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基于LC-QTOF-MS代谢组学解析牛樟芝子实体和菌丝体中氨基酸代谢差异 被引量:3
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作者 郑焕 林冬梅 +4 位作者 刘峻源 张引莲 林标声 林占熺 李晶 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期254-266,共13页
为分析氨基酸在牛樟芝子实体和菌丝体代谢中的差异,采用LC-QTOF-MS系统质谱技术对牛樟芝子实体和菌丝体等3组样品进行代谢组分析,运用SIMCA软件(V16.0.2)对差异氨基酸代谢物进行筛选,分析重要氨基酸及其代谢途径,挖掘潜在标记物用于牛... 为分析氨基酸在牛樟芝子实体和菌丝体代谢中的差异,采用LC-QTOF-MS系统质谱技术对牛樟芝子实体和菌丝体等3组样品进行代谢组分析,运用SIMCA软件(V16.0.2)对差异氨基酸代谢物进行筛选,分析重要氨基酸及其代谢途径,挖掘潜在标记物用于牛樟芝品种多样性和差异性分析。样品间主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)表明样品间在负离子条件下具有显著差异,在t检验P<0.05,VIP>1的条件下,牛樟芝子实体(ACFB)与液体培养14 d菌丝体(ACM-14)中有288个显著差异代谢物,其中主要差异氨基酸有15种;在ACFB与液体培养28 d菌丝体(ACM-28)中有332个显著差异代谢物,其中主要差异氨基酸有11种;ACM-14与ACM-28间存在283个显著差异代谢物,其中主要差异氨基酸有14种。牛樟芝子实体与菌丝体间氨基酸代谢差异大于菌丝体间,其中以L-精氨酸差异尤为显著。本研究为挖掘牛樟芝子实体、菌丝体氨基酸标记性代谢物和开发产品等提供理论参考。 展开更多
关键词 牛樟芝 LC-QTOF-MS 子实体 菌丝体 氨基酸代谢
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地方高校“3+1”顶岗实习生物技术专业实践教学体系的探索与实践 被引量:1
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作者 林标声 华宝玉 +1 位作者 陈彤 邱龙新 《安徽农业科学》 CAS 2021年第9期268-270,共3页
对应用型地方高校生物技术专业学生实行“3+1”顶岗实习的实施方案、质量保障体系及意义进行了阐述,并对该实践教学体系进行探索与研究。实践表明,绝大部分的学生认可“3+1”顶岗实习模式。“3+1”顶岗实习提升了学生的专业技能和综合素... 对应用型地方高校生物技术专业学生实行“3+1”顶岗实习的实施方案、质量保障体系及意义进行了阐述,并对该实践教学体系进行探索与研究。实践表明,绝大部分的学生认可“3+1”顶岗实习模式。“3+1”顶岗实习提升了学生的专业技能和综合素质,真实对接了人才的“培养和需求”,有利于学生走向社会提升就业能力,有利于实现学校转型发展和地方经济发展的双赢。 展开更多
关键词 地方高校 “3+1”顶岗实习 生物技术 实践教学
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不同饲养方式对贵妃鸡鸡蛋品质和蛋黄脂肪酸组成的影响 被引量:2
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作者 何玉琴 杨松 +6 位作者 雷金荣 李志鸿 林标声 杨守深 杨小燕 邱龙新 戴爱玲 《特产研究》 2022年第3期63-67,77,共6页
本试验旨在研究不同饲养方式对贵妃鸡鸡蛋品质和蛋黄脂肪酸组成的影响。选取饲养200日龄产蛋率接近的贵妃鸡180羽,随机分成“大棚网上鱼腥草”和“大棚网上”两组饲养模式,每组3个重复,每个重复30羽,饲养日粮均相同。试验期67 d,预试期7... 本试验旨在研究不同饲养方式对贵妃鸡鸡蛋品质和蛋黄脂肪酸组成的影响。选取饲养200日龄产蛋率接近的贵妃鸡180羽,随机分成“大棚网上鱼腥草”和“大棚网上”两组饲养模式,每组3个重复,每个重复30羽,饲养日粮均相同。试验期67 d,预试期7 d,正试期60 d。结果表明,与“大棚网上”饲养模式相比,“大棚网上鱼腥草”饲养模式中蛋重和蛋壳厚度有显著差异(P<0.05),蛋形指数、蛋壳强度、蛋黄颜色、哈氏单位及蛋黄比率无显著差异(P>0.05);多不饱和脂肪酸(PUFAs)和饱和脂肪酸(SFAs)含量有显著差异(P<0.05),ω-3系PUFAs有显著差异(P<0.05);ω-6系PUFAs无显著差异(P>0.05);ω-6/ω-3PUFAs的比值8.60与“大棚网上”组的比值14.10有降低;胆固醇含量有显著差异(P<0.05)。“大棚网上鱼腥草”饲养模式提高了贵妃鸡鸡蛋的品质和脂肪酸的含量,降低了ω-6/ω-3PUFAs的比值和胆固醇含量。 展开更多
