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黄山土壤细菌群落及氮循环功能群的垂向分布格局 被引量:3
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作者 向兴 满百膺 +5 位作者 张俊忠 罗洋 毛小涛 张超 孙丙华 王希 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期56-69,共14页
山地生态系统是研究土壤微生物垂向变化规律的天然场所,受采样空间尺度、样本异质性、测序深度、变化的生态因子、环境参数及多样性度量指数等因素的制约,目前对该系统土壤细菌群落及氮循环功能群垂向分异格局的认识仍然薄弱。以植被和... 山地生态系统是研究土壤微生物垂向变化规律的天然场所,受采样空间尺度、样本异质性、测序深度、变化的生态因子、环境参数及多样性度量指数等因素的制约,目前对该系统土壤细菌群落及氮循环功能群垂向分异格局的认识仍然薄弱。以植被和土壤垂直分带明显的黄山为研究对象,选取海拔926—1 800m的典型森林土壤样本,采用IlluminiaHiSeq高通量测序技术获取土壤细菌群落信息,在生物信息学分析中引入谱系结构指数(MNTD和NTI),结合土壤理化参数及FAPROTAX功能预测手段,探究黄山森林土壤细菌群落多样性和氮循环功能群垂向变化的潜在规律。结果显示,(1)变形菌门(Proteobacteria,44.77%)、酸杆菌门(Acidobacteria,21.85%)和放线菌门(Actinobacteria,14.88%)为优势细菌门类,其垂向分布依次呈现递减式、“U”型式和单峰式。(2)细菌群落的物种多样性指数和谱系多样性指数的空间垂向分布呈单峰模式。(3)谱系结构指数分析揭示细菌群落的系统发育关联度随海拔升高呈单调递增模式,表明环境过滤作用显著影响细菌群落的形成过程。(4)系统发育方法和分类学方法均表明pH和温度(t)是黄山森林土壤细菌群落结构垂向分布的主控因素。(5)4个主要的氮循环功能群中,尿素降解功能群(8.14%)、好氧氨氧化功能群(2.73%)和好氧亚硝酸氧化功能群(0.99%)的相对丰度在垂向分布上呈单峰模式,其优势类群依次为中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、Ellin6067类群和硝化螺菌属(Nitrospira);固氮功能群(21.45%)在垂向呈“U”型分布模式,其优势类群是慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)。研究结果揭示黄山森林土壤细菌群落多样性、物种组成及氮循环功能群的垂向分异格局,为认识中亚热带森林生态系统土壤微生物群落结构及功能群对环境变化的响应提供理论依据。 展开更多
关键词 黄山 细菌群落 谱系结构指数 土壤PH 氮循环功能群 垂向分布格局
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大豆GmPID基因生物信息学分析及克隆 被引量:1
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作者 张超 张勇 +8 位作者 满百膺 伍应保 张高阳 张惠宁 涂班策 吕晶晶 李思楠 程鹏 武小霞 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期13-22,共10页
利用同源克隆技术,对拟南芥再生相关基因PID作同源序列比对,从大豆中克隆PID基因全长CDS序列,得到大豆再生相关基因GmPID,分析大豆再生相关基因GmPID启动子序列、氨基酸序列、编码的蛋白质结构、亲疏水性、蛋白质结构及同源进化树。结... 利用同源克隆技术,对拟南芥再生相关基因PID作同源序列比对,从大豆中克隆PID基因全长CDS序列,得到大豆再生相关基因GmPID,分析大豆再生相关基因GmPID启动子序列、氨基酸序列、编码的蛋白质结构、亲疏水性、蛋白质结构及同源进化树。结果表明,GmPID编码区cDNA长度为1359 bp,编码452个氨基酸,GmPID编码的蛋白为碱性亲水性蛋白;分析其蛋白功能结构域发现,GmPID蛋白含有丝氨酸/苏氨酸激酶催化结构域,为PKc-like超家族成员;构建系统进化树发现其与密花豆亲缘较近。研究结果有利于深入研究大豆再生相关基因GmPID在大豆再生过程中的关键作用,为提高大豆再生效率提供理论基础。 展开更多
关键词 大豆 再生 AGC激酶 GmPID 生物信息学
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高蛋白饲用红麻品种筛选及饲用品质研究 被引量:1
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作者 张超 黄思齐 +6 位作者 邓勇 李建军 张高阳 伍应保 满百膺 陶杰 李德芳 《中国麻业科学》 2021年第6期287-293,共7页
为了筛选高蛋白饲用红麻品种,试验选取红麻全叶型材料"348"和"349"以及裂叶型材料"352"和"353"为研究对象,在生育期(6月至9月)分别测定叶片中参与氮素代谢指标(硝酸还原酶、谷氨酰胺合成酶、... 为了筛选高蛋白饲用红麻品种,试验选取红麻全叶型材料"348"和"349"以及裂叶型材料"352"和"353"为研究对象,在生育期(6月至9月)分别测定叶片中参与氮素代谢指标(硝酸还原酶、谷氨酰胺合成酶、硝态氮)及其营养品质(粗纤维、粗脂肪、灰分、粗蛋白),在成熟期(10月)测定其农艺性状(株高、茎粗、皮厚)及产量。结果显示,各材料在8~9月的叶中粗蛋白含量百分比较高,且"348"和"349"的粗蛋白含量百分比显著高于"352"和"353"(p<0.05);"353"的粗脂肪含量在9月较高,达到6.14%;"352"的粗纤维含量在8月较高,达到10.73%;"349"粗灰分含量在6月较高,达到6.43%。"348"和"349"农艺性状及产量测定结果均显著高于"352"和"353"(p<0.05)。综合以上结果,"348"和"349"与"352"和"353"相比更适合作为植物饲料资源在南方地区种植与开发利用。 展开更多
关键词 红麻 饲料 硝酸还原酶 谷氨酰胺合成酶 硝态氮
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红麻亚硝酸还原酶基因HcNiR的克隆与表达分析
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作者 张超 邓勇 +4 位作者 黄思齐 伍应保 张高阳 满百膺 李德芳 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期600-608,共9页
