水稻条叶枯病毒(RStV)基因组组分4的克隆与序列分析

利用ＲＴＰＣＲ技术合成并扩增了水稻条叶枯病毒（ＲＳｔＶ）中国云南分离物基因组组分４的全长ｃＤＮＡ，将ＰＣＲ产物克隆在载体ｐＣＲＩ上，并进行全序列测定，所得核苷酸序列及推测的氨基酸序列与日本分离物Ｔ进行比较。结果表明，在核苷酸水平，两分离物的ｖＯＲＦ、ｖｃＯＲＦ及基因间非编码区序列的同源性分别为９４９％、９４１％、８６１％，５’端非编码区序列相同，而３’非编码区同源性为９６１％，仅有两个核苷酸不同；在氨基酸水平，ｖＯＲＦ及ｖｃＯＲＦ编码蛋白的同源性分别为９９４％和９８３％。可见，编码区的大小及其氨基酸序列和两末端序列都是很保守的。因此，中国云南分离物Ｙ与日本分离物Ｔ可能有很近的亲缘关系。

水稻条叶枯病毒基因组组分3的克隆与序列分析

利用RT -PCR技术 ,合成并扩增了水稻条叶枯病毒 (RStV)中国云南分离物基因组组分 3的全长cDNA。将PCR产物克隆在载体 pCRⅡ上 ,进行全序列测定。将所得核苷酸序列及其所推导的氨基酸序列与日本分离物T进行同源性比较 ,结果表明 ,在核苷酸水平上 ,两分离物的 5′端非编码区序列相同 ,vORF、vcORF及基因间非编码区序列的同源性分别为 97 6 %、96 8%及 87 6 % ,而 3′端非编码区同源性为 98 9% ,仅有一个核苷酸不同 ;在氨基酸水平上 ,vORF及vcORF编码蛋白的同源性分别为 99 1%和 98 5 %。可见编码区的大小及其氨基酸序列和两末端序列都是很保守的。序列分析显示 ,两个RStV分离物的RNA3均有双义编码特性。因此 ,中国云南分离物Y与日本分离物T可能有很近的亲缘关系。