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环状RNA_0015278与甲状腺乳头状癌及预后的相关性
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作者 丁华杰 那磊 +3 位作者 杨绍石 李莎 史华宁 龚雪 《安徽医学》 2023年第4期378-382,共5页
目的探讨甲状腺乳头状癌(PTC)患者环状RNA_0015278(circ_0015278)表达与甲状腺癌及预后的相关性。方法回顾性分析2016年6月至2021年12月承德医学院附属医院收治的甲状腺切除术后PTC患者206例,通过逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测PT... 目的探讨甲状腺乳头状癌(PTC)患者环状RNA_0015278(circ_0015278)表达与甲状腺癌及预后的相关性。方法回顾性分析2016年6月至2021年12月承德医学院附属医院收治的甲状腺切除术后PTC患者206例,通过逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测PTC及癌旁组织中circ_0015278的表达,以病理结果为金标准,使用受试者工作特征(ROC)曲线评价circ_0015278在PTC及癌旁组织中的诊断价值;circ_0015278表达按照分位数划分四等级,使用Spearman相关分析,分析不同等级分位数circ_0015278表达与PTC 5年复发率、死亡率的相关性。使用KM曲线对数秩检验对不同等级分位数circ_0015278表达患者随访5年的无病生存率(DFS)和总生存率(OS)进行比较。通过单变量和多变量Cox比例风险回归模型分析影响PTC患者预后的因素。结果PTC组织中circ_0015278表达与癌旁组织相比明显降低,差异有统计学意义(Z=-14.146,P<0.001);以病理结果为金标准建立PTC及癌旁组织circ_001527表达的ROC曲线,以表达量0.740为截断值时对鉴别PTC及癌旁组织有较好价值(AUC:0.903,95%CI:0.847~0.932),灵敏度为76.7%,特异度为89.2%;较高的circ_0015278表达与肿瘤复发率降低相关(r=-0.162,P=0.011),与死亡率无关(r=-0.102,P=0.110);不同等级分位数circ_0015278表达的DFS之间差异有统计学意义(χ^(2)=3.268,P=0.017),利于DFS延长。OS之间差异无统计学意义(χ^(2)=5.551,P=0.136);多因素Cox回归分析表明,较高肿瘤circ_0015278表达与有利的DFS独立相关(HR=0.529,P=0.026)。结论PTC组织中circ_0015278表达明显降低,对PTC有较好的诊断价值,其高表达与肿瘤复发率降低及患者DFS延长相关。 展开更多
关键词 环状RNA_0015278 甲状腺 乳头状癌 预后
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犬ANP32蛋白多态性及其对A型流感病毒RNA聚合酶活性的影响 被引量:2
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作者 张媛 于萌萌 +6 位作者 孙留克 郭兴 那雷 刘荻萩 姜骞 张海丽 王晓钧 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第7期2462-2473,共12页
【目的】探索犬酸性核磷蛋白32(canis acidic(leucine-rich)nuclear phosphoprotein 32 ku,caANP32)对不同物种A型流感病毒(Influenza A virus,IAV)RNA聚合酶活性的影响。【方法】利用实时荧光定量PCR方法分析caANP32家族基因(caANP32A... 【目的】探索犬酸性核磷蛋白32(canis acidic(leucine-rich)nuclear phosphoprotein 32 ku,caANP32)对不同物种A型流感病毒(Influenza A virus,IAV)RNA聚合酶活性的影响。【方法】利用实时荧光定量PCR方法分析caANP32家族基因(caANP32A、caANP32B及caANP32E)的组织分布并对其进行扩增和克隆,评估caANP32家族蛋白对不同物种A型流感病毒RNA聚合酶活性的支持作用。【结果】caANP32家族基因在不同组织中分布相似,其中caANP32B基因组织丰度显著或极显著高于caANP32A和caANP32E基因(P<0.05;P<0.01),在心脏、盲肠和大脑中caANP32E基因组织丰度极显著或显著高于caANP32A基因(P<0.01;P<0.05),在肝脏、肺脏等组织中caANP32E与caANP32A基因丰度均无显著差异(P>0.05)。在犬心脏组织和MDCK细胞中发现,caANP32A基因仅存在1个转录本,caANP32B基因存在3个不同剪接变体:caANP32B_X1、caANP32B_X2和caANP32B_X3;caANP32E基因具有2个不同剪接变体:caANP32E_X1和caANP32E_X2。通过分析ANP32家族蛋白对不同物种A型流感病毒RNA聚合酶活性的影响发现,caANP32A和caANP32B均能支持犬流感病毒(H3N2_(GD11))和马流感病毒(H3N8_(JL89))RNA聚合酶活性,而对禽流感病毒(H9N2_(ZJ12))RNA聚合酶活性支持较低。caANP32B_X2剪接变体对哺乳动物流感病毒RNA聚合酶活性的支持能力显著高于caANP32B_X1和caANP32B_X3(P<0.05);而caANP32E不支持A型流感病毒RNA聚合酶活性。【结论】本研究初步解析了caANP32家族蛋白的组织分布及序列多态性,阐明了其对不同物种A型流感病毒RNA聚合酶活性的支持作用,为解析MDCK细胞作为流感病毒分离和疫苗生产细胞系的分子机制提供了新的借鉴。 展开更多
关键词 A型流感病毒(IAV) 犬酸性核磷蛋白32(caANP32) MDCK细胞 聚合酶活性
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肠道菌群与microRNA失调对慢传输型便秘的影响 被引量:3
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作者 吴容 田洋平 +3 位作者 雷娜 闻永 占煜 唐学贵 《中国现代医学杂志》 CAS 北大核心 2022年第23期60-66,共7页
慢传输型便秘是一种常见的临床疾病,患者常伴有肠道菌群的改变。肠道菌群对维持人体健康有重要作用,若肠道菌群的结构和功能发生变化,出现肠道菌群紊乱,则可能引起便秘等疾病。MicroRNA是一种小的非编码RNA,作为基因表达过程转录后调控... 慢传输型便秘是一种常见的临床疾病,患者常伴有肠道菌群的改变。肠道菌群对维持人体健康有重要作用,若肠道菌群的结构和功能发生变化,出现肠道菌群紊乱,则可能引起便秘等疾病。MicroRNA是一种小的非编码RNA,作为基因表达过程转录后调控因子,其具有调节包括胃肠道在内的所有细胞蛋白表达的作用。肠道菌群能通过microRNA调节宿主基因的表达,而宿主的microRNA同样能调节菌群的生长和基因表达。肠道菌群与microRNA在维持肠道内稳态和预防相关疾病方面发挥着重要作用。该文就肠道菌群与宿主microRNA对慢传输型便秘影响的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 慢传输型便秘 肠道菌群 MICRORNA
