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我国生物种质资源保护和共享利用的现状与发展思考 被引量:9
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作者 程苹 卢凡 +2 位作者 张鹏 马俊才 王瑞丹 《中国科技资源导刊》 2018年第5期64-68,共5页
生物种质资源的保护和共享利用是提升生物种质资源对科技创新支撑作用的核心内容。文章首先基于生物种质资源多样性阐述生物种质资源在科研基础研究中的重要作用,然后通过对国内外生物种质资源的保存及共享利用情况进行对比分析,最后在... 生物种质资源的保护和共享利用是提升生物种质资源对科技创新支撑作用的核心内容。文章首先基于生物种质资源多样性阐述生物种质资源在科研基础研究中的重要作用,然后通过对国内外生物种质资源的保存及共享利用情况进行对比分析,最后在科技创新对生物种质资源建设发展需求分析的基础上,提出加强我国生物种质资源保护和共享利用的思考与建议。 展开更多
关键词 科技创新 生物种质资源 科技资源保护 科技资源共享利用 现状与发展
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IA:一种科学数据云分析服务管理引擎 被引量:2
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作者 孟珍 王学志 +6 位作者 谢志敏 胡良霖 陈之端 马俊才 佟继周 张艳玲 周园春 《数据与计算发展前沿》 2020年第2期31-39,共9页
【目的】随着科学大数据技术的发展,问题导向的数据端分析成为常态。科学数据处理以云计算的形式跑在数据端,并提供安全的用户访问方式、可选的算法资源库、高效的数据存取接口、便捷的用户交互工具、有效扩展的计算和存储资源,将有力... 【目的】随着科学大数据技术的发展,问题导向的数据端分析成为常态。科学数据处理以云计算的形式跑在数据端,并提供安全的用户访问方式、可选的算法资源库、高效的数据存取接口、便捷的用户交互工具、有效扩展的计算和存储资源,将有力提升科学家的数据分析探索效率。【方法】本文提出一种基于容器技术的科学数据端云分析服务管理引擎设计方案:资源节点以自动注册的方式进行横向扩展,资源节点可以是物理主机或虚拟主机;当在用资源达到阈值,管理节点通过接口启动资源节点的注册,同时资源入池;可选的算法资源库、高效的数据和计算访问接口均以容器镜像的方式进行版本控制,在构造资源池时选用。容器实例池的健康度在节点内部进行维护,根据用户的最长使用时间、静默时间等进行实例生命周期管理;内部资源池的容器实例有准备中、准备好、使用中、消亡中几种状态,并始终维护资源池的固定大小。用户认证访问时,根据用户的领域算法库的选择和资源池的使用率进行新用户资源的接入,并通过代理配置提供唯一的标识入口以供用户访问;用户以安全加密的网络访问方式访问交互编程组件或交互应用组件,即可使用数据端的数据资源和计算资源。每个交互组件均在独立的容器实例中,可以进行有效的资源隔离。【结果】基于以上科学数据端云分析服务管理引擎构建的交互分析云服务系统IA(Interactive Analysis Cloud Service System)V1.0,实现了科学数据端云分析资源的统一管理服务,可以通过服务门户直接面向终端科学家使用,也可以通过API接口以docker容器交付的方式给其它现有数据系统调用。已逐步构建生命健康、生态环境、气象水文等领域的科学数据端云分析服务,已应用于中国科学院战略先导专项A、中国科学院战略先导专项B、国家烟草专卖局重大专项等重大项目;已应用于国家微生物科学数据中心、国家空间科学数据中心等国家科学数据中心;已应用于地理空间数据云、DarwinTree分子数据与应用环境等领域公共平台。并提供面向R、TensorFlow、Data Science、All Spark等的常用工具服务,用户可以https的方式访问交互编程组件(iJupyter)或交互应用组件(iWorkflow),即可使用数据端的数据资源和计算资源。 展开更多
关键词 数据端分析 大数据 容器技术 IA 云服务及管理
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基于多视角学习和注意力的特征选择算法 被引量:2
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作者 庞华鑫 韦世奎 +2 位作者 马俊才 赵玉凤 赵耀 《北京交通大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期70-76,共7页
从海量且包含噪声的数据中挑选出关键性的特征,即特征选择,一直是机器学习任务中的重要挑战.鉴于此,提出了基于多视角表征学习和注意力机制的特征选择方法.首先,该算法通过多实例生成器为每个样本生成实例包,同时采用特殊的填补方式来... 从海量且包含噪声的数据中挑选出关键性的特征,即特征选择,一直是机器学习任务中的重要挑战.鉴于此,提出了基于多视角表征学习和注意力机制的特征选择方法.首先,该算法通过多实例生成器为每个样本生成实例包,同时采用特殊的填补方式来保证特征位置不变性.其次,多视角表征模块从多个视角挖掘特征的自身信息及交互信息,并利用注意力机制模块为这些表征计算贡献度权重,最后,分类网络利用权重化表征进行分类.实验结果表明:该模型可以为每个标签挑选出最具代表性的特征群,并在不同类型数据集上取得了性能提升. 展开更多
关键词 信号与信息处理 注意力机制 多视角表征 特征选择
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西北地区海绵城市建设“治山”模式初探--以西宁市海绵城建设试点13排水分区总体规划为例 被引量:4
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作者 朱江 王国玉 +2 位作者 马竣才 邱莉淘 蔡芳 《中国园林》 北大核心 2018年第A01期33-38,共6页
