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杉木GRF和GIF基因家族鉴定、表达与互作分析
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作者 邱姗 王文新 +2 位作者 江梅 黄华宏 林二培 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1224-1233,共10页
生长调节因子(GRF)和GRF相互作用因子(GIF)在植物的生长发育和逆境胁迫响应中发挥重要作用。为研究GRF和GIF基因在杉木生长发育和逆境胁迫响应中的功能,本研究基于杉木全长转录组数据,利用生物信息学手段共鉴定获得5个ClGRFs基因和2个Cl... 生长调节因子(GRF)和GRF相互作用因子(GIF)在植物的生长发育和逆境胁迫响应中发挥重要作用。为研究GRF和GIF基因在杉木生长发育和逆境胁迫响应中的功能,本研究基于杉木全长转录组数据,利用生物信息学手段共鉴定获得5个ClGRFs基因和2个ClGIFs基因。分析结果显示,ClGRFs氨基酸残基数目范围为386(ClGRF4)~723 aa(ClGRF3),等电点为7.07(ClGRF4)~9.26(ClGRF5);2个ClGIFs蛋白氨基酸数目分别为242和258 aa,等电点均在6左右,蛋白质分子质量分别为25.64和27.96 kDa。保守结构域和基序分析发现ClGRFs蛋白均含QLQ和WRC结构域,ClGIFs蛋白均含SSXT结构域,且高度保守。进一步分析结果显示,ClGRFs分别属于进化枝Ⅲ和进化枝Ⅵ,且均受miR396调控。表达分析结果表明,ClGRFs基因的表达具有一定的组织特异性,而ClGIFs在不同组织呈组成性表达,且ClGRFs和ClGIFs基因均能响应赤霉素(GA3)和水杨酸(SA)的处理。酵母双杂交结果表明5个ClGRFs蛋白和2个ClGIFs蛋白均存在互作关系。本研究结果为进一步研究杉木GRF和GIF基因的功能提供了理论基础。 展开更多
关键词 杉木 GRF基因 GIF基因 表达分析 互作
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利用流式细胞术鉴定桦木染色体倍性和DNA含量 被引量:1
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作者 黄茂根 沈凝 +7 位作者 刘雪羽 吴兴盛 陈爱平 孟岩 胡现铬 童再康 黄华宏 楼雄珍 《西南林业大学学报(自然科学)》 CAS 北大核心 2023年第1期49-57,共9页
基于流式细胞术(FCM)研究体系,构建能快速、准确鉴定桦木属植物倍性和测定DNA含量的研究体系,是测定不同桦木属植物倍性与基因组大小的有效方法。使用流式细胞术检测7种桦树属类物种,以物种不同生长状态(嫩叶、幼叶、成熟叶)为实验材料... 基于流式细胞术(FCM)研究体系,构建能快速、准确鉴定桦木属植物倍性和测定DNA含量的研究体系,是测定不同桦木属植物倍性与基因组大小的有效方法。使用流式细胞术检测7种桦树属类物种,以物种不同生长状态(嫩叶、幼叶、成熟叶)为实验材料,不同存储方式(常温、冷藏和聚乙烯吡咯烷酮保存PVP)进行实验处理,对9种常用的裂解液进行筛选与优化。结果表明:桦木属植物DNA含量测定中,新鲜幼叶以1%PVP浸泡常温保存,并使用MgSO_(4)裂解液制备细胞核悬浮液上机效果最佳;桦木属植物中,基因组倍性依次为黑桦((2.09±0.04)Gb,8倍体)>坚桦((1.53±0.08)Gb,6倍体)>光皮桦((0.87±0.05)Gb,4倍体)=岳桦((0.80±0.07)Gb,4倍体)>垂枝桦((0.46±0.03)Gb,2倍体)=河桦((0.51±0.01)Gb,2倍体)。因此,桦木属植物DNA倍性和DNA含量可以通过FCM研究体系进行测定,且3倍体((0.66±0.02)Gb)子代的鉴定结果表明光皮桦与河桦之间不存在生殖隔离。 展开更多
关键词 流式细胞术 桦木 染色体倍性 DNA含量
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农村配电网低电压治理研究进展 被引量:4
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作者 夏得青 向星宇 +2 位作者 李宽龙 黄华鸿 黎朝晖 《电气技术》 2023年第6期1-5,共5页
