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Barley and Wheat Share the Same Gene Controlling the Short Basic Vegetative Period 被引量:1
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作者 lü rui-hua XU Yan-hao +5 位作者 Rodger Boyd ZHANG Xiao-qi Sue Broughton Michael Jones lI Cheng-dao CHEN Yao-feng 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2013年第10期1703-1711,共9页
Basic vegetative period(BVP) is an important trait for determining flowering time and adaptation to variable environments.A short BVP barley mutant is about 30 d shorter than its wild type.Genetic analysis using 557... Basic vegetative period(BVP) is an important trait for determining flowering time and adaptation to variable environments.A short BVP barley mutant is about 30 d shorter than its wild type.Genetic analysis using 557 F 2 individuals revealed that the short BVP is governed by a single recessive gene(BVP-1) and was further validated in 2 090 F 3 individuals.The BVP-1 gene was first mapped to barley chromosome 1H using SSR markers.Comparative genomic analysis demonstrated that the chromosome region of BVP-1 is syntenic to rice chromosome 5 and Brachypodium chromosome 2.Barley ESTs/genes were identified after comparison with candidate genes in rice and Brachypodium;seven new gene-specific markers were developed and mapped in the mapping populations.The BVP-1 gene co-segregated with the Mot1 and Ftsh4 genes and was flanked by the gene-specific markers AK252360(0.2 cM) and CA608558(0.5 cM).Further analysis demonstrated that barley and wheat share the same short BVP gene controlling early flowering. 展开更多
关键词 basic vegetative period candidate genes Hordeum Triticum
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北柴胡转录因子BcWRKY70基因鉴定与表达分析 被引量:4
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作者 冯飞雪 吕瑞华 +6 位作者 李依民 张明英 王凯 肇玉博 高静 彭亮 张岗 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期3184-3189,共6页
WRKY是植物特有的一类转录因子,参与植物响应多种环境因子及生物胁迫的调控过程。为探究北柴胡WRKY家族成员WRKY70的基因功能,本研究从北柴胡转录组数据库中克隆到BcWRKY70基因开放阅读框(ORF),进行编码氨基酸序列及DNA启动子区域生物... WRKY是植物特有的一类转录因子,参与植物响应多种环境因子及生物胁迫的调控过程。为探究北柴胡WRKY家族成员WRKY70的基因功能,本研究从北柴胡转录组数据库中克隆到BcWRKY70基因开放阅读框(ORF),进行编码氨基酸序列及DNA启动子区域生物信息学分析,并用实时荧光定量PCR检测BcWRKY70在不同组织部位与不同激素处理下的表达模式。结果表明,北柴胡BcWRKY70基因ORF长948 bp,编码316个氨基酸,具有典型的WRKY结构域,不含信号肽,预测定位在细胞核中;系统进化分析显示BcWRKY70与棉花GhWRKY70亲缘关系最近。BcWRKY70基因启动子区包含响应干旱、茉莉酸甲酯、脱落酸等环境或激素因子的顺式元件。qRT-PCR结果显示BcWRKY70在北柴胡根中表达量最高,且能快速应答茉莉酸甲酯和脱落酸的诱导。这些结果为下一步研究BcWRKY70在北柴胡抗逆中的分子作用机制提供科学依据。 展开更多
关键词 北柴胡 WRKY转录因子 克隆 表达模式 启动子区
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陕西关中野生商陆资源的ITS2和psbA-trnH条形码序列研究 被引量:8
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作者 吕瑞华 冯昭 +5 位作者 马添翼 吕蕊花 张明英 彭亮 高静 张岗 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1951-1956,共6页
为探讨DNA条形码在陕西关中野生商陆资源中的鉴定作用,本研究采用通用引物ITS2和psbA-trnH对29份商陆样品DNA进行PCR扩增和测序,用Codon CodeA-ligner V3.0进行序列拼接和校对,随后进行BLAST比对鉴定分析;同时运用MEGA 6.0分析序列特征... 为探讨DNA条形码在陕西关中野生商陆资源中的鉴定作用,本研究采用通用引物ITS2和psbA-trnH对29份商陆样品DNA进行PCR扩增和测序,用Codon CodeA-ligner V3.0进行序列拼接和校对,随后进行BLAST比对鉴定分析;同时运用MEGA 6.0分析序列特征、K2P遗传距离及种内或种间变异,并构建系统进化树,评价两对引物对该区域商陆及其混伪品的鉴别能力。研究结果表明,ITS2和psbA-trnH序列的PCR扩增和测序成功率均为100%;NJ系统进化树显示ITS2和psbA-trnH序列均可明显将所有样本分别聚为商陆、垂序商陆并与其同属近源种鄂西商陆、日本商陆及两种混伪品各自聚为不同分支;ITS2序列在种间遗传距离上较psbA-trnH有一定优势。ITS2和psbA-trnH序列均可作为DNA条形码对商陆及其混伪品进行识别和鉴定,为商陆资源品种现状与分布研究及合理开发利用提供理论依据。 展开更多
关键词 商陆 DNA条形码 ITS2 PSBA-TRNH 分子鉴定
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