城市山体是西北地区大部分城市的重要生态屏障,对城市海绵城市建设体系的构建具有重要意义。以青海省西宁市海绵城建设试点13排水分区为研究对象,通过现状条件分析和问题总结,明确规划思路和技术路线,确定规划目标,制定实施策略,初步提... 城市山体是西北地区大部分城市的重要生态屏障,对城市海绵城市建设体系的构建具有重要意义。以青海省西宁市海绵城建设试点13排水分区为研究对象,通过现状条件分析和问题总结,明确规划思路和技术路线,确定规划目标,制定实施策略,初步提出了西北地区海绵城市建设"治山"模式,以期为类似项目提供借鉴。 展开更多
关键词 风景园林 海绵城市 西北地区 山体治理 模式
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基于微生物分类的信息推荐模型
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作者 李威耀 范国梅 马俊才 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2020年第S01期211-212,210,共3页
信息技术的快速发展使得互联网上每天都会产生亿万条信息,面对如此海量的信息,单纯地依靠人力去筛选有效信息已经不现实,于是,能够快速筛选有效信息的推荐算法应运而生并得到了快速发展。为了解决实际工作中快速对获取的微生物信息进行... 信息技术的快速发展使得互联网上每天都会产生亿万条信息,面对如此海量的信息,单纯地依靠人力去筛选有效信息已经不现实,于是,能够快速筛选有效信息的推荐算法应运而生并得到了快速发展。为了解决实际工作中快速对获取的微生物信息进行分类的需求,使用自然语言处理技术,通过用户访问日志获取历史信息,使用隐含狄利克雷分布(LDA)算法从被访问信息中抽取主题模型,对所获得的微生物信息进行分类,然后使用协同推荐算法,建立基于微生物分类的信息推荐模型,通过这个模型,可以快速将信息分类。实验结果具有较高的准确率,能够为用户提供个性化服务。 展开更多
关键词 推荐算法 访问日志 latent Dirichlet allocation(LDA) 主题模型 协同推荐
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DNA Barcoding and the International Barcode of Life Project in China 被引量:6
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作者 CHE Jing HUANG Dawei +2 位作者 LI Dezhu ma juncai ZHANG Yaping 《Bulletin of the Chinese Academy of Sciences》 2010年第4期257-260,共4页
1.Scientific and Social Benefits of DNA Barcoding Along with the accelerated global trade and climate change,the needs for sustainable development and for understanding biodiversity are increasing.Rapid and accurate s... 1.Scientific and Social Benefits of DNA Barcoding Along with the accelerated global trade and climate change,the needs for sustainable development and for understanding biodiversity are increasing.Rapid and accurate species identification and sustainable utility of biodiversity resources have become a great need for the world. 展开更多
关键词 条形码 DNA 生物多样性资源 条码 生命 国际 中国 可持续发展
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微生物物种编目数据库
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作者 刘彭涛 刘全贺 +2 位作者 劳一美 孙清岚 马俊才 《中国科学数据(中英文网络版)》 2016年第1期49-54,共6页
随着微生物资源不断被开发与利用,科学数据库在微生物研究中显现出极为重要的作用。开发和维护此微生物物种编目数据库,立足于收集我国微生物物种资源信息,服务基础科研、工业、农业、医药健康等多个领域。微生物物种编目数据库记录和... 随着微生物资源不断被开发与利用,科学数据库在微生物研究中显现出极为重要的作用。开发和维护此微生物物种编目数据库,立足于收集我国微生物物种资源信息,服务基础科研、工业、农业、医药健康等多个领域。微生物物种编目数据库记录和收集了微生物资源的分类、分离、生物学性状、相关科学文献等信息。所收录的物种主要为真菌,采集地基本在中国境内。本数据库共收录了12256条微生物资源信息,8纲42目118科11449种。用户可以按照微生物名称、性状、采集地等字段进行数据检索。微生物物种编目数据库的建立,将有助于提升我国微生物的科学价值,提供数据共享服务,对推动我国微生物的研究具有重要意义。 展开更多
关键词 微生物资源 微生物物种 生物学性状 真菌
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西宁城市“绿芯”总体规划探讨
