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金沙江干热河谷区胡枝子(Lespedeza Michx)根瘤菌多样性及其系统发育
被引量:
9
1
作者
彭贤超
张小平
+2 位作者
徐开未
黄昌学
k.lindstrom
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期5469-5481,共13页
研究利用数值分类、BOXAIR-PCR指纹图谱、16SrDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析等方法,研究了分离自金沙江干热河谷区的86株胡枝子根瘤菌的多样性和系统发育,结果表明金沙江干热河谷区胡枝子根瘤菌蕴涵丰富的生物多样性。通过数值...
研究利用数值分类、BOXAIR-PCR指纹图谱、16SrDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析等方法,研究了分离自金沙江干热河谷区的86株胡枝子根瘤菌的多样性和系统发育,结果表明金沙江干热河谷区胡枝子根瘤菌蕴涵丰富的生物多样性。通过数值分类,供试未知菌株表现出极大的表型性状多样性,能耐高温(60℃)和低pH(4.0),在低温(10℃)或者高pH(9.0)条件下生长很差,耐盐性也很差。供试未知菌株的16S rDNA用HaeⅢ、MspⅠ、HinfⅠ和TaqⅠ酶切后具有16种遗传图谱类型,其中10株供试未知菌的16S rDNA遗传图谱类型不同于所选用的已知参比菌株。BOXAIR-PCR的分群结果分散,很多在16S rDNA PCR-RFLP中具有相同遗传类型的菌株也表现较大差异,表明了供试菌株在基因组水平上差异很大。序列分析结果表明,6株代表菌株分布于Rhizobium、Sinorhizobium、Mesorhizobium、Bradyrhizobium4个属,16S rDNA序列与GSⅡ序列分别构建的系统发育树在属水平上基本一致,但16S rDNA序列的同源性比GSⅡ高,6株代表菌株间16S rDNA序列的同源性在87.5%~99.5%之间,GSⅡ序列的同源性在79.4%~89.8%之间;而代表菌株与亲缘关系最近的参比菌株间的16S rDNA序列的同源性为99.9%~100%,GSⅡ的同源性为88.9%~99.6%。
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关键词
数值分类
BOXAIR-PCR
16S
RDNA
PCR-RFLP
GSⅡ基因
序列分析
下载PDF
职称材料
用荧光酶基因(cfp)标记法研究菜豆根瘤菌的竞争性和有效性
被引量:
3
2
作者
凌瑶
张小平
+2 位作者
周俊初
谢波
k.lindstrom
《中国土壤与肥料》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期73-77,共5页
试验采用三亲本杂交法将cfp基因导入一株有效性较高的菜豆根瘤菌SC18,获得了一株带cfp基因标记的菌株SC18-cfp。对SC18-cfp进行性状、标记基因的遗传稳定性检测,结果表明,cfp基因不仅能有效表达,而且性状稳定。随机挑取SC18-cfp的10个...
试验采用三亲本杂交法将cfp基因导入一株有效性较高的菜豆根瘤菌SC18,获得了一株带cfp基因标记的菌株SC18-cfp。对SC18-cfp进行性状、标记基因的遗传稳定性检测,结果表明,cfp基因不仅能有效表达,而且性状稳定。随机挑取SC18-cfp的10个转移结合子在无氮砂培条件下进行标记菌株与亲本菌株在3个菜豆品种上的竞争结瘤试验。结果证实,10个转移结合子在供试植物根系上的占瘤率均接近50%,其有效性和竞争结瘤能力与亲本菌株间的差异不显著,品种间的差异性不显著;在控制田间试验中SC18-cfp比土著根瘤菌的竞争结瘤能力强,在品种A、B、C上的占瘤率分别达到了57.8%、60.0%、55.6%。接种SC18的植株干重、全氮量、叶绿素含量和豆荚产量均显著高于对照。
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关键词
CFP
菜豆根瘤菌
竞争结瘤
有效性
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职称材料
题名
金沙江干热河谷区胡枝子(Lespedeza Michx)根瘤菌多样性及其系统发育
被引量:
9
1
作者
彭贤超
张小平
徐开未
黄昌学
k.lindstrom
机构
四川农业大学资源环境学院
Department of Applied Chemistry and Microbiology
出处
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期5469-5481,共13页
