超算中心典型科研应用特征统计与分析

超算中心已经成为众多科研机构的重要科研基础设施,对基于MPI的高性能计算应用进行数据建模和分析对优化网络流量、资源调度等许多方面十分重要.已有的研究工作大都集中在超算中心大规模MPI整体使用情况,或小规模的某个特定应用的研究,缺乏对科研行业超算中心的研究.本文通过采集和跟踪中国科学技术大学超算中心最典型的两个应用的流量信息:小规模并行的VASP应用和大规模并行的OpenFOAM应用,对MPI各个函数调用的流量数据和数据包传输进行了统计分析并发现其特点和性质,得出了一些新结论,这些结论可以用于指导超算中心网络设计和优化.