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作者 牛萌 达周才让 +1 位作者 李洪澄 马竣才 《中国园林》 北大核心 2018年第A01期115-120,共6页
西宁城市"绿芯"位于西宁环状核心发展区的核心,具有构筑城市生态安全格局,解决城乡二元矛盾,增加城市休闲游憩空间及保护和传承乡土文化的多重功能。该规划以生态修复为核心,通过生态敏感性分析,构建区域生态安全格局,点线面... 西宁城市"绿芯"位于西宁环状核心发展区的核心,具有构筑城市生态安全格局,解决城乡二元矛盾,增加城市休闲游憩空间及保护和传承乡土文化的多重功能。该规划以生态修复为核心,通过生态敏感性分析,构建区域生态安全格局,点线面结合综合修复棕地、水系沟道、森林植被等生态环境。在生态修复的基础上适度发展生态产业,以生态农业、生态旅游和美丽乡村建设为主导,严格控制建设用地,保障"绿芯"绿的本质。 展开更多
关键词 风景园林 生态修复 生态安全格局 产业布局 土地利用
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加强开放数据基础设施建设,推动开放科学发展 被引量:10
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作者 郭华东 陈和生 +6 位作者 闫冬梅 黎建辉 陈刚 何国金 马俊才 梁栋 孔玲贻 《中国科学院院刊》 CSCD 北大核心 2023年第6期806-817,共12页
为促进经济发展、社会进步与科技创新,必须大力推动开放科学,开放数据成为开放科学的重要组成。开放数据基础设施由物理实体和虚拟系统组成,是支撑开放数据和满足不同领域数据应用需求的基础,其发展是信息技术演进的客观过程。文章分析... 为促进经济发展、社会进步与科技创新,必须大力推动开放科学,开放数据成为开放科学的重要组成。开放数据基础设施由物理实体和虚拟系统组成,是支撑开放数据和满足不同领域数据应用需求的基础,其发展是信息技术演进的客观过程。文章分析了开放数据基础设施的要素,阐明了开放数据基础设施对促进开放科学实施的意义和积极作用,分析了我国开放数据基础设施的现状,针对我国开放数据基础设施存在的不足与挑战提出了发展建议。 展开更多
关键词 开放数据 开放数据基础设施 开放科学 地球大数据 科学数据中心
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我国食品来源金黄色葡萄球菌种群结构分析
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作者 郭亚慧 贺子龙 +15 位作者 姬庆龙 周海健 孟凡亮 胡晓丰 魏销玥 马俊才 杨玉花 赵薇 龙丽瑾 王新 范佳铭 遇晓杰 张建中 华德 闫笑梅 王海滨 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期982-989,共8页
目的了解我国食源性金黄色葡萄球菌(金葡菌)的种群结构。方法通过全基因组测序方法对2006-2020年我国16个省份收集的763株食源性金葡菌进行多位点序列分型、葡萄球菌蛋白A编码基因(spa)和葡萄球菌染色体mec基因盒(SCCmec)分型,使用BioNu... 目的了解我国食源性金黄色葡萄球菌(金葡菌)的种群结构。方法通过全基因组测序方法对2006-2020年我国16个省份收集的763株食源性金葡菌进行多位点序列分型、葡萄球菌蛋白A编码基因(spa)和葡萄球菌染色体mec基因盒(SCCmec)分型,使用BioNumerics 7.5软件创建基于ST类型的最小生成树。国外进口食品分离到的金葡菌31株被纳入基因组系统发育树的构建。结果763株金葡菌共鉴定出90个ST型和160个spa型别,其中20种为新ST型别。72个(72/90,80.0%)ST型属于22个克隆群,其中主要型别为CC7、CC1、CC5、CC398、CC188、CC59、CC6、CC88、CC15和CC25,占82.44%(629/763)。其中优势克隆群中ST型和spa型别随着时间的变化呈多态性变化。耐甲氧西林金葡菌(MRSA)的阳性率为7.60%,共鉴定出7种SCCmec型别,以ST59-t437-Ⅳa(17.24%,10/58)、ST239-t030-Ⅲ(12.07%,7/58)、ST59-t437-Ⅴb(8.62%,5/58)、ST338-t437-Ⅴb(6.90%,4/58)和ST338-t441-Ⅴb(6.90%,4/58)为主。本研究分离株在系统发育树上被分为2个种群分支,命名为Clade1和Clade2,相同克隆群、ST型和spa型别的菌株呈聚集分布。Clade1全部为CC7甲氧西林敏感菌株,Clade2中包括21种克隆群和所有MRSA菌株,MRSA菌株按照SCCmec和ST型呈聚集分布。CC398、CC7、CC30、CC12和CC188中的国外分离株与我国分离株进化关系较远。结论本研究中食源性菌株主要优势克隆群型别为CC7、CC1、CC5、CC398、CC188、CC59、CC6、CC88、CC15和CC25,与既往报道的我国医院、社区感染和食物中毒的克隆群存在重叠现象,这提示食品作为病原体社区传播和食物中毒的载体,需高度关注。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 食源性 全基因组测序 分子分型
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中国生物多样性大数据平台建设 被引量:40
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作者 马克平 朱敏 +4 位作者 纪力强 马俊才 郭庆华 欧阳志云 朱丽 《中国科学院院刊》 CSCD 北大核心 2018年第8期838-845,共8页