基金
国家自然科学基金资助项目(30570062)~~
文摘
研究利用数值分类、BOXAIR-PCR指纹图谱、16SrDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析等方法,研究了分离自金沙江干热河谷区的86株胡枝子根瘤菌的多样性和系统发育,结果表明金沙江干热河谷区胡枝子根瘤菌蕴涵丰富的生物多样性。通过数值分类,供试未知菌株表现出极大的表型性状多样性,能耐高温(60℃)和低pH(4.0),在低温(10℃)或者高pH(9.0)条件下生长很差,耐盐性也很差。供试未知菌株的16S rDNA用HaeⅢ、MspⅠ、HinfⅠ和TaqⅠ酶切后具有16种遗传图谱类型,其中10株供试未知菌的16S rDNA遗传图谱类型不同于所选用的已知参比菌株。BOXAIR-PCR的分群结果分散,很多在16S rDNA PCR-RFLP中具有相同遗传类型的菌株也表现较大差异,表明了供试菌株在基因组水平上差异很大。序列分析结果表明,6株代表菌株分布于Rhizobium、Sinorhizobium、Mesorhizobium、Bradyrhizobium4个属,16S rDNA序列与GSⅡ序列分别构建的系统发育树在属水平上基本一致,但16S rDNA序列的同源性比GSⅡ高,6株代表菌株间16S rDNA序列的同源性在87.5%~99.5%之间,GSⅡ序列的同源性在79.4%~89.8%之间;而代表菌株与亲缘关系最近的参比菌株间的16S rDNA序列的同源性为99.9%~100%,GSⅡ的同源性为88.9%~99.6%。
关键词
数值分类
BOXAIR-PCR
16S
RDNA
PCR-RFLP
GSⅡ基因
序列分析
Keywords
numerical taxonomy
BOXAIR-PCR
16S rDNA
PCR-RFLP
GS Ⅱ gene
sequences analysis
分类号
S541.5 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
用荧光酶基因(cfp)标记法研究菜豆根瘤菌的竞争性和有效性
被引量:
3
2
作者
凌瑶
张小平
周俊初
谢波
k.lindstrom
机构
四川农业大学生命科学与理学院
四川农业大学资源与环境学院
华中农业大学生命科学院农业微生物国家重点实验室
赫尔辛基大学
出处
《中国土壤与肥料》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期73-77,共5页
基金
该项目由国家自然科学基金项目(NO:30570062)
国家“973”项目(NO:2001CB108905)
+1 种基金
华中农业大学农业微生物国家重点实验室开放课题
芬兰赫尔辛基大学资助
文摘
试验采用三亲本杂交法将cfp基因导入一株有效性较高的菜豆根瘤菌SC18,获得了一株带cfp基因标记的菌株SC18-cfp。对SC18-cfp进行性状、标记基因的遗传稳定性检测,结果表明,cfp基因不仅能有效表达,而且性状稳定。随机挑取SC18-cfp的10个转移结合子在无氮砂培条件下进行标记菌株与亲本菌株在3个菜豆品种上的竞争结瘤试验。结果证实,10个转移结合子在供试植物根系上的占瘤率均接近50%,其有效性和竞争结瘤能力与亲本菌株间的差异不显著,品种间的差异性不显著;在控制田间试验中SC18-cfp比土著根瘤菌的竞争结瘤能力强,在品种A、B、C上的占瘤率分别达到了57.8%、60.0%、55.6%。接种SC18的植株干重、全氮量、叶绿素含量和豆荚产量均显著高于对照。
关键词
CFP
菜豆根瘤菌
竞争结瘤
有效性
Keywords
cfp
phaseolus rhizobia
competitive nodulation
effectiveness
分类号
S154.3 [农业科学—土壤学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
金沙江干热河谷区胡枝子(Lespedeza Michx)根瘤菌多样性及其系统发育
彭贤超
张小平
徐开未
黄昌学
k.lindstrom
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
9
下载PDF
职称材料
2
用荧光酶基因(cfp)标记法研究菜豆根瘤菌的竞争性和有效性
凌瑶
张小平
周俊初
谢波
k.lindstrom
《中国土壤与肥料》
CAS
CSCD
北大核心
2008
3
下载PDF
职称材料
已选择
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统计分析
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