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基于生物信息学及分子对接技术探究补肾健脾与益气养血类中药配伍干预骨质疏松的分子机制研究 被引量:4
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作者 刘国强 王桂香 +3 位作者 刘丹 王峰 季文辉 潘浩 《世界中西医结合杂志》 2021年第9期1633-1639,1643,共8页
目的利用生物信息学及分子对接技术探究补肾健脾与益气养血类中药配伍干预骨质疏松的分子机制。方法通过GEO数据库获取骨质疏松相关芯片,利用R语言进行差异基因表达分析。借助GeneCards、DisGeNET、OMIM、MalaCards、PharmGKB等数据库... 目的利用生物信息学及分子对接技术探究补肾健脾与益气养血类中药配伍干预骨质疏松的分子机制。方法通过GEO数据库获取骨质疏松相关芯片,利用R语言进行差异基因表达分析。借助GeneCards、DisGeNET、OMIM、MalaCards、PharmGKB等数据库对骨质疏松靶基因进行检索与筛选,将所得基因与差异表达基因合并去重,从而对骨质疏松疾病靶基因进行预测。运用TCMSP数据库对补肾健脾与益气养血类代表药物熟地黄、山药、黄芪、当归的主要有效成分及作用靶基因进行筛选和挖掘,构建药物与疾病映射靶基因的PPI网络,通过David数据库对药物-疾病关键靶基因进行GO生物过程及KEGG通路富集分析。最终将中药中主要有效成分与关联度较高的关键靶基因进行分子对接。结果中药-有效成分-靶点网络图包含38个有效成分,相对应靶点144个;GEO数据库获筛选得差异表达基因154个,其中上调基因99个,下调基因55个;通过疾病数据库检索并与差异基因合并去重后得到与骨质疏松相关的疾病靶基因3839个;获得映射靶基因98个,关键靶基因14个。补肾健脾与益气养血类中药配伍代表药物熟地黄、山药、黄芪、当归主要通过IL6、VEGFA、TNF、TP53、EGF、JUN、PTGS2等作用于TNF子信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路等多个经典信号通路,涉及一氧化氮生物合成过程的正调控、DNA模板转录正调控、酶结合、平滑肌细胞增殖的正调控、基因表达的正调控等多个生物过程。分子对接结果示:关联度较高的主要有效成分在与关键靶基因对接过程中均进入了活性位点,具有很强的结合能力。结论应用生物信息学和分子对接技术可揭示补肾健脾与益气养血类中药配伍干预骨质疏松的分子机制,为骨质疏松的治疗提供了新的思路和方法。 展开更多
关键词 骨质疏松 补肾健脾 益气养血 生物信息学 网络药理学 分子对接
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基于生物信息学及分子对接技术探究清热利湿与活血化瘀类中药配伍干预骨关节炎的分子机制 被引量:1
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作者 潘浩 王桂香 +4 位作者 刘琳琳 刘丹 王峰 季文辉 刘国强 《实用药物与临床》 CAS 2022年第4期307-312,共6页
目的应用生物信息学及分子对接技术探究清热利湿与活血化瘀类中药配伍干预骨关节炎的分子机制。方法通过NCBI GEO数据库获取骨关节炎相关芯片,采用R语言进行差异基因表达分析。应用GeneCards数据库对骨关节炎靶基因进行检索与筛选,对骨... 目的应用生物信息学及分子对接技术探究清热利湿与活血化瘀类中药配伍干预骨关节炎的分子机制。方法通过NCBI GEO数据库获取骨关节炎相关芯片,采用R语言进行差异基因表达分析。应用GeneCards数据库对骨关节炎靶基因进行检索与筛选,对骨关节炎疾病靶基因进行预测。应用TCMSP数据库对黄柏、苍术、桃仁、红花的主要有效成分及作用靶基因进行筛选和挖掘,构建药物与疾病映射靶基因的PPI网络,通过David数据库对关键靶基因进行GO生物过程及KEGG通路富集分析。最终将中药主要有效成分与关联度较高的关键靶基因进行分子对接。结果中药有效成分-靶基因网络图包含86个有效成分,相对应靶点40个;筛选得到差异表达基因136个,其中上调基因61个,下调基因75个;通过疾病数据库检索并与差异基因合并去重后得到与骨关节炎相关的疾病靶基因628个;获得映射靶基因40个,关键靶基因10个。关键靶点IL6、TNF、PTGS2、MAPK14、MPO富集作用于TNF信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、GnRH信号通路、Estrogen信号通路、T细胞受体信号通路等多个经典信号通路,主要涉及一氧化氮生物合成过程的正调控、平滑肌细胞增殖的正调控、细胞对脂多糖的反应、血管生成、对糖皮质激素的反应等多个生物过程。关联度较高的主要有效成分在与关键靶基因对接过程中均进入了活性位点,具有很强的结合能力。结论应用生物信息学和分子对接技术,可揭示清热利湿与活血化瘀类中药配伍干预骨关节炎的分子机制,为骨关节炎的治疗提供了新的思路和方法。 展开更多
