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核磁共振代谢组学数据的尺度归一化新方法
被引量:
6
1
作者
董继扬
李伟
+3 位作者
邓伶莉
许晶晶
julian l.griffin
陈忠
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期262-268,共7页
提出了一种新的尺度归一化方法,该方法不强调各变量在尺度上的归一,而是在原始数据的基础上,通过提高稳定性高且在不同类别样本中具有显著差异性的变量的权重,以增强与特征代谢物相关的信息.分别采用模拟数据和真实代谢组学数据对新归...
提出了一种新的尺度归一化方法,该方法不强调各变量在尺度上的归一,而是在原始数据的基础上,通过提高稳定性高且在不同类别样本中具有显著差异性的变量的权重,以增强与特征代谢物相关的信息.分别采用模拟数据和真实代谢组学数据对新归一化方法的性能进行评估,并与单位方差法(Unit variance)、变量稳定性(Variable stability)和尺度缩放法(Level scaling)等常用的尺度归一化方法进行了比较.研究结果表明,新归一化方法能够提高多变量统计模型的预测能力,较好地保留了核磁共振谱的分子信息,有助于特征代谢物的识别,并使后续的数据分析结果具有更好的可解释性.
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关键词
尺度归一化
核磁共振
代谢组学
特征代谢物
下载PDF
职称材料
题名
核磁共振代谢组学数据的尺度归一化新方法
被引量:
6
1
作者
董继扬
李伟
邓伶莉
许晶晶
julian l.griffin
陈忠
机构
厦门大学物理系
Department of Biochemistry
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期262-268,共7页
基金
国家卫生部科学研究基金-福建省卫生教育联合攻关计划(批准号:WKJ2008-2-36)
福建省自然科学基金(批准号:2009J01299)资助
文摘
提出了一种新的尺度归一化方法,该方法不强调各变量在尺度上的归一,而是在原始数据的基础上,通过提高稳定性高且在不同类别样本中具有显著差异性的变量的权重,以增强与特征代谢物相关的信息.分别采用模拟数据和真实代谢组学数据对新归一化方法的性能进行评估,并与单位方差法(Unit variance)、变量稳定性(Variable stability)和尺度缩放法(Level scaling)等常用的尺度归一化方法进行了比较.研究结果表明,新归一化方法能够提高多变量统计模型的预测能力,较好地保留了核磁共振谱的分子信息,有助于特征代谢物的识别,并使后续的数据分析结果具有更好的可解释性.
关键词
尺度归一化
核磁共振
代谢组学
特征代谢物
Keywords
Variable scaling
NMR
Metabolomics
Signature metabolite
分类号
O657 [理学—分析化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
核磁共振代谢组学数据的尺度归一化新方法
董继扬
李伟
邓伶莉
许晶晶
julian l.griffin
陈忠
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
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