关键词 饲养方式 贵妃鸡 蛋品质 蛋黄脂肪酸
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银杏叶葡萄籽复合粉对贵妃蛋鸡血清酶活性、血脂水平和鸡蛋胆固醇含量的影响 被引量:1
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作者 何玉琴 雷金荣 +5 位作者 李志鸿 林标声 杨守深 戴爱玲 邱龙新 杨小燕 《特产研究》 2021年第6期95-98,共4页
本文旨在研究银杏叶葡萄籽复合粉对贵妃蛋鸡血清酶活性、血脂水平和鸡蛋胆固醇含量的影响。选取30周龄的健康贵妃蛋鸡120羽,随机分成对照组和试验组共4组,各设3个重复,每个重复10羽对照组饲喂基础日粮,试验组在基础日粮中分别添加1.0%、... 本文旨在研究银杏叶葡萄籽复合粉对贵妃蛋鸡血清酶活性、血脂水平和鸡蛋胆固醇含量的影响。选取30周龄的健康贵妃蛋鸡120羽,随机分成对照组和试验组共4组,各设3个重复,每个重复10羽对照组饲喂基础日粮,试验组在基础日粮中分别添加1.0%、1.5%和2.0%的银杏叶葡萄籽复合粉,预试期7d正试期60d。结果表明,与对照组相比,各试验组能显著提高血清中乳酸脱氢酶的活性(P<0.05),谷丙转氨酶和谷草转氨酶的活性有下降趋势,但均差异不显著(P>0.05)。试验组能显著降低血清甘油三酯和血清总胆固醇含量(P<0.05),血清HDL-C含量随着银杏叶葡萄籽复合粉添加水平的提高有升高的势态,且以1.5%银杏叶葡萄籽复合粉组提高最多,为37.65%差异达显著水平(P<0.05)。试验组的蛋黄相对重差异不显著(P>0.05),试验组的蛋黄胆固醇和每个全蛋胆固醇含量随着银杏叶葡萄籽复合粉添加水平的提高有降低的势态且以1.5%银杏叶葡萄籽复合粉组降低显著,分别降低了13.73%(P<0.05)和27.17%(P<0.05)。试验结果显示,蛋鸡饲粮中添加银杏叶葡萄籽复合粉可以提高贵妃蛋鸡血清酶的活性、降低血脂水平和鸡蛋胆固醇含量且以添加1.5%为宜。 展开更多
关键词 银杏叶粉 葡萄籽粉 血清酶活性 血脂水平 胆固醇 贵妃蛋鸡
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巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的克隆及生物信息学分析
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作者 林标声 张浣星 +2 位作者 何玉琴 罗茂春 林占熺 《湖北农业科学》 2020年第3期147-153,共7页
研究巨菌草(Pennisetum giganteum)内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的生物学信息,对GN02菌株nifH基因进行克隆及完整性验证,并采用多种生物学在线软件对其进行生物信息学预测和分析。结果表明,GN02菌株nifH基因具有完整的... 研究巨菌草(Pennisetum giganteum)内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的生物学信息,对GN02菌株nifH基因进行克隆及完整性验证,并采用多种生物学在线软件对其进行生物信息学预测和分析。结果表明,GN02菌株nifH基因具有完整的ORF,长度882 bp,编码293个氨基酸,NCBI GenBank登录号为MK131264。生物信息学分析表明,GN02菌株nifH基因具有高度保守性,与其他物种来源的nifH基因核苷酸序列及氨基酸序列同源性均达到95%以上。nifH蛋白总相对分子量为31 970.73、理论等电点pI为4.72;跨膜模型倾向N-末端向外的由内到外的跨膜、整个多肽链表现为亲水性;有2个糖基化位点但无分泌信号肽,有可能存在螺旋卷曲结构;二级结构预测表明α-螺旋和无规则卷曲是其多肽链中的主要结构元件,延伸链散布于整个蛋白质中;在数据库中能对该蛋白进行三维同源建模。 展开更多
关键词 巨菌草(Pennisetum giganteum) 内生固氮菌 KLEBSIELLA variicola NIFH基因 克隆 生物信息学
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化肥减量配施菌草固氮菌肥对巨菌草生长、营养品质及土壤养分的影响 被引量:8
