食管癌GATA基因家族高甲基化研究

背景GATA转录因子家族在胚胎发育时期能够促进胃肠道的正常发育,并有助于在成年肠上皮的不断更新中调节组织分化,最近有报道在人胃肠肿瘤中GATA基因,即GATA-4,GATA-5的表达缺失.目的探讨在食管肿瘤中渐进性的转录沉默而导致GATA相关基因表达缺失的情况.方法用RT-PCR法检测GATA-4,-5,-6基因在17个食管鳞癌细胞系中的表达,从每个细胞系及88例原发性食管肿瘤标本中提取DNA,进行甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP),以检测GATA相关基因增强子区的甲基化情况,用5-aza-2'-deoxycytidine c5-aza-dc)在去甲基化的细胞系中进行检测GATA-4,-5基因的表达与增强子甲基化之间的关系,并对GATA增强子区进行亚硫酸氢盐测序以证实MSP的结果.结果GATA-4/-5的表达在大多数食管癌细胞系中缺失,在每个未检测到GATA基因表达的细胞系中均可发现转录起始下游包括CpG岛在内的异常甲基化,GATA-6在每一细胞系中均表达.在正常食管粘膜中未发现GATA-4/-5增强子的甲基化,而 GATA-4/-5的甲基化却可以在原发性食管癌中检测到.在27/44(61%)的食管鳞癌和31/44(71%)的食管腺癌中,发现GATA-4的甲基化,与此类似,GATA-5的甲基化也在一部分食管肿瘤中被检测到.结论本文是关于继发于基因增强子高甲基化的食管肿瘤中,GATA-4,-5而不包括-6表达沉默的首篇报告.