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常规超声及弹性成像引导下甲状腺结节细针穿刺活检对C-TI-RADS4类结节的诊断价值 被引量:6
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作者 丁华杰 那磊 +2 位作者 龚雪 李莎 史华宁 《河北医学》 CAS 2023年第5期782-785,共4页
目的:探讨常规超声及弹性成像应变率比引导下甲状腺结节细针穿刺活检对C-TI-RADS4类结节的诊断价值。方法:回顾分析2019年6月至2021年12月于承医附院已行甲状腺结节手术切除术的141例共141个结节患者,所有结节均为C-TI-RADS4类,全部结... 目的:探讨常规超声及弹性成像应变率比引导下甲状腺结节细针穿刺活检对C-TI-RADS4类结节的诊断价值。方法:回顾分析2019年6月至2021年12月于承医附院已行甲状腺结节手术切除术的141例共141个结节患者,所有结节均为C-TI-RADS4类,全部结节行常规超声及弹性成像应变率比引导下甲状腺细针穿刺活检术(US-FNAB、E-US-FNAB),获得细胞病理学结果,最终与术后组织病理学结果对照,分析常规超声及弹性成像引导下甲状腺结节细针穿刺活检对C-TI-RADS4类结节的诊断价值。结果:141个C-TI-RADS4类甲状腺结节,常规超声引导下甲状腺结节细针穿刺活检的灵敏度、特异度、准确率、阳性及阴性预测值分别为86.5%、86.7%、86.5%、96%、63.4%;弹性成像引导下甲状腺结节细针穿刺活检的灵敏度、特异度、准确率、阳性及阴性预测值分别为96.4%、86.7%、94.3%、96.4%、86.7%。两者的灵敏度、准确率及阴性预测值之间差异有统计学意义(χ^(2)=6.964、χ^(2)=4.956、χ^(2)=4.779,P<0.05);两者诊断的特异度及阳性预测值之间差异无统计学意义(χ^(2)=0.000、χ^(2)=0.000,P>0.05)。结论:超声弹性成像应变率比引导下甲状腺结节细针穿刺活检对C-TI-RADS4结节诊断有一定的临床价值。 展开更多
关键词 超声 弹性成像应变率比引导 穿刺活检 甲状腺结节 C-TI-RADS 4类
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Therapeutic effect of okra extract on gestational diabetes mellitus rats induced by streptozotocin 被引量:10
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作者 Zhao-Hua Tian Feng-Tai Miao +3 位作者 Xia Zhang Qiao-Hong Wang na lei Li-Chen Guo 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2015年第12期1010-1013,共4页
Objective:To explore the effect of okra extract on gestational diabetes mellitus(GDM) rats and its probable molecular mechanism.Methods:A total of 30 female SD rats were caged with male rats for pregnancy,27 pregnant ... Objective:To explore the effect of okra extract on gestational diabetes mellitus(GDM) rats and its probable molecular mechanism.Methods:A total of 30 female SD rats were caged with male rats for pregnancy,27 pregnant rats were obtained and weighed.The pregnant rats were equally randomized into the control group,GDM group and intervention group.Once the pregnancy was verified,GDM group and intervention group were given 45 mg/kg streptozotocin by peritoneal injection for inducing GDM,control group was given equal volume of citrate buffer.Once the model was established successfully,intervention group was administered orally the solution containing 200 mg/kg/d okra extract,the other groups were given the diet and water only.On the 19 th day of pregnancy,the blood samples and fetal rats of all groups were collected,fetal rats weight and placental weight was recorded and the serum glucose,lipids,serum insulin and C-peptide of pregnant rats before the delivery were determined.Results:The pregnant rats weight before the delivery,fetal rats weight and placental weight of GDM group were lower than control group and intervention group(P<0.05).After the treatment of okra extract,serum glucose and lipids levels of intervention group were both improved significantly(P<0.05),especially,the FBG,HDL,FINS,serum m insulin and hepatic glycogen levels were equivalent to control group(P>0.05).Antioxidant enzymes levels of GDM group in liver and pancreas tissues were lower than the other groups,and after treatment of okra extract,antioxidant enzymes levels in liver and pancreas tissues were equivalent to control group(P>0.05).Conclusions:Okra extract,rich in antioxidant substances,could avoid the excessive consuming of antioxidant enzymes,then,suppresses the oxidative stress and insulin resistance,thereby improving blood glucose level of GDM rats. 展开更多
