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萝卜和白菜属间杂种硫甙基因表达与组分特征分析 被引量:1
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作者 王鹏 李晓曼 +6 位作者 holger budahn 刘同金 宋江萍 王海平 张晓辉 阳文龙 李锡香 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1279-1286,1294,共9页
硫甙是十字花科蔬菜中重要的次生代谢物质。在不同的十字花科作物中,硫甙的种类及其降解产物不同,从而产生了各自的特殊风味与生物功能。萝卜的主要硫甙4-甲基亚磺酰基-3-丁烯基硫甙(RAE)及其降解产物具有强力的抗癌活性;而白菜的主要硫... 硫甙是十字花科蔬菜中重要的次生代谢物质。在不同的十字花科作物中,硫甙的种类及其降解产物不同,从而产生了各自的特殊风味与生物功能。萝卜的主要硫甙4-甲基亚磺酰基-3-丁烯基硫甙(RAE)及其降解产物具有强力的抗癌活性;而白菜的主要硫甙2-羟基-3-丁烯基硫甙(PRO)的降解产物噁唑烷硫酮,被认为有致甲状腺肿大的副作用。本研究采用高效液相色谱分析法,分析了萝卜(‘36-2’)、白菜(‘Chiifu’)以及属间杂种(DH)中硫甙组分及其含量,共鉴定出13种硫甙。萝卜中的主要硫甙是4-甲硫基-3-丁烯基硫甙(RSA)和RAE;白菜中的主要硫甙为PRO、3-丁烯基硫甙(NAP)和吲哚-3-甲基硫甙(GBC);远缘杂交种的主要硫甙则有RAE、4-戊烯基硫甙(GBN)、NAP和PRO。通过与‘36-2’的比较转录组分析,发现DH中硫甙通路基因有14个下调表达和23个上调表达,其中萝卜特有基因RsIQD1.1和RsMYB34.2下调表达,而RsMYB34.1上调表达。值得注意的是萝卜中的RsFMOGS-OX2.1在DH中显著上调表达。通过与‘Chiifu’的比较分析,发现DH中硫甙通路基因有24个下调表达和15个上调表达,其中白菜特有基因BrIPMI-SSU3.1、BrIPMDH3.1和BrMAM3.1显著上调表达。这些基因在不同物种中的表达特点与其硫甙组分的变化有关。这在一定程度上证实远缘杂交可能通过改变后代的遗传组成和基因表达而改变其硫甙组成及含量,为以属间杂种作为桥梁种质实现物种间基因交流,创制高品质十字花科新种质奠定了理论基础和技术支撑。 展开更多
关键词 硫甙 萝卜 白菜 远缘杂种 转录组
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油菜附加系EE抗根结线虫的蛋白质组学初步研究
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作者 余萍 董超 +2 位作者 罗红梅 holger budahn 张绍松 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第10期2267-2273,共7页
【目的】通过蛋白质组技术寻找抗线虫油菜附加系EE和感病油菜接种根结线虫后根系表达蛋白的差异,筛选出抗根结线虫相关蛋白。【方法】以抗根结线虫的油菜附加系EE和感根结线虫的油菜根系为材料,通过蛋白质组学双向电泳技术和Image Maste... 【目的】通过蛋白质组技术寻找抗线虫油菜附加系EE和感病油菜接种根结线虫后根系表达蛋白的差异,筛选出抗根结线虫相关蛋白。【方法】以抗根结线虫的油菜附加系EE和感根结线虫的油菜根系为材料,通过蛋白质组学双向电泳技术和Image Master 5.0软件分析筛选差异表达蛋白,经MALDI-TOF-TOF/MS质谱测序鉴定蛋白。另外,通过Gene Ontology,KEGG,WoLF PSORT和STRING生物信息学分析对鉴定蛋白进行功能分类、代谢途径分析、亚细胞定位和蛋白互作分析。【结果】Madora和油菜附加系EE分别有1184和1163个蛋白点。21个差异蛋白质经MALDI-TOF/TOF MS质谱测序成功鉴定,其中一半以上定位于细胞外(52.38%),其次为细胞质(28.57%),叶绿体(4.76%),线粒体(4.76%),内质网(4.76%),液泡(4.76%)。蛋白质相互作用分析表明,与抗病相关的上调蛋白内源性α-淀粉酶/枯草杆菌蛋白酶抑制剂与3-异丙基苹果酸脱水酶大亚基,微管蛋白α-6链,表皮特异性分泌糖蛋白EP1,BnaC04g03560D和BnaC06g34210D 5个蛋白质具有一定的相关性。【结论】筛选的抗线虫相关蛋白对于将来克隆抗性基因和用分子标记培育新的抗性品种奠定基础。 展开更多
关键词 油菜 油菜附加系 根结线虫 差异表达蛋白
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甘蓝型油菜-萝卜C染色体附加系与普通白菜杂交F_(1)的SSR标记鉴定
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作者 丁云花 holger budahn +1 位作者 赵泓 赵岫云 《中国蔬菜》 北大核心 2021年第8期46-50,共5页
根据21个已知萝卜染色体组成的标准材料及其基因组中萝卜染色体的组成信息,利用SSR分子标记技术,确定了萝卜C染色体的特异SSR标记RsSA078-170和RH148-190,并应用这2个标记对甘蓝型油菜-萝卜C染色体附加系CC与普通白菜559杂交获得的F_(1... 根据21个已知萝卜染色体组成的标准材料及其基因组中萝卜染色体的组成信息,利用SSR分子标记技术,确定了萝卜C染色体的特异SSR标记RsSA078-170和RH148-190,并应用这2个标记对甘蓝型油菜-萝卜C染色体附加系CC与普通白菜559杂交获得的F_(1)进行外源萝卜C染色体鉴定,结果表明全部F_(1)单株都扩增出了萝卜C染色体的特异条带。同时,利用萝卜基因组特异探针pURsN对F_(1)基因组进行荧光原位杂交鉴定,结果显示F_(1)有杂交信号,表明F_(1)含有萝卜基因组,该结果佐证了SSR特异标记RsSA078-170和RH148-190鉴定结果的准确性。说明SSR特异标记RsSA078-170和RH148-190可以用于甘蓝型油菜-萝卜C染色体附加系与普通白菜杂交后代中外源萝卜C染色体的鉴定。 展开更多
关键词 萝卜C染色体 普通白菜 SSR分子标记 荧光原位杂交
