102例HIV-1感染者病毒株反转录酶基因多态性及耐药性变异研究

目的:目前中国未接受或已接受反转录酶抑制剂(RTI)治疗的HIV感染者的HIV反转录酶基因类型的数据较少。本研究探讨了HIV-1反转录酶的基因多态性,及在RTI选择性压力下出现的已知和未知变异位点。方法:分析研究21例未接受治疗及81例接受RTI治疗的HIV感染者的RT基因。大部分感染者(>80%)应用司他夫定(d4T)+地达诺新(ddI)+奈韦拉平(NVP)或d4T+拉米夫定(3TC)+依菲韦仑(EFV)三联HAART治疗方案。结果:在未接受治疗的患者中,发现了4个高度多态性位点(122、200、207和211)。在接受RTI治疗的患者中,发现了2种耐药相关变异(RAMs):①接受ddI+d4T+NVP治疗方案的患者中发现,K65R(9.8%)、L74V(7.4%)、M184V(7.4%)、Q151M(5%)和胸腺嘧啶类似物变异(TAMs)(9.3%),包括T215Y(5.5%);②接受d4T+3TC+EFV治疗方案的患者中发现,T215Y(23%)、M184V(20%)和TAMs(15.4%)。在所有病例中,非核苷反转录酶抑制剂(NNRTI)RAM的出现率很高(41.9%),而在142、221、224和228位点发现了4种可疑的新RAMs。结论:目前中国非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)耐药相关变异十分普遍,本研究描述了RTI选择性变异的基因模式,提出了新的一些变异与RTI治疗的相关性。

未接受蛋白酶抑制剂治疗者的HIV-1基因的多态性及蛋白酶抑制剂耐药相关性变异

目的:研究未接受蛋白酶抑制剂(PIs)治疗的人类获得性免疫缺陷病毒1(HIV-1)感染者HIV-1多态性以及PIs耐药相关性变异的分布情况。方法:取自中国4个省市(上海、安徽、河南和云南)81例未接受PIs治疗的HIV-1感染者中分离的病毒株,经反转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增HIV-1病毒的pol基因,并进行测序及进化分析。结果:HIV-1病毒株基因最多的为B′亚型(82.7%),其他分别为CRF01_AE亚型(11%)、CRF07_BC或CRF08_BC亚型(3.7%)、CRF02_AG亚型(1.2%)以及B亚型(1.2%)。B′亚型主要存在于有偿助血员以及经输血感染的患者中。R41K、K70Q/R/E和L89M变异在非B亚型中比在B′和B亚型中更为常见。次要PIs耐药相关性变异I15M/V、K20M/R/I、M36I和H69K在非B亚型中比在B和B′亚型中更为常见。相对于非B亚型,次要PIs耐药相关性变异I62V、L63P、A71V/T、V77I和I93L则在B和B′亚型中更为常见。在3例(3.7%)感染B亚型的患者中发现了主要PIs耐药相关性变异M46I。结论:在未接受PIs治疗的患者中,HIV-1病毒基因多态性及次要PIs耐药相关性变异的出现率较高,而主要PIs耐药相关性变异的流行率则较低。