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猪卵泡液外泌体处理卵巢颗粒细胞的SNP/Indel筛选分析
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作者 刘阳光 章会斌 +6 位作者 文浩宇 谢帆 赵世明 丁月云 郑先瑞 殷宗俊 张晓东 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期576-586,共11页
旨在分析卵泡液外泌体对卵巢颗粒细胞基因的影响,了解卵泡液外泌体在卵泡发育过程中的调控机理,为母猪繁殖研究提供理论依据。本研究选取6月龄、健康状态良好且体重相近的二元母猪为材料,屠宰后收集卵巢150枚,利用梯度离心法获取卵泡液... 旨在分析卵泡液外泌体对卵巢颗粒细胞基因的影响,了解卵泡液外泌体在卵泡发育过程中的调控机理,为母猪繁殖研究提供理论依据。本研究选取6月龄、健康状态良好且体重相近的二元母猪为材料,屠宰后收集卵巢150枚,利用梯度离心法获取卵泡液外泌体与猪卵巢颗粒细胞(porcine ovarian granulosa cells,POGCs),并在体外将卵泡液外泌体与猪卵巢颗粒细胞共培养。通过RNA-seq技术对猪卵巢颗粒细胞(granulosa cell samples,GC,n=3)和与外泌体共培养的猪卵巢颗粒细胞(granulosa-exosome co-culture samples,GCE,n=3)进行测序。结果显示,在GC和GCE组中平均每个样品获得5.54×10^(7)条clean reads,Q20和Q30质量得分均在92%以上。在GC和GCE组的6个样品中共获得1310979个SNPs突变和104498个InDel突变,其中纯合型SNP/Indel突变数量为170426个,杂合型SNP/Indel突变数量为1245052个,突变杂合子数目明显高于纯合子且SNP的发生率较高。另外,在突变类型中,转换类型共计973003个,颠换类型339974个,转换的类型显著高于颠换类型。经基因注释,突变主要发生在基因3′UTR、5′UTR、内含子区域,其次为外显子和基因间隔区。另外,通过与差异基因对比后,够筛选出1583个候选基因,经GO和KEGG功能富集发现,候选基因主要与细胞周期以及细胞增殖/凋亡过程相关。此外,共发现14个与细胞周期、增殖/凋亡通路相关的关键候选基因,其中11个基因存在互作关系。本研究获得的这些SNP/Indel信息可为后续研究外泌体在母猪生殖上的调控奠定科学基础。 展开更多
关键词 卵泡液外泌体 卵巢颗粒细胞 SNP RNA-SEQ
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纤维和磷石膏对淤泥强度及饱和渗透系数的影响规律
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作者 郑清松 曾佑荣 +1 位作者 刘阳光 刘红位 《水利与建筑工程学报》 2024年第2期1-6,31,共7页
为了将产生的淤泥重复利用,开展改良淤泥废土试验。以纤维和磷石膏为固化剂固化处理淤泥,进行不同养护龄期下不同掺量的纤维、磷石膏-淤泥混合土的无侧限抗压试验和渗透试验,探究不同纤维和磷石膏掺量下的力学性质以及饱和渗透系数变化... 为了将产生的淤泥重复利用,开展改良淤泥废土试验。以纤维和磷石膏为固化剂固化处理淤泥,进行不同养护龄期下不同掺量的纤维、磷石膏-淤泥混合土的无侧限抗压试验和渗透试验,探究不同纤维和磷石膏掺量下的力学性质以及饱和渗透系数变化规律。研究结果表明:聚丙烯纤维对强度的增强效果显著,且随着聚丙烯纤维掺量的增加,纤维固化淤泥土的强度逐渐提高。固化淤泥土的无侧限抗压强度随着磷石膏掺量增加呈现先增大后减小的趋势,磷石膏的最优掺量为1.84%(干重量之比)。磷石膏-固化淤泥土混合样的无侧限抗压强度随养护时间的增加而增大,14d之后趋于稳定。固化淤泥土的饱和渗透系数随着纤维和磷石膏掺量增加而提高。磷石膏-固化淤泥土饱和渗透系数随着养护龄期增加而提高,养护14d后其值趋于稳定。淤泥的饱和渗透系数均随着纤维和磷石膏掺量的增加而增加。 展开更多
关键词 淤泥 纤维 磷石膏 无侧限抗压强度 饱和渗透系数
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Comparative Assessment on Microstructure and Properties of in-situ TiC+Ti_(5)Si_(3)Reinforced TiAl-Sn-Zr Matrix Composites by Spark Plasma Sintering and Argon Protected Sintering 被引量:1
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作者 姚辉 许晓静 +4 位作者 CAI Chengbin LI Chen CHEN Fenghua liu yangguang XIAO Yishui 《Journal of Wuhan University of Technology(Materials Science)》 SCIE EI CAS CSCD 2023年第1期199-205,共7页