关键词 骨关节炎 生物信息学 网络药理学 分子对接
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基于生物信息学及分子对接技术探究红花化瘀汤治疗骨关节炎的分子作用机制 被引量:1
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作者 刘国强 王桂香 +3 位作者 刘琳琳 刘丹 季文辉 潘浩 《世界中西医结合杂志》 2022年第6期1143-1149,1154,共8页
目的利用生物信息学及分子对接技术探究红花化瘀汤干预骨关节炎的相关分子机制研究。方法通过NCBI GEO数据库获取骨关节炎相关芯片,利用R语言进行差异基因表达分析。借助GeneCards数据库对骨关节炎靶基因进行检索与筛选,并与差异表达基... 目的利用生物信息学及分子对接技术探究红花化瘀汤干预骨关节炎的相关分子机制研究。方法通过NCBI GEO数据库获取骨关节炎相关芯片,利用R语言进行差异基因表达分析。借助GeneCards数据库对骨关节炎靶基因进行检索与筛选,并与差异表达基因合并去重,对骨关节炎疾病靶基因进行预测。运用TCMSP数据库对红花化瘀汤主要有效成分及作用靶基因进行筛选和挖掘,构建药物与疾病映射靶基因的PPI网络,通过David数据库对关键靶基因进行GO生物过程及KEGG通路富集分析。最终将中药中主要有效成分与关联度较高的关键靶基因进行分子对接。结果共筛选出红花化瘀汤药物活性成分110个;与骨关节炎的共同靶点23个,核心靶点为IL-6、PTGS2、IL-1B、MMP2、VEGFA;GO分析结果得出,红花化瘀汤治疗骨关节炎的机制主要和缺氧、炎症反应、骨代谢、微循环等生物过程密切相关;根据KEGG富集分析显示类风湿性关节炎、肿瘤坏死因子信号通路、toll样受体信号通路等是红花化瘀汤治疗骨关节炎的主要信号通路;分子对接结果表明槲皮素、山柰酚、鼠尾草酚酮可靶向调节MMP2、PTGS2、PTGS2。结论研究证实红花化瘀汤通过控制炎症因子水平、促进软骨细胞死亡等多方面对骨关节炎发挥治疗作用,具有多靶点、多通路的特征;为基础研究与相关临床应用提供新的证据和思路。 展开更多
关键词 红花化瘀汤 骨关节炎 生物信息学 基因芯片 分子对接
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GPR50生物学功能研究进展
4
作者 兰道亮 姚颖 +3 位作者 陈艳 熊显荣 吉文汇 李键 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2021年第3期238-245,共8页
G蛋白偶联受体50(G protein-coupled receptor, GPR50)是属于G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptors, GPCRs)超级家族的一类跨膜蛋白,与Mel1c受体同源,介导跨膜转运和信号传递,在神经系统发育、能量代谢调节及糖皮质激素受体信号... G蛋白偶联受体50(G protein-coupled receptor, GPR50)是属于G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptors, GPCRs)超级家族的一类跨膜蛋白,与Mel1c受体同源,介导跨膜转运和信号传递,在神经系统发育、能量代谢调节及糖皮质激素受体信号等多种生理活动中发挥重要作用,同时也是阿尔茨海默病、肝癌等疾病的潜在生物学标志物,阐明GPR50的生理功能有助于为相关疾病治疗的进展、预后和发展提供可能方向.近年来,随着GPR50潜在作用不断被发现,其涉及的生理功能也不断被拓宽.详细介绍了GPR50的分子结构特征,总结了近年来GPR50的生物学功能研究进展,为GPR50的进一步研究提供参考. 展开更多
关键词 GPR50 跨膜蛋白 信号传递 生物标志物
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OBE理念下量子力学课程信息化教学改革探索
5
作者 呼和满都拉 冀文慧 +1 位作者 杨洪涛 王艳华 《集宁师范学院学报》 2022年第5期36-38,共3页
在量子力学中,公式推导很多,学习难度也相当大。因此,很多教师在教学时往往注重公式的推导过程,而忽略了对基本概念与原理的分析。这样,就使得学生在学习的过程中抓不住重点,学习积极性不高,这就有悖于OBE教育理念。笔者对在OBE理念下... 在量子力学中,公式推导很多,学习难度也相当大。因此,很多教师在教学时往往注重公式的推导过程,而忽略了对基本概念与原理的分析。这样,就使得学生在学习的过程中抓不住重点,学习积极性不高,这就有悖于OBE教育理念。笔者对在OBE理念下的量子力学课堂信息化教学改革展开探索。 展开更多