关键词 OKRA EXTRACT GESTATIONAL DIABETES MELLITUS Pregnan
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数字化赋能农村人居环境整治提升路径研究——以宁德市寿宁县为例
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作者 唐江桥 王小雨 雷娜 《中央社会主义学院学报》 2023年第6期58-65,共8页
数字化赋能乡村治理已成为推动乡村治理体系和治理能力现代化的重要手段和必然趋势。在理论上,数字化能够为破解农村人居环境整治问题提供全面监测和评估的手段、智能化的管理方法,提升农村人居环境整治的治理能力。在实践中,福建省宁... 数字化赋能乡村治理已成为推动乡村治理体系和治理能力现代化的重要手段和必然趋势。在理论上,数字化能够为破解农村人居环境整治问题提供全面监测和评估的手段、智能化的管理方法,提升农村人居环境整治的治理能力。在实践中,福建省宁德市寿宁县通过数字化赋能,提升了当地农村人居环境整治的数据收集与分析能力、信息共享与传播能力、管理和监督能力。但是,将数字技术应用于农村人居环境整治之中还面临数据采集成本高、隐私易泄露、技术推广和普及难、人员专业素养不高等问题。为应对上述问题,在农村人居环境整治进程中需要加大资金投入力度、构建安全的个人信息防范机制、完善乡村数字化基础设施建设、注重乡村数字化人才培养,从而有效提升数字化对农村人居环境整治的赋能效果。 展开更多
关键词 农村人居环境整治 数字化 治理
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Feature Preserving Parameterization for Quadrilateral Mesh Generation Based on Ricci Flow and Cross Field
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作者 na lei Ping Zhang +2 位作者 Xiaopeng Zheng Yiming Zhu Zhongxuan Luo 《Computer Modeling in Engineering & Sciences》 SCIE EI 2023年第10期843-857,共15页
We propose a newmethod to generate surface quadrilateralmesh by calculating a globally defined parameterization with feature constraints.In the field of quadrilateral generation with features,the cross field methods a... We propose a newmethod to generate surface quadrilateralmesh by calculating a globally defined parameterization with feature constraints.In the field of quadrilateral generation with features,the cross field methods are wellknown because of their superior performance in feature preservation.The methods based on metrics are popular due to their sound theoretical basis,especially the Ricci flow algorithm.The cross field methods’major part,the Poisson equation,is challenging to solve in three dimensions directly.When it comes to cases with a large number of elements,the computational costs are expensive while the methods based on metrics are on the contrary.In addition,an appropriate initial value plays a positive role in the solution of the Poisson equation,and this initial value can be obtained from the Ricci flow algorithm.So we combine the methods based on metric with the cross field methods.We use the discrete dynamic Ricci flow algorithm to generate an initial value for the Poisson equation,which speeds up the solution of the equation and ensures the convergence of the computation.Numerical experiments show that our method is effective in generating a quadrilateral mesh for models with features,and the quality of the quadrilateral mesh is reliable. 展开更多
关键词 Quadrilateral mesh feature preserving Ricci flow cross field
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Spin–orbit torque in perpendicularly magnetized[Pt/Ni]multilayers
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作者 曹颖 谢志成 +4 位作者 赵治源 杨雨民 雷娜 缪冰锋 魏大海 《Chinese Physics B》 SCIE EI CAS CSCD 2023年第10期145-150,共6页