配电网作为供电系统的主要组成部分,与广大人民群众的生产生活关系密切。当前,农村配电网普遍存在低电压的问题,用户端的用电量快速增加,导致电能质量降低,影响用户的正常生活水平。本文通过对近期相关文献的研究,介绍低电压产生的原因... 配电网作为供电系统的主要组成部分,与广大人民群众的生产生活关系密切。当前,农村配电网普遍存在低电压的问题,用户端的用电量快速增加,导致电能质量降低,影响用户的正常生活水平。本文通过对近期相关文献的研究,介绍低电压产生的原因和解决低电压问题的方法。低电压产生的原因主要从线路供电半径较长、无功补偿设置不合理、低压三相负载不平衡、电源点布置不当等几个方面进行分析,低电压解决方法从技术和管理措施两个方面进行阐述,最后提出适合我国台区低电压综合治理的建议。 展开更多
关键词 低电压 配电网 电能质量 治理措施
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战场海流对管装鱼雷反潜作战效能影响分析
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作者 程帅 李斌 +1 位作者 黄华红 陈嘉杰 《水下无人系统学报》 2023年第5期798-803,共6页
海流的存在对反潜作战的声呐状态、鱼雷和目标等均有一定影响,严重时甚至会影响作战结果。文中以水面舰反潜为例,开展了多种作战想定的反潜全流程仿真,研究海流对反潜作战效能影响。通过构建海流、声呐误差、鱼雷运动与自导检测误差等... 海流的存在对反潜作战的声呐状态、鱼雷和目标等均有一定影响,严重时甚至会影响作战结果。文中以水面舰反潜为例,开展了多种作战想定的反潜全流程仿真,研究海流对反潜作战效能影响。通过构建海流、声呐误差、鱼雷运动与自导检测误差等数学模型,设定多种想定态势并结合仿真软件,分析了不同海流流向下的管装鱼雷反潜作战效能。仿真结果表明,不同攻击阵位下反潜作战中海流流向对鱼雷命中概率具有不同程度的影响。当海流与鱼雷设定主航向夹角在0°~90°之间时,鱼雷的命中概率相较于无海流时提升较大,而当海流与鱼雷航向的夹角在-180°~0°之间时,鱼雷命中概率较无海流的情况下有所降低。通过获取作战海域的海流强度及走向可为精细化预估管装鱼雷反潜作战能力、优化管装鱼雷反潜射击参数提供支撑。 展开更多
关键词 反潜作战 鱼雷 海流 作战效能
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云锦杜鹃转录组SSR分析及其分子标记开发 被引量:14
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作者 杨彬 许蔷薇 +4 位作者 牛明月 楼雄珍 黄华宏 童再康 林二培 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期2335-2345,共11页
为开发云锦杜鹃SSR分子标记,并研究云锦杜鹃SSR引物在杜鹃属内的通用性,本研究利用Misa软件对云锦杜鹃转录组数据进行SSR信息分析,并开发引物通过PCR扩增和毛细管电泳检测,进行了引物多态性和通用性分析。结果表明,利用云锦杜鹃转录组... 为开发云锦杜鹃SSR分子标记,并研究云锦杜鹃SSR引物在杜鹃属内的通用性,本研究利用Misa软件对云锦杜鹃转录组数据进行SSR信息分析,并开发引物通过PCR扩增和毛细管电泳检测,进行了引物多态性和通用性分析。结果表明,利用云锦杜鹃转录组数据拼接组装得到84 633条Unigene,通过Misa软件发现21 900个SSR位点,发生频率为20.58%,平均分布距离为2.67 kb,单、二、三个核苷酸重复为主要的SSR位点类型;根据云锦杜鹃SSR序列设计获得SSR引物8 439对,随机选取45对SSR引物进行多态性分析,结果显示32对SSR位点具有多态性,多态性位点的等位基因介于2~8个,平均等位基因数5.25个;有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、香农多样性指数和多态信息含量的平均值分别为3.175 5、0.700 6、0.640 4、1.326 4和0.701 7。进一步分析表明,其中25对SSR引物可在其他31种不同杜鹃属植物(或品种)中扩增出多态性条带,可转移率为78.125%,表明云锦杜鹃SSR引物在杜鹃属植物间具有较高的通用性。本研究结果为云锦杜鹃遗传多样性分析、分子标记辅助育种以及杜鹃属植物亲缘关系等研究奠定了一定的理论基础。 展开更多
关键词 云锦杜鹃 转录组 SSR 多态性
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杉木NAC转录因子基因ClNAC1的克隆、表达及单核苷酸多态性分析 被引量:4
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作者 魏明科 俞金健 +4 位作者 黄晓龙 刘琼瑶 黄华宏 林二培 童再康 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第9期49-59,共11页
