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基于简化基因组测序评估陇南山羊群体遗传多样性和群体结构
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作者 马克岩 刘占经 +1 位作者 白雅琴 马友记 《中国畜禽种业》 2024年第4期8-17,共10页
该试验旨在利用简化基因组测序(specific-locus amplified fragment sequencing, SLAF-seq)分析陇南山羊群体遗传多样和群体结构,为陇南山羊后续保种计划的制订提供依据。该研究对50只陇南山羊(公、母各25只)进行全基因组SNP检测;计算... 该试验旨在利用简化基因组测序(specific-locus amplified fragment sequencing, SLAF-seq)分析陇南山羊群体遗传多样和群体结构,为陇南山羊后续保种计划的制订提供依据。该研究对50只陇南山羊(公、母各25只)进行全基因组SNP检测;计算观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、香浓维纳指数(SHI)、基因多样性指数(Nei)及次要等位基因频率(MAF)等6个指标进行遗传多样性评估。结果表明,50只陇南山羊共检测到655514个SNPs位点。陇南山羊的Ho、 He、 PIC、 SHI、 Nei及MAF指标值分别为0.193、0.286、 0.236、 0.449、 0.290、 0.200,说明该群体遗传多样性较低。陇南山羊群体LD值较低,衰退速度较快,说明该群体并未受到过强烈的人工选择压力。此外,PCA与系统发育树结果均表明陇南山羊群体内部出现分化,可分为2个大的亚群。陇南山羊群体平均IBS遗传距离为0.7391,结合亲缘关系G矩阵热图,表明陇南山羊群体大部分个体亲缘关系较远。50只陇南山羊个体共检测到47206个ROH,平均ROH长度37.86 Mb,基于ROH的近交系数FROH范围为0.0535~0.2574,平均FROH值为0.1472,说明陇南山羊群体存在近交风险。可见,陇南山羊内部存在分化,可分为2个大的亚群,陇南山羊群体遗传多样性较低,部分个体间存在较大的近交风险,可能需要采取保种措施保护陇南山羊遗传资源。 展开更多
关键词 陇南山羊 简化基因组测序 种质资源 遗传多样性 连续纯合片段
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伊犁马体尺与心脏结构和功能参数的关联性分析 被引量:2
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作者 彭宣 王彤亮 +8 位作者 鲍奕柯 姚新奎 孟军 王建文 祁居中 欧阳文 阿胡·吾拉力别克 马钶炎 曾亚琦 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期4615-4624,共10页
旨在研究不同体尺伊犁马之间心脏结构和功能参数的内在联系,提高运动马选育效率。本研究使用彩色多普勒超声系统测定健康状况良好的30匹2岁伊犁马的心脏结构和功能参数,分析伊犁马体高、体长、胸围、管围等体尺与心脏结构和功能参数的... 旨在研究不同体尺伊犁马之间心脏结构和功能参数的内在联系,提高运动马选育效率。本研究使用彩色多普勒超声系统测定健康状况良好的30匹2岁伊犁马的心脏结构和功能参数,分析伊犁马体高、体长、胸围、管围等体尺与心脏结构和功能参数的相关性并拟合线性模型。结果表明,伊犁马体重、体表面积、体长、胸围与舒张末期左心房内径(LADd)呈极显著正相关(P<0.01);体重、体表面积、胸围与二尖瓣内径(MVD)、舒张末期肺动脉内径(PAd)呈显著正相关(P<0.05);体长与MVD呈极显著正相关(P<0.01),与收缩末期左心室游离壁厚度(LVFWs)、左心室心肌质量(LVM)呈显著正相关(P<0.05);体高与左心室长轴径(LVLD)呈极显著正相关(P<0.01);管围与收缩末期左心房内径(LADs)、MVD呈显著正相关(P<0.05)。其他各体尺与心脏结构间相关性均不显著(P>0.05)。体重、体表面积、体长、胸围与舒张末期左心室容量(EDV)、收缩末期左心室容量(ESV)呈显著正相关(P<0.05);体表面积、胸围与左心室射血分数(EF)呈显著负相关(P<0.05);体高与EDV、每搏量(SV)呈极显著正相关(P<0.01),与心输出量(CO)呈显著正相关(P<0.05);管围与左心室心肌质量指数(LV MASS-I)呈显著负相关(P<0.05)。共拟合12个线性回归方程,R^(2)值(决定系数)均高于0.9,达到极显著水平,均可用于生产实践中。伊犁马体长与体高对心脏结构和功能参数的影响较大。对不同体尺的伊犁马间的心脏结构和功能参数进行相关性及回归分析,为马匹心脏评估提供理论依据。 展开更多