The performance of spin–orbit torque(SOT)in heavy metal/ferromagnetic metal periodic multilayers has attracted widespread attention.In this paper,we have successfully fabricated a series of perpendicular magnetized[P... The performance of spin–orbit torque(SOT)in heavy metal/ferromagnetic metal periodic multilayers has attracted widespread attention.In this paper,we have successfully fabricated a series of perpendicular magnetized[Pt(2-t)/Ni(t)]_4 multilayers,and studied the SOT in the multilayers by varying the thickness of Ni layer t.The current induced magnetization switching was achieved with a critical current density of 1×10^(7)A/cm^(2).The damping-like SOT efficiencyξ_(DL)was extracted from an extended harmonic Hall measurement.We demonstrated that theξ_(DL)can be effectively modulated by t_(Pt)/t_(Ni)ratio of Pt and Ni in the multilayers.The SOT investigation about the[Pt/Ni]N multilayers might provide new material candidates for practical perpendicular SOT-MRAM devices. 展开更多
关键词 spin–orbit torque perpendicular magnetic anisotropy SPINTRONICS
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Action Mechanism of Radix Aucklandiae against Gastric Ulcer Based on Network Pharmacology
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作者 Run YIN Xiaohong LIU +2 位作者 Yun CHEN na lei Gang LI 《Medicinal Plant》 CAS 2023年第4期14-17,23,共5页
[Objectives] To explore the potential targets and action mechanism of radix aucklandiae (RA) in the treatment of gastric ulcer (GU) by network pharmacology. [Methods] Gene targets were obtained through TCMSP, DisGeNet... [Objectives] To explore the potential targets and action mechanism of radix aucklandiae (RA) in the treatment of gastric ulcer (GU) by network pharmacology. [Methods] Gene targets were obtained through TCMSP, DisGeNet, OMIM, GeneCards databases, which related to GU and the active components of RA. The mutual potential functional targets were selected through Venny to constitute the PPI protein interaction network. The DAVID database was applied for GO and KEGG enrichment analysis of the common targets to construct the "Active component-Target-Pathway" network and analyze the relationship between them. [Results] There are 31 active components, 82 related targets and 16 common targets in the treatment of GU. The active components in Ra may exert anti-ulcer effects through six signaling pathways, including NF-κB, Toll-like receptors, VEGF and HIF-1. In addition, PTGS2, TNF, TLR4, JUN, IL2, SRC, RELA, KDR, NOS2 and PLAU may be the 10 key targets of Ra in the treatment of GU. [Conclusions] Ra controls GU through the synergies of multiple components, targets and pathways. It can provide a theoretical basis for further study on the mechanism of RA in treating GU. 展开更多
关键词 Network pharmacology Radix Aucklandiae Gastric ulcer
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超声弹性成像对甲状腺C-TIRADS 4类结节校正及指导穿刺活检价值 被引量:1
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作者 丁华杰 那磊 +3 位作者 杨绍石 李莎 史华宁 龚雪 《河北医药》 CAS 2022年第18期2787-2789,2793,共4页