关键词 OBE理念 量子力学 课程信息化 教学改革研究
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GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟进程中的表达及亚细胞定位
6
作者 王甜 黄显朋 +4 位作者 朱洪阳 吉文汇 付伟 殷实 兰道亮 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第3期245-254,共10页
旨在探究GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟进程中的表达规律及亚细胞定位.通过卵母细胞体外培养技术、qPCR技术及免疫荧光技术测定GPR50在小鼠不同时期卵母细胞的转录水平及亚细胞定位.结果表明,所建立的qPCR方法敏感性高、特异性强、重复... 旨在探究GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟进程中的表达规律及亚细胞定位.通过卵母细胞体外培养技术、qPCR技术及免疫荧光技术测定GPR50在小鼠不同时期卵母细胞的转录水平及亚细胞定位.结果表明,所建立的qPCR方法敏感性高、特异性强、重复性好且检测效率高,可用于测定GPR50在小鼠卵母细胞中转录水平的表达;GPR50在不同阶段小鼠卵母细胞中均有表达,生发泡破裂(GVBD)后,GPR50的表达量显著高于GV期(P<0.05);随着卵母细胞的发育,其表达量不断增高,到MII期达到顶峰,极显著高于GV、GVBD及MI期(P<0.01).随着卵母细胞的发育,GPR50大量表达于细胞质和细胞膜,但在成熟卵母细胞中,GPR50主要集中分布于细胞膜.以上结果说明,GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟中发挥重要的作用,为解析GPR50在哺乳动物卵母细胞体外成熟进程的分子机制奠定了基础. 展开更多
关键词 GPR50 小鼠卵母细胞 体外成熟 转录水平表达 亚细胞定位
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3台平行机上带有2个服务等级的离线负载均衡 被引量:1
7
作者 贾珊珊 嵇雯蕙 陈智斌 《软件导刊》 2022年第2期97-100,共4页
排序问题是一类重要的组合最优化问题,在生产计划、计算机控制等领域有着广泛应用,一直是理论界研究热点。对带服务等级的3台平行机排序问题进行研究,每台机器和每个工件都有等级标号,每个工件只能被某台服务等级不高于该工件等级的机... 排序问题是一类重要的组合最优化问题,在生产计划、计算机控制等领域有着广泛应用,一直是理论界研究热点。对带服务等级的3台平行机排序问题进行研究,每台机器和每个工件都有等级标号,每个工件只能被某台服务等级不高于该工件等级的机器加工,目标是最小化最大机器的完工时间。运用新的算法思想解决离线状态等级约束下的3台机器负载均衡问题。对等级约束为1、2、2的3台平行机给出一个43-近似算法;对于等级约束为1、1、2的3台平行机给出一个2-近似算法。 展开更多
关键词 等级约束 排序问题 近似比 目标函数
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牛诱导多能干细胞的建立及应用研究进展
8
作者 曾虹 曾睿琳 +2 位作者 付伟 吉文汇 兰道亮 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期130-141,共12页
诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSCs)是指通过导入特定的转录因子将终末分化的体细胞重编程为可以无限增殖更新并具有分化为三胚层多种细胞类型的一类干细胞系。目前对人与小鼠的iPSCs研究已经取得了很多重要成果,... 诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSCs)是指通过导入特定的转录因子将终末分化的体细胞重编程为可以无限增殖更新并具有分化为三胚层多种细胞类型的一类干细胞系。目前对人与小鼠的iPSCs研究已经取得了很多重要成果,但其他动物,如牛等经济型有蹄类家畜iPSCs的研究始终没有突破性的进展。如何将外源转录因子通过重编程载体高效安全地导入体细胞中并持续表达是生产牛诱导多能干细胞(bovine induced pluripotent stem cells,biPSCs)的主要瓶颈。本文就biPSCs建立中重编程系统的选择、诱导因子的选择、小分子化合物的添加等方面进行综述,以期为进一步完善biPSCs及牛胚胎干细胞系的建立提供参考。 展开更多
关键词 牛诱导多能干细胞 体细胞重编程 培养体系 小分子化合物
