基于细胞焦亡基因构建肾上腺皮质癌预后模型及免疫微环境分析

目的:建立一个细胞焦亡基因相关的肾上腺皮质癌预后模型,分析其免疫微环境并实验验证。方法:运用TCGA数据库和GTEx数据库筛选焦亡相关的差异表达基因,Cox回归和Lasso分析构建ACC预后风险模型,外部队列验证预后价值及临床相关性,对差异表达基因进行GO-KEGG和GSEA富集分析,探究致癌可能的相关通路,ssGSEA算法、Pearson相关性分析研究ACC的免疫微环境,实时荧光定量及免疫组化实验验证预测结果。结果:Lasso分析成功构建了ACC风险模型,Cox多因素回归分析显示风险评分可作为评价预后的独立因素。高风险患者具有更低的OS和PFI,时间依赖性ROC曲线下面积(AUC)均大于0.5。风险模型还与T、M、N临床分期相关,对外部队列进行同样的风险分组,显示高风险患者预后更差,进一步证实风险模型的普适性。富集分析显示E2f、MYC等致癌通路被显著上调。高风险组中多数免疫细胞浸润较差,且MHC分子、趋化因子等分子分泌下降,不利于抗癌免疫微环境的形成。TP53和DNNB1蛋白提示为ACC的潜在治疗靶点。实时荧光定量和免疫组化实验验证了模型的普适性。结论:本研究利用生物信息学方法,成功构建出肾上腺皮质癌风险模型,外部验证良好,具有较准确的预后能力。免疫微环境分析得出ACC患者常处于免疫抑制状态,因此热门免疫检查点抑制剂效果不佳。TP53和DNNB1癌蛋白在高风险患者中表达显著,可作为潜在治疗靶点,以改善免疫治疗失效的现状。希望该风险模型能为肾上腺皮质癌的预后识别及靶向治疗提供新思路。

鼻咽癌组织中高表达的GSDME对TME免疫浸润和患者预后的影响

目的:探究细胞焦亡相关基因GSDME在鼻咽癌组织中的表达及其对肿瘤微环境(TME)和患者预后的影响。方法:从TCGA数据库获得548例鼻咽癌患者的基因表达数据及临床资料,运用R语言对GSDME进行差异表达分析、GO-KEGG富集分析;从人类蛋白质图谱(HPA)数据库中获取GSDME蛋白在鼻咽癌组织和相应癌旁组织中的表达数据,通过STRING数据库探究与GSDME相互作用的蛋白质网络;应用ss GSEA算法分析GSDME在鼻咽癌组织中的表达及其与24种免疫细胞浸润的相关性,运用Spearman法分析GSDME与免疫检查点分子的相关性,通过TISIDB数据库分析GSDME表达与细胞因子基因表达的相关性。单因素和多因素COX回归分析筛选预后风险因素,基于风险因素GSDME绘制预后预测列线图和校准图,根据GSDME的表达水平对鼻咽癌患者进行生存分析和风险分析。qPCR法验证中国人鼻咽癌组织中GSDME及4种趋化因子mRNA的表达。结果:数据库数据分析显示,与癌旁组织相比,鼻咽癌组织中GSDME呈高表达(P<0.01),GO-KEGG富集分析显示GSDME参与免疫反应、细胞焦亡相关信号通路,GSDME表达与免疫细胞浸润、细胞因子及免疫检查点分子表达等相关,q PCR检查结果验证了中国人鼻咽癌组织中GSDME呈高表达。GSDME表达量、N分期和M分期是鼻咽癌患者预后的风险因素,基于风险因素建立的列线图和校正图能较好地预测鼻咽癌患者OS,鼻咽癌组织中GSDME高表达的患者预后差。结论:GSDME在鼻咽癌癌组织中呈高表达且是患者预后风险因素,基于GSDME建立的列线图预测预后效能良好;GSDME高表达与TME免疫浸润有关,其可能是免疫治疗的潜在靶点。

Study on Color Information Degradation Induced byγ-ray Radiation in CMOS Cameras

Theγ-rays are widely and abundantly present in strong nuclear radiation environments,and when they act on the camera equipment used to obtain environmental visual information on nuclear robots,radiation effects will occur,which will degrade the performance of the camera system,reduce the imaging quality,and even cause catastrophic consequences.Color reducibility is an important index for evaluating the imaging quality of color camera,but its degradation mechanism in a nuclear radiation environment is still unclear.In this paper,theγ-ray irradiation experiments of CMOS cameras were carried out to analyse the degradation law of the camera’s color reducibility with cumulative irradiation and reveal the degradation mechanism of the color information of the CMOS camera underγ-ray irradiation.The results show that the spectral response of CMOS image sensor(CIS)and the spectral transmittance of lens after irradiation affect the values of a^(*)and b^(*)in the LAB color model.While the full well capacity(FWC)of CIS and transmittance of lens affect the value of L^(*)in the LAB color model,thus increase color difference and reduce brightness,the combined effect of color difference and brightness degradation will reduce the color reducibility of CMOS cameras.Therefore,the degradation of the color information of the CMOS camera afterγ-ray irradiation mainly comes from the changes in the FWC and spectral response of CIS,and the spectral transmittance of lens.