目的探讨超声弹性成像对甲状腺C-TIRADS 4类结节分类校正及指导穿刺活检的价值。方法收集承德医学院附属医院2017年1月至2020年10月已行手术切除的甲状腺结节患者150例,共196个结节,全部为C-TIRADS 4类,超声弹性成像校正分类后,行常规... 目的探讨超声弹性成像对甲状腺C-TIRADS 4类结节分类校正及指导穿刺活检的价值。方法收集承德医学院附属医院2017年1月至2020年10月已行手术切除的甲状腺结节患者150例,共196个结节,全部为C-TIRADS 4类,超声弹性成像校正分类后,行常规超声及弹性成像引导下穿刺活检,获取穿刺活检结果与术后病理结果,分析超声弹性成像对C-TIRADS分类校正及指导穿刺活检价值。结果196个超声C-TIRADS 4类结节,其中C-TIRADS 4a级76例,C-TIRADS 4b级84例,C-TIRADS 4c级36例,经弹性成像校正分类后:C-TIRADS 3级4例,C-TIRADS 4a级54例,C-TIRADS 4b级94例,C-TIRADS 4c级40例,C-TIRADS 5级4例。与病理结果对照,C-TIRADS分类的诊断灵敏度为68.5%,特异度为60.0%,准确率为66.0%,AUC:0.642。弹性成像校正分类后的灵敏度为87.7%,特异度为80%,准确率为85.7%,AUC:0.838。二者之间差异有统计学意义(χ^(2)=24.814,P<0.05)。超声引导下穿刺活检的灵敏度为90.4%,特异度为90.0%,准确率为90.0%,AUC:0.902。弹性成像指导下穿刺活检的灵敏度为96.6%,特异度为94%,准确率为95.9%,AUC:0.953。二者之间差异有统计学意义(χ^(2)=80.410,P<0.05)。结论超声弹性成像对甲状腺C-TIRADS 4类结节的分类校正及指导穿刺活检具有一定的临床价值。 展开更多
关键词 超声 弹性成像 C-TIRADS分类 校正 穿刺活检
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超声弹性成像应变率比值对TI-RADS 4类甲状腺结节的校正价值 被引量:1
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作者 丁华杰 那磊 +2 位作者 杨绍石 李莎 龚雪 《河北医学》 CAS 2021年第12期2032-2035,共4页
目的:探讨超声弹性成像应变率比值对TI-RADS4类甲状腺结节分类校正的价值。方法:收集承德医学院附属医院2018年1月至2020年6月已手术的甲状腺结节患者137例,共个137个结节,均为TI-RADS 4类,经超声弹性成像应变率比值校正后,最终与术后... 目的:探讨超声弹性成像应变率比值对TI-RADS4类甲状腺结节分类校正的价值。方法:收集承德医学院附属医院2018年1月至2020年6月已手术的甲状腺结节患者137例,共个137个结节,均为TI-RADS 4类,经超声弹性成像应变率比值校正后,最终与术后组织病理金标准对比,分析超声弹性成像应变率比值对TI-RADS4类甲状腺结节的分类校正价值。结果:137个TI-RADS4类甲状腺结节,TI-RADS4a、4b、4c分别为67个、48个、22个,经过超声弹性成像应变率比值校正后,TI-RADS3、4a、4b、4c、5类分别为20个、27个、58个、28个、4个,最终与术后病理金标准对比,弹性成像校正前超声TI-RADS分类的灵敏度为62.6%、特异度为78.9%、准确性为67.2%、阳性预测值为88.5%、阴性预测值为44.8%;弹性成像校正后:灵敏度为85.8%、特异度为86.8%、准确性为86.1%、阳性预测值为94.4%、阴性预测值为70.2%。弹性成像校正前TI-RADS分类与弹性成像校正后的诊断灵敏度(χ^(2)=13.971,P<0.05)、准确性(χ^(2)=13.782,P<0.05)及阴性预测值(χ^(2)=7.229,P<0.05)之间差异有统计学意义;特异度(χ^(2)=0.835,P>0.05)及阳性预测值(χ^(2)=1.819,P>0.05)之间差异无统计学意义。结论:超声弹性成像应变率比值对TI-RADS 4类甲状腺结节的分类校正有一定的临床价值。 展开更多
关键词 超声弹性成像 应变率比值 TI-RADS分类 校正
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稳定表达Cas9蛋白的HeLa细胞系的建立 被引量:3
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作者 刘燕飞 那雷 王晓钧 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期893-898,共6页
为建立基于CRISPR-Cas9技术的基因敲除细胞文库,本研究利用慢病毒载体pMD2.G、pSPAX2(HIV-1的gag-pol表达质粒)和lentiCRISPR v2-Hyg包装慢病毒,感染HeLa细胞2 d后用400μg/mL潮霉素培养液筛选两周,获得稳定表达Cas9蛋白的多克隆细胞系... 为建立基于CRISPR-Cas9技术的基因敲除细胞文库,本研究利用慢病毒载体pMD2.G、pSPAX2(HIV-1的gag-pol表达质粒)和lentiCRISPR v2-Hyg包装慢病毒,感染HeLa细胞2 d后用400μg/mL潮霉素培养液筛选两周,获得稳定表达Cas9蛋白的多克隆细胞系。利用流式细胞分选系统分选及western blot鉴定获得9株HeLa-Cas9单克隆细胞系。为获得具有高效率敲除内源基因的HeLa细胞系,利用同时表达绿色荧光蛋白(GFP)和GFP sgRNA的慢病毒感染HeLa-Cas9单克隆细胞系,经1μg/mL嘌呤霉素培养液筛选一周,流式细胞术检测表达绿色荧光蛋白细胞的百分比,以计算HeLa细胞株的敲除效率,进而建立了一株稳定表达Cas9蛋白的具有高敲除效率的HeLa单克隆细胞系。该细胞的Cas9敲除效率为87%,CCK-8检测结果表明其具有很好的细胞活性。本研究获得的具有高敲除效率的稳定表达Cas9蛋白的HeLa细胞系可以用于CRISPR敲除文库的转导,建立基因敲除细胞文库,为筛选参与特定功能的未知蛋白提供细胞平台。 展开更多
关键词 Cas9蛋白 HELA细胞系 基因敲除效率
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EIAV Rev蛋白拮抗eqTRIM5α介导的AP-1信号通路的机制研究 被引量:1
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作者 宋丹丹 那雷 王晓钧 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期12-17,共6页