【目的】克隆与杉木次生壁形成相关的Cl NAC1基因,在组织表达特异性分析基础上开展该基因的单核苷酸多态性(SNP)及其连锁不平衡(LD)分析,以期为深入解析该基因功能和开展LD作图提供重要依据。【方法】基于杉木根、茎、叶等混合样本转录... 【目的】克隆与杉木次生壁形成相关的Cl NAC1基因,在组织表达特异性分析基础上开展该基因的单核苷酸多态性(SNP)及其连锁不平衡(LD)分析,以期为深入解析该基因功能和开展LD作图提供重要依据。【方法】基于杉木根、茎、叶等混合样本转录组测序获得的相关数据,分离杉木Cl NAC1的c DNA序列,进行同源比对和进化树构建分析。利用实时荧光定量PCR技术(q PCR)检测Cl NAC1的表达模式。通过MEGA 6.0和Dna SP 5.0分析Cl NAC1在40个杉木无性系的SNP变异,以及LD衰减程度。【结果】分离到Cl NAC1基因c DNA序列1 286 bp,开放阅读框(ORF)长度为1 092 bp,编码蛋白质在N端含有1个由128个氨基酸残基组成的NAC结构域。相应基因组序列长2 546 bp,有3个外显子和3个内含子,且第1个内含子位于5'非翻译区(UTR)。系统进化树分析表明,Cl NAC1蛋白位于B分支,与拟南芥的NST1/2/3、毛果杨的Ptr WND2A/B等聚在一起,属于次生生长相关的NAC转录因子类别。Cl NAC1在雄球花中的表达量最大,在当年生成熟叶中最小;该基因在当年生半木质化茎中的表达量是未木质化茎的2.8倍,且在去年生茎木质部中的表达量比皮层大3倍左右。利用来自6个地理种源的40个无性系发现Cl NAC1内存在104个常见SNP位点,平均发生频率为1/24 bp,多样性水平达到0.012 53。编码区域有32个SNP位点,其中25个属于同义突变,7个属于错义突变。SNP多样性指数πtot、πsil、πs、πn在6个群体间的差异不显著,且不同群体的非同义突变多样性πn皆小于同义突变多样性πs。LD分析显示,当r2>0.1时,在6个群体中LD衰退序列长度在1 025~2 460 bp间变化,在基因内部LD水平已衰退至不显著。【结论】杉木Cl NAC1基因可能参与次生壁的发育。Cl NAC1在不同无性系间存在丰富的SNP变异,且在进化中主要受纯化选择作用。不同杉木群体中Cl NAC1基因SNP位点间的LD皆在较短序列长度内迅速消失,表明基于候选基因的LD作图策略在杉木关联作图研究中是可行的。 展开更多
关键词 杉木 NAC转录因子 基因表达 SNP 连锁不平衡
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3种杉木种子活力测定方法比较 被引量:6
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作者 徐振飞 过晟鹏 +4 位作者 钱旺 包苗清 林二培 黄华宏 童再康 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1230-1234,共5页
【目的】建立一种快速简便的杉木Cunninghamia laneolata种子活力测定方法。【方法】以3个不同品种杉木种子为材料,以标准发芽法为参照,比较四氮唑法(TTC)和紫外分光光度计法(UVS)测定种子活力时的准确性和便捷性。【结果】标准发芽法... 【目的】建立一种快速简便的杉木Cunninghamia laneolata种子活力测定方法。【方法】以3个不同品种杉木种子为材料,以标准发芽法为参照,比较四氮唑法(TTC)和紫外分光光度计法(UVS)测定种子活力时的准确性和便捷性。【结果】标准发芽法测定种子活力最为准确,但耗费时间长,难以开展大批量测定;TTC法测定杉木种子活力准确度不稳定,且操作繁琐;UVS法的测定值与真实萌发率比较接近,有较高可信度,且操作简便。【结论】UVS法可作为快速测定杉木种子活力的优选方法。 展开更多
关键词 森林培育学 杉木 种子活力 标准发芽法 紫外分光光度计法(UVS) 四氮唑法(TTC)
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光皮桦BlCCoAOMT基因的克隆、表达及单核苷酸变异分析 被引量:3
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作者 俞子承 倪飞 +3 位作者 江成 黄华宏 林二培 童再康 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期870-879,共10页
咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)是植物木质素合成过程中的一个关键酶,对木质素组成和结构有重要的作用。为探究BlCCoAOMT基因在木质素合成中的作用,本研究从光皮桦中克隆了该基因,并分析其基因结构和表达模式,以及在73个基因型中的... 咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)是植物木质素合成过程中的一个关键酶,对木质素组成和结构有重要的作用。为探究BlCCoAOMT基因在木质素合成中的作用,本研究从光皮桦中克隆了该基因,并分析其基因结构和表达模式,以及在73个基因型中的单核苷酸多态性(SNP)。结果表明,BlCCoAOMT基因cDNA全长1 114 bp,含有一个744 bp的完整ORF,编码一个由247个氨基酸残基组成的蛋白;该编码蛋白包含高等植物CCoAOMT所有的8个典型保守基序。BlCCoAOMT在木质化茎段中优势表达,且随着木质化程度提高而逐渐增强,表明BlCCoAOMT可能参与光皮桦木质素的生物合成;在拉弯处理的6 h到7 d间,该基因在应拉区发育木质部中的表达显著下调,与应拉木木质素含量的下降相符。共检测到BlCCoAOMT基因有119个SNP位点,平均每14 bp就有1个SNP位点,其中在外显子区域存在26个SNP位点,表明不同基因型中存在丰富SNP变异;在不同群体间BlCCoAOMT基因的分化程度无显著差异,且非同义突变和同义突变的位点的比值均小于1,表明在演化进程中主要受到了纯化选择压力。本研究结果为深入解析光皮桦木质素合成分子机制及后续分子标记辅助育种提供了理论依据。 展开更多
关键词 光皮桦 CCoAOMT基因 基因克隆 表达模式 单核苷酸多态性
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杉木根边缘细胞生物学特性及其对铝胁迫的响应 被引量:2
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作者 李舟阳 陆文玲 +4 位作者 钱旺 黄奕孜 林二培 黄华宏 童再康 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第7期73-81,共9页
【目的】分析杉木根边缘细胞的生物学特性及其对铝胁迫的响应,为进一步研究杉木对铝胁迫的响应机制和耐铝种质筛选提供参考。【方法】利用悬空气培法研究不同根长杉木幼苗根边缘细胞的数量、活性等生物学特性,并通过铝离子处理分析杉木... 【目的】分析杉木根边缘细胞的生物学特性及其对铝胁迫的响应,为进一步研究杉木对铝胁迫的响应机制和耐铝种质筛选提供参考。【方法】利用悬空气培法研究不同根长杉木幼苗根边缘细胞的数量、活性等生物学特性,并通过铝离子处理分析杉木根边缘细胞对铝胁迫的响应。【结果】杉木种子刚萌发时,根尖处就开始产生边缘细胞,且边缘细胞数量随着根的伸长而逐渐增多,在根长1.5 cm时达到最大值,平均7497个。边缘细胞活性在根长小于0.5 cm时可达95%,随着根的伸长会逐渐降低,但基本稳定在80%左右。在根边缘细胞发育过程中,根冠果胶甲酯酶(PME)活性随着根的伸长呈现出先高后低的趋势,进一步的表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)处理表明PME活性与边缘细胞游离至根际环境有关。铝胁迫处理结果表明,铝离子会显著抑制杉木幼苗根的伸长,且这种抑制作用在擦除根边缘细胞后会更加明显;低浓度的铝离子(100-200μmol•L^(-1))会促使边缘细胞分泌更多黏液,黏液层阻止铝离子吸附在根尖部位,从而对根尖起到一定保护作用。【结论】杉木幼苗根尖会产生大量具有活性的边缘细胞,其游离至根际环境的过程可能主要受到PME酶的调控;这些根边缘细胞会对铝离子胁迫作出响应,分泌更多黏液,从而起到减轻铝毒害或保护根尖免受铝毒害的作用。 展开更多
关键词 杉木 根边缘细胞 果胶甲酯酶 铝胁迫
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光皮桦AP2/ERF基因家族鉴定与表达分析 被引量:2
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作者 黄奕孜 钱旺 +3 位作者 邱姗 王文新 黄华宏 林二培 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1183-1193,共11页