关键词 伊犁马 心脏结构 超声心动 功能
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基于简化基因组测序的永登七山羊遗传多样性分析 被引量:9
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作者 马克岩 韩金涛 +2 位作者 白雅琴 李讨讨 马友记 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1939-1950,共12页
旨在通过简化基因组测序(specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq)技术分析永登七山羊群体遗传多样性和群体结构,为永登七山羊作为新发现资源申报提供支撑。本研究以甘肃省4个地方绵羊群体(每个群体随机选取10只成年健... 旨在通过简化基因组测序(specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq)技术分析永登七山羊群体遗传多样性和群体结构,为永登七山羊作为新发现资源申报提供支撑。本研究以甘肃省4个地方绵羊群体(每个群体随机选取10只成年健康母羊)作为研究对象,利用SLAF技术检测全基因组范围内的单核苷酸多态性位点(SNPs)。通过perl编程计算观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、香浓维纳指数(SHI)和基因多样性指数(Nei)等5个遗传多样性指标;PopLDdecay软件分析每个品种连锁不平衡情况;elgensoft软件进行主成分分析(PCA);mega x软件构建4个绵羊品种的系统发育树;structure软件进行群体遗传结构分析;gcta软件进行亲缘关系分析。结果表明,40只绵羊个体共检测到1658596个SNPs位点,其中大部分SNPs位点位于基因间区域。永登七山羊群体Ho、He、PIC、SHI、Nei指标值分别为0.082、0.277、0.221、0.411和0.305,且永登七山羊的连锁不平衡系数较高,衰减速度较慢,说明永登七山羊群体遗传多样性低;永登七山羊与滩羊、兰州大尾羊和岷县黑裘皮羊之间的遗传分化系数(F_(st))分别为0.0906、0.0980和0.1045,表明永登七山羊与其他3个品种之间分化程度较高;PCA显示,群体间聚类模式差异明显,可将永登七山羊与兰州大尾羊、滩羊和岷县黑裘皮羊区分开;系统发育树结果表明,兰州大尾羊独自聚为一大支,永登七山羊和滩羊聚为另一大支,亲缘关系较近,随后永登七山羊逐渐分离出来独自聚为一小支;structure分析表明,K=2为最优分群数,即4个群体来自两个原始祖先,随着K值逐渐增加,部分永登七山羊个体发生分离,与其他品种遗传背景差异明显。亲缘关系热图显示,每个亚群个体之间亲缘关系较低。结果提示,永登七山羊与兰州大尾羊群体遗传多样性低,永登七山羊与滩羊、兰州大尾羊和岷县黑裘皮羊之间分化明显,这为进一步挖掘永登七山羊种质资源特性提供了理论数据。 展开更多
关键词 永登七山羊 种质资源 遗传多样性 群体结构 简化基因组测序
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永登七山羊全基因组选择信号检测分析
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作者 栗登攀 马克岩 +3 位作者 韩金涛 白雅琴 李讨讨 马友记 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期4577-4588,共12页
旨在检测永登七山羊群体基因组选择信号,挖掘永登七山羊有价值的种质特性基因。本研究以4个绵羊群体(永登七山羊、岷县黑裘皮羊、兰州大尾羊和滩羊)共40个个体为研究对象,利用简化基因组测序(specific-locus amplified fragment sequenc... 旨在检测永登七山羊群体基因组选择信号,挖掘永登七山羊有价值的种质特性基因。本研究以4个绵羊群体(永登七山羊、岷县黑裘皮羊、兰州大尾羊和滩羊)共40个个体为研究对象,利用简化基因组测序(specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq)技术检测全基因组范围内的单核苷酸多态性位点(SNPs)。