为探究马传染性贫血病毒(EIAV)附属蛋白Rev负调控Tripartite motif-containing protein 5α(TRIM5α)介导的AP-1信号通路的机制,本研究将pEIAV-Rev-HA和pcDNA3.1质粒分别与含TRIM5α基因的质粒及pGL3-AP-1-Luc(AP-1报告质粒)共转染HEK 2... 为探究马传染性贫血病毒(EIAV)附属蛋白Rev负调控Tripartite motif-containing protein 5α(TRIM5α)介导的AP-1信号通路的机制,本研究将pEIAV-Rev-HA和pcDNA3.1质粒分别与含TRIM5α基因的质粒及pGL3-AP-1-Luc(AP-1报告质粒)共转染HEK 293T细胞,采用荧光素酶试验检测Rev对TRIM5α激活的AP-1信号通路的影响;将pEIAV-Rev-HA和pcDNA3.1质粒分别与含TAK1、TAB2、P38和c-Jun基因的质粒及pGL3-AP-1-Luc共转染HEK 293T细胞,采用荧光素酶试验检测Rev对TRIM5α下游转导分子(TAK1、TAB2、P38、c-Jun)激活的AP-1信号通路的影响;将pEIAV-Rev-HA和pcDNA3.1质粒分别与含TAK1、TAB2、P38基因的质粒共转染HEK293T细胞,利用western blot试验分别检测TAK1、TAB2、P38的表达水平;将pEIAV-Rev-HA和pcDNA3.1质粒分别与含P38基因的质粒共转染HEK 293T细胞后加入蛋白酶体抑制剂MG132,利用western blot检测P38蛋白的表达情况。结果显示,共转染EIAV-Rev-HA实验组中TRIM5α对AP-1的激活倍数为0.4,而共转染pcDNA3.1对照组中相应的激活倍数为26.0;共转染pEIAV-Rev-HA实验组中,TAK1、TAB2、P38和c-Jun对AP-1信号通路的激活倍数分别为7.7、0.1、0.6、9.8,而共转染pcDNA3.1对照组中对AP-1信号通路的激活倍数分别为60.0、1.5、6.3、12.0;转染pEIAV-Rev-HA+pP38-Flag组与转染pcDNA3.1+pP38-Flag组相比,前者P38蛋白的表达量显著降低;加入蛋白酶体抑制剂组则恢复了P38蛋白的表达。上述结果表明,EIAV Rev显著下调eqTRIM5α及其下游转导分子TAK1、TAB2、P38激活的AP-1信号通路,但不显著下调c-Jun激活的AP-1信号通路;EIAV Rev通过蛋白酶体途径降解P38蛋白的表达而抑制eqTRIM5α激活的AP-1信号通路。本研究结果为理解EIAV与宿主蛋白相互作用提供参考依据。 展开更多
关键词 EIAV TRIM5α REV P38
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Fzd2诱导ER阴性乳腺癌细胞上皮-间质转化 被引量:1
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作者 尹萍 王巍 +2 位作者 白瑜 那磊 赵成海 《现代肿瘤医学》 CAS 2020年第16期2740-2744,共5页
目的:分析Frizzled 2(Fzd2)在雌激素受体阴性(ER^-)乳腺癌中的表达及其对ER^-乳腺癌细胞上皮-间质转换(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的影响。方法:采用免疫组化方法检测Fzd2在乳腺癌组织中的表达;采用Western blot检测Fzd2、... 目的:分析Frizzled 2(Fzd2)在雌激素受体阴性(ER^-)乳腺癌中的表达及其对ER^-乳腺癌细胞上皮-间质转换(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的影响。方法:采用免疫组化方法检测Fzd2在乳腺癌组织中的表达;采用Western blot检测Fzd2、E-cadherin、Vimentin、Slug、Zeb1在乳腺癌细胞中的表达;采用伤口愈合试验和Transwell试验检测细胞迁移和侵袭。结果:Fzd2在ER^-乳腺癌组织及细胞系中过表达;Fzd2敲减促进Hs578T细胞表达E-cadherin,减少Hs578T细胞表达Vimentin、Slug和Zeb1;Fzd2敲减抑制Hs578T细胞迁移和侵袭。结论:Fzd2诱导ER^-乳腺癌细胞发生EMT;Fzd2可能作为ER^-乳腺癌防治的一个潜在靶向分子。 展开更多
关键词 Frizzled 2 ER^-乳腺癌 上皮-间质转换
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基于Gluc的马源NLRP3炎症小体激活系统的建立
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作者 王岩 刘聪 +3 位作者 那雷 王雪峰 林跃智 王晓钧 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1039-1044,共6页
为建立一种快速、敏感的马源NLRP3炎症小体的体外激活检测系统,本研究利用PCR扩增马IL-1β(eqIL-1β)、马Caspase-1(eqCaspase-1)、马ASC(eqASC)和马NLRP3(eqNLRP3),构建重组真核表达质粒pCAGGS-eqIL-1β-flag、pCAGGS-eqIL-1β-GLuc-f... 为建立一种快速、敏感的马源NLRP3炎症小体的体外激活检测系统,本研究利用PCR扩增马IL-1β(eqIL-1β)、马Caspase-1(eqCaspase-1)、马ASC(eqASC)和马NLRP3(eqNLRP3),构建重组真核表达质粒pCAGGS-eqIL-1β-flag、pCAGGS-eqIL-1β-GLuc-flag、pCAGGS-eqCaspase-1-HA、pcDNA3.1-eqASC-HA和pcDNA3.1-eqNLRP3-HA,分别转染HEK 293T细胞,培养24 h后采用western blot方法检测细胞中各蛋白的表达,结果显示各重组质粒均构建正确,且均在HEK 293T细胞中正确表达;通过质粒共转染HEK 293T细胞依次对NLRP3炎症小体复合物中不同组分进行剂量依赖性试验,培养24 h后采用western blot检测细胞中切割的eqIL-1β蛋白,利用荧光素酶底物检测细胞上清中的荧光强度,结果显示NLRP3炎症小体体外激活系统中各质粒的最适转染剂量分别为pCAGGS-eqIL-1β-GLuc-flag 250 ng、pCAGGS-eqCaspase-1-HA 3.12 ng、pcDNA3.1-eqASC-HA 3.12 ng和pcDNA3.1-eqNLRP3-HA 6.25 ng;通过在该系统中加入不同剂量的NLRP3炎症小体激活剂(Nigericin),检测该系统有效性,结果显示细胞中切割的IL-1β蛋白水平以及上清中的荧光强度与Nigericin存在剂量依赖性,表明基于Gluc的马源NLRP3炎症小体体外激活系统正确构建,且其能对马源NLRP3炎症小体激活的相关蛋白和药物进行筛选。本研究建立的马源NLRP3炎症小体的体外激活检测系统为马属动物炎症及炎症小体调控方面的研究提供重要的工具。 展开更多
关键词 NLRP3炎症小体 IL-1Β Gluc
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基于SYNJ2BP敲除的HEK293T细胞系研究SYNJ2BP对EIAV复制的影响
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作者 王欣慧 段盈伊 +4 位作者 陈克伟 王雪峰 那雷 杜承 王晓钧 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1258-1262,1281,共6页