The effects of SiC particles(SiCp)on high temperature oxidation behavior of titanium matrix composites(TMCs)under different powder metallurgy processes were investigated.In situ Ti C+Ti_(5)Si_(3)reinforced titanium ma... The effects of SiC particles(SiCp)on high temperature oxidation behavior of titanium matrix composites(TMCs)under different powder metallurgy processes were investigated.In situ Ti C+Ti_(5)Si_(3)reinforced titanium matrix composites were prepared by discharge plasma sintering(SPS)and argon protective sintering(APS).The results show that the two processes have a negligible effect on the composition and hardness of the samples,but the hardness of the two samples is significantly improved by adding SiCp.The apparent porosity of SPS process is obviously smaller than that of APS process,whereas,the apparent porosity increases slightly with the addition of SiCp.The oxide layer thickness and mass gain of the samples obtained by SPS process are smaller than those obtained by APS process.The oxide thickness and mass gain of both processes are further reduced by adding SiCp.The SPS composites showed the best high temperature oxidation resistance.Therefore,TMCs with Si Cp by SPS can effectively improve the high-temperature oxidation behavior of the materials. 展开更多
关键词 powder metallurgy titanium matrix composites High-temperature oxidation TiC and Ti_(5)Si_(3) Ti-Al-Sn-Zr
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Effect of Solution-ECAP-Aging Treatment on the Microstructure and Properties of TB8 Titanium Alloy
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作者 陈枫华 许晓静 +3 位作者 liu yangguang HU Chaoxing CAO Bin BAI Xiang 《Journal of Wuhan University of Technology(Materials Science)》 SCIE EI CAS CSCD 2023年第3期669-676,共8页
The microstructure and mechanical properties of the TB8 titanium alloy were controlled by a secondary processing technology of solution-equal channel angular pressing(ECAP)-aging treatment,which combined strong plasti... The microstructure and mechanical properties of the TB8 titanium alloy were controlled by a secondary processing technology of solution-equal channel angular pressing(ECAP)-aging treatment,which combined strong plastic deformation with heat treatment. The effects of ECAP and heat treatment on the microstructure and properties of the titanium alloy were systematically investigated by optical microscopy(OM), scanning electron microscopy(SEM), hardness tests, and