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水稻协优9308重组自交系群体白叶枯病抗性的全基因组关联分析 被引量:2
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作者 赵海涵 练旺民 +6 位作者 占小登 徐海明 张迎信 程式华 楼向阳 曹立勇 洪永波 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期121-137,共17页
白叶枯病是水稻生产最严重的细菌性病害,挖掘新的白叶枯病抗性基因资源并培育抗病品种是控制该病害的重要方法。本研究利用父母本抗性差异较大的协优9308衍生的139个重组自交系群体作为遗传材料,人工接种不同白叶枯菌后的病斑长度作为... 白叶枯病是水稻生产最严重的细菌性病害,挖掘新的白叶枯病抗性基因资源并培育抗病品种是控制该病害的重要方法。本研究利用父母本抗性差异较大的协优9308衍生的139个重组自交系群体作为遗传材料,人工接种不同白叶枯菌后的病斑长度作为连续型表型,结合经DNA深度测序获得的476,505个单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)标记进行全基因组关联分析(genome-wide associated study,GWAS)。结果表明在P<1×10^(-4)下,4个菌株处理后共鉴定到109个与白叶枯抗性显著关联的SNPs位点,解释表型变异率59.78%~63.29%。其中CR4接种发现了25个SNP位点其贡献率为61.00%,在这些SNP位点附近共筛选到19个基因,其中有2个为NBS-LRR抗病相关基因(LOC_Os11g43420和LOC_Os11g45930)。表达分析验证发现该2个基因在抗性亲本中恢9308的表达量分别为感病母本协青早B的4.42倍和8.86倍,表明其可能在正调控白叶枯病抗性机制中发挥重要作用。进化树分析发现这2个候选基因与已克隆的抗性基因属于不同的亚组,表明可能是新基因。本研究为进一步挖掘白叶枯抗性基因和培育抗病品种提供了理论基础和基因资源。 展开更多
关键词 水稻白叶枯病 全基因组关联分析 NBS-LRR 抗病育种
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42例儿童化脓性脑膜炎的临床分析 被引量:4
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作者 邓巧儿 唐丹霞 +3 位作者 李平甘 何展文 罗向阳 李栋方 《岭南急诊医学杂志》 2019年第6期560-563,共4页
目的:总结儿童化脓性脑膜炎的诊治特点及探讨影响预后的危险因素。方法:回顾性分析我院儿科2008年3月至2018年2月收治确诊为化脓性脑膜炎的42例患儿的临床资料。以发病年龄分新生儿组及非新生儿组;按随访结果分预后不良组及预后良好组... 目的:总结儿童化脓性脑膜炎的诊治特点及探讨影响预后的危险因素。方法:回顾性分析我院儿科2008年3月至2018年2月收治确诊为化脓性脑膜炎的42例患儿的临床资料。以发病年龄分新生儿组及非新生儿组;按随访结果分预后不良组及预后良好组。结果:非新生儿组出现嗜睡和抽搐症状比例、发热最高体温均>新生儿组;非新生儿组脑脊液(CSF)中的蛋白水平(出、入院)、CSF中的白细胞水平(出院)<新生儿组,预后不良组CSF蛋白水平(出院)、CSF葡萄糖降低发生率(入院)>预后良好组;预后不良组发病年龄、CSF葡萄糖水平(入院)<预后良好组,差异均有统计学意义(P<0.05);多因素Logistic回归分析示出院时CSF中蛋白浓度值是影响化脓性脑膜炎不良预后的独立危险因素。结论:儿童化脓性脑膜炎患儿出院前脑脊液的蛋白值越高;预后可能越差,新生儿化脓性脑膜炎的临床表现更隐匿,对可疑病例应尽早作辅助检查以协助诊治。免疫治疗可调节改善患儿体内免疫状态,但对远期预后的作用还有待观察。 展开更多
关键词 儿童化脓性脑膜炎 临床分析 危险因素 预后
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Mapping and genetic validation of a grain size QTL qGS7.1 in rice(Oryza sativa L.) 被引量:3
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作者 XUE Pao ZHANG Ying-xin +7 位作者 lou xiang-yang ZHU Ai-ke CHEN Yu-yu SUN Bin YU Ping CHENG Shi-hua CAO Li-yong ZHAN Xiao-deng 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2019年第8期1838-1850,共13页
Grain size is a major determinant of grain weight, which is one of the components of rice yield. The objective o this study was to identify novel, and important quantitative trait loci(QTLs) for grain size and weight ... Grain size is a major determinant of grain weight, which is one of the components of rice yield. The objective o this study was to identify novel, and important quantitative trait loci(QTLs) for grain size and weight in rice. QTLs were mapped using a BC4F4 population including 192 backcross inbred lines(BILs) derived from a backcross between Xiaolijing(XLJ) and recombinant inbred lines(RILs). The mapping population was planted in both Lingshui(Hainan, 2015) and Fuyang(Zhejiang, 2016), with the short-and long-day conditions, respectively. A total of 10 QTLs for grain length, four for grain width, four for the ratio of grain length to width, and 11 for grain weight were detected in at least one environment and were distributed across 11 chromosomes. The phenotypic variance explained ranged from 6.76–25.68%, 14.30–34.03%, 5.28–26.50%, and 3.01–22.87% for grain length, grain width, the ratio of grain length to width, and thousand grain weight, respectively. Using the sequential residual heterozygotes(SeqRHs) method, qGS7.1, a QTL for grain size and weight, was mapped in a 3.2-Mb interval on chromosome 7. No QTLs about grain size and weight were reported in previous studies in this region, providing a good candidate for functional analysis and breeding utilization. 展开更多
关键词 RICE (Oryza sativa L.) quantitative TRAIT LOCI GRAIN size GRAIN weight residual HETEROZYGOTE
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