马铃薯/乳清蛋白复合凝胶的性质和微观结构

为减少乳清蛋白用量,用马铃薯蛋白替代乳清蛋白质量的一半制备了热诱导凝胶。通过色度、质构、水分分布、流变考察了总蛋白质量浓度(40~80 g/L)对于复合凝胶物理性质的影响。结果表明,复合凝胶最低成胶质量浓度为50 g/L(其中乳清蛋白质量浓度为25 g/L),与乳清蛋白最低成胶质量浓度80 g/L相比,乳清蛋白用量减少了68.8%。总蛋白质量浓度从50 g/L提高到80 g/L时,复合凝胶偏黄,硬度和弹性分别增加了5.28倍和5.90%,但束缚水含量降低了3.51%;储能模量(G’)显示较弱的频率依赖性。蛋白质量浓度为80 g/L的复合凝胶孔隙尺寸小,具有由颗粒聚集体组成的均一致密网络结构,因而具有较高的G’。复合凝胶中β-折叠和β-转角结构约占蛋白二级结构的70%。维持复合凝胶结构的作用力中氢键和疏水相互作用的贡献高于二硫键。

EB病毒潜伏膜蛋白LMP1疫苗的预测及验证

目的采用生物信息学方法分析EB病毒潜伏膜蛋白LMP1,为疫苗的研发提供理论依据。方法在NCBI数据库中获取LMP1蛋白的基因组序列和氨基酸序列,采用生物信息学分析工具ProtParam、SOPMA、SWISS MODEL、SignalP、TMHMM、Cell-PLoc 2.0、NetNGly、NetPhos-3.1、Conserved domains、IEDB、BLAST、Immunomedicine Group、UniProt预测LMP1蛋白的理化性质,二、三级结构,信号肽和跨膜区域,亚细胞定位,糖基化位点和磷酸化位点,保守结构域,B、T细胞表位,同源性,抗原决定簇以及相互作用蛋白。构建重组质粒LMP1-pMV261以及重组卡介苗,并通过检测LMP1分子及蛋白表达水平探究构建疫苗的基本条件。结果LMP1蛋白分子式为C1901H2877N493O562S11,氨基酸数为386,相对分子质量为41.98238×10^(3),原子总数为5844。LMP1蛋白为稳定亲水蛋白,二级结构主要为无规则卷曲(Cc),占49.48%,易与抗体嵌合。该蛋白无信号肽,具有6个跨膜区,亚细胞定位在宿主细胞膜,无糖基化位点,有27个磷酸化位点,7个相互作用蛋白。实时荧光定量PCR及Western blot检测该蛋白基因及蛋白表达均稳定。结论生物信息学分析LMP1蛋白为稳定亲水蛋白,含有丰富的B、T细胞表位,构建的重组卡介苗蛋白表达稳定,可作为EB病毒的候选疫苗。

3.0 T MRI动态增强评估肝纤维化分期的实验研究

目的探讨3.0 T磁共振动态增强定量参数评估肝纤维化分期的可行性。方法家兔40只,随机分为实验组30只,对照组10只;实验组采用四氯化碳腹腔注射法建立肝纤维化模型,对照组清水及饲料喂养。于造模第6、8、10、12、16周末对兔行3.0 T磁共振动态增强扫描,获得肝脏定量灌注参数：K^trans、Kep、Ve。扫描结束后取肝组织行肝纤维化病理分期。统计学分析不同肝纤维化分期的MRI参数差异,各定量参数与肝纤维化分期的相关性,ROC曲线判别各参数诊断不同级别肝纤维化的敏感性和特异性,P〈0.05为差异有统计学意义。结果实验结束获取肝纤维化F0-F4分别为：10、8、7、9、6例。F0-F4,K^trans、Kep逐渐减低,组间有统计学差异（P〈0.05）;Ve逐渐增加,组间没有统计学差异（P〉0.05）。K^trans、Kep值在F0 vs F1-4、F0-2 vs F3-4组间差异有统计学意义（P〈0.05）。K^trans、Kep与肝纤维化分期呈负相关（r=-0.739、-0.530,P〈0.005）,Ve与肝纤维化分期呈正相关（r=0.306,P〈0.05）。ROC曲线分析,K^trans值对判别F0 vs F1-4、F0 vs F1-2、F0 vs F3-4、F0-2 vs F3-4的ROC曲线下的面积分别为0.878、0.770、0.967、0.898;Kep均值对判别F0 vs F1-4、F0 vs F1-2、F0 vs F3-4、F0-2 vs F3-4的ROC曲线下的面积分别为0.699、0.563、0.810、0.820。结论 3.0 T磁共振定量参数K^trans、K_（ep）可鉴别正常肝脏与肝纤维化,也有助于鉴别轻度-重度肝纤维化。