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Structure and functional heterogeneity of soil microbial communities in different farmland types on the Loess Plateau
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作者 XU Chen SU Cuicui +3 位作者 CHEN Yiping ma jifu WU Junhua JIANG Yao 《地球环境学报》 CSCD 2024年第4期653-664,共12页
Background,aim,and scope Soil microbes are important drivers of nutrient transformation and energy f low.Reclaiming forest land for agricultural use may have profound effects on soil properties and microbial communiti... Background,aim,and scope Soil microbes are important drivers of nutrient transformation and energy f low.Reclaiming forest land for agricultural use may have profound effects on soil properties and microbial communities.However,the response of soil microbial communities to soil reclamation in the dryland agroecosystem is less understood.Therefore,it is necessary to investigate the changes of soil microbial communities driven by land use conversion to promote nutrient cycling in reclaimed farmland.Materials and methods Based on the metagenomic technique,we evaluated the microbial composition and function of the newly created farmland(NF)after reclamation with two types of traditional farmland(slope farmland(SF),checkdam farmland(CF))on the Loess Plateau,and explored the response of nutrient cycling function to dominant genera and soil properties.Results The results showed that Proteobacteria,Actinobacteria,and Acidobacteria were prevalent in the three types of farmlands.Compared with SF and CF,NF increased the relative abundance of Actinobacteria and Nocardioides,as well as genes related to amino acid metabolism and carbohydrate metabolism.The relative abundance of functional genes related to carbon and nitrogen cycling in the NF was higher than that in the traditional farmland(SF and CF).The relative abundance of nutrient cycling functional genes was positively correlated with dominant genera in the three types of farmlands.Except for pH,soil physicochemical factors were negatively correlated with genes related to amino acid metabolism and carbon cycle.Discussion Previous studies have shown that the nutrient conditions of the soil may intensify the competition between the eutrophic and oligotrophic microbial populations.After long-term cultivation and fertilization,the soil properties of traditional farmland were significantly different from those of NF,leading to the differentiation of dominant microbial groups.Microbes usually have functional redundancy to cope with changing environments.Soil microbes in traditional farmland may contain more genes related to replication and repair,cell growth and death,and environmental adaptation in response to disturbances caused by agricultural practices.On the contrary,the NF was less disturbed by