为分析突触小泡磷酸酶2结合蛋白(SYNJ2BP)对马传染性贫血病毒(EIAV)复制的影响,本研究设计了2条靶向SYNJ2BP基因外显子的特异性sgRNA,将sgRNA插入plenti-CRISPRv2GFP载体获得重组质粒pSYNsgRNA1和pSYN-sgRNA2,将这2个重组质粒转染HEK293... 为分析突触小泡磷酸酶2结合蛋白(SYNJ2BP)对马传染性贫血病毒(EIAV)复制的影响,本研究设计了2条靶向SYNJ2BP基因外显子的特异性sgRNA,将sgRNA插入plenti-CRISPRv2GFP载体获得重组质粒pSYNsgRNA1和pSYN-sgRNA2,将这2个重组质粒转染HEK293T细胞,通过流式细胞仪分选获得单克隆细胞株,测序结果显示SYNJ2BP基因产生插入突变,经western blot确认已敲除SYNJ2BP基因并稳定遗传,表明获得了SYNJ2BP敲除的HEK293T细胞系。将EIAV感染性克隆质粒CMV3-8分别转染SYNJ2BP敲除的HEK293T细胞系与野生型细胞,经western blot证实与野生型细胞相比敲除SYNJ2BP抑制了EIAV囊膜蛋白的表达,灰度值显示囊膜蛋白表达量降低50%。综上所述,本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建了SYNJ2BP敲除的HEK293T细胞系,并发现SYNJ2BP基因敲除后抑制了EIAV囊膜蛋白的表达,本研究为进一步分析SYNJ2BP调节EIAV复制的分子机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 马传染性贫血病毒 SYNJ2BP HEK293T
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A Geometric Understanding of Deep Learning 被引量:11
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作者 na lei Dongsheng An +5 位作者 Yang Guo Kehua Su Shixia Liu Zhongxuan Luo Shing-Tung Yau Xianfeng Gu 《Engineering》 SCIE EI 2020年第3期361-374,共14页
This work introduces an optimal transportation(OT)view of generative adversarial networks(GANs).Natural datasets have intrinsic patterns,which can be summarized as the manifold distribution principle:the distribution ... This work introduces an optimal transportation(OT)view of generative adversarial networks(GANs).Natural datasets have intrinsic patterns,which can be summarized as the manifold distribution principle:the distribution of a class of data is close to a low-dimensional manifold.GANs mainly accomplish two tasks:manifold learning and probability distribution transformation.The latter can be carried out using the classical OT method.From the OT perspective,the generator computes the OT map,while the discriminator computes the Wasserstein distance between the generated data distribution and the real data distribution;both can be reduced to a convex geometric optimization process.Furthermore,OT theory discovers the intrinsic collaborative-instead of competitive-relation between the generator and the discriminator,and the fundamental reason for mode collapse.We also propose a novel generative model,which uses an autoencoder(AE)for manifold learning and OT map for probability distribution transformation.This AE–OT model improves the theoretical rigor and transparency,as well as the computational stability and efficiency;in particular,it eliminates the mode collapse.The experimental results validate our hypothesis,and demonstrate the advantages of our proposed model. 展开更多
关键词 GENERATIVE Adversarial Deep learning Optimal transportation Mode collapse
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ANP32A和ANP32B蛋白是HIV-1病毒复制过程中的关键宿主因子 被引量:3
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作者 Wang Yu-jie Zhang Hai-li na lei 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1085-1085,共1页
人类免疫缺陷病毒1型(Human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)是人获得性免疫缺陷综合征即艾滋病(AIDS)的病原,HIV-1感染人类免疫细胞,渐进性地破坏免疫系统,最终引发艾滋病。ANP32A (酸性核磷蛋白32A)与ANP32B同属于ANP32蛋白家族... 人类免疫缺陷病毒1型(Human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)是人获得性免疫缺陷综合征即艾滋病(AIDS)的病原,HIV-1感染人类免疫细胞,渐进性地破坏免疫系统,最终引发艾滋病。ANP32A (酸性核磷蛋白32A)与ANP32B同属于ANP32蛋白家族,是近几年新发现的与流感病毒复制相关的宿主蛋白。前期有研究证明宿主因子ANP32A/B是A型流感病毒聚合酶发挥功能所必需的宿主因子,并揭示了其与聚合酶相互作用的关键位点,为新型抗流感药物及转基因动物的研发提供了有效靶点(Zhang H et al. Journal of Virology 2019)。 展开更多
关键词 宿主因子 复制过程 RNA CRM ANP32B HIV-1 病毒复制
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The association between the genetic polymorphisms of LMP2/LMP7 and the outcomes of HCV infection among drug users 被引量:6
