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SPP1基因在肺腺癌中的表达及与预后的相关性研究 被引量:3
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作者 栾艳超 梁超 +3 位作者 韩青松 刘佳坤 杨立伟 李志峰 《临床肺科杂志》 2022年第6期884-891,共8页
目的SPP1基因与多种肿瘤的发生、侵袭和转移有关,但SPP1与肺腺癌(Lung adenocarcinoma LUAD)的关系尚未研究。本研究拟探讨SPP1在肺腺癌中的表达与患者临床特征及预后的关系。方法挖掘UALCAN数据库分析SPP1表达与临床关系;运用GEPIA、K-... 目的SPP1基因与多种肿瘤的发生、侵袭和转移有关,但SPP1与肺腺癌(Lung adenocarcinoma LUAD)的关系尚未研究。本研究拟探讨SPP1在肺腺癌中的表达与患者临床特征及预后的关系。方法挖掘UALCAN数据库分析SPP1表达与临床关系;运用GEPIA、K-M数据库分析SPP1表达与预后关系。采用qPCR、western blot和免疫组织化(IHC)法检测肺腺癌中SPP1的表达情况,并分析SPP1表达与临床参数及预后的关系。结果SPP1在肺腺癌中高表达,与肿瘤临床分期、淋巴结转移、和生存状况显著相关。SPP1表达与患者OS负相关。Cox分析提示SPP1蛋白表达、肿瘤临床分期、远处转移为影响LUAD患者预后的独立危险因素。结论SPP1表达水平与肺腺癌的预后显著相关,有可能成为LUAD诊治、评估预后的重要分子标志物。 展开更多
关键词 SPP1 肺腺癌 预后 生物信息学
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基于信息检索的软件缺陷定位技术研究进展 被引量:8
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作者 张芸 刘佳琨 +2 位作者 夏鑫 吴明晖 颜晖 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2020年第8期2432-2452,共21页
缺陷定位是软件工程研究最活跃的领域之一.大部分软件缺陷都会被提交到类似于Bugzilla和Jira的缺陷追踪系统中.由于提交的缺陷报告数量过多,开发人员不能及时处理,因而迫切需要一个自动化工具来帮助开发人员识别缺陷相关源代码文件.研... 缺陷定位是软件工程研究最活跃的领域之一.大部分软件缺陷都会被提交到类似于Bugzilla和Jira的缺陷追踪系统中.由于提交的缺陷报告数量过多,开发人员不能及时处理,因而迫切需要一个自动化工具来帮助开发人员识别缺陷相关源代码文件.研究人员已提出了大量缺陷定位技术.基于信息检索的软件缺陷定位技术(information retrieval-based bug localization,简称IRBL)利用了缺陷报告的文本特性,并且由于计算成本低、对不同的程序语言更具普适性而成为缺陷定位领域的研究热点,取得了一系列研究成果.然而,IRBL技术也在数据预处理、相似度计算和工程应用等方面存在诸多挑战.鉴于此,对现有的IRBL技术进行梳理总结,主要内容包括:(1)梳理了IRBL中数据预处理的过程和信息检索通用方法;(2)对IRBL技术中利用的数据特征进行了详细的分类和总结;(3)总结了技术评估中使用的性能评估指标;(4)归纳出了IRBL技术的关键问题;(5)展望了IRBL技术的未来发展. 展开更多
关键词 缺陷报告定位 信息检索 软件工程
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IL-12B多态性与卵巢子宫内膜异位症遗传易感性的关联研究 被引量:2
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作者 赵玮 刘佳坤 +2 位作者 李琰 张海波 康山 《现代免疫学》 CAS 北大核心 2022年第4期312-316,334,共6页
本研究通过病例-对照研究探讨了IL-12B多态性与卵巢子宫内膜异位症(endometriosis,EMT)遗传易感性的关系。应用多重聚合酶连接反应-连接酶检测反应(polymerase chain reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)技术对700例卵巢EMT患... 本研究通过病例-对照研究探讨了IL-12B多态性与卵巢子宫内膜异位症(endometriosis,EMT)遗传易感性的关系。应用多重聚合酶连接反应-连接酶检测反应(polymerase chain reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)技术对700例卵巢EMT患者和700例健康对照者IL-12B rs17860508和rs3212227位点进行多态性检测。同时采用qRT-PCR技术检测45例携带不同基因型患者在位内膜组织中IL-12B mRNA表达水平。结果显示,IL-12B启动子区rs17860508多态性位点的基因型和等位基因频率在病例组和对照组间分布差异均有统计学意义(P=0.018,P=0.013)。与CTCTAA/CTCTAA基因型相比,GC/CTCTAA和GC/GC基因型能显著增加卵巢EMT的发病风险(OR=1.38,95%CI=1.07~1.78;OR=1.47,95%CI=1.09~1.98);携带GC等位基因的人群较携带CTCTAA等位基因者有较高的患病风险(OR=1.21,95%CI=1.04~1.41)。另外,携带GC/GC基因型的患者在位内膜组织中IL-12B mRNA的表达水平显著高于携带GC/CTCTAA和CTCTAA/CTCTAA基因型的患者(P=0.032)。而rs3212227位点基因型和等位基因频率在病例组和对照组人群中的分布差异无统计学意义。因此,IL-12B启动子区rs17860508多态性位点可能与卵巢EMT的发病风险有关。 展开更多
关键词 卵巢子宫内膜异位症 白细胞介素12B基因 多态性 信使核糖核酸
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Sox9治疗兔椎间盘退变的效果及机制研究 被引量:1