agricultural activities,and the soil properties were more similar to forest land,so the carbon and nitrogen cycle function genes were more abundant.The nutrient cycling function was affected by the abundance of microbial dominant groups and soil properties,which may be related to the availability of soil nutrients and agricultural disturbance in different farmlands.Aspects of soil microbial-driven nutrient cycling in agriculture could be regulated in sustainable method.Conclusions The change from forest land to farmland kept more carbon and nitrogen cycling function in the newly created farmland,while long-term agricultural activities have drastically changed the functional structure of traditional farmland,resulting in the nutrient cycling function more concentrated to meet the needs of crop growth.Recommendations and perspectives Hence,it is necessary to apply sustainable agricultural method to regulate microbial-driven nutrient cycling.The insights are meaningful for sustainable agricultural development and land management in arid areas. 展开更多
关键词 METAGENOMICS microbial function FARMLAND nutrient cycling Loess Plateau
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抑制素α亚基特异性纳米抗体基因筛选与鉴定
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作者 马继福 巴合提·博代 +2 位作者 黑子别克·哈孜别克 李振伟 吾热力哈孜·哈孜汗 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1532-1542,共11页
【目的】从新疆双峰驼淋巴细胞基因组中筛选出抑制素α亚基(INHα)特异性纳米抗体(VHH)基因,制备新型抑制素免疫制剂,以期间接提高动物血液促卵泡素(FSH)水平、排卵率和产羔率。【方法】利用pET32a-INHA原核表达载体诱导表达INHα蛋白... 【目的】从新疆双峰驼淋巴细胞基因组中筛选出抑制素α亚基(INHα)特异性纳米抗体(VHH)基因,制备新型抑制素免疫制剂,以期间接提高动物血液促卵泡素(FSH)水平、排卵率和产羔率。【方法】利用pET32a-INHA原核表达载体诱导表达INHα蛋白并纯化,纯化后的INHα蛋白经尿素溶液复性后免疫新疆双峰驼。通过对免疫前和免疫后全血中淋巴细胞VHH基因进行巢式PCR扩增、高通量测序并建立VHH氨基酸差异数据库;分别对免疫前和免疫后血清及从免疫后血清中筛选出的INHα特异性抗体进行液相色谱质谱/质谱联用(LC-MS/MS)分析获得质谱数据;对质谱数据进行蛋白数据库检索和数据分析后建立INHα特异性抗体和免疫后特异性抗体的肽段库和蛋白库;通过将VHH氨基酸差异数据库分别与INHα特异性抗体和免疫后特异性抗体的肽段库进行序列比对,筛选出INHα特异性纳米抗体基因;对筛选出的VHH基因进行序列比对、三维结构预测和蛋白-蛋白模拟对接。【结果】试验成功诱导表达并纯化了INHα蛋白,INHα蛋白免疫新疆双峰驼获得的抗体效价达1∶1024000;成功从淋巴细胞中克隆出VHH基因,从免疫后血清中筛选出INHα特异性抗体;通过高通量测序、质谱分析及数据处理筛选出5个INHα特异性VHH基因,其氨基酸序列比对结果显示,整体相似性为70.98%,其中互补决定区1(CDR1)长10~13个氨基酸,CDR2长12~13个氨基酸,CDR3长12~22个氨基酸,CDR3在3个互补决定区中氨基酸序列差异最大;系统进化树显示,选择的5条氨基酸序列具有丰富的多样性;蛋白-蛋白模拟对接结果表明,除VHH-267外其余4株纳米抗体均可与INHα配对连接,且主要作用力为疏水相互作用和氢键。【结论】本研究首次通过高通量测序技术联合质谱分析从新疆双峰驼淋巴细胞基因组中筛选出5个INHα特异性VHH基因。本研究结果可为提高动物机体FSH水平及排卵率提供理论指导和技术支持,对繁殖免疫学的发展具有一定参考价值。 展开更多
关键词 抑制素α亚基(INHα) 双峰驼 纳米抗体 高通量测序 质谱分析
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基于噬菌体展示技术筛选抑制素α亚基特异性纳米抗体
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作者 马继福 阿德力·克坦 +3 位作者 解津刚 巴合提·博代 李振伟 吾热力哈孜·哈孜汗 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期2032-2043,共12页