【目的】深入研究AP2/ERF基因家族在光皮桦Betula luminifera生长发育及环境胁迫响应中的生物学功能。【方法】利用光皮桦基因组数据,通过生物信息学方法开展AP2/ERF基因家族鉴定、基因特征、系统进化、基因结构、保守基序、顺式作用元... 【目的】深入研究AP2/ERF基因家族在光皮桦Betula luminifera生长发育及环境胁迫响应中的生物学功能。【方法】利用光皮桦基因组数据,通过生物信息学方法开展AP2/ERF基因家族鉴定、基因特征、系统进化、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白互作和表达分析。【结果】在光皮桦基因组中共鉴定到77个AP2/ERF基因,其编码的蛋白理化性质存在差异,大多数蛋白(60个)的理论等电点小于7.0。系统进化分析显示:这77个AP2/ERF转录因子属于5个亚家族,其中ERF亚家族最大,包含34个成员。光皮桦AP2/ERF各亚家族间的基因结构存在较大差异,其中AP2亚家族成员均具有6~9个内含子,而DREB亚家族基因则没有内含子;但AP2/ERF各亚家族内的不同成员具有相似的保守基序类型和分布。同时,AP2/ERF基因启动子上都存在大量与激素、调节、胁迫响应及生长发育相关的顺式作用元件。此外,互作网络分析预测不同的光皮桦AP2/ERF亚家族蛋白间存在广泛的互作关系。进一步的表达分析显示:绝大多数光皮桦AP2/ERF基因(71个)的表达存在较强组织特异性,且在高温胁迫下,多数ERF或DREB基因的表达发生显著变化,表明ERF和DREB基因在高温胁迫应答中可能发挥着重要作用。【结论】通过生物信息学分析获得光皮桦77个AP2/ERF基因,分属于5个亚家族。不同亚家族基因具有相似的基因结构、保守基序等特征。基因启动子区含激素、胁迫响应等相关的作用元件。基因表达具有较强的组织特异性,且多数ERF或DREB基因对高温胁迫有明显响应。图6表1参39。 展开更多
关键词 光皮桦 AP2/ERF家族 表达模式 高温胁迫
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植物体细胞胚胎发生及其分子调控机制研究进展 被引量:2
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作者 王诗忆 黄奕孜 +2 位作者 李舟阳 黄华宏 林二培 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期223-232,共10页
植物的每个细胞都包含着该物种的全部遗传信息,具备发育成完整植株的遗传能力,这被称为植物细胞的全能性。体细胞胚胎(体胚)发生是指在没有受精的情况下,由体细胞或营养细胞发育成胚胎,是诱导植物细胞全能性的一种形式。体胚发生在种质... 植物的每个细胞都包含着该物种的全部遗传信息,具备发育成完整植株的遗传能力,这被称为植物细胞的全能性。体细胞胚胎(体胚)发生是指在没有受精的情况下,由体细胞或营养细胞发育成胚胎,是诱导植物细胞全能性的一种形式。体胚发生在种质资源保存、种苗生产、分子育种和植物基础研究等方面都有着广泛的应用,已成为重要的植物生物技术工具和研究平台。多年来的分子遗传学研究表明:体胚发生受到由众多转录因子、激素信号途径及表观遗传修饰等构成的复杂网络的调控。本研究概述了植物体胚发生的途径,并重点综述了体胚发生关键基因的功能与调控机制、体胚发生的表观遗传修饰以及体胚发生关键基因在基因工程中的应用。随着研究的深入和新技术的出现,体胚发生过程中涉及的代谢组分动态变化、转录调控、激素信号转导与表观遗传调控等复杂生物学过程有望得到更深入地阐释,将更进一步地解析植物体胚发生的分子调控机制。此外,利用体胚发生关键基因的功能与调控机制,开发更高效的体胚诱导和遗传转化方法,有望为更多植物的基因功能研究和遗传改良提供新的思路和技术。参81。 展开更多
关键词 体胚发生 转录因子 调控机制 表观遗传修饰
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枫香观赏新品种‘金钰’扦插繁育试验 被引量:6
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作者 王豪 陆云峰 +2 位作者 黄华宏 李修鹏 王建军 《福建林业科技》 2022年第1期99-105,共7页
为规模化培育枫香新品种‘金钰’扦插苗,从不同扦插基质、植物生长调节剂、扦插时间、穗条部位4个方面开展‘金钰’扦插繁育试验,并调查分析不同部位穗条的扦插苗移植当年到第3年的生长情况。结果表明:以黄心土+珍珠岩(体积比1∶1)为基... 为规模化培育枫香新品种‘金钰’扦插苗,从不同扦插基质、植物生长调节剂、扦插时间、穗条部位4个方面开展‘金钰’扦插繁育试验,并调查分析不同部位穗条的扦插苗移植当年到第3年的生长情况。结果表明:以黄心土+珍珠岩(体积比1∶1)为基质扦插的生根率和生根指数较好,生根率为68.22%,生根指数35.92;植物生长调节剂对枫香‘金钰’扦插生根有明显促进作用,以IBA+NAA(质量比1∶1)500 mg·L^(-1)处理插穗30 min的生根表现最好,生根质量最佳,生根率可达75.78%,平均生根数8.93条,平均根长7.06 cm,生根指数47.79;6月中旬扦插的生根率、平均生根数、平均根长和生根指数均显著高于3月、9月扦插;嫁接基部萌条扦插的生根表现和生根质量最好。不同部位穗条扦插苗移植当年到第3年的苗高、地径、新梢生长量均有显著差异,以嫁接基部萌条扦插的苗木表现最好。 展开更多