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角动量算符及其性质的研究
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作者 呼和满都拉 王艳华 +1 位作者 冀文慧 冯有良 《集宁师范学院学报》 2021年第5期61-66,共6页
本文主要研究量子力学中角动量算符(包括轨道角动量算符、自旋角动量算符及总角动量算符)的定义及性质问题.通过将经典力学中的角动量与量子力学中的角动量算符进行比较,推导出量子力学中角动量算符的定义式,并根据以前学过的知识,进一... 本文主要研究量子力学中角动量算符(包括轨道角动量算符、自旋角动量算符及总角动量算符)的定义及性质问题.通过将经典力学中的角动量与量子力学中的角动量算符进行比较,推导出量子力学中角动量算符的定义式,并根据以前学过的知识,进一步推导出其性质.通过研究会发现,轨道角动量算符、自旋角动量算符及总角动量算符有许多相似的性质,这样以后就可以将其中某一个算符已知的性质引用到其中另一个算符相似的性质,为研究量子力学中关于角动量算符的许多其他问题都提供了方便. 展开更多
关键词 轨道角动量 对易关系 本征值 本征函数 自旋角动量算符 总角动量算符
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Preparation of alkaline-responsive nano-electrospinning and anticorrosion properties of self-healing coating
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作者 ji wen-hui CAO Lin +6 位作者 ji Xiao-hong PENG Li-ming MYRONYUK Oleksiy HAN Dong-xiao PEI Yan-tong LI Wei-hua WANG Wei 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS 2024年第10期3463-3481,共19页
In this paper,1-butyl-3-methylimidazole tetrafluoroborate([BMIM]BF4)is used as corrosion inhibitor.Polyacrylonitrile(PAN)is used to load the corrosion inhibitor.PAN/[BMIM]BF4 hybrid nanofibers are successfullysynthesi... In this paper,1-butyl-3-methylimidazole tetrafluoroborate([BMIM]BF4)is used as corrosion inhibitor.Polyacrylonitrile(PAN)is used to load the corrosion inhibitor.PAN/[BMIM]BF4 hybrid nanofibers are successfullysynthesized by electrospinning technology.The alkyd varnish is coated on the fiber membrane to prepare a compositecoating,and then a series of tests are carried out on the self-healing and anticorrosive performance of the compositecoating.It is observed by scanning electron microscope that the fiber morphology is stable and there is no bead-likestructure.The composition of the composite fiber is analyzed by Fourier infrared spectroscopy,and it is confirmed thatthe hybrid nanofiber was successfully prepared.3D laser confocal scanning microscope was used to observe thecorrosion morphology and profile of the carbon steel.The composite coating shows good self-healing performance.