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作者 赵哲 刘贾昆 +2 位作者 王焕 王文波 徐宁 《现代生物医学进展》 CAS 2020年第3期445-448,423,共5页
目的:探究Sox9用于治疗椎间盘退变的效果及调控机制。方法:将Ad-sox9和Ad-GFP各20μL分别转染至椎间盘退变兔的髓核组织中,转染后3、7、30、60天取材,采用免疫组化、免疫荧光和MRI等研究方法检测椎间盘髓核组织中II型胶原、蛋白多糖的... 目的:探究Sox9用于治疗椎间盘退变的效果及调控机制。方法:将Ad-sox9和Ad-GFP各20μL分别转染至椎间盘退变兔的髓核组织中,转染后3、7、30、60天取材,采用免疫组化、免疫荧光和MRI等研究方法检测椎间盘髓核组织中II型胶原、蛋白多糖的表达情况,并分析对椎间盘退变的改善情况。结果:免疫组化染色显示sox9组中椎间盘髓核组织中II型胶原、蛋白多糖的表达明显升高,MRI显示sox9组椎间盘T2像信号有明显改善(P<0.05)。结论:体内转染腺病毒介导的sox9基因能够增加椎间盘内II型胶原和蛋白多糖的表达,并抑制椎间盘的退变进程。 展开更多
关键词 椎间盘 髓核 SOX9 Ⅱ型胶原 基因表达
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Interleukin-1 inhibits Sox9 and collagen type Ⅱ expression via nuclear factor-κB in the cultured human intervertebral disc cells 被引量:12
5
作者 YU Zhan-ge XU Ning +3 位作者 WANG Wen-bo PAN Shang-ha LI Ke-shen liu jia-kun 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2009年第20期2483-2488,共6页
Background The most significant biological change in intervertebral disc degeneration is the decrease of chondrocyte specific gene and protein expression of Sox9 and collagen type Ⅱ. Interleukin-1 (IL-1) is not exp... Background The most significant biological change in intervertebral disc degeneration is the decrease of chondrocyte specific gene and protein expression of Sox9 and collagen type Ⅱ. Interleukin-1 (IL-1) is not expressed in the normal intervertebral disc tissue but increases in the degenerated intervertebral disc tissue. This suggests that IL-1 may play a role in regulation of the expression of Sox9 and collagen type Ⅱ. Methods Human intervertebral disc cells were isolated and cultured. Sox9 and collagen type Ⅱ expression during treatment with IL-1, with or without the nuclear factor-κB (NF-κB) activity inhibitor curcumin, were detected by using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and Western blotting, and the activity of the NF-κB signaling pathway was detected by the electrophoretic mobility shift assay (EMSA). Results IL-1 lowered the mRNA level and protein expression of Sox9 and collagen type Ⅱ in the cultured intervertebral disc cells in a dose dependent manner (P 〈0.05), and this effect was attenuated by curcumin. Curcumin alone had no effect on Sox9 and collagen type Ⅱ expression (P 〉0.05). IL-1 at concentrations of 0.1 ng/ml, 1 ng/ml and 10 ng/ml could stimulate the activity of NF-κB in the intervertebral disc cells in a dose dependent manner (P 〈0.05) that was inhibited by curcumin. Conclusions We demonstrated the previously unknown function of IL-1 in inhibiting Sox9 and collagen type Ⅱ via NF-κB in the intervertebral disc cells. This inhibition can be attenuated by curcumin, which is an effective NF-κB activity inhibitor. 展开更多
关键词 INTERLEUKIN-1 SOX9 collagen type nuclear factor-κB intervertebral disc cells
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