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作者 贾雨雷 廖真 +6 位作者 汪丽芳 卜建超 林标声 林辉 苏德伟 鲁国东 林占熺 《草业学报》 CSCD 北大核心 2021年第3期215-223,共9页
生物肥料替代部分化肥在植物种植中发挥了重要作用。利用从巨菌草根部筛选的优良内生固氮菌株制作菌草固氮菌肥,并进行田间随机完全区组试验,设不施肥(空白对照,CK0),灭菌的菌草固氮菌肥(基质对照,CK1),全量化肥(FHF),菌草固氮菌肥(T1)... 生物肥料替代部分化肥在植物种植中发挥了重要作用。利用从巨菌草根部筛选的优良内生固氮菌株制作菌草固氮菌肥,并进行田间随机完全区组试验,设不施肥(空白对照,CK0),灭菌的菌草固氮菌肥(基质对照,CK1),全量化肥(FHF),菌草固氮菌肥(T1),菌草固氮菌肥+75%化肥(T2)共5个处理,研究其对巨菌草生长、产量、营养品质及土壤理化性质的影响。结果表明:与不施肥相比,只施菌草固氮菌肥和菌草固氮菌肥+75%化肥处理均能显著促进巨菌草生长,提高其产量,改善巨菌草品质和土壤理化性质;与只施化肥相比,只施菌草固氮菌肥处理在不同程度上降低了巨菌草产量、粗纤维、木质素、粗灰分含量和土壤碱解氮、速效磷、速效钾、有机质含量;而菌草固氮菌肥+75%化肥处理下,巨菌草叶片数、分蘖数、粗蛋白、粗纤维、酸性洗涤纤维、木质素、粗灰分含量均显著高于只施化肥处理,巨菌草产量、株高、粗脂肪含量和土壤碱解氮、速效磷、速效钾、有机质含量比只施化肥高但差异不显著,中性洗涤纤维含量则低于只施化肥处理。因此,适当减施化肥配施菌草固氮菌肥(化肥菌草固氮菌肥+75%化肥)在稳定巨菌草产量的同时,也能够在一定程度上促进其生长,改善其营养品质和土壤理化性质。 展开更多
关键词 菌草固氮菌肥 巨菌草 产量 营养品质
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芦竹属菌草内生固氮菌nifH基因的表达研究 被引量:1
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作者 李曼 李巧琪 +3 位作者 廖真 林标声 鲁国东 林占熺 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第8期1776-1780,共5页
【目的】检测5种芦竹属菌草绿洲成熟期根样本内生固氮菌的丰度及nifH基因的表达,为nifH基因的快速定量检测及实时监测提供技术手段。【方法】采用实时荧光定量PCR技术(Real-time quantitative reverse transcription PCR,qRT-PCR)分析... 【目的】检测5种芦竹属菌草绿洲成熟期根样本内生固氮菌的丰度及nifH基因的表达,为nifH基因的快速定量检测及实时监测提供技术手段。【方法】采用实时荧光定量PCR技术(Real-time quantitative reverse transcription PCR,qRT-PCR)分析根样本内生固氮菌nifH基因的拷贝数及相对表达量。【结果】5种芦竹属菌草成熟期根样本内生固氮菌nifH基因表达量及拷贝数均有较大的差异。其中,绿洲2号nifH基因相对表达量最高,呈过表达水平,且绿洲2号样本差异达显著水平(P<0.05),其余各样本差异不显著;固氮基因nifH的拷贝数呈逐步递减,其中绿洲1号样本nifH基因的拷贝数最高,达8.84×10^(11)/g;绿洲5号最低,达1.54×10^(11)/g,各样本的差异均达到显著水平。【结论】基于实时荧光定量PCR对固氮基因nifH的定量及定性分析,可为nifH基因的定量检测及表达情况提供理论依据。 展开更多
关键词 芦竹属菌草 内生固氮菌 固氮基因 相对表达量 拷贝数
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Effects of Microbial Fermentation Feeds on Growth Performance of Weaned Piglets
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作者 lin biao-sheng LUO Jian +1 位作者 DAI Ai-ling YANG Xiao-yan 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2010年第1期11-13,共3页