生物多样性大数据资源是国家重要战略资源,也关乎国家生态安全和生态文明建设。中国生物多样性大数据平台将包括基于宏观与微观生物生态数据协同整合的大数据库和大数据深度挖掘与模型模拟运算库,支持生物多样性和生态系统多源数据整合... 生物多样性大数据资源是国家重要战略资源,也关乎国家生态安全和生态文明建设。中国生物多样性大数据平台将包括基于宏观与微观生物生态数据协同整合的大数据库和大数据深度挖掘与模型模拟运算库,支持生物多样性和生态系统多源数据整合和共享的标准以及数据集成应用的方法,实现古生物化石数据与遗传组学数据、生理与性状数据、物种多样性、生态系统多样性等跨学科数据融合,与地理、气象、遥感、环境、国民经济等跨领域数据整合,形成完整的共享数据集或栅格化图集。利用分析模型和可视化技术实现对多源生物多样性数据集的挖掘和利用,构建开放开源的生物多样性大数据处理利用的通用接口,建立一个以生物多样性和生态安全为核心的包括对海量数据进行有效管理、高效分析和可用易用的综合大数据系统,面向政府部门提供标准化、可视化服务,促进我国生物多样性资源保护和生态安全格局构建,保障国家生态安全,支撑我国生物多样性交叉学科前沿领域科学发现和产业创新发展。 展开更多
关键词 生物多样性大数据 生态安全 数据共享 数据挖掘 决策支持
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Characteristics of AlGaN/GaN/AlGaN double heteroj unction HEMTs with an improved breakdown voltage 被引量:1
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作者 ma juncai Zhang Jincheng +5 位作者 Xue Junshuai Lin Zhiyu Liu Ziyang Xue Xiaoyong ma Xiaohua Hao Yue 《Journal of Semiconductors》 EI CAS CSCD 2012年第1期47-51,共5页
We studied the performance of AlGaN/GaN double heterojunction high electron mobility transistors (DH-HEMTs) with an AlGaN buffer layer, which leads to a higher potential barrier at the backside of the two- dimension... We studied the performance of AlGaN/GaN double heterojunction high electron mobility transistors (DH-HEMTs) with an AlGaN buffer layer, which leads to a higher potential barrier at the backside of the two- dimensional electron gas channel and better carrier confinement. This, remarkably, reduces the drain leakage current and improves the device breakdown voltage. The breakdown voltage of AlGaN/GaN double heterojunction HEMTs (-100 V) was significantly improved compared to that of conventional AlGaN/GaN HEMTs (-50 V) for the device with gate dimensions of 0.5 - 100μm and a gate-drain distance of 1μm. The DH-HEMTs also demonstrated a maximum output power of 7.78 W/mm, a maximum power-added efficiency of 62.3% and a linear gain of 23 dB at the drain supply voltage of 35 V at 4 GHz. 展开更多
关键词 AlGaN/GaN/A1GaN double heterojunctions breakdown voltage carrier confinement
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语义网在生物安全监测领域的应用研究
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作者 李博 戚晓鹏 +4 位作者 李言飞 陈强 马俊才 孙清岚 王松旺 《科研信息化技术与应用》 2018年第4期74-83,共10页
近年来,随着各个学科领域数据信息的不断增长,语义网的研究及应用逐渐变成了热点及难点,一个重要的原因就是对知识共享、知识集成及知识使用的强大需求。生物安全是当今社会关注的重要问题之一,新发突发传染病、蚊虫等重要传播媒介与疾... 近年来,随着各个学科领域数据信息的不断增长,语义网的研究及应用逐渐变成了热点及难点,一个重要的原因就是对知识共享、知识集成及知识使用的强大需求。生物安全是当今社会关注的重要问题之一,新发突发传染病、蚊虫等重要传播媒介与疾病传播等一系列安全问题影响着人类的日常生活、国家经济等。本文首先对语义网的相关技术进行介绍和总结,如RDF、本体等,并着重将语义网相关技术应用在生物安全监测领域上,利用现有的标准体系框架,建立适合生物安全监测的统一数据标准体系及数据整合与转换技术,便于进一步数据集成、数据挖掘。 展开更多
关键词 语义网 知识共享 RDF 本体 生物安全监测
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