关键词 枫香‘金钰’ 扦插育苗 生根指数 质量评价
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Cloning and Bioimformatic Analysis of Cellulose Synthase-like Protein Gene,CICsID1 from Cunninghamia lanceolata
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作者 Peng Shasha Tong Zaikang +3 位作者 huang huahong Zhou Houjun Shi Jian Lin Erpei 《Chinese Forestry Science and Technology》 2012年第3期50-50,共1页
The protein structure of the cellulose synthase-like protein(CSL) was similar to cellulose synthase(CesA),including the conservative sequence D,D,D,QXXRW.One full-length cDNA of the cellulose synthase-like protein D(C... The protein structure of the cellulose synthase-like protein(CSL) was similar to cellulose synthase(CesA),including the conservative sequence D,D,D,QXXRW.One full-length cDNA of the cellulose synthase-like protein D(CslD) gene was cloned by reverse transcriptase(RT)-polymerase chain reaction(PCR) with 5’,3’ rapid amplification of cDNA ends(RACE) methods using degenerate primers designed from the homologous sequences of the CesA genes.A multiple comparison sequence analysis was conducted concurrently with bioinformatic methods to analyze the obtained sequence.Results of the sequence analysis showed that this cDNA was 4 150 bp in length and contained a single open reading frame encoding a protein of 1 132 amino acids.The multiple comparison sequence analysis showed that the deduced amino acid sequence shared high similarity (over 71%) with the ClCslD genes from Populus tremuloides,Oryza sativa,and Arabidopsis thaliana. This work will help lay an important foundation for further molecular studies with cellulose synthesis of plants. 展开更多
关键词 forest tree breeding Cunninghamia lanceolata CELLULOSE synthase-like(CSL) protein CLONE expression
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