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作者 Qian Cui Yongxiang Zhang +7 位作者 Jing Su Chao Shi na lei Keqin Ding Jun Li Rongbin Yu L u Wang Ning Wang 《The Journal of Biomedical Research》 CAS 2010年第5期374-380,共7页
Objective:To investigate a possible association of LMP2/LMP7 genes with chronic hepatitis C virus(HCV) infection,and to assess whether LMP2/LMP7 genes could influence the outcomes of HCV infection among drug users.... Objective:To investigate a possible association of LMP2/LMP7 genes with chronic hepatitis C virus(HCV) infection,and to assess whether LMP2/LMP7 genes could influence the outcomes of HCV infection among drug users.Methods:Genomic DNAs of 362 anti-HCV sero-positive drug users and 225 control drug users were extracted from the peripheral blood leukocytes.The sero-positive patients were divided into those who had persistent infection and those who had spontaneously cleared the infection.Polymorphisms of LMP genes were determined by PCR combined with restriction fragment length polymorphism(RFLP).Results:The distribution of LMP2 genotypes among the control,persistent infection and spontaneous clearance groups were not different.However,the LMP7 codon 145 Gln/Lys,Lys/Lys,and Gln/Lys+Lys/Lys genotypes were found significantly more frequent in the persistent infection group than in control group(OR=1.75,95%CI=1.06~2.90;OR=3.16,95%CI=1.23-8.12;OR=1.94,95%CI=1.21-3.12,respectively).Similarly,the frequencies of the codon 145 Gln/Lys,Lys/Lys,and Gln/Lys+Lys/Lys genotypes were found significantly more frequent in the persistent infection group than in the spontaneous clearance group(OR=1.64,95%CI=1.04-2.57;OR=2.40,95%CI=1.09-5.28;OR=1.76,95%CI=1.152.69,respectively).Stratified analysis indicated that combined genotype Gln/Lys+Lys/Lys of the LMP7 gene was related to an increasing susceptibility to HCV infection(OR=1.91,95%CI=1.02-3.55;OR=2.19,95%CI=1.243.89;OR=1.91,95%CI=1.05-3.48,OR=2.86,95%CI=1.41-5.78,respectively)and the risk of persistent HCV infection(OR=1.94,95%CI=1.12-3.34;OR=2.02,95%CI=1.21-3.38;OR=1.78,95%CI=1.12-2.85,OR=2.23,95%CI=1.09-4.58,respectively)among30-year-old,males,the injection drug user(IDU)subjects and/or the shorter duration drug users(≤5 y).Conclusion:These results suggest that polymorphism of the LMP7 gene may have an influence on the outcomes of HCV infection,and is one of the factors accounting for the genetic susceptibility to HCV infection among drug users. 展开更多
关键词 hepatitis C virus LMP gene polymorphism infection outcome
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马干扰素限制慢病毒感染的分子机制
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作者 Ji Shuang na lei Ren Hui-ling 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期664-664,共1页
动物天然免疫系统的组成存在种问差异性。同一种属的不同病毒往往来源于不同的动物。天然免疫如何识别不同病毒并发挥抗病毒机制存在诸多未知。逆转录病毒科慢病毒属的成员具有严格的种属特异性,如I型人免疫缺陷病毒(HIV-1)只感染人... 动物天然免疫系统的组成存在种问差异性。同一种属的不同病毒往往来源于不同的动物。天然免疫如何识别不同病毒并发挥抗病毒机制存在诸多未知。逆转录病毒科慢病毒属的成员具有严格的种属特异性,如I型人免疫缺陷病毒(HIV-1)只感染人类,猴获得性免疫缺陷病毒(SIV)只感染猴子,而马传染性贫血病毒(EIAV)只能感染马。研究慢病毒与天然免疫相互作用机制可为解释病毒侵染与天然免疫限制、病毒适应于宿主限制等提供直接依据。 展开更多
关键词 病毒感染 分子机制 人免疫缺陷病毒 干扰素 马传染性贫血病毒 种属特异性 天然免疫 逆转录病毒科
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