tensile property analysis. The results indicate that the metallographic structure without ECAP treatment is mainly equiaxed β-phase, while that after ECAP treatment is equiaxed β-phase with grain fragmentation, slip bands, and new small grains. After 850 ℃ solutionECAP-520 ℃ aging treatment, the titanium alloy has the smallest grain size, while the directionality of tissue growth along the ECAP direction is the most apparent. Under the same solution-aging conditions, the hardness of the titanium alloy increases from 431.5 to 531.2 HV compared to that without ECAP treatment, i e, increases by 23.11%, and the tensile strength increases from 1 045.30 to 1 176.25 MPa, i e, increases by 12.5%. 展开更多
关键词 equal channel angular pressing heat treatment TB8 titanium alloys MICROSTRUCTURE mechanical properties
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皖岳黑猪基因组遗传变异分析及特征SNPs挖掘 被引量:1
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作者 王静琳 刘阳光 +7 位作者 徐启隆 陈朔 邓在双 程诗雨 丁月云 郑先瑞 殷宗俊 张晓东 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期2783-2793,共11页
旨在揭示皖岳黑猪全基因组遗传变异情况,筛选皖岳黑猪特征分子标记SNP位点。本研究随机选取体重达110 kg的24头皖岳黑猪进行全基因组重测序,检测皖岳黑猪全基因组变异类型、分析群体遗传多样性参数;结合公共数据库信息,下载北京黑猪、... 旨在揭示皖岳黑猪全基因组遗传变异情况,筛选皖岳黑猪特征分子标记SNP位点。本研究随机选取体重达110 kg的24头皖岳黑猪进行全基因组重测序,检测皖岳黑猪全基因组变异类型、分析群体遗传多样性参数;结合公共数据库信息,下载北京黑猪、杜洛克、大白猪、蓝塘猪、民猪、深县黑猪的SNPs信息,利用挑选最大分类能力方法,将7个品种133个个体的SNPs分成两个数据集,进行皖岳黑猪特征位点选择,并对筛选到的SNPs进行基因功能注释。全基因组重测序分析结果显示,皖岳黑猪群体共获得31534384个SNPs,43673个SVs,3258个CNVRs,并筛选出33个皖岳黑猪特异位点;对33个SNP位点所注释基因进行功能富集分析,发现它们与生长(SUSD4、NELL1、GPC6)、繁殖(KHDRBS2、CRISP1)、免疫(NECTIN1)、神经调节及环境适应性(GRIK4)相关;群体遗传结构分析结果显示,皖岳黑猪有效群体较小为4.2,个体间的遗传距离在0.1574~0.2873之间,平均为0.2435±0.0222;皖岳黑猪群体期望杂合度为0.320,观察杂合度为0.328,多态性标记比例为0.788,多态性较为丰富;皖岳黑猪基因组ROH总长度在14.6~178.0 Mb,平均ROH长度为(61±9.4)Mb,群体近交系数较低,为0.025±0.004。综上,皖岳黑猪基因组遗传变异位点丰富,证明了皖岳黑猪在选育过程中保留了较丰富的遗传多样性,个体间遗传距离较远。结果为皖岳黑猪的持续选育提供了科学参考。 展开更多
关键词 皖岳黑猪 全基因组重测序 基因组遗传变异 特征SNPs 遗传结构
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HowNet义原标注一致性检验方法研究 被引量:7
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作者 刘阳光 岂凡超 +1 位作者 刘知远 孙茂松 《中文信息学报》 CSCD 北大核心 2021年第4期23-34,共12页
义原(sememe)被定义为人类语言中不可再分的最小语义单位。一个词语的意义可以由多个义原的组合来表示。以往人们已经人工为词语标注义原并构建了知网(HowNet)这一语言知识库,并借此将义原应用到了多种自然语言处理任务。但传统的人工... 义原(sememe)被定义为人类语言中不可再分的最小语义单位。一个词语的意义可以由多个义原的组合来表示。以往人们已经人工为词语标注义原并构建了知网(HowNet)这一语言知识库,并借此将义原应用到了多种自然语言处理任务。但传统的人工标注费时费力,而且不同的专家进行标注难免会引入标注者的主观偏差,导致标注的一致性和准确性难以保证。因此,保证词的义原标注一致性已成为建设高质量语言知识库HowNet、提升义原应用任务效果的首要任务。该文首次提出了一种对HowNet已标注的义原进行一致性检验的方法。实验结果表明,所提方法切实有效,能够很好地应用于HowNet知识库的标注一致性检验以及完善扩充。 展开更多