基于SNPs数据集,通过elgensoft软件进行主成分分析;运用Treemix软件分析基因流事件;利用群体遗传分化指数(Fst)和核苷酸多样性比值(πratio)进行全基因组选择性清除分析,取top 5%Fst和πratio的交集以确定基因组受选择区域,并对候选基因进行GO和KEGG富集分析。结果共得到1658596个群体SNPs;主成分分析(PCA)发现永登七山羊能够独立分群,基因流表明永登七山羊和兰州大尾羊存在较弱的基因交流。以永登七山羊为试验群体,岷县黑裘皮羊、兰州大尾羊和滩羊为参考群体进行选择清除分析,3个比较组的受选择区域分别检测出424、294、301个候选基因;GO和KEGG分析结果表明,候选基因分别显著富集在65、79、41个GO条目及15、22、10条KEGG通路上(P<0.05)。此外,将岷县黑裘皮羊、兰州大尾羊和滩羊3个群体的数据合并为一个数据集与永登七山羊进行比较,共筛选到466个候选基因,显著富集到124个GO条目及7条KEGG通路(P<0.05)。从中筛选到永登七山羊重要经济性状相关的功能基因BMP2、GRM 1和ALDH 1A1。研究结果表明,在永登七山羊全基因组范围内进行选择信号检测,鉴定到与生长发育、脂尾进化相关的候选基因,为永登七山羊的分子遗传标记挖掘提供参考。 展开更多
关键词 永登七山羊 简化基因组测序 基因流 选择性清除分析 功能富集
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橡胶粉-废塑料复合改性沥青高低温性能研究
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作者 马岢言 王斌 +1 位作者 韦正鹏 刘富强 《中国科技论文》 CAS 北大核心 2023年第12期1334-1339,共6页
为获得高低温性能更佳的沥青胶结料,同时缓解废旧橡胶和塑料产生的“黑色污染”和“白色污染”问题,采用废旧橡胶粉和废旧聚乙烯塑料改性SK90#基质沥青获得橡胶粉-废塑料复合改性沥青,通过动态剪切流变(dynamic shear rheological,DSR)... 为获得高低温性能更佳的沥青胶结料,同时缓解废旧橡胶和塑料产生的“黑色污染”和“白色污染”问题,采用废旧橡胶粉和废旧聚乙烯塑料改性SK90#基质沥青获得橡胶粉-废塑料复合改性沥青,通过动态剪切流变(dynamic shear rheological,DSR)试验和弯曲梁流变试验对橡胶粉-废塑料复合改性沥青的高低温性能进行研究,并与SBS改性沥青进行对比分析。结果表明:橡胶粉和废塑料可有效改善SK90#基质沥青的高低温性能,在58℃和94℃下,橡胶粉-废塑料复合改性沥青的复数模量是SBS改性沥青的1.39倍和2.69倍,橡胶粉-废塑料复合改性沥青的车辙因子是SBS改性沥青的1.42倍和2.94倍,SBS改性沥青的相位角是橡胶粉-废塑料复合改性沥青的1.03倍和1.23倍,橡胶粉-废塑料复合改性沥青的蠕变劲度模量(S)较SBS改性沥青降低了25.33%,蠕变速率(m)较SBS改性沥青增大了12.01%。 展开更多
关键词 沥青路面 改性沥青 橡胶粉 塑料 高温流变性能 低温性能
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Zynq7020的PCM遥测数据测试系统设计
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作者 孙雪飞 马科研 +2 位作者 苏旭 刘敏霞 王亚凯 《单片机与嵌入式系统应用》 2023年第8期75-78,82,共5页
飞行器在地面测试以及飞行试验过程中,广泛采用脉冲编码调制(PCM)技术实现遥测数据的高速采集和稳定传输。针对目前要求遥测数据传输速率高、容量大、实时性强的特点,设计了基于Zynq7020的PCM遥测数据测试系统。该系统以Zynq7020为主控... 飞行器在地面测试以及飞行试验过程中,广泛采用脉冲编码调制(PCM)技术实现遥测数据的高速采集和稳定传输。针对目前要求遥测数据传输速率高、容量大、实时性强的特点,设计了基于Zynq7020的PCM遥测数据测试系统。该系统以Zynq7020为主控中心,通过CPCI总线实现上位机通信,能够模拟弹上设备向遥测采编发送装置发送LVDS数据,并实现两路PCM数据的实时高速采集与存储。经过反复测试验证,PCM数据未发现任何丢帧现象,可以满足飞行器地面测试的需要。 展开更多
关键词 PCM数据 Zynq7020 PCI9054
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快中子活化法测量放射性核素半衰期 被引量:3
