与18β-Gly最佳配比为2:8时能显著降低呼吸消化系统中的脏器指数,极显著降低运动系统中骨骼肌指数,明显升高脑指数;明显降低心脏指数和脾脏指数。配比为4:6和2:8时减轻肝细胞脂肪变性并降低肝脏内脂质堆积;配比小于或等于4:6时肾小球炎症减轻,毛细血管袢清晰,玻璃样变减少;配比为4:6时脾脏内界面红白髓分界清楚。综上,18α-Gly与18β-Gly改善酒精引起的脏器损伤的最佳配比为4:6和2:8。 展开更多
关键词 18Α-甘草酸 18Β-甘草酸 不同配比 酒精性肝损伤 脏器 组织病理
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不同18α和18β-甘草酸配比对P-gp转运功能和大鼠CYP3A酶活性的影响 被引量:2
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作者 霍小位 王士中 +2 位作者 孟祥波 柳亚飞 赵燕燕 《现代食品科技》 EI CAS 北大核心 2018年第9期26-31,共6页
本研究旨在探究不同配比的18α、18β-甘草酸(18α、18β-GA)对P-糖蛋白(P-gp)转运功能和大鼠CYP3A酶活性的影响。建立Caco-2细胞单层模型,通过检测接收池罗丹明123溶液的荧光强度,考察不同配比的18α、18β-GA对P-gp转运功能的影响;利... 本研究旨在探究不同配比的18α、18β-甘草酸(18α、18β-GA)对P-糖蛋白(P-gp)转运功能和大鼠CYP3A酶活性的影响。建立Caco-2细胞单层模型,通过检测接收池罗丹明123溶液的荧光强度,考察不同配比的18α、18β-GA对P-gp转运功能的影响;利用大鼠的肝脏制作微粒体,通过温孵实验检测不同浓度及不同比的18α、18β-GL对CYP3A酶活性的影响。当18α-GA和18β-GA配比为6:4时,对P-gp的抑制作用最强;当两种异构体配比为0:10时,对P-gp的诱导作用最强。18α-GA浓度在50~100μg/m L范围内,对CYP3A酶活性有明显抑制作用。18β-GA浓度在10~50μg/m L范围内,对CYP3A酶活性有明显诱导作用。在甘草酸总浓度为10μg/m L,18α、18β-GA比例为2:8时,对CYP3A酶活性的诱导作用最强,高于相同浓度的18β-GA单体。随着药物浓度及18α-GA比例增加,对CYP3A酶活性的抑制作用增强。当浓度为100μg/m L、18α与18β-GA配比为10:0时,对CYP3A酶抑制作用最强。18α、18β-GA的配比不同,对P-gp转运功能及对大鼠CYP3A酶活性的影响不同,这将为指导临床用药提供科学依据。 展开更多
关键词 甘草酸 细胞色素P-450 CYP3A P糖蛋白
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基于转录组数据分析药用大黄的密码子使用偏好性 被引量:11
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作者 高梦琦 邹建珍 +5 位作者 霍小位 李依民 张明英 高静 张岗 刘蒙蒙 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第20期6344-6349,共6页
目的研究药用大黄Rheum officinale转录组编码序列的密码子使用特点及其影响因素,为蒽醌类化合物异源合成的载体选择及药用大黄分子进化研究提供理论基础。方法利用perl程序及Codon W软件分析4733条药用大黄转录组编码序列的密码子使用... 目的研究药用大黄Rheum officinale转录组编码序列的密码子使用特点及其影响因素,为蒽醌类化合物异源合成的载体选择及药用大黄分子进化研究提供理论基础。方法利用perl程序及Codon W软件分析4733条药用大黄转录组编码序列的密码子使用偏好性。结果药用大黄转录组编码序列的GC、GC3平均含量分别为45.6%、44.73%,GC12与GC3存在显著正相关(r=0.215,P<0.001);ENc-GC3中性图及偏倚性分析结果显示,大部分基因分布于远离期望曲线和平面中心点,大部分基因分布偏离期望曲线和中心点。通过基因高表达筛选密码子方法确定了29个药用大黄的最优密码子,大多数的最优密码子以U和A结尾。结论突变压力在药用大黄转录组编码序列的密码子使用偏好性形成过程这起到主要作用。 展开更多
关键词 药用大黄 转录组 密码子偏好性 最优密码子 突变压力
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