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萝卜-甘蓝型油菜中萝卜基因组的RAPD与dpRAPD分析效率研究 被引量:2
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作者 丁云花 holger budahn +1 位作者 简元才 Herbert Peterka 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2004年第2期20-23,共4页
应用RAPD与dpRAPD方法鉴定萝卜-甘蓝型油菜中萝卜基因组,筛选了140条随机引物。结果表明,平均每条引物(组合)能产生的萝卜基因组特异标记数dpRAPD高于RAPD,分别为1.69和1.33;在dpRAPD扩增产物中有77.6%谱带清晰易辨,略高于RAPD(75.4%... 应用RAPD与dpRAPD方法鉴定萝卜-甘蓝型油菜中萝卜基因组,筛选了140条随机引物。结果表明,平均每条引物(组合)能产生的萝卜基因组特异标记数dpRAPD高于RAPD,分别为1.69和1.33;在dpRAPD扩增产物中有77.6%谱带清晰易辨,略高于RAPD(75.4%)。两者所检测到的萝卜基因组标记大部分为各自特异的扩增产物。由于结合了荧光标记引物,dpRAPD反应产物可在Genetic Analyzer上分离检测,因此能检测到100 bp以下的小片段DNA。 展开更多
关键词 萝卜-甘蓝型油菜 萝卜基因组 RAPD dpRAPD 多态性
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The carrot monoterpene synthase gene cluster on chromosome 4 harbours genes encoding flavour-associated sabinene synthases 被引量:1
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作者 Sven Reichardt holger budahn +4 位作者 Dominic Lamprecht David Riewe Detlef Ulrich Frank Dunemann Lilya Kopertekh 《Horticulture Research》 SCIE 2020年第1期69-81,共13页
In plants,low molecular weight terpenes produced by terpene synthases(TPS)contribute to multiple ecologically and economically important traits.The present study investigates a carrot terpene synthase gene cluster on ... In plants,low molecular weight terpenes produced by terpene synthases(TPS)contribute to multiple ecologically and economically important traits.The present study investigates a carrot terpene synthase gene cluster on chromosome 4 associated with volatile monoterpene production.Two carrot mutants,yellow and cola,which are contrasting in the content of low molecular weight terpenes,were crossed to develop an F2 mapping population.The mapping analysis revealed overlapping QTLs on chromosome 4 for sabinene,α-thujene,α-terpinene,γ-terpinene,terpinen-4-ol and 4-carene.The genomic region of this locus includes a cluster of five terpene synthase genes(DcTPS04,DcTPS26,DcTPS27,DcTPS54 and DcTPS55).DcTPS04 and DcTPS54 displayed genotype-and tissue-specific variation in gene expression.Based on the QTL mapping results and the gene expression patterns,DcTPS04 and DcTPS54 were selected for functional characterization.In vitro enzyme assays showed that DcTPS54 is a single-product enzyme catalysing the formation of sabinene,whereas DcTPS04 is a multiple-product terpene synthase producingα-terpineol as a major product and four additional products including sabinene,β-limonene,β-pinene and myrcene.Furthermore,we developed a functional molecular marker that could discriminate carrot genotypes with different sabinene content in a set of 85 accessions. 展开更多
关键词 cluster volatile mapping
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