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作者 许可 马克岩 +1 位作者 许旭 梁桁楠 《大学物理实验》 2018年第6期1-4,45,共5页
半衰期是放射性核素的重要特征之一,每种放射性核素都有着它特有的半衰期,因而测定半衰期就成了鉴别放射性核素的一种方法。本文中使用快中子活化法,使用一定能量和通量的快中子,辐照样品与靶原子核发生核发应,产生短期放射性核素,记录... 半衰期是放射性核素的重要特征之一,每种放射性核素都有着它特有的半衰期,因而测定半衰期就成了鉴别放射性核素的一种方法。本文中使用快中子活化法,使用一定能量和通量的快中子,辐照样品与靶原子核发生核发应,产生短期放射性核素,记录放射性核素衰变时产生的特定能量的特征γ射线计数,根据计数随时间的衰减规律,测量放射性核素的半衰期。 展开更多
关键词 快中子活化法 放射性核素 半衰期
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基于北斗智慧云监测平台的高边坡变形控制研究 被引量:4
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作者 程胜伟 段继东 +2 位作者 马科研 马第江 周扬佳 《施工技术》 CAS 2019年第S01期149-151,共3页
北斗智慧云监测平台通过云架构建立六套系统:监测体管理系统、监测系统、大数据分析预警系统、应急指挥系统、通信系统、科研系统,省道S316线怒江州六库至兰坪公路青吾甸至兰坪古盐都隧道试验段项目利用该监测预警平台,通过六套系统项... 北斗智慧云监测平台通过云架构建立六套系统:监测体管理系统、监测系统、大数据分析预警系统、应急指挥系统、通信系统、科研系统,省道S316线怒江州六库至兰坪公路青吾甸至兰坪古盐都隧道试验段项目利用该监测预警平台,通过六套系统项目相互协作,实现对YK27+390—YK27+540段高边坡监测体全天候、多方位的精准监测,节省人力、物力;对灾害发生进行预警和分析,最大限度地保障人民的生命财产安全。 展开更多
关键词 高边坡 变形监测 北斗系统 智慧云平台
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雨季路基施工生石灰处治湿软填土的施工技术研究 被引量:2
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作者 程胜伟 段继东 +2 位作者 马科研 马第江 邓靖 《施工技术》 CAS 2019年第S01期1199-1201,共3页
公路路基填筑施工中对填土质量和含水量要求较高,填土本身含水量过高或者遭受降雨浸泡,都会引起填筑路基出现冒浆、强度不足、弯沉值过大的质量问题。从而,如何减小填土含水量对路基施工的影响成了公路工程施工中一项重要的研究课题。... 公路路基填筑施工中对填土质量和含水量要求较高,填土本身含水量过高或者遭受降雨浸泡,都会引起填筑路基出现冒浆、强度不足、弯沉值过大的质量问题。从而,如何减小填土含水量对路基施工的影响成了公路工程施工中一项重要的研究课题。对生石灰处治湿软填土技术的作用机理以及工艺工法进行理论阐述,并进行了现场填筑碾压试验,得到不同天然含水量下的生石灰掺量范围,以有效对现场施工进行指导;结合国内外研究成果,创造性地提出采用以压实度为主,CBR值为辅的双指标参数对生石灰处治土的填筑质量进行控制,且给出控制指标的建议值,并在生产实践中验证其适用性。 展开更多
关键词 生石灰 湿软土 掺量 压实度 CBR值
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放射源^(226)Ra和^(133)Ba的衰变γ能谱分析
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作者 许旭 常艺 +3 位作者 陆景彬 刘佳强 马克岩 唐婉月 《吉林大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期979-985,共7页
采用p型同轴高纯锗探测器测量含^(226) Ra的荧光仪表盘与标准源^(133) Ba的衰变γ能谱,并分析特征γ射线的能量和强度.结果表明:^(226) Ra能谱中出现^(226) Ra的特征γ射线及大量^(226) Ra的衰变子核的特征γ射线;^(133)Ba谱中出现^(133... 采用p型同轴高纯锗探测器测量含^(226) Ra的荧光仪表盘与标准源^(133) Ba的衰变γ能谱,并分析特征γ射线的能量和强度.结果表明:^(226) Ra能谱中出现^(226) Ra的特征γ射线及大量^(226) Ra的衰变子核的特征γ射线;^(133)Ba谱中出现^(133)Ba特征射线及大量和峰,由计数率随距离变化关系及γ射线级联关系证明存在和峰. 展开更多