关键词 义原标注 HOWNET 一致性检验
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基于RNA-seq筛选白藜芦醇致猪卵巢颗粒细胞凋亡的可变剪接基因 被引量:4
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作者 章会斌 韩政 +6 位作者 刘阳光 周忍 陈一歌 许黎明 徐启隆 殷宗俊 张晓东 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2022年第8期36-44,共9页
本研究旨在探究参与白藜芦醇(Resveratrol,RES)诱导猪卵巢颗粒细胞(Porcine Ovarian Granulosa Cells,pGCs)凋亡的可变剪接基因。实验以50、100μmol/LRES处理pGCs,并设置空白对照,利用转录组测序(RNA-seq)技术分析3组之间差异可变剪接... 本研究旨在探究参与白藜芦醇(Resveratrol,RES)诱导猪卵巢颗粒细胞(Porcine Ovarian Granulosa Cells,pGCs)凋亡的可变剪接基因。实验以50、100μmol/LRES处理pGCs,并设置空白对照,利用转录组测序(RNA-seq)技术分析3组之间差异可变剪接基因的表达谱,对差异可变剪接基因进行GO和KEGG富集分析,通过qRT-PCR验证RNA-seq数据。结果表明,与对照组相比,低浓度组有198种基因参与了236个可变剪接事件,高浓度组有603种基因发生了779个可变剪接事件。在log2|FoldChange|>1、P<0.05条件下,分别在低浓度组筛选到6个、高浓度组筛选到35个差异可变剪接基因。GO分析显示,差异可变剪接基因主要参与生物学过程条目。KEGG分析发现,显著富集的通路均与激素分泌及代谢途径相关,如卵巢类固醇生成信号通路、氨基酸代谢相关信号通路等。进一步从中筛选出可能参与RES诱导pGCs凋亡的关键基因(AKR1C1、GLUL、SARDH、MADD基因)。综上,RES通过影响pGCs中基因的可变剪接,从而影响相关信号通路和生物学功能;同时,筛选出的关键基因可作为进一步研究RES调控pGCs凋亡机制的候选靶标。 展开更多
关键词 白藜芦醇 颗粒细胞 转录组测序 可变剪接
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地球科学双语课程综合教学改革实践
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作者 刘仰光 齐永安 宋党育 《实验科学与技术》 2018年第4期67-71,共5页
该文针对高等院校地矿类专业地球科学双语课程设置的差异性,双语教学目标、定位和实践中的不规范性等特点,在授课内容、师资队伍建设、教材建设、课堂教学模式、实验室建设和现代化教育技术的利用等方面进行了改革和实践。实践表明,地... 该文针对高等院校地矿类专业地球科学双语课程设置的差异性,双语教学目标、定位和实践中的不规范性等特点,在授课内容、师资队伍建设、教材建设、课堂教学模式、实验室建设和现代化教育技术的利用等方面进行了改革和实践。实践表明,地球科学双语课程的综合教学改革加强了地球科学双语课程教学团队、教材、教学模式、实践基地和实验平台的建设,在提高授课质量,培养学生创新思维能力和知识综合运用能力等方面效果显著。 展开更多
关键词 地球科学 双语教学 教学改革 教学模式 实验平台建设
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氧化镧添加剂和盐浴共渗温度对TC4钛合金硼氧共渗组织与性能的影响 被引量:1
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作者 刘阳光 许晓静 +3 位作者 宋振华 汪洋 朱亮亮 朱劲松 《金属热处理》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期180-186,共7页
采用OM、SEM、XRD、EDS、维氏硬度计以及摩擦试验机等分析手段研究了氧化镧添加剂和共渗温度对盐浴硼氧共渗试样组织与性能的影响。结果表明,共渗层厚度随着La_2O_3添加量的增加先增大后减小,当La_2O_3添加量为3%时,共渗层厚度达最大值(... 采用OM、SEM、XRD、EDS、维氏硬度计以及摩擦试验机等分析手段研究了氧化镧添加剂和共渗温度对盐浴硼氧共渗试样组织与性能的影响。结果表明,共渗层厚度随着La_2O_3添加量的增加先增大后减小,当La_2O_3添加量为3%时,共渗层厚度达最大值(32.74μm);与低温(950℃)相比,高温(1000℃)时盐浴共渗层具有较好的表面,较高的共渗层厚度(34.19μm),较高表面硬度(1211 HV0.2),较大界面结合力(87.36 N)和更低的摩擦因数(0.28)。通过将温度对共渗过程的影响和试验结果分析得出:高温1000℃盐浴硼氧共渗试验更有研究价值。 展开更多
关键词 氧化镧 盐浴渗硼 TC4钛合金 界面结合力 摩擦磨损性能
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