[ Objective] TO study the effects of microbial fermentation feeds on growth performance of piglets, and provide the basis for their promotion and application, [ Method ] All of 60 Duroc x Landrace x Yorkshire crossbre... [ Objective] TO study the effects of microbial fermentation feeds on growth performance of piglets, and provide the basis for their promotion and application, [ Method ] All of 60 Duroc x Landrace x Yorkshire crossbred weaned piglets, weighing 8-10 kg, were randomly housed in six groups, 10 piglets in each group. The piglets in control groups were fed with traditional daily food which contained aureomycin at 70 mg/kg . BW and concentrate feeds without antibiotics. While the piglets in experimental groups were fed with concentrate feeds without antibiotics and microbial fermentation feeds. [ Result] The results indicated that the average daily gain of experimental groups raised by 5.56%, and the feed conversion ratio reduced by 3.53% compared to control group. Moreover, the number of probiotics in the feces of experimental groups increased and pH value decreased significantly compared with the control groups (P 〈 0.05). [ Conclusion] Microbial fermentation feeds can be used to replace antibiotics feeds, and promote healthy growth of the piglets. 展开更多
关键词 MICROORGANISM Fermented feed Weaned piglets Growth performance
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一株粗糙脉孢菌的分离、鉴定及其基因组变异和功能分析 被引量:6
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作者 林标声 何玉琴 +1 位作者 陈小红 罗茂春 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期771-781,共11页
【背景】粗糙脉孢菌LY03是从武平传统“红菌豆腐”中分离得到的主要发酵菌株。【目的】研究粗糙脉孢菌LY03菌株的基因组信息,揭示武平传统“红菌豆腐”发酵特性。【方法】采用形态学观察、ITS鉴定、重测序及框架图测序对所分离的LY03菌... 【背景】粗糙脉孢菌LY03是从武平传统“红菌豆腐”中分离得到的主要发酵菌株。【目的】研究粗糙脉孢菌LY03菌株的基因组信息,揭示武平传统“红菌豆腐”发酵特性。【方法】采用形态学观察、ITS鉴定、重测序及框架图测序对所分离的LY03菌株进行鉴定和基因组信息解析。【结果】武平传统“红菌豆腐”中分离得到的主要发酵菌株LY03确定为粗糙脉孢菌,将其在中国普通微生物菌种保藏管理中心进行专利保藏,保藏号为CGMCC 3.19233。LY03菌株比对到参考基因组上的总Read数目为95.85%,测序对应深度的位点占全基因组76.13%;各变异类型在内含子区域均无变异,主要变异存在于基因组的外显子区域,具体变异数量为:单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)位点变异总数203128个、插入缺失(insertion/deletion,InDel)突变总和26859个、拷贝数变异(copy number variation,CNV)增加和减少的拷贝总数1039个、结构变异(structure variation,SV)注释的变异总数777个;LY03菌株基因组序列长度为30538737 bp、(G+C)mol%为52.24%、编码5550个基因、编码基因占比24.3%,参与了氨基酸代谢(amino acid metabolism)、碳水化合物代谢(carbohydrate metabolism)、能量产生与转化(energy production and conversion)等多种物质的代谢途径转化过程。【结论】对武平传统“红菌豆腐”主要发酵菌株的鉴定及基因组信息分析有利于揭示其产品发酵的特性及其发酵菌株遗传信息的本质,并为将来产品发酵性能的提高及推广提供理论依据。 展开更多