关键词 衰变γ能谱 特征射线 和峰 计数率
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基于壳模型分析^(94)Tc能级结构
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作者 吴义恒 杨东 +2 位作者 马克岩 罗朋威 程飞 《吉林大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1508-1512,共5页
利用NUSHELLX球形壳模型程序,考虑两种不同组态空间下^(94)Tc的能级结构.计算结果表明,^(94)Tc的正宇称自旋态激发机制主要为p1/2轨道质子跨越Z=40亚壳向高jg9/2轨道跃迁,(f_(5/2),p_(3/2))轨道质子跨越Z=38闭壳向(p1/2,g9/2)轨道激发,... 利用NUSHELLX球形壳模型程序,考虑两种不同组态空间下^(94)Tc的能级结构.计算结果表明,^(94)Tc的正宇称自旋态激发机制主要为p1/2轨道质子跨越Z=40亚壳向高jg9/2轨道跃迁,(f_(5/2),p_(3/2))轨道质子跨越Z=38闭壳向(p1/2,g9/2)轨道激发,负宇称自旋态为d5/2轨道中子跨越N=56亚壳向(g7/2,h11/2)轨道激发. 展开更多
关键词 高自旋态 单粒子激发 壳模型
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河西地区沥青路面车辙病害原因及防治措施 被引量:5
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作者 万娟霞 马岢言 李自齐 《山西建筑》 2021年第17期108-110,共3页
近年来河西地区某二级公路车辙发展迅速,严重影响路面行驶质量和安全。通过对该地区车辙路段沥青路面实体工程的调查分析和钻芯取样,初步分析车辙产生原因。为此,建立了昼夜大温差、重载作用下不同路面结构的沥青路面车辙计算模型,分析... 近年来河西地区某二级公路车辙发展迅速,严重影响路面行驶质量和安全。通过对该地区车辙路段沥青路面实体工程的调查分析和钻芯取样,初步分析车辙产生原因。为此,建立了昼夜大温差、重载作用下不同路面结构的沥青路面车辙计算模型,分析了温度和轴重对路面车辙的影响。结果表明:车辙深度与超载量呈几何倍数增长;温度对车辙的贡献率随着沥青路面厚度的增加而增大。 展开更多
关键词 沥青路面 温度 车辙
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绵羊TGF-β1在临床型乳腺炎乳腺组织中的表达
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作者 马克岩 尹德恩 马友记 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1471-1477,共7页
转化生长因子β1受体(transforming growth factor-β 1,TGF-β1)是CD14单核细胞中的生存因子,当TGF-β1缺失时CD14单核细胞迅速执行凋亡程序。然而,目前有关TGF-β1基因在绵羊乳腺炎发生过程中的调控机制尚不清楚。为研究TGF-β1基因... 转化生长因子β1受体(transforming growth factor-β 1,TGF-β1)是CD14单核细胞中的生存因子,当TGF-β1缺失时CD14单核细胞迅速执行凋亡程序。然而,目前有关TGF-β1基因在绵羊乳腺炎发生过程中的调控机制尚不清楚。为研究TGF-β1基因在患临床型乳房炎绵羊乳腺组织中的表达差异,本试验使用NCBI网站已公布的绵羊TGF-β1基因CDS序列,运用生物信息学分析方法对该基因生物学特征进行预测。通过qRT-PCR、Western blot检测健康和临床型乳腺炎绵羊乳腺组织中TGF-β1 mRNA及蛋白的表达,并使用免疫组织化学染色确定该蛋白在绵羊乳腺组织内分布情况。生物信息学分析结果表明,绵羊TGF-β1蛋白为疏水性不稳定蛋白,属于分泌蛋白,不同物种间保守性较高。qRT-PCR与蛋白免疫印迹结果显示,在健康和临床型乳腺炎乳腺组织中均存在TGF-β1基因的表达,且TGF-β1 mRNA与蛋白相对表达量均极显著(P<0.01)高于健康组。免疫组织化学结果显示,TGF-β1蛋白在临床型乳腺炎乳腺组织中均强烈表达于基质细胞和乳腺上皮细胞。由此推测可能是由于TGF-β1基因表达上调,导致患临床型乳腺炎乳腺组织中基质细胞与乳腺上皮细胞中炎症反应加剧。这为进一步研究TGF-β1基因在绵羊乳腺炎发病机制中的调控作用提供基础信息。 展开更多
