目的探讨聚蛋白聚糖(aggrecan,ACAN)在泛癌中的表达,并聚焦乳腺癌分析其临床预后意义、免疫细胞浸润及功能富集分析。方法采用生物信息学分析ACAN在多种肿瘤组织及正常组织中的表达、临床预后;运用GEPIA 2、UALCAN、The Human Protein A...目的探讨聚蛋白聚糖(aggrecan,ACAN)在泛癌中的表达,并聚焦乳腺癌分析其临床预后意义、免疫细胞浸润及功能富集分析。方法采用生物信息学分析ACAN在多种肿瘤组织及正常组织中的表达、临床预后;运用GEPIA 2、UALCAN、The Human Protein Altas多组学数据库分析ACAN在乳腺癌和正常乳腺组织中的表达;采用TCGA数据库分析ACAN在乳腺癌中的表达水平与临床病理参数及预后的关系;利用TIMER2.0数据库分析ACAN在乳腺癌中的表达水平与免疫细胞浸润的关系,并进一步了解ACAN与免疫检查点的关系;利用GeneMANIA和STRING数据库构建ACAN基因与蛋白质互作网络;运用Metascape数据库对ACAN相关基因进行功能富集分析。结果ACAN在多种肿瘤组织中差异表达,在乳腺癌组织中呈现高表达且为预后不良因素(P<0.05);ACAN高表达与T、B淋巴细胞低浸润、巨噬细胞和中性粒细胞高浸润相关(P<0.05);ACAN与ADAMTS4、ADAMTS5、HAPLN1及COMP相互作用并参与人体多种生物学过程。结论ACAN在乳腺癌中表达水平增高,且ACAN高表达的乳腺癌患者预后较差,其机制可能与抑制T、B淋巴细胞浸润,促进巨噬细胞、中性粒细胞浸润有关。展开更多
矢量元胞自动机模型(VCA)能精细地模拟城市土地利用变化,在VCA中引入合理的地块分裂规则更符合城市扩张高度破碎化的特点。由于地块破碎及其模拟实现的复杂性,目前已有研究尚未考虑地块的动态分裂。该文提出了一种对地块分裂进行约束的...矢量元胞自动机模型(VCA)能精细地模拟城市土地利用变化,在VCA中引入合理的地块分裂规则更符合城市扩张高度破碎化的特点。由于地块破碎及其模拟实现的复杂性,目前已有研究尚未考虑地块的动态分裂。该文提出了一种对地块分裂进行约束的矢量元胞自动机模型(Constrained Dynamic Land Parcel Subdivision and Vectorbased Cellular Automata,CDLPS-VCA),通过形状、坡度、邻域来约束动态地块分裂过程,采用逻辑回归模型挖掘转换规则,并耦合矢量元胞自动机进行城市扩张模拟。该模型被应用于深圳市宝安区2009-2014年的城市扩张模拟,结果表明:与VCA和DLPS-VCA相比,CDLPS-VCA能获得最高的模拟精度(FoM=0.266,分别提高了0.046和0.020)和最相似的空间格局(al=86.08%,分别提高了11.30%和3.11%),说明在VCA中有机融合合理的地块分裂过程,能更精确地模拟土地利用变化;同时,基于模拟结果识别出了宝安中心组团、西部工业组团、西部高新组团3个城市发展热点区域。该方法能准确地模拟城市化进程,为城市土地利用监测和城市发展规划提供依据。展开更多
文摘目的探讨聚蛋白聚糖(aggrecan,ACAN)在泛癌中的表达,并聚焦乳腺癌分析其临床预后意义、免疫细胞浸润及功能富集分析。方法采用生物信息学分析ACAN在多种肿瘤组织及正常组织中的表达、临床预后;运用GEPIA 2、UALCAN、The Human Protein Altas多组学数据库分析ACAN在乳腺癌和正常乳腺组织中的表达;采用TCGA数据库分析ACAN在乳腺癌中的表达水平与临床病理参数及预后的关系;利用TIMER2.0数据库分析ACAN在乳腺癌中的表达水平与免疫细胞浸润的关系,并进一步了解ACAN与免疫检查点的关系;利用GeneMANIA和STRING数据库构建ACAN基因与蛋白质互作网络;运用Metascape数据库对ACAN相关基因进行功能富集分析。结果ACAN在多种肿瘤组织中差异表达,在乳腺癌组织中呈现高表达且为预后不良因素(P<0.05);ACAN高表达与T、B淋巴细胞低浸润、巨噬细胞和中性粒细胞高浸润相关(P<0.05);ACAN与ADAMTS4、ADAMTS5、HAPLN1及COMP相互作用并参与人体多种生物学过程。结论ACAN在乳腺癌中表达水平增高,且ACAN高表达的乳腺癌患者预后较差,其机制可能与抑制T、B淋巴细胞浸润,促进巨噬细胞、中性粒细胞浸润有关。
文摘矢量元胞自动机模型(VCA)能精细地模拟城市土地利用变化,在VCA中引入合理的地块分裂规则更符合城市扩张高度破碎化的特点。由于地块破碎及其模拟实现的复杂性,目前已有研究尚未考虑地块的动态分裂。该文提出了一种对地块分裂进行约束的矢量元胞自动机模型(Constrained Dynamic Land Parcel Subdivision and Vectorbased Cellular Automata,CDLPS-VCA),通过形状、坡度、邻域来约束动态地块分裂过程,采用逻辑回归模型挖掘转换规则,并耦合矢量元胞自动机进行城市扩张模拟。该模型被应用于深圳市宝安区2009-2014年的城市扩张模拟,结果表明:与VCA和DLPS-VCA相比,CDLPS-VCA能获得最高的模拟精度(FoM=0.266,分别提高了0.046和0.020)和最相似的空间格局(al=86.08%,分别提高了11.30%和3.11%),说明在VCA中有机融合合理的地块分裂过程,能更精确地模拟土地利用变化;同时,基于模拟结果识别出了宝安中心组团、西部工业组团、西部高新组团3个城市发展热点区域。该方法能准确地模拟城市化进程,为城市土地利用监测和城市发展规划提供依据。