关键词 红菌豆腐 粗糙脉孢菌 分离鉴定 基因组 序列分析
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固氮菌Klebsiella variicola GN02基因序列及其分泌胞外多糖的相关特性
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作者 林标声 陈小红 +1 位作者 何玉琴 罗茂春 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期727-737,共11页
【背景】一些固氮菌能分泌胞外多糖,与宿主植物的关系密切,在提供氮素和促进植物生长有重要作用。【目的】进行固氮菌Klebsiella variicola GN02的基因序列分析,了解分泌胞外多糖的相关基因和其蛋白的结构特性。【方法】用二代和三代测... 【背景】一些固氮菌能分泌胞外多糖,与宿主植物的关系密切,在提供氮素和促进植物生长有重要作用。【目的】进行固氮菌Klebsiella variicola GN02的基因序列分析,了解分泌胞外多糖的相关基因和其蛋白的结构特性。【方法】用二代和三代测序技术相结合的方法对GN02菌株进行全基因组分析,并对其分泌的胞外多糖进行理化、结构特性解析。【结果】GN02菌株基因组中含有许多与氮代谢及多糖合成、分泌相关的基因及蛋白,该菌株培养后提取的胞外多糖得率为6.90 g/L、分子量1.8×10^3 Da、比旋度[α]25 D 75°、粘度[η]80.28;多糖组成为葡萄糖、半乳糖和甘露糖,为(1→3)及(1→6)糖苷键连接的β构型多糖,具有多糖的红外光谱特征吸收峰。【结论】提供了K.variicola GN02菌株基因组序列,解析了分泌胞外多糖的基因相关蛋白、理化性质及结构特性,有助于进一步了解该固氮菌分泌多糖的机理及为植物促生作用的相关性研究提供基础。 展开更多
关键词 固氮菌 KLEBSIELLA variicola 基因序列 胞外多糖 蛋白 结构特性
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巨菌草不同生长时期的内生固氮菌群组成分析 被引量:16
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作者 林标声 范锦琳 +3 位作者 宋昭昭 张丽丽 张煜隆 林占熺 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期1479-1490,共12页
【背景】禾本科植物中存在着丰富的内生固氮菌资源,可为植物的生长、营养利用、增强抗逆性等起到重要的促进作用。【目的】揭示巨菌草不同生长时期根、茎、叶内生固氮细菌的组成及其变化。【方法】采用高通量测序技术对不同生长时期的... 【背景】禾本科植物中存在着丰富的内生固氮菌资源,可为植物的生长、营养利用、增强抗逆性等起到重要的促进作用。【目的】揭示巨菌草不同生长时期根、茎、叶内生固氮细菌的组成及其变化。【方法】采用高通量测序技术对不同生长时期的巨菌草根、茎、叶内生固氮菌群进行群落分析。【结果】不同生长时期巨菌草根、茎、叶的15个样本分别得到4-6万条有效序列,主要分布在360 bp左右。根部巨菌草内生固氮菌群在成熟期最高,茎部和叶部均为拔节期最高,同一生长时期则为根>叶>茎,变化趋势与巨菌草植物样本的固氮酶活性变化趋势一致,其主要的菌群门类为变形菌门(Proteobacteria)和蓝藻菌门(Cyanobacteria),主要核心属为克雷伯氏菌属(Klebsiella)、草螺菌属(Herbaspirillum)和慢生根瘤菌(Bradyrhizobium)。整体上看,根、叶部来源的各自微生物菌群组成较为接近,茎部来源的菌群与根部、叶部有交叉,成熟期根部的联合固氮菌群种类和丰度最高。典范对应分析表明各来源样本固氮菌群的组成主要受环境温度影响,其次为湿度和pH。【结论】不同生长时期巨菌草根、茎、叶固氮菌群的组成及丰度存在着较大的差异,本研究可为巨菌草内生固氮菌群资源的开发和利用以及种质资源库的建立提供基础依据。 展开更多
关键词 高通量测序 巨菌草 内生固氮菌 菌群群落
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