【目的】通过噬菌体展示技术构建抗抑制素α亚基(INHα)纳米抗体文库,并筛选出针对绵羊INHα的特异性纳米抗体,以期制备出新型抑制素免疫制剂,为提高绵羊外周血促卵泡素(FSH)水平和排卵率做前期准备。【方法】利用pET32a-INHA原核表达... 【目的】通过噬菌体展示技术构建抗抑制素α亚基(INHα)纳米抗体文库,并筛选出针对绵羊INHα的特异性纳米抗体,以期制备出新型抑制素免疫制剂,为提高绵羊外周血促卵泡素(FSH)水平和排卵率做前期准备。【方法】利用pET32a-INHA原核表达载体诱导表达INHα蛋白,并对诱导表达的INHα蛋白进行SDS-PAGE和Western blotting鉴定;用Ni琼脂糖凝胶纯化后的INHα蛋白免疫新疆双峰驼。通过巢式PCR扩增制备骆驼噬菌体展示纳米抗体文库,通过三轮免疫亲和淘选及噬菌体ELISA从该文库中富集和筛选INHα特异性纳米抗体,并通过测序得知纳米抗体的基因序列;用蛋白-蛋白模拟对接初步鉴定该纳米抗体与INHα蛋白的亲和性。【结果】通过原核诱导表达及Ni琼脂糖凝胶纯化得到了大小为36 ku的INHα重组蛋白,通过Western blotting检测到约36 ku的蛋白条带;双峰驼通过6次INHα蛋白免疫抗体效价达到1∶1024000;通过巢式PCR获得了400 bp左右的VHH基因,通过电转化等试验构建了库容量为1.05×10^(12)CFU的纳米抗体文库,文库阳性率为94%;通过三轮免疫亲和淘选获得3.0×10^(8)CFU的抗INHα纳米抗体文库,利用噬菌体ELISA获得了4株(VHH-4、VHH-29、VHH-89、VHH-108)INHα特异性纳米抗体,且4株INHα特异性纳米抗体基因序列相似度为80.31%;通过蛋白-蛋白模拟对接鉴定发现4株纳米抗体均与INHα具有较强的亲和性。此外,VHH-4与INHα的总自由能为-576.28 kJ/mol,是4种VHH中的最佳抗体。【结论】成功构建了抗INHα纳米抗体库,并从该库中获取了VHH-4、VHH-29、VHH-89和VHH-1084株INHα特异性纳米抗体。本研究结果可为纳米抗体在生殖免疫学中的应用提供参考。 展开更多
关键词 抑制素α亚基(INHα) 纳米抗体 噬菌体展示技术
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青海柴达木盆地乡镇空间规划的实践与思考 被引量:2
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作者 李永浮 蔡宇超 +3 位作者 刘曦 唐依依 赵光林 马吉福 《上海城市规划》 2019年第4期78-84,110,共8页
以我国青海省海西州的尕海镇、柯鲁柯镇和宗加镇为例,探索我国西部青藏地区乡镇空间规划的核心内容和编制技术方法,思考乡镇空间规划深层次问题。利用综合分析法与比较分析法,探讨柴达木盆地地区乡镇空间发展问题,总结典型乡镇空间发展... 以我国青海省海西州的尕海镇、柯鲁柯镇和宗加镇为例,探索我国西部青藏地区乡镇空间规划的核心内容和编制技术方法,思考乡镇空间规划深层次问题。利用综合分析法与比较分析法,探讨柴达木盆地地区乡镇空间发展问题,总结典型乡镇空间发展模式,并对西部资源开发地区乡镇空间规划对策展开思考。结果表明:(1)柴达木盆地乡镇空间发展存在城镇空间扩张明显、耕地后备空间不足、生态空间保护难度大等问题;(2)柴达木盆地乡镇空间发展分为城区工业型、近郊旅游型、远郊农牧型3种典型模式;(3)西部资源开发地区乡镇空间规划应注重“分类引导”的空间发展战略框架、“自下由上”的多点反馈工作方式与“四位一体”的空间规划技术路线。 展开更多
关键词 柴达木盆地 乡镇空间规划 经济发展 生态保护
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抑制素对促卵泡素作用机制的研究进展 被引量:2
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作者 马继福 巴合提·博代 +1 位作者 贾昊天 吾热力哈孜·哈孜汗 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2023年第1期37-41,126,127,共7页
抑制素(inhibins)是一种主要由卵巢颗粒细胞和睾丸支持细胞分泌的性腺激素,可以选择性抑制垂体促卵泡素(FSH)的合成与分泌。文章综述了众多学者建立的抑制素对FSH的作用机制,以及该作用机制与近年来研究结果的矛盾之处,并依据近年来的... 抑制素(inhibins)是一种主要由卵巢颗粒细胞和睾丸支持细胞分泌的性腺激素,可以选择性抑制垂体促卵泡素(FSH)的合成与分泌。文章综述了众多学者建立的抑制素对FSH的作用机制,以及该作用机制与近年来研究结果的矛盾之处,并依据近年来的研究结果修正了抑制素对FSH的作用机制模型,以期为将来研究抑制素提供新的思路。 展开更多
关键词 抑制素 激活素Ⅱ型受体 β-多糖 促卵泡素 促性腺激素细胞
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延安新造耕地下不同品种马铃薯微量元素含量分析与评价 被引量:1
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作者 王祥龙 苏翠翠 +1 位作者 马吉福 陈学林 《生物学通报》 2018年第11期37-41,共5页
为筛选出适宜在延安新造耕地种植的优良马铃薯品种,为后期的筛选工作提供数据支持,采用火焰原子吸收法和石墨炉法对延安新造耕地下12个马铃薯品种中Fe、Mn、Zn、Cu、Mo、Co、Cr、Ni共8种微量元素含量进行测定,并采用主成分因子分析方法... 为筛选出适宜在延安新造耕地种植的优良马铃薯品种,为后期的筛选工作提供数据支持,采用火焰原子吸收法和石墨炉法对延安新造耕地下12个马铃薯品种中Fe、Mn、Zn、Cu、Mo、Co、Cr、Ni共8种微量元素含量进行测定,并采用主成分因子分析方法对各个品种的微量元素含量进行综合分析与评价。结果显示,不同品种间微量元素含量均值顺序为Fe>Cu>Zn>Mn>Ni>Mo>Cr>Co,其中Fe的含量在24.99~107.06 mg/kg之间;Mn的含量在1.38~8.47 mg/kg之间;Zn的含量在1.71~26.46 mg/kg之间;Cu的含量在2.32~19.96 mg/kg之间;Mo的含量在0.078~0.536 mg/kg之间;Co的含量在0.021~0.075 mg/kg之间;Cr的含量在0.039~0.118 mg/kg之间;Ni的含量在0.302~0.912 mg/kg之间。不同品种间的微量元素之间存在一定的正相关性,各元素的吸收与积累存在着相互促进作用;各品种间‘费乌瑞它’微量元素含量最优,其次是‘克新1号’,‘青薯168’最差。 展开更多
关键词 延安 新造耕地 马铃薯 微量元素 分析 评价
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