【目的】了解红麻亚硝酸还原酶基因HcNiR生物信息学特性及组织表达特异性,为培育红麻氮高效利用品种提供理论依据。【方法】以红麻材料349叶片的cDNA为模板,利用PCR扩增HcNiR基因的CDS序列,采用生物信息学方法分析HcNiR的氨基酸组成、... 【目的】了解红麻亚硝酸还原酶基因HcNiR生物信息学特性及组织表达特异性,为培育红麻氮高效利用品种提供理论依据。【方法】以红麻材料349叶片的cDNA为模板,利用PCR扩增HcNiR基因的CDS序列,采用生物信息学方法分析HcNiR的氨基酸组成、蛋白质跨膜结构、信号肽、高级结构以及蛋白的同源进化树;采用实时荧光定量PCR检测HcNiR基因在红麻不同组织的表达情况。【结果】HcNiR基因cDNA全长1395 bp,编码蛋白含有464个氨基酸,包含2个保守的亚硝酸和亚硫酸还原酶4Fe-4S结构域及铁氧蛋白部分结构域。HcNiR蛋白是一个不含跨膜转运结构与信号肽的亲水稳定性蛋白质,该蛋白质等电点是5.49,分子量51.68 kDa;具有26处潜在磷酸化位点。在其蛋白二级结构中,α-螺旋和无规则卷曲所占比例超过70%。通过氨基酸序列同源性分析发现,红麻HcNiR氨基酸序列与木槿HsNiR氨基酸序列相似性较高,达到97.37%,都含有铁-硫/铁血红素结合位点。进化树分析结果表明,红麻HcNiR基因与木槿HsNiR基因亲缘关系较近。组织特异性表达结果显示,红麻HcNiR基因在叶中的表达量高于根。【结论】HcNiR基因编码蛋白含亚硝酸和亚硫酸还原酶4Fe-4S结构域及铁氧蛋白部分结构域;HcNiR基因具有组织表达特异性,在红麻叶片中表达较高,推测其主要在初级氮的同化过程中发挥重要调控作用。 展开更多
关键词 红麻 亚硝酸还原酶 HcNiR基因 基因克隆 表达分析
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Application of phosphate-containing materials affects bioavailability of rare earth elements and bacterial community in soils 被引量:3
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作者 JIN ShuLan HU ZhongJun +3 位作者 man baiying PAN HuaHua KONG Xiao JIN DeCai 《Science China(Technological Sciences)》 SCIE EI CAS CSCD 2019年第9期1616-1627,共12页
The exploitation and smelting of rare earths can cause serious pollution to the farmland around the mining area. The rare earth elements(REEs) are absorbed by crops and enter the human body through the food chain, whi... The exploitation and smelting of rare earths can cause serious pollution to the farmland around the mining area. The rare earth elements(REEs) are absorbed by crops and enter the human body through the food chain, which threatens people’s health. The effects of four phosphorus-containing materials-calcium superphosphate(SSP), phosphate rock(PR), calcium magnesium phosphate(CMP) and bone charcoal(BC) on rice growth and bacterial community structure in REE mining area of Xinfeng County were studied by pot experiment. The soil solution was collected during rice transplanting and harvest periods respectively, the rice and soil samples were collected and sequenced. The concentrations of water-soluble REEs were measured by inductively coupled plasma mass spectrometry(ICP-MS), and bacteria in soil was deeply sequenced by the Illumina Miseq sequencing platform. PR, CMP and BC promoted the growth of rice, improved the biomass of rice roots, shoots and grains, and significantly reduced absorption and accumulation of REEs in rice roots, shoots and grains. SSP treatment reduced the pH value of soil, significantly improved the concentration of REE solution in soil and improved biomass of rice roots, shoots and grains,and significantly improved the concentration of REEs in grain. The effects of phosphorus-containing materials on the absorption and accumulation of 15 REEs in rice roots, shoots and grains were very different, and significantly influenced the soil bacterial community. SSP reduced richness and diversity of bacteria. CMP improved the diversity of soil bacteria, but reduced their richness. PR and BC treatment improved the richness and diversity of soil bacteria, and significantly increased the abundance of Bacillus. The results showed that adding PR, CMP and BC to soil in the REE mining area of Xinfeng can improve food security and eco-environmental quality, and hence, are potential restorative materials;SSP is not recommended for use in acidic soils. 展开更多
关键词 CALCIUM SUPERPHOSPHATE PHOSPHATE rock CALCIUM magnesium phosphorus bone charcoal rare earth elements rice bacterial community
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