[BMIM]BF4 can form a protective film on the surface of the bare carbon steel substrate through physical adsorption orchemical adsorption in an alkaline environment.Electrochemical impedance spectroscopy was tested and analyzed.It isfound that the maximum corrosion inhibition efficiency of the coating is 88.5%in 3.5 wt.%alkaline NaCl solution.Compared with the blank coating without nanofibers,the composite fiber varnish composite coating exhibits good selfhealingand anti-corrosion properties. 展开更多
关键词 electrospinning self-healing coating alkaline-responsive corrosion protection
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某型TRT机组叶片性能优化设计 被引量:1
11
作者 余道刚 冀文慧 赵宝德 《热能动力工程》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期155-162,共8页
某运行高炉煤气余压回收透平发电装置(Blast Furnace Gas Top Pressure Recovery Turbine Unit, TRT)的动叶片是直叶片,机组运行效率不高。在不改变机组进气条件的前提下,通过优化叶型降低流道中的损失,提高TRT涡轮的效率。在给定TRT涡... 某运行高炉煤气余压回收透平发电装置(Blast Furnace Gas Top Pressure Recovery Turbine Unit, TRT)的动叶片是直叶片,机组运行效率不高。在不改变机组进气条件的前提下,通过优化叶型降低流道中的损失,提高TRT涡轮的效率。在给定TRT涡轮通流尺寸的基础上优化动叶片的型线,对原始型线进行三维CFD计算,在原型线的基础上进行优化改进,并针对动叶片的叶身部分做了强度校核计算,优化后机组的总效率提高了1.7%,机组的输出功增加了4.2%。 展开更多
关键词 TRT涡轮 数值模拟 叶片型线优化 强度校核
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5 MW超临界CO2向心透平设计及变工况性能分析 被引量:11
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作者 李翔宇 冯永志 +1 位作者 冀文慧 李宇峰 《工程热物理学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第10期2259-2265,共7页
本文开发了一套基于遗传算法理念的向心透平热力优化设计程序和一套向心透平变工况性能预测程序,可快速生成向心透平最优的热力设计方案和性能曲线。基于某项目超临界CO2布雷顿循环的热力参数,设计了一台5 MW级S-CO2向心透平,并采用CFD... 本文开发了一套基于遗传算法理念的向心透平热力优化设计程序和一套向心透平变工况性能预测程序,可快速生成向心透平最优的热力设计方案和性能曲线。基于某项目超临界CO2布雷顿循环的热力参数,设计了一台5 MW级S-CO2向心透平,并采用CFD方法对设计工况和变工况进行数值模拟。结果表明,设计工况下,所设计透平满足设计要求,流场通畅;当转速上下波动10V,膨胀比在1.5~2.7范围内时,性能良好。热力优化设计方案与CFD结果吻合,验证了热力设计程序的可靠性;但是变工况性能预测程序得到的特性线与CFD方法得到的特性线存在一定的偏差,原因是程序以常物性条件进行计算,导致压比等参数的计算精度不足,为该程序和方法指明了改进方向。 展开更多
关键词 向心透平 遗传算法 气动设计 变工况 超临界二氧化碳
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我国检验检测市场的特征与改革的方向 被引量:4
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作者 季文晖 谭晓东 《中国检验检测》 2018年第6期3-6,共4页
本文简要总结了我国检验检测市场的基本特征,分析了我国检验检测机构与国际同行相比存在的差距和薄弱环节,提出了我国检验检测市场的改革方向和发展建议。
关键词 检验检测 市场 特征 国际比较 差距 改革 发展 建议
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