关键词 绵羊 乳腺炎 转化生长因子β1(TGF-β1) 表达 定位
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An experiment-library least-squares method on on-line coal element contents analysis 被引量:6
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作者 WANG HuiDong LU JingBin +5 位作者 LU YuPing YANG Dong ma keyan YANG Kang LIU YuMin CHENG DaoWen 《Science China(Physics,Mechanics & Astronomy)》 SCIE EI CAS 2012年第11期2062-2069,共8页
A new experiment-library least-squares(experiment-LLs) method used in the neutron inelastic-scattering and thermal-capture analysis(NITA) technique for on-line coal analysis was developed,which has significantly decre... A new experiment-library least-squares(experiment-LLs) method used in the neutron inelastic-scattering and thermal-capture analysis(NITA) technique for on-line coal analysis was developed,which has significantly decreased the non-linear radiation effects.In this method,sixty samples with preset elemental contents were made,from whose experimental spectra twenty single-element spectrum libraries corresponding to twenty kinds of coal were built using the least-squares method.The spectrum of the unknown sample was analyzed based on these twenty libraries to estimate its element contents.With the initial estimated result,the procedure of developing library and analysis was iterated to build a new library with the closest element contents to the unknown sample.Hence the experiment-LLs method can reduce non-linear radiation effects.The experiment-LLs method was performed on an improved coal analysis system which was equipped with a long-life 14 MeV pulsed-neutron generator,a bulk BGO detector with a temperature controller,a moisture meter and coal-smoothing device.The precisions of this system for ash content,water content,volatile content and calorific value have reached 1.0wt%,0.5wt%,1.0wt%,350 kJ/kg,respectively. 展开更多
关键词 on-line coal analysis neutron activation analysis library least-squares
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